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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000029_pilon:17374..26571+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038515 ID=XLOC_038515|Name=XLOC_038515|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9198bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000029_pilon:17374..26571+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATTTTCTTGGTCGGATGTTGGGAAAGGTAAGTTAAAGAATCCCGATTCC
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aacctttttttttcttgcTAGGAATTTATTCGAGTTGAAGAATTATAGTG
GAGATGCGGACGACCTCAGTTTAAATTTCGCTatcatcaaaaatcaatat
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aacgttcatctaacgttcacaacgtccatataacgttagatgaacgttga
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TGTCTCAACTACAGTATGTTAGACCCAATCCCATCCCGGTAAACACGAAG
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TCTGACTTGGTTGAAACACGTGACGTTGCTTTTTGCTTCAAAGcgaaact
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TGATATTTGTTTGTAGGTGGTAGAGCTGAAACCAGGCGGAAAAGATATAT
GCGTGGATAATTCAAATAAAATAGAATACATTCATCTTATGGCTGACTAC
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TAGTTGACCAGAGGCAAAcctaggcaaaaatgggtgctggatATGTGCGG
TCGGCGGTAAGggttggtctctctaagggtcggaaaattcatgattttta
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AGGTCTAgttcgcacatacccctcatctacaaaccctagtaccccccccc
ctggaccaGAACAATTCTTTTTCGGGGAAAACTTCCTCGCTTGCACCTCT
TTTCCCCCAGGTTTATGATGATTCTCTCAATGTAGCCTTTAAACGGGCCC
CaccttttggtaatttttctATATTATTCTAACCCCcacggaccttatta
ggacccacccttttattaattttcgaaaatattttcagctgtcaattGTT
GTTTTTCACCTGAGAGTACATTGACAAACTCTATGAAAGGAAACTCTATA
AAAGGCATGAAATTGCCAAAAGTCACGTCTTAGAATTCGACTGTTGAAAA
AGCAACCCTTTCCTGAGTTGATTTGTTTAAATGTATTAGGTCGTAAAAGC
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GTGTTTTTTAAAACCATTAAAGTGCAATGATTATCCATTGAGATGACTAC
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ATATTTTTACATacgtgttcccgtttcatatcggacacatatttcatatc
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TATTAGTGTGGGACGATCACAAATATGTTGCTTAAAATCACAAAGTGGCA
TAATTGTTATGTTAAAGGCTTGGACATCCTAGGTACTTGTGGAATCGAAT
TCGAccacaatagacgatatcgcgtttagataaatgcaatgcattctggt
atctcggggactctcaaaggaattataatgtcgattatataatgatctgg
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tttatctaaacgcgatatcgtctattagcaAACATCTATTTTACGCTCTT
GTGTAGCAgggggggagtaaaatctcagacataatgacgtttgcTACGGT
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gggtggtatatatgtgttaaatgttgaaaagattttactacctgggtagt
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ATTTACTGTTTCTAAACTTCTTCCCTTTCAGATTTTGATATCAGGTGCAC
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AAGTGATTGATaattaattcaaaaagtttCAGAATCATGCGACATGTTTC
AGGCATTGAGTCTCAAGCCCGAAGTGCTAGAGgtgagactcctggatggg
