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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000029_pilon:106704..113317- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038535 ID=XLOC_038535|Name=XLOC_038535|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6614bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000029_pilon:106704..113317- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAATCACTTCATCAAGTATGGCTTTCGTCGTTAAATTGGCTACCATTTT
TCTTTGGTTGTTGCTAAGCAACGTATGGACACAGTACATAAACGAATTTG
ACGAAGAACTTCGATTTGAATGTCCAAAGAATCAATATATCAGTGAAATC
GGCAGTAAGTCAGTTTTATAAAAAACTTTGGTATTACTTTTTTCAAAGGA
ATCTAGTGTCCGTGTAAACCTAGGCTTTACGTATCACTGAAATAGTTTTT
GTTTTAAAAATATTGGAGGGATTCTGGGAGCCAATTGTACAAGCCAATAA
TGGAGCCAATAATGTGGTAGCGGTTTTGTATCCCGATATTCTTCAAAATC
CAATGAATTTATATGTTGGAAGGTTAAACACACACTTAGGAAAACCCACC
AAAGGTTATTTTTTCCAGGTGTGTATTGGGCCATTCCATTTTATATCCAA
ACAGGGGGTAATCAGAGAAGAATTTCCAGGGAGTATAAAAAAGTATTCTT
TCATTTTTCCAGGGGCCAAAAGATTGGTTTTAGTCCGTCCATTCTTACTT
TTAAGCTTTTAAGATATGAAAATAATTTTTTCAATGGGTTCTTTTGCAAA
TTTTGATACCAGGGGGTATTCACATATTTCTAAAAATCTTTCTTTGACTT
GAAAAGGTTCGTCCAGCCCCTGTATGGAAATTTTATGGAACAGTTCATTA
ATTCTTCATTATATTTGTATCTTTTTTATTGATAAAATAAATAAAATCAG
GATTTATCTGTTTTCAGGCAAACATCAAAATGCTGAAGAAGACAGACAAT
GGAAATATACTTGTCGTTCTGGTCTAGTAAATGATCAATGTGATTGGTCA
GTAGATTATGTTAATAATTATGACCAAATCATGGATTGGAAATGTGCTCA
AAATGGACTTGTTGCTGGTGTCCGAAGTATCCATAGCAATGAGAGGGAAG
ATCGAATCTGGAAATTTAAATGTTGCCAGGTTACCCAGCTGGCACACAAC
GTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTTATATGGACGTTGTGAATGTTAGAAA
AACGTTGAAACAATGTTGTGTTCCAGCTGGGTAATAACTCGAACCTCTAT
TCTTTCTATAACTCGAATGTCTCCTTAACTCGAACAAGTTTTCTCGTCCC
TTCAGTTAACAATGCCTTATACAAATCTCCATAACTCGAAATTTCCGCAA
CTCAGAACTCGAACAAATATTTGGTTCCCATATATTTACGACTGTAGTAG
TAAACGTAAAAGTTTGAATTTAGGACACGTCTTTAGATTTAGCCTTTTTC
ACAGGATTGGTGTTTCTAGTGTACAAATTTTGCACTGCAGTAATTATCTT
TAACGTCTTTTTCGTATGGTAGTTTGTACAGAATACACTTTTCTCGAGAT
GCATAAATTTATTGTTGTCCTCGTTTTCAAACAGATTTCATTGCTATGAA
ATAATACATTTAAACCAATTTAAATTCCCAAAAGGCAAAAATTAACTCTA
AAACAAAAGTACTTGAAATTCAAAATGTCTCATGAGGTGTAAACAACACA
ATTATCATTGTGAATATTTAATTTTATAGCAATGAAATCTGTTTGAAAAC
GAGGACAACAATAAATTTATGCATCTCGAGAAAAGTGTATTGAATTTAAA
ATAGCCTGTAAATGATGCGCAAATCCTATGAAATAGAGGTGCAGGTTAGT
AATACACGGGTTGCAAAATTATTTTAATGCAGTCAAAACATGTGATTACT
CGAAAGAGTTCACGTGATTTTATTCCCCGGTTTTATTCCCATATTACTTG
