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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000393_pilon:178831..187607+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045636 ID=XLOC_045636|Name=XLOC_045636|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8777bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000393_pilon:178831..187607+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACAAAAGGTCCAAAATGGAAGGACGACCCCAAGATTTTGCAATACAC
AtgaaacgtcatcaaaaattgcaAGAAGTCTTGCGGCAGGTGGAAGGGTA
AGTTTAAATTCATACCGGACTTTAATCGGAATAATTGCATATCGTGAGCA
AAAAAGAACCGCAAAAATTGTGATTCATTTTACggatcagaatttgaaaa
aatttaattgcttttaattGTTTAATTGCATTTTTATGCTGCTCAATCGA
AACTCCTAAATCTTCCGATAAgtgcacttttttcttttacctataacttt
tgaaggaattctttatCTTATGAATTTGGTTCATTGGAAAGTTATTATTA
GGAGTGGAacgatttgaaataaaaaatcttttaaataacttctaaaatga
agattgaaaatgagaagAaaaaaatgaagatcttgtagaaaagtgcaata
actatcattttcacagaagtgaatccttaatcatcgaacgtcatcactgt
gaaaaagattctcaaaaataatcattcagtcaaaagatatcaaacaaagg
ttgcatcaaggatttattatacactggatatacaagtaacagatttttgc
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TTCCCTCTTAAATGCTTTTTCGAAGCTTTTTATTGCTTCTATcgaaaaat
cactcatccaactCCCAAAAAGACTTAAACTTTCCTTGGAGTCAGATTTC
CACTTAATGCTAATTACAAGTCGTTATGCGTTTCAAGCTGTTTAAAGATG
CAAACGgttgtgtataaaatttatGTTGACCGGGGAAAGTTTCACTTAAC
CtcaaaaaaccaccttgcccaGTTGCCTCCCAAGGATTTTCAACCACagg
gagccaagacactcagtCTATGTATATTTTCGTCTTCTGGGGCCagcttg
gaaagatatttccaattgaaaatttcgtgtcattataagcattttgtctg
aatttctggTTTATGTtgttttctcacattagattttaCAGATGTATCCT
GCTTGGTATGCTAGCcctactttcaaacttttttatgcaaatgtacaaaa
gaaagactagagaactttttaaaataagactgataacattttttaaatag
acATTCTCCGAGCCGCCCATGacAgttgtcctttgcggacaaagctagaa
catcaattgttttctgaaacaatgaaaatacaatgatcgctctccaccgt
tttatgagtcgtttatccagtgtataataaatctttggttgCATACCTTT
TAATGTTCAAAACCAACAAACTCAAACCGTTTCACTAAACTgcaaatggt
ttgggtttgttTACCTAGACAAAGAAGCTATTGCATTGCTAATTCGATTT
CTAGGATCTTACAGTTCTCCGcttaccattttgaatttgaatgccTGAAG
TCACAGCaaccaatttcaaaatggtagcctagCTGAAGAAAACATTAAAG
CTTAGGCCTTATGCATGCGTGCGCTTAGTGAACTAGTGTGAACAAGGTGT
AGTGCTTGGTTACAAAAATGGTGTTTAgcaaaactaaaaatcaaatgGTG
CAGTTTGTTGGCTAAACCCTCGGTTTAGCGAACgaagaaaacacagaaaa
aagacTGTTGGCTTTGATCGTCTGTTTAGGTAAACTTTTAGATGAATCAA
TGCGTTCGCTAAAccctctgtttcacttttttgggtttttggctaAATGG
TATGCACCCAAAgatataagctgattgacgtctaaaaatgctgttttctg
ctgttttctgctgtttttggggtcaatcacttattaactttgtatcgtaa
ctttatattgaaaataaatatttttagtgaaattttttcacagtgatgac
ctcctaagatcacagaatctctccagtgaaaatgaaagttattatccata
tagcggtcattaagtaagccattaaagattcgaacggcgggcggtattga
