XLOC_006436 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_006436
Unique NameXLOC_006436
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000322_pilon:197743..214416+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_006436 ID=XLOC_006436|Name=XLOC_006436|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16674bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:197743..214416+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGACATTATGTAAATCATTCTCCTCCAGGAGCGAGAGAAATAAA AGTTGGTATTTTGACAGGTAAAATTcctttctttatattttttgtatgtG GTCTCCTGAAAATTTAAGTCCTGAATATTTTTTAGACCTGAATAGACCGT TTTTCTACAATCTCattcattgaaatttttgtgttttatttcTGTTTCAC AATATTTTGTATACAGTCCAAGAAATTGCATAGAGATTTGCTTTTCCACT ATCAAATTTGGCAACACACTTACTTTTGACAGTCTGTGGCGTGGGAACGT TGTGAAAAACAGCCAGGCTGTTAGCTGGAGTCGGtggattttttgataaa ttcaaAATGATTGTGTATCTTACAAAAGGTCATGGAGCACTTTGCCTTTT CCTGCTTTCTCTATCTGTTTTTTAATATCACATTATTTCCCACTACTTGC TTCATTCGCATAATTAAAACAATCTCAATGTTACAGTGCAGAATTAACGG AACCCTCTAGCAGTTTGTGTGAATGTGTGactgggcttttttggttgtgT AAAtgcatgaattgaaaaaaacttgcatGAACATGAAAACCCACTTCTTG ATTGTATGAATGTCTTAATATGCCCTATTTGTGTGAatacatgaattttt ttttacagatttcctcgatttcctcaattttctcagatttttacaagaaa tttcccaattttttgaaaattcctgtTTGTGTGAAGCTTGAAAAAAGTTA CCTGAATGTGTGAAATTTAGGTACTGCgggggagggggggCTCATTAATC TCACTTTCAAACCTgatcaaaatttcattcatcAAGTTCTCAGGAGTTTT TATGTAACTCCAGcatcaaaatgtttgaaaaccTTCTCTATATTTAGTGA GTGATAGATGCTCAGCTGGAACACAAGAAGACAAAAGTGGACCAAATTTG AAAGCCCTTGTACATAAACATCTGCAAAAGTAGGTATTGGAGCCTTTTGT AATtaccttttttgaaattatatgaTTAAACCATCACCACTGTATCTAAC ATTTAGAAGAATCTATCACGCAAGTTTTAGAGTAGATTTAAAATACATAC AGTAATAGTATATTCAATTATATAATTAAGGATTCACTTTCACTCAGTTT ATGGTCAAGGAGGAATATCAATCAATTCAAAAGTATTAACACACTGACAT GATTATTTCTGCTTTTATTACAGGCTTGGTGTAGTACAAGTCCTTTCATC ATGTGTTCCTGATGAAGTCCATATTATAAAGGTatacaaatattgaaaaa ggttgatattttttctttcataggaTGATTTATGTTGTGGTAGAATTTTC CACTTCAATACTTTTAAATCATTGAGAAAATTATACCCGACTTCACGATA CCTAAcaagaaagtgtaaaaaaaaaagatttccaatTCCCgattttctca atattttctagGTGAacattgaaaaaagataattttatggttcggtttga aatttaaatcaaaTTGTTTTACAAGGTTTTATAATCAGTCAATACAATAC AATGTGTCATTTATTTTCAGAGTTGTTTGTTACACTGGGCAGATCAAGAG AAATGTGTGTTGATATTAACAACAGGTGGTACAGGATTCAGTGCCAGAGA TGTCACACCAGAGGTAATTAGGGGTATTGTTAATGTTTATTCTGTGTATG TAATAAGAACATAATATATCTAGCAGTATTAGGCCGGACATGCCAAATTA TAAAAACGGTCTGCCAAACGTACTTAAATCCTAGGTCACAAACTTTGATA agaagtgtgtcaaaatcttttattgattttataaacttttttgttgtacT CTTGACTCAGGCTACCAAAGAAGTTATTGAAAGAGAGGCACCTGGACTAG CTATCAGAATGCTGTCCAAATCTATAGAGACCACACCAATGGCAATGTTA TCACGGTAACTAAAAGTTATATTCATGATCATGTTTGCAATAGGCTTTAA AAATTCTACTTTGTTCTATGCATCACTTAtctttagtttatttttatgta atttgatttacattgaaaaagcaaattatCATGATAAGTTTAATgacttg tttttattatttaggCCAATATGTGGAATCAGAAAATCAACAATCATTGT GAATTTACCAGGCAGTAAAAAAGGGTCACAGGTATATATGACCACttcat ttctttcaaaaaaatataactttatgTTTTGATGTAACATGAGATATAAA AAACATTACTATATACTGTGATCAAATTGTCTTACgtaaaatttacataa tttttggTTTTCTATATAGGAATGCTTTGAGTTCATTCTACCTGCACTTC CTCATGCTTTTGGTATGTTTAAGATTTTACTATGAAAAGAATATCTGTCT