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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000322_pilon:197743..214416+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006436 ID=XLOC_006436|Name=XLOC_006436|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16674bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:197743..214416+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTGGACATTATGTAAATCATTCTCCTCCAGGAGCGAGAGAAATAAA
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GGGTTGGTCTAATAACGGAAATTATAGCTTAGAAAATACCTGATTTTAAT
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TTGACTCAGTTGGAACGTGGATATACCATTGCTTGTCGTTATTTGTTGCT
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AATCgtgtttttaaaaatcaacTCTTATCTTATCTGATATGAGTGGAGGC
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TGTCAGTAAGGCTCTCTCCCTCGTTCTCAGTTGCATCAAAGTACCCAAGA
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CTTGTTCATTTGTAGCTTCTGACGGTGCAGGTGTGCGAACAGTACTGGAA
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TGCGTTagttcaaattttgatttaccAGCCTGGGACGAGTCTTTCGgtgg
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TACTGTGTATTTTCACTTTGTCACTTATCAGGGTCGCGTTGAAGTGAGCG
TCCGAATCAAGACCGCGCCGCGTGTACTTCAAGAAGTCAGGTATTATAAT
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ctgattttaaaatgttttagtTATTCCTCATCTTTTCATAAACAGGCCTG
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ttgaaattttgaaaatatagctTCGATCCAATCATCAACATCCCTCATCT
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TTGTATGTTATAACGGCATTTAGTTTTGCTAATCAGCAAgaattacctta
ttggaactaattttcgcgggaactaattttcgcggtcgaaaaaaaatatc
cagaaaattgcatttcgcgggttttaattttcgcggttttttccattctg
gaattttcgcgggttttaattttcgcggttttgcccttttttggacaaat
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GAAACACGAAAATCTGTGACATTCATGTAGTTAAGATCATGGGGTCAtgc
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tgaCATGAGATTAATGTCATACTCCGATCATTATAAGACCATTAATATGT
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AAAAGTTTTACAAAACCTCTCACGGAAATATAATGGGGGTGAATTAAAAG
AGAACATTTCAAACATTCTGACAATTCGTGTACTGAGTCACGCTTGAAAA
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caaaaaaatgtttaaatcaaACCACCCAAAAACTTTCGCAATAGTTTCGA
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TTTTCCCCCGACGAATATTTTATCTGACGAAAAACTTTAAGTTTTCCCCT
TTAATAAGCTACCACTCCAGGGTTTTCTACCTCGTCTTAATTTTTGCTTG
AGTCGaacattttcaatatatttcaaggAATCTGCTCGCACATAAACAAT
GCTCggaatttgttttgaattaGAAAATTCGCAGTAAGAATATTGAATTC
GTGTTCGAGAAGTTCACTTTAatatcagaaaattttgcgcTCAAAGAGTT
TAGTGACTCCGGCTGttctttaatgaaatttaatttcGTAAATGAAGCaa
aaaaaGAACGTCCCTGGCATTAATATctcttgtttttgtttatctcATAG
TTGGTGACACCAGGTTCAAAACGAAGTGAGGGGCAAATCTTCGATTCGAA
CAAAATTGCATTATTGACAGCGATACGTGAACAGGGTTTCAATGCTGCTG