aaggttctatgactcaaatagtcatacccgcgctgaggaaACAAGGGTGT
CGtccttcagagggctgaaatatcattaaccgccctggttatagggcgat
aacgtcatttgcggcccgctcggaactttattgaagtcgttgcattgaag
cgatgagactaaaccgacgtcagaaaaaaacactttttggtcatttgcgg
cccgctcgcaagggtactcaaaacttgttgaagtcattgcattgaagcga
aaagacttggctgacgctagaaaaaaacgtgtgtGTGGATTTaacagaaa
ataacaacaacgacctcaaactgaacgctattgttatattatagcacttt
tctacaagatcttcatttttttcttcttcattttcatctttatttttgta
atttttttaatttgttgaaGCAATGCTTTCATCCATCAAAAGAGTGCTTA
ACCAACCGAAGTTAGAAGCGTTATATCGTAGTTAAAGTATAtaatgaaaa
tcattttttcaatactggcagtttcatttttttacaaacaatcctcagtt
gaaaataaattttttaaaaactagagttccgttgctcttacaaaaaaata
acactGCAGGGTCTTCGAAAGAAATTGACGTCATTTTAGTCCTTGGTGTC
GTGAACTTTTAAAATGAACTTGTTCACGTGACGGCATTTTGAAATCAGTT
CATTCCTGGAATAATGACCCCCAAGAATGTACTCCCCCCGTACAACCAGA
ACGTTGAAACGAAAGTTGCACGAAGGTTTCTGAAACTCATAGATAAGTAC
TTTCCAAAACACCACATGCTCAACAAAATATTCAACCGCAACACTGTCAA
AGTCAGCTATAGTTGcaccaaaaacatgaaaaatatcataCAGAGTCACA
ATAAAAACATCCTGGAAGACGAAGCAAACGAGAACGTAGACAACCGAATG
TGTAACTGCAGGGTAAAAGCCAACTGTCCCCTGAACAGATCGTGTTTAGT
TGAGCGATCAGTATACCAAGCCACATGCGAGGAAGAACCAGATTACGACG
AGAAGTTTTACATCGGACTTGCCGAACCTGCTTTCAAAAAACGTTTTGCA
AACCACCGCTACGAAAAAGAGACGGAATTGTCAAAAGAAGTTTGGAGGTT
AAAACGAAAAAACCTATCGCCAAAAATCGCATGGAAAACCATCCGACAGT
GCCCACCGTTCAACCGTTCGTCGCTGAAATGCTCACTTTGTCTCGCGGAG
AAACTTGAAATCGCTACATTTCCGAACCCTGACAAGCTTTTGAATTCCAG
GAATGAACTGATTTCGAAATGCCGTCACGTGAACAAGTTCActttaatag
ttcacgacacaaggactaaaatgacgtcaatttttgacgaagaccctgca
atgttatttttttgtgagagcaacggaactctagtttttaaaaaatataa
ttttttaaagatttttttatttcaaattgtcccactcactaatatcttac
caatgataccaaatttataaagattaaagaattccttcaaaagttattat
AGATAAAAGACAAAAGAGTGCACtaatcgtgaatagactttagtcccggg
ggggggggggtactacccttgtcgaccgacgggggtgctccgctgaggtt
cgaaaaatggaccctacgtgggactcgaaatttgcgaaaaaagtgaccct
gaatgggactgaaattccaaaattttctcaaattttctactttttcacca
aatcttccaaaaataggcaccctacgagggagtgatttttctattttggt
gtttttgcgacgctacctgggactcatggaggttaaaaaaggtaccctga
tcagcggagcatccccgtaacccattttgccctagtaccccccccccccc
gggaCtttagTTATGTTTTGTTAATTTCTCTCCGAAAGTATTTCATTCTT
TTAAAAtccttttcgaatgttttttttgttcgaaaacTTCCTTACAACAT
TTTCCTACACTGTTTCATTTAATTAAAGCTACCTGCGCTGACAAAAACGT
AAAGTGTCCTAAATGGAAGGACGACCAAAGAGATTTGTGTAATACACATG
AATACGTCATCCAAAATTGCAAGAAGTCTTGTGGCAGATGTGGAGGCTCA
GGTATGTTGTTAAAGTTAACAAAGGAGGAGGGGAGTAACTAGATAACAAA
TACTTTAAAGCATTTTTACAAGATGTGATAATTTGAAATCCTGTTGTTTT
TGACATATGTGTTCtaaatataaattaaatttcttgGCTTTCAAATTAAG
GATCTTGCgaaatttgaagttttgcacttctttttttctttgacattttt
tgacttatttttCAACTCTAACATTATTCTAAACCGCTGAAAAGATAATC
AAAaaagcattttaattttttaggcaAATAACTTCAAAGATTGGACTTTT