TGTCTGGTCTGAttggtacaccattttaaaagaGGCTTGATTTTGTGTAA TTCTCATCCTCTTATCATCAAAAATTGTCTTATATCCCGACACTAAGCTT TTATTAGATTCTAAGGCATGATTGATTTAATCTGTAGATATCACAGCACT TCAAAGGCAAACCTCTTCCCTGTGAAGTTAAGAAATTGATGAAATGATTT GAGCTGTTAAGAAAGTTtatttgacagatttttgttgattactttttgtt tattataaaaaaaaatctattaaaatcCATTATAGATTTAGTGTCAAGTA ATGAAGAGAATGTCAGTCAGACTCattcaaaaatgcaaaaatcacCATCC CCTTTGCCTATGGATAATGAAGCCCCCACCACAGTAAGACAAGGATTGAA CTTCATGGGTCCTACTTTTCGATAACAAACAGCTatttataattcttttt tttacgtAAATGCATTTTATTGAATTGAAGAATGCATTACTTTCTGAGCA CATAGCATATTTTAAATTCCTGCTtttcttcaaataaaaagaTCCAGTCA TATTGGTGTTACATGTATTTTAAGCAGTTACGTTTTAATgatataataaa atattttgttttatttaggATTTTCAAAATGGGCATATGAACTCCCATGA TACTGATAGGGATAGTGGTAATTATAGCGCACATAACcatcatcatcacc atcaccatcatcatgatcaCAATTTACCGCTAGATGATTCGGCAAGTGGT ATCATATGTTTAGTACCAGGATGTGATGGCTCTTCCTCTATGGTATGTAT CGATAATACAATACACCAGGGCTAGAAATGCTGCTCGGACATTAAACATT TTCTGAGCAAAATTCTCttgcaattaaaatttttaagcaaaGGTGAAACC CCTATTGGATATTTTGTGCAAACTTTTTAAAATCGTTATTTTGAGCCTTG TATACTTCTCGACGCATCTTTCATAATTGCATTGTTATGGTTTCAGGATT AGTTAGTGATAAAGAGATGTTTATTTAACTGATTAGGCGGATTAGCTGTT ACTGAAAGATCCATTTTGGTAATTACAAGATCGAATTTCTTGATTACctg aaatagctatttcactCTAATGATATGTAATTCATATCACTCCGTGACAG AGTTTGgacaaaaaaaactaaacagCTAGACAGTTTTTTATTATGACGTT GATAATTTATCATTGAAACTGCTGCTCCATTTCTTTCTAAGTCATAAACT TTGAAGTTTGATTTATAATTAAAGATCGGAAGAAAAGAATGCATAATAGA AAGCAGTTACAGTTTTATGTGAATCATATCCTCTTTGCAACTTCCTGGTG TTACCAATTCACATTATTGTGTTATGTGTTATTtgcacaaaaaaaacata tagcAAACCCTTAGAAATAAATTTTGCAAGCTCATTTATATAACACAAGA TTTACATCTTACTCTATTTGGGGGCAAGCTGTTAAATTGGATCATCTAAA GTAATAACATGATTAATCTTTTTTGGAAGAAATAAGAATCTTGCAAAAGA AGGGAACAACCACAAAATCTCCAAAATCTACAGAGGAATAGTATTCTTGT AAATAATTGGATCTACCTAATTGACATGTGAATGCTAAATTAATTTTCCA GAGCattctgttttttatttcaaaatgattaTTCTTTTCTTTATCGGTAT GCCTGCCTCTAACCATAAAGGGATTTGAATTACCtttttttATGAATGAA ATTCCAATTGGTCggataatatttctttttgtggCTTTCCATAACGAGGC CACAATTATATTGTGCTTCAGTCAACTTTAGTTTctcaagtgattttttt tttatttctagttCCTCCTATAAAATTCACACGTTGCAATTTCaggtcta ttgaaaattttaaaaaaagactCTATACCATCACTTCTAAATTGGAACTC CTAAAAACGATAATATAGTCCATACTCAGTTTTTTATCTTCAGAGCTTTC CCCTAAGGTGCCTAGAGTGAGTTCTTTAAAGTTAATATTTGCACAAACTA TAACTTGCAAAACTAACTAAACTtacttgtttttaaaaaaatctttaaaa ggaaAGGTTAATAACCTTTCATATTAGTTTTACTTCCTAAAACAATTTTT GGCTTTCTTCATTATTTACATTTACATGACGAAGCAATACCAAAATAGTA AACCATTTGAAATACTTTATAGCATGATCCATTAAAAAACTGTTTAGGGT ATACTGTAGGAGTGGCCTAATCAACAACGATTTTATGTTTGACCTCAGAA AATTATTACGCAGTAATCATTTTCCCATTTCTCGCTATTTGGGGACTTTG ATATCTTATGTTTTGTTAAAAAAGGGGGTTAATCTGCTCTAAAAGAGATG CAGTGAATTTGATGATCTGACATGCTTGCTcagccaaaacattcaaaacg aaaacgaaaatgaaagtgaaagtgactCGGTTCTAACTATGATTATGATT GAAATGTGGTTATTTAAATTCAGATAGTCACTGCGCCCAAAAGCTCAATT TAAATATTTAACCAGAATCTGGCTGCTGCAGATCTTAAATGAGAACTGTT GACACGGGAAGATCCCTTTACGGAGCCAGAGAGCCTTAAGAGTCAATGCG TGCGTCGTGCAGAGTAATCGGGATCTACTAGGAGATTAGAAAGATACTGA ACATATCTTCACATAATTGGCTGTTTTATCATCTCTTCTTTTATTAAAGG GCACGCCGCCACCTCACTCCAACCGTCAAAGTATCGAAAGTCTTCAAAGT