ACCTTGGAACCATCTCTGACGAGTAAGTTATATGATGCGGATATTTTAAA
CCTATCTTCTTTATTCTTGAAGAATGAATctttaagaaaacttttgaatt
ctAATGGTGATATTTCAATCGGTTTGTTTCCGCGATGAATGGAGTTCTTC
GTTTATTTCTTATCTTACGCAAGACTAAATCCGACGTACCAGGCACTTGT
ATGAGTTAAGTAAAAAGTTACTCAAATCTGGATTGCTAAAACGTTAATAT
GAATAGTGACTTTCCGGAGGGCTTACTTTGGACCACGTGAATTAAAAGTT
GTTGTTCtctcttcattttttcagttattcgtTGATGAAAGAAAAACTGT
TGAACGTGATTGACGATGGAACACATCGAGTCATCATCTCTACCGGTGGC
GTCTCCATGGGAGAAAAGGTAGCCATATTCGTGCCTAGAACCTTTTAGAT
ATCTTCTCCGTCTGTAAAATTATTTGTTAAAACCCTACTTTTACGTTCTT
AAGCCTAGATTATGAGAGTGGTCCTAGAAGATGAGAGGCTTAAAAATGGG
GTTAACGCTTCCAGGAAACCTGTTCAACCTAGAACTAAGTGGACTTATAG
AATTATAGTAAATAGGcgtagtagtgtagtggtcatcgttcttgacttcc
gtgctggaggtcagggttcgattcccactcggtgctaCGATTCaattggc
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ggtaccatcactctgatacaagagtatggggagatatgccggacattgaa
tgtggtgtggtgatggtACTCATATGTTCAGTACCTGCGAGAACGCAAGT
TTCTCCCGTACTGTgcgagtatcatcatcgatacagcacggctctgatgt
gtcgcgagcacagagtacaatatctggtaagcgctgtgatttccctacct
aggggtaggaaactatcccgggatagggcccggtccgatgatatTGGAGG
GTCCGCTTCTCTCCTCTCAtttttttCGAAGTTTACTAATTTAGCGGAGG
AGCTGTCGTTGAAACAATTCAttctttgacttgaaatttattcttatttt
atctTTTACAGGACTTAGTGAAGAAGttccttgaaaattttggcGAAGTG
AAGTTTGGAAGACTGAACATGAAGCCAGGGTATGAATAAACTGCACAATC
CTCATCTCCGACTTTTTATTACTGACTAAAACTGTCCCTCTAAAATAGGt
ggattgattgattgatctcCTGTATGAATAACACCTTAGAGAAATATGGA
GCCCTGCATTAGCTAGAAAAGAACGGAAGGGAAAATGACAACCGCTTCAA
AATGTGTGATCTGGATTTTATCATCGTTAATTACAGCGttcggcgtaaaa
agggccgataaggtattcaaaaacaaagaaacaacaATATTCAATCAGTC
GTAATGATTGCTGCCCGtattataacttttttttaccCGACAAAATGGTT
TGGTAGACCTTTTCCCTATGTTATCACCaaaaaaaCTGACCcgtgaaaat
ggtaattttaTAGAGTGTCTTGAaagatttcaaacatttttatttcaggA
AACCTACCACATTTGCCACCATCATTCGCGGATCGAAAACTACTTATTTC
TTTGCGTTGCCTGGCAACCCGGTATCAGCCATGGTCACCTTTTATCTCTT
TGTTCTACCCGCCATTCGGAAGTTGGCAGGCTACAGGAAGCCCCATTTAC
AAAGAATCCAGGCTAGAGtatgttcaaaattttgttgtGTAATACGACGA
GATTGACGTTTTTAGTATTTTAGCCCAATCGAAGTACTGTCGTTTGTTAC
GGTTAGAAAGCATTCCGTGTCtgcactttttttcttatttcttctTTAGT
AGAGTGATTTTCTATTCTTAGTATacatttttatataagcaaTCAGGCTG
CTAAGGCTCGAGCCCTGAAACTAGCCAATTCGTAAATTTGCTTTTTAGAT
AATGTAAGCctggcaaacgatagcccttgacaCAATTTAGCATGAATATG
GTTgaatatcaggggtggtcaaagcaattttttagaaaaaaagagctAGA
ATATTAAGAAACCCCAGCCCTGAACCCAAAATTGGGAGTTCCTTGTAAAA
GGAATGTATAAGTGAACTTCTTGAAACCTTACTTTATCCACCTCAATGTC
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CAAGAAATCGCCCGTGGTAGAGATGGAACTGGCTCTTAACATGTAGTTTA
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CAGTCGTTTATTGAGCATGCGCTCGTGCCATGCCCTTCTAGAATTACCAA
GCTCAGACAATACAAAACGGTTAACACGTGGTAGCATGGTAACCGCATTG