TATCCTCTAATTCCAGGAACCTTATTTTTGCTAAACTGGTACTCTTAAGC
CTCTGGATATCAGCTATAAAGCCTTTAGAAGCAATTTCATCTGAGTGAAa
gacttttttgttgttgctatGTTTGCATCTACGGGCCACATTCTAAATAA
GAACGTAACTTCCGATGCAATAAGTTTATGTTATCTAGCTGAAATCTAGC
TGAAATCAGGAggctttacacgtttttttttttttaagaaacacactttt
aagaaacatgaggctcagaatgcctaaaaactaagaaacatctaagaaac
atgctgaggctgagaatgagaaaatgacatttttaaaacggtttttttag
aaccttccaatctttgcatgaaaagtaggctgattatgtcaaaaaagttt
agaaacatgtaaaaaacatttaaggctcaaaaggccgatttcttaagaaa
cattgagactgcttggtaaaactagtttcttaaaaaaaacgtgtataata
cGTCTGTttagcaaaaattagttcctagCGTCGAAGGATAAAAACCTAtt
ttttttcgtcttcaactttcattttcgaacatttttgaaatctttttgac
aGTCTATGCTTCTTAAACTGCTTTTTCATATAACTTAAGCTACCTGCGCT
GACAAAAACGCAAAATGTCCTAAATGGAAGGACGACCGAAGAGATTTGTG
TAATACACATGAATACGTCATCCAAAATTGCAAGAAGTCTTgtggcagat
gtggaggctctggtggtggttcaggcggaggctctggtggtggtggtggt
tcAGGCGGATCCACCGGTGGATCGGAAGGAAAATGTGGCGTTTCACGGGC
GGCCCAAAGTCGAATTGTTGGAGGGACCACAGCCAGAGCTGGTGCTTGGC
CGTGGCAAGTTTCTTTGCAAATTTATAACCAGCACTTTTGCGGCGGAAGT
ATTTTGACATCAACCTGGGTAAGTATCTTATCCGGACAAGTATTTTGAAA
TATCTCAGATATGATTCTAAATATAAGTTTTTTAGTTTCTAgccaaattt
taaatctttttgttcctatgaaaattttctataccttaaaggaagaaatt
ttagcaggaatttaatttggcggatggccggaaaagttttttagagggaa
tttaatttggcggacggacgcaaaaactaaatttgccgggaatttaattt
ggcgtttgctgaaaaatttatccttaaaatggtgtaaaaacggtaaaaat
aatgcaaaaacactttaaaaaaatttaatttggcgggaatttaatttggc
ggattctggccgaatccgccaaatctgccaaattttctttccgccaaaat
ttcttcctttaagtaGCATTTTCTTTGTATGTAATTTgatatatttcgat
ttgggaggagTTTAGTTTCTTTCAGTCTATATTCTCTGCCTTATTGGTAC
CAATATTTGAGCTTTTGAATCCTGAAATCGTACGAGTAAGTTGATTATTT
CTGACTATAATCGAAACCGACAAATAGAGCATAACAGTAAAGATGTAGAC
CATTTCATTCTCAGATTTTGACTGCGGCACATTGCGTCGATGACAAGACA
GAACGACCAAATCAAGTCTACGTTATCGCTGGTgctcaaaacataaaaat
taccGAATCAAGTCAACAGAGGATAAGAGCAAGGAGAATTATAATGCATC
CATCGTTTCGCAGGGATGAAAATAACACACCTATTAGCGATATCGCCCTT
ATCCAACTTTCATCAAAACTGAACATGAATGATCGCGTCGTAAGAGCATG
TTTACCGCAACAAGGAGTCTACCCAACAATTGGAAAAAGGTGTTACATCA
CAGGTAAGACGTTTTCAATTCTTGAATAATCATACTTACTGATAAATATG
TTCTTAATCATTTATTGACCCAGCGGCGCGCGCAATGGGCCTTTGAAACA
CAACTGGTCGAAAATATTTGACTTTGTCGGGCTCAAACCCTGGTCGGGGC
CTATGCGTGCGCAATTATGAATCGACGATTTCAGGCTAAAATCGAACTAC
CTGACTTTCTATTGTGTGCATGTGTGAGAAGTAATTAATACCTCCAACTT
atatggtcaaatctttctttcttaacTAGTAACAAAagtttaaaataatt
aaatctTTATTACTCGCCCGACTCGAGtctatacattgaaaaaaaatcgc
tCCTGTTGTAAGGCGATTCTGCAGCGGAAAAATATGCCAACAGTGCCAAC
ACTGCTGGGCCTATACGCCGCTTAGGATTTCTTCTGTACATTCAAATGGt
cattcttaaattttatttcaaacaatGTTTCAACCTCCTTAGGTTGCATA
CCTTTTAATactcaaaaccaaaaaaactcaaaccgtTTCGCTAAACTgca
