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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000156_pilon:454038..459019+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042742 ID=XLOC_042742|Name=XLOC_042742|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4982bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000156_pilon:454038..459019+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCATCCAAGATACAGTAGATATAACCTGAATGCAGATATCGCTCTTTT
GGAATTGAAAACACCTGCTCAATTGAACAGTCGCGTACGTCTTGCGTGCG
TACCTCAAGTTGGCGTTTATCCACCAACCGGAAAACAATGCTACCTTGCA
GGTTAGTAAAACGACGTTGACAGTCTTGAAAGGGATTAATCATTTAAGAT
AAGAACCTCCATGTCTCAAAAACTAAACGCATGCTTCAAAAGTCTTTCCT
GGGACTCCTTTGGCCAGAAGAAAGTCGTTCAGAATAAGAAATTCCCCTCT
CATACATGCGCAATACCTCAAGCTTTTACTCTATCAACAAGTGTTTTCCA
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GTTCTTTTATGACGGAACAGGAGcggaaatttgagaaataagaaatttac
cattgaataattttaaaggTTGGGGAACGACAACCCACCCAGGGATTTCA
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TACACCTTTACTAAGGGCTAATCTGAAATtaagaaaatgaagatattcCC
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atttggaaaaagcttttactttagaTAGTGTATATAGTGTagatctttta
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gaagtataaagGCCCCATTACACCTAAGAATAAGGGGGAAGAATATATCT
CTGCAGCTGTTACGATTCGTAAATTCTTGTTCTAGATACacgtaaaaata
ttcaaaaatggaaaatctcagagtttttccaaatttgccatctgttaatt
tttgtaaattctgcCGTAAAATTACACGAAagaatgtaaaaattttatca
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ttcccttttttcgaaAcccccccAACTTTCGAGAGGGAAAATCCTTTGTA
AAGTTTGTTTGCACAGTCTACACAATAGCCAAAATTCCACACTAATCCCC
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TTGGACACCTCCAAAGGaatagaaaattatgaaattaattaaacaataga
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CAACTGATTACACAggagaatttaataaaattgcTCACAAGTGTCAGGTG
TGCAGTAAATTTCACATTATTCTTCCTTTATATTCTTAGGTGTAATGGGG
CCTTAACATTTTATTAAAGGAATGGTTCggtaaaaaattcatttttttat
attatctGTCCTATCGGATTCTCCTTTTAAAAAGACACACATAGATATAA
ACTTTTAAACTAATTGATTATTCGTTTCCTTTAAAACGCCACTCACTTTT
GTATGCCTTTTAAACAAGACCTTTTGCTTACGTCACAGAGGCTGTTAAAA
GCTGTAGCTGTGTTTACTGAAGTGAATTAAGGCCCCATTACACCTAAGAA
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aattttattaaattctccTGTGTAATCAGTTGAAAGAATAGTATAAAGAA
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tcataattttctattCCTTTGGAGGTGTCCAAAGGAATGGAAAATTATGA
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TTGGCTATTGTGTAGACTGTGCAAACAAACTTTACAAAGGATTTTCCCTC
TCGAAAGTTgggggggTttcgaaaaaagggaaaaatatcGAATTAAAGAA
CTTCCGTTTTGCCTTTTGCAATAAAATTAatctgataaaatttttacatt
ctTTCGTGTAATTTTACGgcagaatttacaaaaattaacagatggcaaat
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TTGTActataatatttttgaatactttGGTAAATGTATTCTGACTCGAAA
AGCGATATATTCAAGCTAAGAAGAATATGATATCAATGGAAATAAAGCAG
ATTCTGAGTgagagagagagaATGGAGTAAGCAAGAGAGATATGGACCCC
TCATTAACAAGCTGAAGATATTTAATCCCTGTCTCTATGAGCCTGAACGA
GAATTATTGAGTACAAGCGAGAGTGACACTTCTTCATCCGAAGACAAAGG
TGACTATGAAACTTGTTCTAAAGGTAGAAGTGGGAGTTTAGATTGGTGCG
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aaatttgatcagGGAGATTTTCAGTGTATTATTGATAGGCAACAATTCCC
AAAAATGTGCCTTGATGAGGACATTTTGAGGAGAATGTGCTGACTGGCCT
TCACGAGACAAAAGGAGATCATTTGGAAGAGATACCGTCGAATAGATCCC
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TTGAGAAAAAACAATCGCTGAGTTCTCCTATCATGACATCATGTGTGCTT
TCAAAGACGCGAAGTACGTCGTGCAGTGACCCTGAAGGATAAAGGAAGGT