TTGCTACCCAAATTAATCacctga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000322_pilon:197743..214416+ >XLOC_006436 ID=XLOC_006436|Name=XLOC_006436|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000322_pilon:197743..214416+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTGGACATTATGTAAATCATTCTCCTCCAGGAGCGAGAGAAATAAA AGTTGGTATTTTGACAGATGGCTGGACATTATGTAAATCATTCTCCTCCA GGAGCGAGAGAAATAAAAGTTGGTATTTTGACAGTGAGTGATAGATGCTC AGCTGGAACACAAGAAGACAAAAGTGGACCAAATTTGAAAGCCCTTGTAC ATAAACATCTGCAAAATGAGTGATAGATGCTCAGCTGGAACACAAGAAGA CAAAAGTGGACCAAATTTGAAAGCCCTTGTACATAAACATCTGCAAAAGC TTGGTGTAGTACAAGTCCTTTCATCATGTGTTCCTGATGAAGTCCATATT ATAAAGGCTTGGTGTAGTACAAGTCCTTTCATCATGTGTTCCTGATGAAG TCCATATTATAAAGAGTTGTTTGTTACACTGGGCAGATCAAGAGAAATGT GTGTTGATATTAACAACAGGTGGTACAGGATTCAGTGCCAGAGATGTCAC ACCAGAGAGTTGTTTGTTACACTGGGCAGATCAAGAGAAATGTGTGTTGA TATTAACAACAGGTGGTACAGGATTCAGTGCCAGAGATGTCACACCAGAG GCTACCAAAGAAGTTATTGAAAGAGAGGCACCTGGACTAGCTATCAGAAT GCTGTCCAAATCTATAGAGACCACACCAATGGCAATGTTATCACGGCTAC CAAAGAAGTTATTGAAAGAGAGGCACCTGGACTAGCTATCAGAATGCTGT CCAAATCTATAGAGACCACACCAATGGCAATGTTATCACGgCCAATATGT GGAATCAGAAAATCAACAATCATTGTGAATTTACCAGGCAGTAAAAAAGG GTCACAGgCCAATATGTGGAATCAGAAAATCAACAATCATTGTGAATTTA CCAGGCAGTAAAAAAGGGTCACAGGAATGCTTTGAGTTCATTCTACCTGC ACTTCCTCATGCTTTTGGAATGCTTTGAGTTCATTCTACCTGCACTTCCT CATGCTTTTGATTTAGTGTCAAGTAATGAAGAGAATGTCAGTCAGACTCa ttcaaaaatgcaaaaatcacCATCCCCTTTGCCTATGGATAATGAAGCCC CCACCACAATTTAGTGTCAAGTAATGAAGAGAATGTCAGTCAGACTCatt caaaaatgcaaaaatcacCATCCCCTTTGCCTATGGATAATGAAGCCCCC ACCACAgATTTTCAAAATGGGCATATGAACTCCCATGATACTGATAGGGA TAGTGGTAATTATAGCGCACATAACcatcatcatcaccatcaccatcatc atgatcaCAATTTACCGCTAGATGATTCGGCAAGTGGTATCATATGTTTA GTACCAGGATGTGATGGCTCTTCCTCTATGgATTTTCAAAATGGGCATAT GAACTCCCATGATACTGATAGGGATAGTGGTAATTATAGCGCACATAACc atcatcatcaccatcaccatcatcatgatcaCAATTTACCGCTAGATGAT TCGGCAAGTGGTATCATATGTTTAGTACCAGGATGTGATGGCTCTTCCTC TATGGGCACGCCGCCACCTCACTCCAACCGTCAAAGTATCGAAAGTCTTC AAAGTTTGCAGAGCTTACAAAGCTATGGATCATCCATTACATCGTCAGAG CCTGGAGGCTATTCAGAACCGTGTTATTCAGGCTATTCATCTTCAGAATC GGGACGACCATCTACAGGATGTCATCATAAAAAAGGGCACGCCGCCACCT CACTCCAACCGTCAAAGTATCGAAAGTCTTCAAAGTTTGCAGAGCTTACA AAGCTATGGATCATCCATTACATCGTCAGAGCCTGGAGGCTATTCAGAAC CGTGTTATTCAGGCTATTCATCTTCAGAATCGGGACGACCATCTACAGGA TGTCATCATAAAAAAGTTTACATCGATACACCACGCGTAGCAGAGCGCGA TCGCTTCTCCCCTTACCCCATGGTGTGTGTCAGTAAGGCTCTCTCCCTCG TTCTCAGTTGCATCAAAGTACCCAAGAAAAGACATCTCGTCAATTTGCAT GCAGTTTACATCGATACACCACGCGTAGCAGAGCGCGATCGCTTCTCCCC TTACCCCATGGTGTGTGTCAGTAAGGCTCTCTCCCTCGTTCTCAGTTGCA TCAAAGTACCCAAGAAAAGACATCTCGTCAATTTGCATGCAGGTCTGCTG GGCAAGATATTGATGGAAGATGTGAGAGCCAAAGAACCTTATCCTCCGTT TGCTGCTTCTGTAAAAGATGGTTACGCTGTCATTGGTCTGCTGGGCAAGA TATTGATGGAAGATGTGAGAGCCAAAGAACCTTATCCTCCGTTTGCTGCT TCTGTAAAAGATGGTTACGCTGTCATTGCTTCTGACGGTGCAGGTGTGCG AACAGTACTGGAACCCATCACTGCTGGAAAAGTGCTTCTGACGGTGCAGG TGTGCGAACAGTACTGGAACCCATCACTGCTGGAAAAGTGCCAGTGAAGA CGATACGTACAGGACAATGTAGTCGTATAAACACTGGAGCACCATTACCA CCCGGTGCTGACGCCGTCGTTATGGTGGAAGAAACTGAACTCGTTGAATC