aatggtttgggtttgcTTACAGTTGaaaattacgcatgcgcagTATTATG
AAATAGAATTGCGAGAAAGGTCCTTACTCCCTGTGAGTCACACCACTgac
ctggaccaagcaatatctcccatctttgattggagtttttttggaattgg
tacccgaggagaagccattgcaatgttaaaaattaacgtctagtgctgct
acatcatcaaaagaattcgaggaaaagtagacctagcgctctcgatgcat
ttacaccgctatcgagtagtgccgccattagggtaccaattttcaaaaaa
ctccgatcaaagattttgcttggctgggattgagaagcttggtccaggtt
atataaaggtcagtgatggTCAAAATGGTAGCATAGctgaaaaaaacatt
aaagcTTAGGGCTGCGTAAACAAGGTGTAGTACTTGGTCAGAATAATGgt
ttagcaaaacaaaaaattgaatggTGCCGcgtccaatgaagtataagccc
gaagggctagaagtcaatctccattggtaggatttgaagccaacaaatcc
taccaaagttacgcggccttgagcggctcccCTGggttttacacaaatga
cagattgaaactaaaatttaccgctaaatttcgaaaaaaatatcaatcgt
aaacaaaggaattgctagattcaatctgtcgtcaaaaatgcggcgcattt
ttcaaggcttcactttttcttgcctgagaaaggttagagattgaacttta
GCCCTTCGGGTCTTAAACTCAATGGCCGCGTCTCTGTTGGCTAAACCCTC
GGTTTAGCGAACGAAGAAAACACATAAAAAAGACTGTTGACTTTGAAAGT
CTGTTTAGGCaaacttttaaatgaatcaatgCGTTCGCTAAACTCTCTGT
TTCACtattttgggtttttggctaAAACCCTTAGTAGAGGTCTTCATTAG
GTTTACAAACGTTCAGTTGAGATCGGTGTTTTGACGTCATATGACATCAA
TGCAATGACCTCAATCTGATGTGCGAGAGCATTGGTTTCCAGAACCCAGA
CGTCACATACTGACCATAGTCTAAATTTAGACCATGTTTACTATGTGGCA
CCGTCTCACGGAACTGGATCTCCAATGCTTCTTGCGCCTTcctatcaaat
ttattttcctctcTTTTTAAAGGGGTTTAAGATTAGACGTTTTATACAGT
AAGGTttccataacttgaacacgcACGAAGAGTTAAAATCTgtttgaaat
attaaaaattgggttaaagaaaatttcttgtAAGGCGCATCATTAACTGA
CGATGACTGCGTTGAAGTTAATGAAACGTTCAAattattagcctatttca
taggatttgtgttttttgtacatgatatttttctacgtcactgAGGTAAC
TAACCTTTTGTGGCTGAGCACTCTTTTGCTGATTGAGATTAAaggtttta
caaaaagaaaaaacaatggaaaaggAGTTTCTTCTCCATCCCCTTTGGCA
AGGAAATATCTCTTTGGTAAAATTATTACCAGTGTCCTTAAATGTATTAC
CATTCATTTACAAAAAGGTAGAAGATTATTCAGGGTTACATAAAGAACGC
TGATTGAATCataaactctttttttctttaggCTGGGGTGATCTGTCTTT
CGAAGGTTCAAGTCCTGCTCGATTACAACAAGCTAAATTGCCGGTGATCA
GATCAGATGGTGAAACTGTGGATGTTGGATATAATAGCCCAAGAGAAGGT
GTATCCAATGCATGCCAAGGTGATTCTGGTGGTCCCCTGAGTTGTCAACG
TGATGATGGTACATGGCAAGTTGAAGGTGCTGCAAGCTATGTTCTAAATA
GATGTCAATACCTTAGTGCGTATGCGCCACTCAATAAATATTTGAGTTGG
GTCAAAAGATATGTGCCTGGCTTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000393_pilon:178831..187607+ >XLOC_045636 ID=XLOC_045636|Name=XLOC_045636|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2268bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000393_pilon:178831..187607+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACAAAAGGTCCAAAATGGAAGGACGACCCCAAGATTTTGCAATACAC
AtgaaacgtcatcaaaaattgcaAGAAGTCTTGCGGCAGGTGGAAGGAAA
ACAAAAGGTCCAAAATGGAAGGACGACCCCAAGATTTTGCAATACACAtg
aaacgtcatcaaaaattgcaAGAAGTCTTGCGGCAGGTGGAAGGCTACCT