GaaaaaaaaCTAGGGCGAATCAtttttttGATTGATGGGTCTGTCAATTC
ATTCGTTAGTGCAGTGCATTAATAAGTTCATTTTCCAGTTTGCATTGgat
tacacgttgttttttttattagaacccagtttgtaagaacatttaggctg
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TCGAATAGTTTGGCGAAATTCGCttaaaaatctttagatttcttAAGGAA
TTTTGTGCAATTATTACCGTAATTATTCCTCTCATCTAAAAATAATAGCA
AATTTACTCGATTTTTAACCCAATATCGACATTCAAAGgttttattagat
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aataaaaaaaaaacgtgtaacatcCCAAGTTTCCGTATCATCGATTCCGT
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GATGTTGGATGGGTCCTTCAGGGACCTGACACGTTTAGCCTTTTATTGTG
CCCTCCTTTCATTCGACTTTCTTTTAGTTGGTTGTTTGTCTTTAATCGAA
CAAGTTTGGGATAGCGTCTTCCTTCAGTAGTCTATGCGATGAAAGTCCTA
GGATGAGTTTGtgctaaaaaaaaacaacttttggtgttttttttttcgct
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TATAAAGATACTTTCACTCTTTGGCACGTGAGTTGTTAGTACAGTTCACT
GCTCCAAGGCATggtgacacccccttctcacacgATGGGATTTTTCaacc
agtggggatggaaaaataacTGACTTAAACTCGAtgaggattgatatttc
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tggtttatttgattatctcAAAGAATTCTTTATGATTATCTTCAGTGTGG
ACAAAAATTGAGAGatgattttccactggggacgatattctGGCCAATTT
taccagtgggaaggggtcccaatgggtctgtgagaagggggtgtatggTG
GGAAGAAAAGTAAATACATACATCAACTTCACTTGGAAAACAGTCCAAAC
TAACTATAAAATTGAGATAAAACTAACTCAATCTCGTATGAAAAATGTAC
ACTTTTgcgtttctcttttttctcaattttctctGAACAGCCTCCGTGAC
GTCACATAcacaaaattgctttttaaaaaggggctttctgtaaacaaaag
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CTGATTCattaaaaccaataaaattaaaaaatgaggAGTCAAAtttttac
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TAACCATTGATTGTTTGGACGCTTCAGTTAAATGTTTGCTTTATTTTCCA
CCAGGTTCTGATGGTCGATGGGTGTTGGATGGAGTTGCAAGTTATGTGTA
CACTTATTGTAAATATTACACAGCGTATACACCCTTCAACAAATATTTAC
CGTGGGTTAGACAATACGTCAGTGGTGTTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000156_pilon:454038..459019+ >XLOC_042742 ID=XLOC_042742|Name=XLOC_042742|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=948bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000156_pilon:454038..459019+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCATCCAAGATACAGTAGATATAACCTGAATGCAGATATCGCTCTTTT
GGAATTGAAAACACCTGCTCAATTGAACAGTCGCGTACGTCTTGCGTGCG
TACCTCAAGTTGGCGTTTATCCACCAACCGGAAAACAATGCTACCTTGCA
GATGCATCCAAGATACAGTAGATATAACCTGAATGCAGATATCGCTCTTT
TGGAATTGAAAACACCTGCTCAATTGAACAGTCGCGTACGTCTTGCGTGC
GTACCTCAAGTTGGCGTTTATCCACCAACCGGAAAACAATGCTACCTTGC
AGgTTGGGGAACGACAACCCACCCAGGGATTTCACCAGCCATTCTCCAAC
AAACGCGACTACCAGTTGTTCCAAGCCAAAAATGTCTAAACAGTCAAGAA
CATGTCTGTGTTGGAAACGGATTCGATCCACGTCCGGATGGTTCCCAACA
ACCAAATGCTTGCCGTGGAGATTCTGGTGGTCCGTTAGTCTGCCAAGgTT
GGGGAACGACAACCCACCCAGGGATTTCACCAGCCATTCTCCAACAAACG
CGACTACCAGTTGTTCCAAGCCAAAAATGTCTAAACAGTCAAGAACATGT
CTGTGTTGGAAACGGATTCGATCCACGTCCGGATGGTTCCCAACAACCAA
ATGCTTGCCGTGGAGATTCTGGTGGTCCGTTAGTCTGCCAAGGTTCTGAT
GGTCGATGGGTGTTGGATGGAGTTGCAAGTTATGTGTACACTTATTGTAA
ATATTACACAGCGTATACACCCTTCAACAAATATTTACCGTGGGTTAGAC
AATACGTCAGTGGTGTTTAGGTTCTGATGGTCGATGGGTGTTGGATGGAG
TTGCAAGTTATGTGTACACTTATTGTAAATATTACACAGCGTATACACCC
TTCAACAAATATTTACCGTGGGTTAGACAATACGTCAGTGGTGTTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000156_pilon | genome | sc0000156_pilon:454038..459019 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 349-474:4857 |
| Aaloc | 154-345:471 |
| Aaloc | 1-150:1 |
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