CTTTACAACTTACAGCTGAAGTAAATCTCATGTAGCAAGCACATAAAAAC
TTCGAGACTTTAATTTTGCAGCCTGTGTATTCCAATCTCTCTGTAACTCA
AATGACCTACAAATGAATCCTGCATCATGATACACATGCGTAATTTGGCG
TTCTTTATTCATATTCAAAGAGGAATCAAAATATTTAAAACTTATCATAT
TCTTTTTCTCTATCTTTAGTCCGGGGGGAGGGGGTACTTAGGCAAGTGAA
GGGTACGGGTATGTGCCGCCCTTAAGGGTGCCTTTTTTGGGAAAATTAAA
TTTCCGTACCACTAAGAGTCGGAAAAATAGGAAAATTTTCCTATTTTTTC
TCTTTTTTAGTCCCGCTACGAGTCCGAAGGTCGAAAGTCGGGCGGCACAT
ACCCGTCAGCTCACCACCCTAGTACCTCCCCCGGATCTTTAGTAGATGCA
GGATTCTTAAGATTTACTCCCTCCTAGCAAACTAATTCTAGTATCTGTCA
GTTAATATATTGGCAGTGGAGTAAAAAGTTAGCTCTTTTCATAGTTCTGA
ACCCCTCTCCCCTTAAATCAATATGTTATAGACCGACCCATGCCCCCTGA
ACCAGCTCAGAACTCCCCAACATTGATATTTGGGGGAAGGGGGTCATTAG
AAAGAGTTTTCTGCCACTATTTTCCTGACTGATTCTAGTTCGAGAGTCAA
CTGTTTATTTATTTTTTTATTTACAGACGCCAGATTCAAATGAAGGTTGT
CAAAATATAACGATGAATGAATTTGATGAATTTATGGATTTCATTGTACC
ACGTGGTCATGCCATTATTGGTTTCCACAGTATCCATAGCAACAAAAGAG
AGTAAGAAACTCTTTGATTTTATAATTTTCCATTTGGGTAAAGTCTCACG
GATCTCATGTTTGGCCTTACCGCAGTAGGTAAAGTGTCCAAGGGAGGCTC
ACTAGGTGAAATAAGAGATTTCCAATCTTGGAGATATTTTGAAAATATGA
TGTTTCAATGAATTTCAGATTTGGGAATATTATGAAATATGATGTTTCCT
CAACTATGGAAATATAGAAAAGTCATACCTCCATATTTACAAATGTATAT
GGAAATATCATATTTTCAAGATATTTCCAGGATTGGAAATCTCTTGTTTC
GCCCAAGGGGGGCTGTAAGAATAGTTACTAAAGGTTTACATTGATGGCGC
ATCAAATCAATGTTCAAATCTTGGGGATGAATGCTTTACTGCAGATTATT
TTTGAGAATTTTTCGGGTTAAATTACCTTGATGTTAAGAAACTAAAGTAA
AAGTAGCCACTGGAATGGCCAAGTGGAATCTTAAGCCAGAATGAGCAATC
ACCCCATCCTTTTGTTTACATCTAGAGATCGAAAATGGAGAGCTAATGTT
TGTAAATTTGCTAAATGCCAAGCTATAAGAATGAGAGTATTATCTACAAT
CAAACCACGGCAAGAACAAATTAAAATTATCGGTATAGCAACATCTCAAG
GTTGTTCCAATAAAGCTTCATTCCAAACAAAGCTGGAGAATACGGATTCG
GTTATTGAGACTTCAGCTTTTACCACAGAGAAAGGGACTTCGTTTACTTT
TGGTAGGACCTTATCAGTGGAGGTATCAGGTACTATTGGTTTCCTTGGTA
GTGGGGTGGATGTATCTGTTGGACTGCAAACGACTTTTGAGAACACATGG
CATTGGTCATCATCAAAAACTAAAGAAACATCTCTCAAAACGTCCAGTTC
AGCCTCGCAGTCACTTGGATATAAAGGTTTGTTTACTTTCAACACCCCAG
CCTCACTGGAAAATTTGGCAAAAATTTCGTCCCCGCTGGGAAAATACCCT
GAAATTTCAGCCCCACTTGGAAAGTAGAATCTCTATCCCCACTGGGATAT
CACTAGGAATTTTTATCCCCACTGAGGAAAAGAAGTTCCACCAGGGCTGT
GAGACAGGGGTGTCTTTCAATGCAGTGTAATTGCCACCGCAGCGAGCCTG
AGGGCGACCGAGGATGGCAGTCATTGCTTCACGATAGGATATTGGACACG
CATCTCGAATTTTTGCGCGCGCATTTTTTTGTTTTTTTTGTTTGCGTTTG
TTAGTATCGTATGTTCCCGCTGAAATGATATCCCGTAAATTTGGCTTCCC
GGTAAAGTTTCATAGCTTTTCCCTTTTAGCATGCGCAGAGGACGCTTTTC
ATTGCTTTAACTATTAACGGCGATTGATGAATAACAATTGATGGCGAAGA