TTGCAGAGCTTACAAAGCTATGGATCATCCATTACATCGTCAGAGCCTGG AGGCTATTCAGAACCGTGTTATTCAGGCTATTCATCTTCAGAATCGGGAC GACCATCTACAGGATGTCATCATAAAAAAGGTATTGGGTTATCATTTTTA AAGACTTAACTGTTTAACCTTGCTGTCTCACTTTCTGAGGATAGCGATTG TAAGATTGCTCTGTACACGAGGGTACGAGATACAGGCTTACGGTAGTCTG AAACACAGACGTATAAGGATCGTATGGGTTTGTATTAgagaaggtagagc atccagctacggtgcgcaaggttgtgggttagATAGactgatagactctc taccttcacttaTATATCATTCTCtctcaatccggctgataatcgaagta tcgattaacgtcaaatgagcttagtaaagctcaaattgcagatgtagaac aaTAAACTCGATATACATACTACCTTACTACTAACCAGTCCTTTTTACGC CAACTTTTATTCTATGGAGGCTTAAAATTAGTGCCCATAAGACCCGGCTA AAAACGGGATGAAAAGGatataaacaatagaaatgaaatttgatatgTTG AACCACGAATCTATTTATTAATGAAACGAGACGTCCTAAGTGTCAGGGGT GGGTTGGTCTAATAACGGAAATTATAGCTTAGAAAATACCTGATTTTAAT TTCAGATACatcgaaatttgattttttttaattgttacaACTATTGCTTT TTGACTCAGTTGGAACGTGGATATACCATTGCTTGTCGTTATTTGTTGCT AGGGTAACCATCTTATCTATCTAATCAGATAAAATTCgaatcttgtaaaa aaaaccttttttttactaagttgtgtttttattaagtttttattgcactt tttttgtccatgtgaaaaacgaagttatttttttGGTATACTATCATTTT TTCGTATGCTATATGAATTCAACGACATGGATTGGCCTAAAAATGGTTTG ctttatttcaatgtttgaaattttaaagggGCAATCAATGCCAACACTGT GTACCTCTCTTAGAAGCCtttttggttttttATCTCGAAGACTGCGAATA AATCgtgtttttaaaaatcaacTCTTATCTTATCTGATATGAGTGGAGGC TGAAAATGCTTATTATTATAAAAgttgtaaatttttctgattttttattt atgctCAAAAAGACATGTAAGAGGTCGAAATATCCTTCAAACAAAAATGT GTCATGTTTTATTCTGATATTTGGTTACACATCTGATGGCTTTTAATGTT TCACCTTATATGAAATATTCTAACATTctacattttaaagatttttaaca aTATCGACTTCAGCCTCTCAAAAGCCTTCCCCTTTGTCTTCTTGCGTTTA ACTTTATCtgtaaaatcttctttttttttcgtgcTTCAGTTTACATCGAT ACACCACGCGTAGCAGAGCGCGATCGCTTCTCCCCTTACCCCATGGTGTG TGTCAGTAAGGCTCTCTCCCTCGTTCTCAGTTGCATCAAAGTACCCAAGA AAAGACATCTCGTCAATTTGCATGCAGGTAAGAGAAAATCACTTTTCTga tcttataaaagaaagtccTGGCTTTCAAACTTTCGTATGTGGAATTCTTT TAGATTTCTATGTGCAAtataccttttttataagaacaaactatataaga acataaggcttcgagggccGAATAAAACAATATTAGGAACAAGTTAGGAA TATTTTAAGTCTTTGCGGGCTctaacacctgatttcttaagaaaatgggc aaaaatactcacacaatggtgaaagtaagaacatgttaagaggcttaaaa ctcaaaaagttggatgttcttataagaaaacgtgtatcttTGTCTTTCCT TGAAGGGagtgaaatgataaaaaactatAAACAAAACCGTTAAACCAACT GATTCACCGTAAAAAATTCGCGAATTCATTATCTCTATCCCAATACGCGA tttttttATCAGTGTGATGTCGaaaaaaaaagccgtggtcgtctggtatA GGCAAGGCAACAAGTCTAtgaaaaaaagagataaaaactACAAGCATCCC GAAATAACGCTTGCGACACTtttaaaatacacgttttttttttttaagaa actagttttaccaagcagcctcaatgtttcttaagaaatcggccttttga gccttaaatgtttcttacatgtttctaaactttttgacgtaaTCAGCCtt atggaaggctggattggaaggttcttaaaaaaactgaattagaaaatatt attttctcattctcagcctcagcatgtttcttagatgtttcttagttttt aggcattctgagcctcatgtttcttaaaagtgtgtttcttaaaaaaaaaa agtgtagttgAATCGATCGTGAAATACCGACACAAtgtttttatgggttt ttaaatcaaatatcGACAGACACGTGTAAAAAAGGTTTTCCACTGCAAGC AATGAAACTCCTATTACATTGTGTAGACATAACAACGAGATTGGACCTCG TTATAGTGAAAAACTGCAATTTGGTTTAATTTTGATCCAATTAAATCAGA GTACAATGCCGACAGACTCTTATTACGCAATCACGCCTATTTAGAACAAC TTGAATGCTAAACTTCTACTAATACCTAAATACGTGGGAAATTTTGATCA GGTCATTGAAAGTTTCTgcaatattctttaaaaaaagaaatactatTATT TTTTCACCGAGTCTCCTGAATACCTTTCGATTTTCTTTCCTTActtcttt