GCGCTGACAAAAACGTAAAGTGTCCTAAATGGAAGGACGACCAAAGAGAT
TTGTGTAATACACATGAATACGTCATCCAAAATTGCAAGAAGTCTTGTGG
CAGATGTGGAGGCTCAGCTACCTGCGCTGACAAAAACGTAAAGTGTCCTA
AATGGAAGGACGACCAAAGAGATTTGTGTAATACACATGAATACGTCATC
CAAAATTGCAAGAAGTCTTGTGGCAGATGTGGAGGCTCAGCTACCTGCGC
TGACAAAAACGCAAAATGTCCTAAATGGAAGGACGACCGAAGAGATTTGT
GTAATACACATGAATACGTCATCCAAAATTGCAAGAAGTCTTgtggcaga
tgtggaggctctggtggtggttcaggcggaggctctggtggtggtggtgg
ttcAGGCGGATCCACCGGTGGATCGGAAGGAAAATGTGGCGTTTCACGGG
CGGCCCAAAGTCGAATTGTTGGAGGGACCACAGCCAGAGCTGGTGCTTGG
CCGTGGCAAGTTTCTTTGCAAATTTATAACCAGCACTTTTGCGGCGGAAG
TATTTTGACATCAACCTGGCTACCTGCGCTGACAAAAACGCAAAATGTCC
TAAATGGAAGGACGACCGAAGAGATTTGTGTAATACACATGAATACGTCA
TCCAAAATTGCAAGAAGTCTTgtggcagatgtggaggctctggtggtggt
tcaggcggaggctctggtggtggtggtggttcAGGCGGATCCACCGGTGG
ATCGGAAGGAAAATGTGGCGTTTCACGGGCGGCCCAAAGTCGAATTGTTG
GAGGGACCACAGCCAGAGCTGGTGCTTGGCCGTGGCAAGTTTCTTTGCAA
ATTTATAACCAGCACTTTTGCGGCGGAAGTATTTTGACATCAACCTGGAT
TTTGACTGCGGCACATTGCGTCGATGACAAGACAGAACGACCAAATCAAG
TCTACGTTATCGCTGGTgctcaaaacataaaaattaccGAATCAAGTCAA
CAGAGGATAAGAGCAAGGAGAATTATAATGCATCCATCGTTTCGCAGGGA
TGAAAATAACACACCTATTAGCGATATCGCCCTTATCCAACTTTCATCAA
AACTGAACATGAATGATCGCGTCGTAAGAGCATGTTTACCGCAACAAGGA
GTCTACCCAACAATTGGAAAAAGGTGTTACATCACAGATTTTGACTGCGG
CACATTGCGTCGATGACAAGACAGAACGACCAAATCAAGTCTACGTTATC
GCTGGTgctcaaaacataaaaattaccGAATCAAGTCAACAGAGGATAAG
AGCAAGGAGAATTATAATGCATCCATCGTTTCGCAGGGATGAAAATAACA
CACCTATTAGCGATATCGCCCTTATCCAACTTTCATCAAAACTGAACATG
AATGATCGCGTCGTAAGAGCATGTTTACCGCAACAAGGAGTCTACCCAAC
AATTGGAAAAAGGTGTTACATCACAGgCTGGGGTGATCTGTCTTTCGAAG
GTTCAAGTCCTGCTCGATTACAACAAGCTAAATTGCCGGTGATCAGATCA
GATGGTGAAACTGTGGATGTTGGATATAATAGCCCAAGAGAAGGTGTATC
CAATGCATGCCAAGGTGATTCTGGTGGTCCCCTGAGTTGTCAACGTGATG
ATGGTACATGGCAAGTTGAAGGTGCTGCAAGCTATGTTCTAAATAGATGT
CAATACCTTAGTGCGTATGCGCCACTCAATAAATATTTGAGTTGGGTCAA
AAGATATGTGCCTGGCTTGTAAgCTGGGGTGATCTGTCTTTCGAAGGTTC
AAGTCCTGCTCGATTACAACAAGCTAAATTGCCGGTGATCAGATCAGATG
GTGAAACTGTGGATGTTGGATATAATAGCCCAAGAGAAGGTGTATCCAAT
GCATGCCAAGGTGATTCTGGTGGTCCCCTGAGTTGTCAACGTGATGATGG
TACATGGCAAGTTGAAGGTGCTGCAAGCTATGTTCTAAATAGATGTCAAT
ACCTTAGTGCGTATGCGCCACTCAATAAATATTTGAGTTGGGTCAAAAGA
TATGTGCCTGGCTTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000393_pilon | genome | sc0000393_pilon:178831..187607 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 907-1200:8484 |
| Aaloc | 616-903:6015 |
| Aaloc | 289-615:5092 |
| Aaloc | 166-285:4031 |
| Aaloc | 124-162:58 |
| Aaloc | 64-120:1 |
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