AGATGATTATATTTATTTTTCTTATAAGCATCTACTTTATAAGAATGAAA
TCAATAACTCTTTATTGAACGTAATACATCTTTCGGTAATTAGTTCTTAC
AAAGTAAACAATGGGTGGCGAAGAAGATGATCATATTTATTTTTCTTATA
AGCATCTACTTTATTATAAGAATCAAATCAATAAATCTTTATTGAAGGTG
ATATATCTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAATGGATGGCGAAG
AAGATGAGCATATTTATTTTTCTAATAAGCGTCTTCTTTATAAGAATGAA
ATCAAAAACTCTTTATTGAAGGTAATATATCTTTCGGTAATTAGTTCTTA
CAAAGTAAACAATGGATGGCAAAGAAAGTGAGCATATTTATCTTTCTTAT
AAGCATCTACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTTTATTGAAGGTAAT
ATACCTTTCGACAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAATGGATGGCGAAGAA
GATAAACATATTTATTTTTCTTAAAAGCATCTTGTTTATAAGAATCAAAT
CAATAACTCTTTATTGAGGTTATATACCTTTCGGCAATTAGTTCTTACAA
AGTTAACAATGGATGGCGAAGAAAATGAGCATATCTATTTTTCTTATAAG
TGTCTACTTTATAAGACTCTGTTAAAATAAGGAAATTTTTAGTTGCGATT
TTGCAAATCTTGTACTTAAATACGTGACCTTTATGAGAGCGGTGGTAGTT
AGTGCAAACTATGACCTAGTGTAGATTTTATTTTAAACTGCAATATACCA
ACGATGTAAAAATAATAGATAACCAACTTGCCTTGATTCTCAAAAAACAT
CCGTGTTATGGTTGTAAAAATATTAATGACATTTTGCATCGTAAAAAGTG
CAATTAAATAAAAGAACTTGCTTCATTTGCAACCTTCTATTGGACAGAAT
CGATCACGTGATGTATATTTTTCCAAAATTTGGGTTAGAAAAAGTGTATT
TTCCTATAGGCAGCCTCACAGAAGGACAGAAGGAATTTTCTAATTAATCA
ATATATAGTTGTTATATAAACATTCATCTGTTTATTTTGTATCAGGCAAC
CTTCATGCACTTTTCATTCGTGAGATATCGCAGTTCAAATCACACATATA
TTTTTCAGATAACAGCATTTTATGAGCGTTTATTTATCCAGATGAAGATT
AAGTGGTATCAGGCTGATCCGTAGTCAATTTGTCTAAAGATTGGTACCTT
TATCTTTTGAAAAAAATTCCGAAATTTGCTGTAAATAACAATTCAAATTT
TCTATCAATTCAGTGGATGTCAAAAAGTGTGTCAAAATCTAGCAAAAAGC
ATAACACGCACTGCACACAGAGCTTTTTAATAGAGTGCTCATTTCAATAG
GAAAACAATGGTTGTTCTCTTGGGAGAAGTGCCTTCTAGAGGTAGTTGGT
TATCTATTATTTTTACATCGTTGCTTGAAGATTGCGCCAACATGAAACAC
CATGTGCGTTTGTAAGTTTGTTCTTTATGTCTCGAATTTTCTTGAATGCT
TTGTGATTCTATTAATTTCACTGTATTATTTACTTTCAGGCTCATCTTGA
AGCTTATGTGCCATTTTTTGAAAAAAGAAAACTTAAATATTAGTTTCCCA
CAGCACTGAAGACGAATGAGAGTTTTTATTAAAAATTTGGAGATTTGATG
TTTCACAGAAAAGTGCTAGCAAGGGGCATTTCGGATCCCATATCTTCCGA
AGGACTTTTCCGTTTGCCTTGAAATTTGACAAGCTTCTTAACCTAAGGTT
CACCGAGCATAACTAGAAAAAAAAGCTCAATTTTTGAAATCGCAAATTTA
ACCGCTAAAAATCGCGAATTTTTCAGCCAAAAATACATTCAAACATAGCA
CGTTAGATTTTCTAAAATAAGCAAAAAGAATCTTCGCATAAATTTTATTT
GACTATCAAAAGTTACAGGCATTCTTGTTTCCACTGCCAATTATATCTGG
ATAGACTTTAAAATCACTTCTTTACTTTCAGGACCTGGAGCAGCGTTGAT
CATAGGATATGTCACATATTACAGATATGAAAATACAGATGTGGACGTTG
AGTACGACATAACATGTGACAACGGTCAACATCGAAAACAACGCTCAAAA