caaagaaaaatacatactaccatattttgagaaataagCACTAGGGCGCC GGTTTTATAACTTTGGAAGGTTCTATCGGGAGAAGAGGGGTGGGGTAAGA AACGTGCGAGGAAGAATTAAGGGATATGTGATGTTTTTGCatcttatttt tcttaattttctaatAAGCACTGCGTTTGAATTTGCGGCGCGTATTAGAG GGCGGCGTTTGAATACAAAATCTACGTGCGTCGCTTAACGAAGGAAACAC CATAACCCAACAAGTGGGAATGGCCGTAAATGAGATACGCCGTGACCTCT GCCGCCCTTTATTATTTCCCTCTTGAAAACGAATCTTGAGAGTCGAGAGC GACAAGGAAAACTTATTTTGGAATAGGTTCATGtgcatttgaaattttga aatttcatgatttttaaatattgtgCTCTTTCATTAACTATCACCATTTT GGTAGGTCTGCTGGGCAAGATATTGATGGAAGATGTGAGAGCCAAAGAAC CTTATCCTCCGTTTGCTGCTTCTGTAAAAGATGGTTACGCTGTCATTGGT AAATACGGTTTCTTTCTAAACATCCAGCACATCGATTTGATTTAGTTTCT TTGTTTAAGGAGCGATGGTCTAGTAGTCTAAGGCGTTGTTTTCGCAAACT AGTGGACTACAGTTCGACGAATTCTCGTTTTCCAATGTTCCGCTCCGTTC TGTTTACATTATAAACGAGTTTACGTGTCTACTCTTTTGAGGATGTTGGA ACTGCGGGAGTGACTCGAACGATTTGGCACGACCTGCAGTTTTTATCCGC AAAATCAAGGATTGTAAAAGCACTGATTTACTGTCGTCCTTAGTTAGTCA GGACCTAGGCAAATCAAAAACTAACCACCTCCGCTGCATAAAACACGTCA TACATAAACGCTCTATATATTCGGTTCCTAGTCAGTTGTCCATGGGTACC GTGAAACTACTCGAAGAACTGCATCTAGAATTACTAAATATTTGGCTGTC TACAAATATTGAAGTTACAAGAGTCTTACTCTGGAGTGTTCTAGCTTTAC AAGATTTCGCGTGCTGAAAGGAATAATAAGTACGATGCTATTGTCCCTTA AAGGGATGGTAAAAGCGGGAAAATATAGTGCGTAGTTTACAGTCgtatat agaaaaaaaatcgGTGACGATAGAGTTTCGGACAAACGACCGTCAAAAAC TCTACTGATTGTTTTCGGTGTaaaaaaaCCGGTTTGCGAATTCTCTTCGG CTTTgagcttttttcttagataatgattttccttagactatagcatagtc tatacCAAGGTCAAATCATTTACATCTCATTCAATCACTTATACTAATGT CTTGTTCATTTGTAGCTTCTGACGGTGCAGGTGTGCGAACAGTACTGGAA CCCATCACTGCTGGAAAAGTGGcaagtttaaaatattttcacttaaaaat TGCGTTagttcaaattttgatttaccAGCCTGGGACGAGTCTTTCGgtgg tcaaaaacaaaaaaaatcttacctgatcttcttttatatttcaaaacaaa tatccCCTACTGGCTGCAGGTAACGTTGGTCACACAGAATAGTCAAATGC TATCAAATAAAGGCAGGCGCTACCTCTCTTTGCATATACCTAaccttaga ctggagtcgtttataatgcgtgtaatacagaagtataggcgttatatgat aatacgattattaaTTGTTATGGGGTTTAGTTTGTctactaaaatttgtt ccctccattactttttgctttatttctactatgtctgaattagtagtcta gcttgctagactgaCCTAACCAGGATCTTTTTGAATGAAGGCTATAGAAA CCTTTTATTGACGTTTCATCTCTTCTTTGTTGCGTAGCCAGTGAAGACGA TACGTACAGGACAATGTAGTCGTATAAACACTGGAGCACCATTACCACCC GGTGCTGACGCCGTCGTTATGGTGGAAGAAACTGAACTCGTTGAATCTAA ACAAGATGTAAGATGAGATTCCCTTTTATGACCTCTTTTTCCCCTTTTGA TTGGCTCAACTAGGTTGGGTAACAATCATGTGAAGACGATGCATTGTAAC AGTTTTTacaaatcaaattttaaaattttcagaaatttcttcTGAACTTC CAAATCGCCTCTGGATCAACGATACATTGTTCACGCATTACAGAGCTTAT TATATTTTCTAAGACTATGTTTTGATATAACAGGCAACGTTGTGGCATTT TACGAATTTCAAAATAGAGATTTGAATTAGTTCGGATTAACGAGATATCC TACTGTGTATTTTCACTTTGTCACTTATCAGGGTCGCGTTGAAGTGAGCG TCCGAATCAAGACCGCGCCGCGTGTACTTCAAGAAGTCAGGTATTATAAT TTTTCGAGACTAATAGTCTAGGTCACCAACTTTTACAACGCGTTTATTAC TAATGTAATGAAATTAAGAAAACGTGGACACTTAATTAATTTTATCTCAT GTTATAAAAGTAAATTAGCATTCATTAAAGAAATTCGAATTCCTTTTCGT AACTTCTTTTGGATTTAATAGTGACCCGCTGATCTCTATCTAAACAAGAC AAATTATAGTCTGCAATCGATATCTCAGTTTTCTGCCCCCTTAATTCTTG TAGACAAATTTTTGgcttttggaactaattttcgcgggaactaattttcg cggtcgaaaaaaaaatccgaaaaattaCATTTCGCGGGTTtaaattttcg cgttttttttcattcttgaattttcgtgggttttaattttcgcaattttg