aaatgaaaccacttatttcccatccagaacgcccgcgcgtagtttttaca
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TTAAGTCTCTCTCTAAAGGGCTGGTAAATTAAATTTCATGAAAAGatttg
taaaaagattcgaattatgaaaatcattctaaaatgaTTGTTTACCGaaa
aaaaaGATAATGACAACCAAATCGTTGCATtcgatttttcctttttttca
ttcTCTTCAAAGATCACGTCTTAGAAtcttagatttttgaaaaaaaagaa
accctTCACTAAGTTGATTTGCGTTAAATCTATTAGGTCGTAAAAACAAA
CAGGTGTGAATAACGTTATACTTGACCTCGTTACtgagtgtttttgaaaa
aaaatacacgtttatttataagaactttaagTTATAAGCCTAATAATGTT
Ctaaaatatctttattttttaactattttgtgagtatatttttgtaattt
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TTCCTAtatcttgtttttaatattttggccatcaaagcgtTTTGttcttc
tcataaaaaaacgtgtaattaatCCAATAAGAAAGCTGTATTTTCCGCAT
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ATTCATACATCAAAGACTTTTGGGCCATCATTGAAACATTAACGGATAAA
CAAAAACAGCAGTTCTTGAAATTCGTCACCAGTTGTTCCAGACCTCCTCT
ACTCGGTTTTTCGGTGAGTAAATCATtggaatttcttttatttttactaA
TAAATGGCATTGAAACGTAATTTGATTATCAGACAGATAGCTTTGTAGAA
ATTCAAATAACTACATAAGAGCAAAACTATGCCGTTTCTCAACGGTTCAA
CTTTATTGTCCACTGAAGAAAAACCTTATCAGTGCTATAATGCAGTTTTT
ATTTTGGTGCAATAGCATACCGtggtgaatctaaaaatagacatcgaTTT
TTCCGTTTGACAAAAATTCTATCCCATCACACTTTGCGTTTATTACGCTT
ACACGCAAATTACACTcgattacaaagaaaaagtaataacattCACGACT
TTTGatttaagacgaaaaggattgtgggattaaatttcggtcaaatgata
GAAGTAACAATCACGACGTTTGCATAACGAAGCGCTATTTACCCAACAAA
ATCATCctttttcaagtgttttgaggCGAATTTTATTGTCTTTGCTACTG
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ATTTAGCGTAGTCAAGAGAGAAAGCAGATTTTGTTTCCCTCCCCCTGACC
CTCCCGGTAATGCTATTGAAGACAAGATAAGCGCAATTAACAATGAAAAC
CGTTGATTGTTTCATGGCAACTGAAATTGCCCATTTTTTAGATATAATTT
ATAATTGGTTTTTCTTACGGCACCGCCAATCCTTTCACTTTATTCTCGAC
TACAATCCATTTCTCATAATGGATTCATATTTCTGTTTGAAGGcacagaa
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gacccgtcctgtatacatcagattataaaaaaatacaggacggttctcct
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ttttttgcGAAAAGAAAATGATATTTGCTTTGAAACATGATTCTTTTTCA
AGATCCTTATTCTAAAGACGTCTTCAAAAACagatgttttcaattttgtt
ttaacaAAGTAAAGTGactttataacatttttttcctCTTCTCAATTGTT
CCTGAATCTTTTTTCATGAAGATTTATGAAAACCGCAACATATCATCTAG
GCTCATGTTACATCTTAGAAAAAAGTTTCCCTCGCTTTTTAACGGATAAT
TTGGTTAGCGGATAGCTTGGAAGCCAGACTTATCCTAGAAATTTATCACC
CTTTATTCTTCTCCTTAGAAGCTGAATACTAAGCAGAGGGGGTATCAAcg
ttgagtttaaagcccgaagggctagagtagaatctctaacctttcccagg
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gacgacggattatATCTAGCAGTCCTTTGTTTTTAAGTAcggcatttttt
gaaatctagcgatggattttactttcaatccggcgtttgtctAAAagcca
cgcgcgggcgttctggatgggagaTGAAGTAGCTTCATTTCTCATCCAAA
AGTTTCTACTCTAGCCCCTTCGGTGCTTTAAACTCAACGGGTATCAAGTA
TGTTTCTCAATCATTTGGCAAAACCTGGCTAGTGGTTGAACCCACGATCT
TGTATGCTGCATCCCTGAAATAGTGATGATAATCATCAGAATCGTAAAGC
GTTTTCGCTCATTAAGTTTTATAAGTTCGTATTAAACGTGTTAAAAATAG
ATGGAATAGGGTAACCCAGTAGTCTAGGACTCAGCAAACTGACTCGGGTA
GCTATGAACTGAAAGGGACATTAGGAggagccgggtcataccaaagattc