TAAACAAGATCCAGTGAAGACGATACGTACAGGACAATGTAGTCGTATAA ACACTGGAGCACCATTACCACCCGGTGCTGACGCCGTCGTTATGGTGGAA GAAACTGAACTCGTTGAATCTAAACAAGATGGTCGCGTTGAAGTGAGCGT CCGAATCAAGACCGCGCCGCGTGTACTTCAAGAAGTCAGGGTCGCGTTGA AGTGAGCGTCCGAATCAAGACCGCGCCGCGTGTACTTCAAGAAGTCAGGC CTGTTGGATTTGATATCAAACAAGGTGAAACCATTTTGAGCTCTGGTGAA AAACTAGGTCCAGCTGAACTTGGTCTTCTAGCAATGGCTGGTGTACATAC TGCCTGTTGGATTTGATATCAAACAAGGTGAAACCATTTTGAGCTCTGGT GAAAAACTAGGTCCAGCTGAACTTGGTCTTCTAGCAATGGCTGGTGTACA TACTgtATCAGTGTACACTCCACCATCCATTGGAATCATCTCAACTGGTG ATGAGgtATCAGTGTACACTCCACCATCCATTGGAATCATCTCAACTGGT GATGAGTTGGTGACACCAGGTTCAAAACGAAGTGAGGGGCAAATCTTCGA TTCGAACAAAATTGCATTATTGACAGCGATACGTGAACAGGGTTTCAATG CTGCTGACCTTGGAACCATCTCTGACGATTGGTGACACCAGGTTCAAAAC GAAGTGAGGGGCAAATCTTCGATTCGAACAAAATTGCATTATTGACAGCG ATACGTGAACAGGGTTTCAATGCTGCTGACCTTGGAACCATCTCTGACGA ttattcgtTGATGAAAGAAAAACTGTTGAACGTGATTGACGATGGAACAC ATCGAGTCATCATCTCTACCGGTGGCGTCTCCATGGGAGAAAAGttattc gtTGATGAAAGAAAAACTGTTGAACGTGATTGACGATGGAACACATCGAG TCATCATCTCTACCGGTGGCGTCTCCATGGGAGAAAAGGACTTAGTGAAG AAGttccttgaaaattttggcGAAGTGAAGTTTGGAAGACTGAACATGAA GCCAGGGACTTAGTGAAGAAGttccttgaaaattttggcGAAGTGAAGTT TGGAAGACTGAACATGAAGCCAGGgAAACCTACCACATTTGCCACCATCA TTCGCGGATCGAAAACTACTTATTTCTTTGCGTTGCCTGGCAACCCGGTA TCAGCCATGGTCACCTTTTATCTCTTTGTTCTACCCGCCATTCGGAAGTT GGCAGGCTACAGGAAGCCCCATTTACAAAGAATCCAGGCTAGAgAAACCT ACCACATTTGCCACCATCATTCGCGGATCGAAAACTACTTATTTCTTTGC GTTGCCTGGCAACCCGGTATCAGCCATGGTCACCTTTTATCTCTTTGTTC TACCCGCCATTCGGAAGTTGGCAGGCTACAGGAAGCCCCATTTACAAAGA ATCCAGGCTAGAATCGACTTTGACGCTTGTTTAGACACAAGACCCGAATA CCATCGTTCCAAACTCAACTGGGATACAGACGATGGTGTACCCTTAGCCG TGTCAACGGGCAGTCAATGTAGCAGTCGTTTATTGAGCATGCGCTCGTGC CATGCCCTTCTAGAATTACCAAGCTCAGACAATACAAAACGGTTAACACG TGGTAGCATGGTAACCGCATTGTTGCTACCCAAATTAATCacctgaATCG ACTTTGACGCTTGTTTAGACACAAGACCCGAATACCATCGTTCCAAACTC AACTGGGATACAGACGATGGTGTACCCTTAGCCGTGTCAACGGGCAGTCA ATGTAGCAGTCGTTTATTGAGCATGCGCTCGTGCCATGCCCTTCTAGAAT TACCAAGCTCAGACAATACAAAACGGTTAACACGTGGTAGCATGGTAACC GCATTGTTGCTACCCAAATTAATCacctga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000322_pilon | genome | sc0000322_pilon:197743..214416 + |
Properties
| Property Name | Value |
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| Aaloc | 1795-1860:15212 |
| Aaloc | 1702-1794:14426 |
| Aaloc | 1579-1698:14001 |
| Aaloc | 1528-1578:11811 |
| Aaloc | 1426-1527:11347 |
| Aaloc | 1366-1422:10332 |
| Aaloc | 1246-1365:9888 |
| Aaloc | 1192-1245:9368 |
| Aaloc | 1099-1188:8458 |
| Aaloc | 961-1095:6642 |
| Aaloc | 778-957:5150 |
| Aaloc | 604-777:3019 |
| Aaloc | 508-603:2688 |
| Aaloc | 463-504:2320 |
| Aaloc | 397-462:2116 |
| Aaloc | 301-393:1861 |
| Aaloc | 208-300:1571 |
| Aaloc | 151-207:1225 |
| Aaloc | 70-147:900 |
| Aaloc | 1-66:1 |
|