cccttttttggacaatttctttcattttcctagggatttttcaaattttt cgataaaattggaaaaaattgttttttgcgggaatcaattttcgcagttt ttAACTCTCAAAGTTTTTCGCGGgctcaaattttcgcgattttgacaaaa attaattcccgcgaaaattagttccaataaggtatacgttttttttagaa caaactatataaagaacatataaggcttcgatggccaaaatattaagaac aagttaagaacacttgCCGACTCGAAAAcggccaatttcttaggaaaatg gaccaaaatacatataaaaatggggaaaatgagaacatgttaagaacatt tttaggctttgaaactcaaagagttaagaacatccgaaagcttcaaaatt tttggatgttcttataaaaaaaacgtgtaggtacACACCTTATGTATGAG CCCTTTACACGTCAAACTTAGTTCAATGTTAGTTTTGGGTGTccaatttt ctgattttaaaatgttttagtTATTCCTCATCTTTTCATAAACAGGCCTG TTGGATTTGATATCAAACAAGGTGAAACCATTTTGAGCTCTGGTGAAAAA CTAGGTCCAGCTGAACTTGGTCTTCTAGCAATGGCTGGTGTACATACTGT AAGTCAACTTTGATATCCCCtttaagaaatcttttttgtttttgaccgtt ttgaaattttgaaaatatagctTCGATCCAATCATCAACATCCCTCATCT TTTTCTATTTAAATCCCTCATCCGAGTGAAATTCAGCTTGTTGTTCTGTC ACCGCTTTAGATTTTCCATTGGGCAGCTTTCTGGTAACCAGTGAATTCca attttttgaatcttttcaaAACCAACTCGCCGGTTGTTCAGTACCCACGA TaaaaaaaaCGAGGGTGTTTCAAAGGTATCAGTGGACGACCAAatttttt gatcgaatttgaaaaagttttgaccaccatattggatttcttttcttttc tatttttcaggtATCAGTGTACACTCCACCATCCATTGGAATCATCTCAA CTGGTGATGAGGTATttcatttcttctttcttcattttcactttcaaaaa atatcctAACCGACTTTTAAAGGAAGTGATTAACACGGACATATTTATTT TGTGGATCcatgaaaattctaccttaaggGAGCTAATTTTCGCAGGAACT AACCGCGAGAATTAAAAcccaaaaattacaaatttagcCATTTATCAtct agaaatttgaaaattcctaggaaaatgaaatggaaaatgaggcaaaaccg cgaaaatcgATTCCTGTCGAATacgattttttagaatttttttttcgacc gcgaataATAAGTTCCCGCTAAGatttaaggtattttattggatgaaaga tattttttgcCAAATACTGCTAATGGTCTGGTATAGCACGGCTTTGGTGA AAGTATGAGATATTTTAATTTTAGTGAATGGCGAGGCCTATGTTTCCTAC CGATTTAGGATATGAATTATTATTAATGGGACTGTTCACACAACAGGGTC GATTCTTACTCAGAGACATTTTAGAACTTGGTGAGAATTTCGTGCGACTA AGAACGTTcaatttgaatgaaaactttCGTCCATCTCATCATGTGCTCAC atatagtatatatatataACGATATTCAAGATTTATCAATAATTTTCCCa cgaaaaaatgaaatcatttaTACGTTAAGTGTGAAAAGTGGAGTGACCGC CTCTTCTCAAAGCTCTTTTTGGACAGCTCAGTAGTTCTCTTTGTCAGGGA ATCTCGTGTCCAGAAAATTTTGTGCGTGAGACCGTTTTGCGGTCGATATG TTGTATGTTATAACGGCATTTAGTTTTGCTAATCAGCAAgaattacctta ttggaactaattttcgcgggaactaattttcgcggtcgaaaaaaaatatc cagaaaattgcatttcgcgggttttaattttcgcggttttttccattctg gaattttcgcgggttttaattttcgcggttttgcccttttttggacaaat ttctttcattttcctaggggtttttcaaatttttcgataaaattggaaaa aattgtatttcgcagaagttaattttcgcggttttcagctctcaaaattt ttcgcgggatcaaattttcgcgattttgacgaaaaaccgcgaaaaacgct aaaattaaaacccgcgaaaattagttccaataaggtagtttATTTAGTCA GAATTAATTTACATTTAAGGCTCACTCGctaaaattgtgaaattttgcGC GAAACACGAAAATCTGTGACATTCATGTAGTTAAGATCATGGGGTCAtgc gagaattttttttatagttcGCCATGTCGAGAgtcattgataaaaaaaag tgaCATGAGATTAATGTCATACTCCGATCATTATAAGACCATTAATATGT CAAAGAAATATCTCTCGGGTATAATttattgattttcatttttgagtCTT AAAAGTTTTACAAAACCTCTCACGGAAATATAATGGGGGTGAATTAAAAG AGAACATTTCAAACATTCTGACAATTCGTGTACTGAGTCACGCTTGAAAA TTCCAAATATGGGTTTTATATCTGGAATTTTTAAAGTCGTTGCTCggtag caaaaaaatgtttaaatcaaACCACCCAAAAACTTTCGCAATAGTTTCGA AAGGGGATGCTGCAAGTATTCTCAAATAATTCGACTCTTAAAgtaaaagt gacgaaatttttagGTAAGTGAAAAAACTTATCGTCGTCAAAAACTTTTC