ccaaaatggtacttgatgcctctctgcttgatgctcagcaaccaTTTGtc
aagtggagaaatccagggaaaggagtggcaccctcccctaccttcgggta
gacagctagagaaaagggagccttcggatCGCCTCTGACTGTGGTCGCCG
ACTTACTTACTACTACTATTCTTTTATCAGGAGCTGAACCCGAAATTCTG
TATTCACAGCGGTGGTGAAGTCGATCGTTTGCCAACAGCCAGTACGTGCA
TGAACTTACTCAAACTTCCCATCTATAACTCAATCGGACTTTTACGAAAA
CGCTTAATATATGCTATCGAAGCGGAAGCTGGTTTTGAACTTAGTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000029_pilon:17374..26571+ >XLOC_038515 ID=XLOC_038515|Name=XLOC_038515|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1596bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000029_pilon:17374..26571+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATTTTCTTGGTCGGATGTTGGGAAAGCATTTTCTTGGTCGGATGTTGGG
AAAGGTCATTTATGAATCAATGATGGTCGAATTGCCGTTAGCCGATTTTT
TCCTTTGTAAACTTCTCAACAAATATGGCGCCGATATTGACATTCATCAT
TTAGAATCACTTGACCCAGATCTTCACAGGTCATTTATGAATCAATGATG
GTCGAATTGCCGTTAGCCGATTTTTTCCTTTGTAAACTTCTCAACAAATA
TGGCGCCGATATTGACATTCATCATTTAGAATCACTTGACCCAGATCTTC
ACAGGAATTTATTCGAGTTGAAGAATTATAGTGGAGATGCGGACGACCTC
AGTTTAAATTTCGCTatcatcaaaaatcaatatGGTGAAACAGAGGAATT
TATTCGAGTTGAAGAATTATAGTGGAGATGCGGACGACCTCAGTTTAAAT
TTCGCTatcatcaaaaatcaatatGGTGAAACAGAGGTGGTAGAGCTGAA
ACCAGGCGGAAAAGATATATGCGTGGATAATTCAAATAAAATAGAATACA
TTCATCTTATGGCTGACTACAAACTTAACAAGCagGTGGTAGAGCTGAAA
CCAGGCGGAAAAGATATATGCGTGGATAATTCAAATAAAATAGAATACAT
TCATCTTATGGCTGACTACAAACTTAACAAGCagttGAGAAATCAGTGCA
ATGCATTCAGAGCTGGATTATCTGACGTCATCGACTTGAAATGGTTACGG
ATGTTTAGTCATAATGAACTCCAGttGAGAAATCAGTGCAATGCATTCAG
AGCTGGATTATCTGACGTCATCGACTTGAAATGGTTACGGATGTTTAGTC
ATAATGAACTCCAGATTTTGATATCAGGTGCACGTGTAGCGGTTGATTTC
GAAGATTTGAAGCAAAATACCAATTATTCTGATTTTGATATCAGGTGCAC
GTGTAGCGGTTGATTTCGAAGATTTGAAGCAAAATACCAATTATTCTGGC
TCTTTCAAAGAAGAGGATTCATACATCAAAGACTTTTGGGCCATCATTGA
AACATTAACGGATAAACAAAAACAGCAGTTCTTGAAATTCGTCACCAGTT
GTTCCAGACCTCCTCTACTCGGTTTTTCGGCTCTTTCAAAGAAGAGGATT
CATACATCAAAGACTTTTGGGCCATCATTGAAACATTAACGGATAAACAA
AAACAGCAGTTCTTGAAATTCGTCACCAGTTGTTCCAGACCTCCTCTACT
CGGTTTTTCGGAGCTGAACCCGAAATTCTGTATTCACAGCGGTGGTGAAG
TCGATCGTTTGCCAACAGCCAGTACGTGCATGAACTTACTCAAACTTCCC
ATCTATAACTCAATCGGACTTTTACGAAAACGCTTAATATATGCTATCGA
AGCGGAAGCTGGTTTTGAACTTAGTTGAGAGCTGAACCCGAAATTCTGTA
TTCACAGCGGTGGTGAAGTCGATCGTTTGCCAACAGCCAGTACGTGCATG
AACTTACTCAAACTTCCCATCTATAACTCAATCGGACTTTTACGAAAACG
CTTAATATATGCTATCGAAGCGGAAGCTGGTTTTGAACTTAGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000029_pilon | genome | sc0000029_pilon:17374..26571 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 631-798:9031 |
| Aaloc | 502-630:6235 |
| Aaloc | 433-498:5182 |
| Aaloc | 343-432:4095 |
| Aaloc | 244-342:2467 |
| Aaloc | 154-243:1523 |
| Aaloc | 28-150:1218 |
| Aaloc | 1-27:1 |
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