GGGTCAGCTTCAAGGGGCAGTTGAAAAGTATTTGCAAAAAAGTAACGAAG TTTTCCCCCGACGAATATTTTATCTGACGAAAAACTTTAAGTTTTCCCCT TTAATAAGCTACCACTCCAGGGTTTTCTACCTCGTCTTAATTTTTGCTTG AGTCGaacattttcaatatatttcaaggAATCTGCTCGCACATAAACAAT GCTCggaatttgttttgaattaGAAAATTCGCAGTAAGAATATTGAATTC GTGTTCGAGAAGTTCACTTTAatatcagaaaattttgcgcTCAAAGAGTT TAGTGACTCCGGCTGttctttaatgaaatttaatttcGTAAATGAAGCaa aaaaaGAACGTCCCTGGCATTAATATctcttgtttttgtttatctcATAG TTGGTGACACCAGGTTCAAAACGAAGTGAGGGGCAAATCTTCGATTCGAA CAAAATTGCATTATTGACAGCGATACGTGAACAGGGTTTCAATGCTGCTG ACCTTGGAACCATCTCTGACGAGTAAGTTATATGATGCGGATATTTTAAA CCTATCTTCTTTATTCTTGAAGAATGAATctttaagaaaacttttgaatt ctAATGGTGATATTTCAATCGGTTTGTTTCCGCGATGAATGGAGTTCTTC GTTTATTTCTTATCTTACGCAAGACTAAATCCGACGTACCAGGCACTTGT ATGAGTTAAGTAAAAAGTTACTCAAATCTGGATTGCTAAAACGTTAATAT GAATAGTGACTTTCCGGAGGGCTTACTTTGGACCACGTGAATTAAAAGTT GTTGTTCtctcttcattttttcagttattcgtTGATGAAAGAAAAACTGT TGAACGTGATTGACGATGGAACACATCGAGTCATCATCTCTACCGGTGGC GTCTCCATGGGAGAAAAGGTAGCCATATTCGTGCCTAGAACCTTTTAGAT ATCTTCTCCGTCTGTAAAATTATTTGTTAAAACCCTACTTTTACGTTCTT AAGCCTAGATTATGAGAGTGGTCCTAGAAGATGAGAGGCTTAAAAATGGG GTTAACGCTTCCAGGAAACCTGTTCAACCTAGAACTAAGTGGACTTATAG AATTATAGTAAATAGGcgtagtagtgtagtggtcatcgttcttgacttcc gtgctggaggtcagggttcgattcccactcggtgctaCGATTCaattggc aagtgaatgtaccttggcccgggtcaacccataccatgtgaggggaatag ggtaccatcactctgatacaagagtatggggagatatgccggacattgaa tgtggtgtggtgatggtACTCATATGTTCAGTACCTGCGAGAACGCAAGT TTCTCCCGTACTGTgcgagtatcatcatcgatacagcacggctctgatgt gtcgcgagcacagagtacaatatctggtaagcgctgtgatttccctacct aggggtaggaaactatcccgggatagggcccggtccgatgatatTGGAGG GTCCGCTTCTCTCCTCTCAtttttttCGAAGTTTACTAATTTAGCGGAGG AGCTGTCGTTGAAACAATTCAttctttgacttgaaatttattcttatttt atctTTTACAGGACTTAGTGAAGAAGttccttgaaaattttggcGAAGTG AAGTTTGGAAGACTGAACATGAAGCCAGGGTATGAATAAACTGCACAATC CTCATCTCCGACTTTTTATTACTGACTAAAACTGTCCCTCTAAAATAGGt ggattgattgattgatctcCTGTATGAATAACACCTTAGAGAAATATGGA GCCCTGCATTAGCTAGAAAAGAACGGAAGGGAAAATGACAACCGCTTCAA AATGTGTGATCTGGATTTTATCATCGTTAATTACAGCGttcggcgtaaaa agggccgataaggtattcaaaaacaaagaaacaacaATATTCAATCAGTC GTAATGATTGCTGCCCGtattataacttttttttaccCGACAAAATGGTT TGGTAGACCTTTTCCCTATGTTATCACCaaaaaaaCTGACCcgtgaaaat ggtaattttaTAGAGTGTCTTGAaagatttcaaacatttttatttcaggA AACCTACCACATTTGCCACCATCATTCGCGGATCGAAAACTACTTATTTC TTTGCGTTGCCTGGCAACCCGGTATCAGCCATGGTCACCTTTTATCTCTT TGTTCTACCCGCCATTCGGAAGTTGGCAGGCTACAGGAAGCCCCATTTAC AAAGAATCCAGGCTAGAGtatgttcaaaattttgttgtGTAATACGACGA GATTGACGTTTTTAGTATTTTAGCCCAATCGAAGTACTGTCGTTTGTTAC GGTTAGAAAGCATTCCGTGTCtgcactttttttcttatttcttctTTAGT AGAGTGATTTTCTATTCTTAGTATacatttttatataagcaaTCAGGCTG CTAAGGCTCGAGCCCTGAAACTAGCCAATTCGTAAATTTGCTTTTTAGAT AATGTAAGCctggcaaacgatagcccttgacaCAATTTAGCATGAATATG GTTgaatatcaggggtggtcaaagcaattttttagaaaaaaagagctAGA ATATTAAGAAACCCCAGCCCTGAACCCAAAATTGGGAGTTCCTTGTAAAA GGAATGTATAAGTGAACTTCTTGAAACCTTACTTTATCCACCTCAATGTC ACGACATCTTTCCTTTTCTCAAAAGAGCCCCTGTTTTTTCGATAATGACA CAAGAAATCGCCCGTGGTAGAGATGGAACTGGCTCTTAACATGTAGTTTA AGGACCTTTTAACAATGACCTTTCTATCTTACCCTTTTAGATCGACTTTG ACGCTTGTTTAGACACAAGACCCGAATACCATCGTTCCAAACTCAACTGG GATACAGACGATGGTGTACCCTTAGCCGTGTCAACGGGCAGTCAATGTAG CAGTCGTTTATTGAGCATGCGCTCGTGCCATGCCCTTCTAGAATTACCAA GCTCAGACAATACAAAACGGTTAACACGTGGTAGCATGGTAACCGCATTG TTGCTACCCAAATTAATCacctga

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000322_pilon:197743..214416+

>XLOC_006436 ID=XLOC_006436|Name=XLOC_006436|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:197743..214416+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGACATTATGTAAATCATTCTCCTCCAGGAGCGAGAGAAATAAA
AGTTGGTATTTTGACAGATGGCTGGACATTATGTAAATCATTCTCCTCCA
GGAGCGAGAGAAATAAAAGTTGGTATTTTGACAGTGAGTGATAGATGCTC
AGCTGGAACACAAGAAGACAAAAGTGGACCAAATTTGAAAGCCCTTGTAC
ATAAACATCTGCAAAATGAGTGATAGATGCTCAGCTGGAACACAAGAAGA
CAAAAGTGGACCAAATTTGAAAGCCCTTGTACATAAACATCTGCAAAAGC
TTGGTGTAGTACAAGTCCTTTCATCATGTGTTCCTGATGAAGTCCATATT
ATAAAGGCTTGGTGTAGTACAAGTCCTTTCATCATGTGTTCCTGATGAAG
TCCATATTATAAAGAGTTGTTTGTTACACTGGGCAGATCAAGAGAAATGT
GTGTTGATATTAACAACAGGTGGTACAGGATTCAGTGCCAGAGATGTCAC
ACCAGAGAGTTGTTTGTTACACTGGGCAGATCAAGAGAAATGTGTGTTGA
TATTAACAACAGGTGGTACAGGATTCAGTGCCAGAGATGTCACACCAGAG
GCTACCAAAGAAGTTATTGAAAGAGAGGCACCTGGACTAGCTATCAGAAT
GCTGTCCAAATCTATAGAGACCACACCAATGGCAATGTTATCACGGCTAC
CAAAGAAGTTATTGAAAGAGAGGCACCTGGACTAGCTATCAGAATGCTGT
CCAAATCTATAGAGACCACACCAATGGCAATGTTATCACGgCCAATATGT
GGAATCAGAAAATCAACAATCATTGTGAATTTACCAGGCAGTAAAAAAGG
GTCACAGgCCAATATGTGGAATCAGAAAATCAACAATCATTGTGAATTTA
CCAGGCAGTAAAAAAGGGTCACAGGAATGCTTTGAGTTCATTCTACCTGC
ACTTCCTCATGCTTTTGGAATGCTTTGAGTTCATTCTACCTGCACTTCCT
CATGCTTTTGATTTAGTGTCAAGTAATGAAGAGAATGTCAGTCAGACTCa
ttcaaaaatgcaaaaatcacCATCCCCTTTGCCTATGGATAATGAAGCCC
CCACCACAATTTAGTGTCAAGTAATGAAGAGAATGTCAGTCAGACTCatt
caaaaatgcaaaaatcacCATCCCCTTTGCCTATGGATAATGAAGCCCCC
ACCACAgATTTTCAAAATGGGCATATGAACTCCCATGATACTGATAGGGA
TAGTGGTAATTATAGCGCACATAACcatcatcatcaccatcaccatcatc
atgatcaCAATTTACCGCTAGATGATTCGGCAAGTGGTATCATATGTTTA
GTACCAGGATGTGATGGCTCTTCCTCTATGgATTTTCAAAATGGGCATAT
GAACTCCCATGATACTGATAGGGATAGTGGTAATTATAGCGCACATAACc
atcatcatcaccatcaccatcatcatgatcaCAATTTACCGCTAGATGAT
TCGGCAAGTGGTATCATATGTTTAGTACCAGGATGTGATGGCTCTTCCTC
TATGGGCACGCCGCCACCTCACTCCAACCGTCAAAGTATCGAAAGTCTTC
AAAGTTTGCAGAGCTTACAAAGCTATGGATCATCCATTACATCGTCAGAG
CCTGGAGGCTATTCAGAACCGTGTTATTCAGGCTATTCATCTTCAGAATC
GGGACGACCATCTACAGGATGTCATCATAAAAAAGGGCACGCCGCCACCT
CACTCCAACCGTCAAAGTATCGAAAGTCTTCAAAGTTTGCAGAGCTTACA
AAGCTATGGATCATCCATTACATCGTCAGAGCCTGGAGGCTATTCAGAAC
CGTGTTATTCAGGCTATTCATCTTCAGAATCGGGACGACCATCTACAGGA
TGTCATCATAAAAAAGTTTACATCGATACACCACGCGTAGCAGAGCGCGA
TCGCTTCTCCCCTTACCCCATGGTGTGTGTCAGTAAGGCTCTCTCCCTCG
TTCTCAGTTGCATCAAAGTACCCAAGAAAAGACATCTCGTCAATTTGCAT
GCAGTTTACATCGATACACCACGCGTAGCAGAGCGCGATCGCTTCTCCCC
TTACCCCATGGTGTGTGTCAGTAAGGCTCTCTCCCTCGTTCTCAGTTGCA
TCAAAGTACCCAAGAAAAGACATCTCGTCAATTTGCATGCAGGTCTGCTG
GGCAAGATATTGATGGAAGATGTGAGAGCCAAAGAACCTTATCCTCCGTT
TGCTGCTTCTGTAAAAGATGGTTACGCTGTCATTGGTCTGCTGGGCAAGA
TATTGATGGAAGATGTGAGAGCCAAAGAACCTTATCCTCCGTTTGCTGCT
TCTGTAAAAGATGGTTACGCTGTCATTGCTTCTGACGGTGCAGGTGTGCG
AACAGTACTGGAACCCATCACTGCTGGAAAAGTGCTTCTGACGGTGCAGG
TGTGCGAACAGTACTGGAACCCATCACTGCTGGAAAAGTGCCAGTGAAGA
CGATACGTACAGGACAATGTAGTCGTATAAACACTGGAGCACCATTACCA
CCCGGTGCTGACGCCGTCGTTATGGTGGAAGAAACTGAACTCGTTGAATC
TAAACAAGATCCAGTGAAGACGATACGTACAGGACAATGTAGTCGTATAA
ACACTGGAGCACCATTACCACCCGGTGCTGACGCCGTCGTTATGGTGGAA
GAAACTGAACTCGTTGAATCTAAACAAGATGGTCGCGTTGAAGTGAGCGT
CCGAATCAAGACCGCGCCGCGTGTACTTCAAGAAGTCAGGGTCGCGTTGA
AGTGAGCGTCCGAATCAAGACCGCGCCGCGTGTACTTCAAGAAGTCAGGC
CTGTTGGATTTGATATCAAACAAGGTGAAACCATTTTGAGCTCTGGTGAA
AAACTAGGTCCAGCTGAACTTGGTCTTCTAGCAATGGCTGGTGTACATAC
TGCCTGTTGGATTTGATATCAAACAAGGTGAAACCATTTTGAGCTCTGGT
GAAAAACTAGGTCCAGCTGAACTTGGTCTTCTAGCAATGGCTGGTGTACA
TACTgtATCAGTGTACACTCCACCATCCATTGGAATCATCTCAACTGGTG
ATGAGgtATCAGTGTACACTCCACCATCCATTGGAATCATCTCAACTGGT
GATGAGTTGGTGACACCAGGTTCAAAACGAAGTGAGGGGCAAATCTTCGA
TTCGAACAAAATTGCATTATTGACAGCGATACGTGAACAGGGTTTCAATG
CTGCTGACCTTGGAACCATCTCTGACGATTGGTGACACCAGGTTCAAAAC
GAAGTGAGGGGCAAATCTTCGATTCGAACAAAATTGCATTATTGACAGCG
ATACGTGAACAGGGTTTCAATGCTGCTGACCTTGGAACCATCTCTGACGA
ttattcgtTGATGAAAGAAAAACTGTTGAACGTGATTGACGATGGAACAC
ATCGAGTCATCATCTCTACCGGTGGCGTCTCCATGGGAGAAAAGttattc
gtTGATGAAAGAAAAACTGTTGAACGTGATTGACGATGGAACACATCGAG
TCATCATCTCTACCGGTGGCGTCTCCATGGGAGAAAAGGACTTAGTGAAG
AAGttccttgaaaattttggcGAAGTGAAGTTTGGAAGACTGAACATGAA
GCCAGGGACTTAGTGAAGAAGttccttgaaaattttggcGAAGTGAAGTT
TGGAAGACTGAACATGAAGCCAGGgAAACCTACCACATTTGCCACCATCA
TTCGCGGATCGAAAACTACTTATTTCTTTGCGTTGCCTGGCAACCCGGTA
TCAGCCATGGTCACCTTTTATCTCTTTGTTCTACCCGCCATTCGGAAGTT
GGCAGGCTACAGGAAGCCCCATTTACAAAGAATCCAGGCTAGAgAAACCT
ACCACATTTGCCACCATCATTCGCGGATCGAAAACTACTTATTTCTTTGC
GTTGCCTGGCAACCCGGTATCAGCCATGGTCACCTTTTATCTCTTTGTTC
TACCCGCCATTCGGAAGTTGGCAGGCTACAGGAAGCCCCATTTACAAAGA
ATCCAGGCTAGAATCGACTTTGACGCTTGTTTAGACACAAGACCCGAATA
CCATCGTTCCAAACTCAACTGGGATACAGACGATGGTGTACCCTTAGCCG
TGTCAACGGGCAGTCAATGTAGCAGTCGTTTATTGAGCATGCGCTCGTGC
CATGCCCTTCTAGAATTACCAAGCTCAGACAATACAAAACGGTTAACACG
TGGTAGCATGGTAACCGCATTGTTGCTACCCAAATTAATCacctgaATCG
ACTTTGACGCTTGTTTAGACACAAGACCCGAATACCATCGTTCCAAACTC
AACTGGGATACAGACGATGGTGTACCCTTAGCCGTGTCAACGGGCAGTCA
ATGTAGCAGTCGTTTATTGAGCATGCGCTCGTGCCATGCCCTTCTAGAAT
TACCAAGCTCAGACAATACAAAACGGTTAACACGTGGTAGCATGGTAACC
GCATTGTTGCTACCCAAATTAATCacctga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006436XLOC_006436-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000322_pilongenomesc0000322_pilon:197743..214416 +
Properties
Property NameValue
Aaloc2032-2265:16441
Aaloc1864-2031:15700
Aaloc1795-1860:15212
Aaloc1702-1794:14426
Aaloc1579-1698:14001
Aaloc1528-1578:11811
Aaloc1426-1527:11347
Aaloc1366-1422:10332
Aaloc1246-1365:9888
Aaloc1192-1245:9368
Aaloc1099-1188:8458
Aaloc961-1095:6642
Aaloc778-957:5150
Aaloc604-777:3019
Aaloc508-603:2688
Aaloc463-504:2320
Aaloc397-462:2116
Aaloc301-393:1861
Aaloc208-300:1571
Aaloc151-207:1225
Aaloc70-147:900
Aaloc1-66:1