GCGTCCTTAAAACTTGATCGATACAGCCAAACACATTTTGTTCAAAAACA
TGGCGCATTTTATTCCAAGCAAAATTGTGACTATGGAAGTAATGATTGTA
TAAGAAGCTTAAACGGGAAAAAAACACTGGCGCCAAATAAACTTATTTCC
GATTTCGAACGCTGTATCGAGAAAGCAAATATGAAGCCGACAAAACCAAC
GACTGCGACAACGACTACGTCAAGACCGACAAAAATACGACATGATGTTC
TTTCTGACGTCACTAGAGATACGGTTAAACTAAAACCACGTTGGAAAGAT
AACAATAAAGACAACATTTTCACTGGATCTGCAGTCACCGTCAATCATGT
AATCTTAAACAATATTAAATTTATAGTTTCAATTTTACTCTCCATTAGTA
TAATTTTTATGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000029_pilon:106704..113317- >XLOC_038535 ID=XLOC_038535|Name=XLOC_038535|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2850bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000029_pilon:106704..113317- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAATCACTTCATCAAGTATGGCTTTCGTCGTTAAATTGGCTACCATTTT
TCTTTGGTTGTTGCTAAGCAACGTATGGACACAGTACATAAACGAATTTG
ACGAAGAACTTCGATTTGAATGTCCAAAGAATCAATATATCAGTGAAATC
GGCAAAAATCACTTCATCAAGTATGGCTTTCGTCGTTAAATTGGCTACCA
TTTTTCTTTGGTTGTTGCTAAGCAACGTATGGACACAGTACATAAACGAA
TTTGACGAAGAACTTCGATTTGAATGTCCAAAGAATCAATATATCAGTGA
AATCGGCAGCAAACATCAAAATGCTGAAGAAGACAGACAATGGAAATATA
CTTGTCGTTCTGGTCTAGTAAATGATCAATGTGATTGGTCAGTAGATTAT
GTTAATAATTATGACCAAATCATGGATTGGAAATGTGCTCAAAATGGACT
TGTTGCTGGTGTCCGAAGTATCCATAGCAATGAGAGGGAAGATCGAATCT
GGAAATTTAAATGTTGCCAGGCAAACATCAAAATGCTGAAGAAGACAGAC
AATGGAAATATACTTGTCGTTCTGGTCTAGTAAATGATCAATGTGATTGG
TCAGTAGATTATGTTAATAATTATGACCAAATCATGGATTGGAAATGTGC
TCAAAATGGACTTGTTGCTGGTGTCCGAAGTATCCATAGCAATGAGAGGG
AAGATCGAATCTGGAAATTTAAATGTTGCCAGACGCCAGATTCAAATGAA
GGTTGTCAAAATATAACGATGAATGAATTTGATGAATTTATGGATTTCAT
TGTACCACGTGGTCATGCCATTATTGGTTTCCACAGTATCCATAGCAACA
AAAGAGAACGCCAGATTCAAATGAAGGTTGTCAAAATATAACGATGAATG
AATTTGATGAATTTATGGATTTCATTGTACCACGTGGTCATGCCATTATT
GGTTTCCACAGTATCCATAGCAACAAAAGAGAAGATCGAAAATGGAGAGC
TAATGTTTGTAAATTTGCTAAATGCCAAGCTATAAGAATGAGAGTATTAT
CTACAATCAAACCACGGCAAGAACAAATTAAAATTATCGGTATAGCAACA
TCTCAAGGTTGTTCCAATAAAGCTTCATTCCAAACAAAGCTGGAGAATAC
GGATTCGGTTATTGAGACTTCAGCTTTTACCACAGAGAAAGGGACTTCGT
TTACTTTTGGTAGGACCTTATCAGTGGAGGTATCAGGTACTATTGGTTTC
CTTGGTAGTGGGGTGGATGTATCTGTTGGACTGCAAACGACTTTTGAGAA
CACATGGCATTGGTCATCATCAAAAACTAAAGAAACATCTCTCAAAACGT
CCAGTTCAGCCTCGCAGTCACTTGGATATAAAGAGATCGAAAATGGAGAG
CTAATGTTTGTAAATTTGCTAAATGCCAAGCTATAAGAATGAGAGTATTA
TCTACAATCAAACCACGGCAAGAACAAATTAAAATTATCGGTATAGCAAC
ATCTCAAGGTTGTTCCAATAAAGCTTCATTCCAAACAAAGCTGGAGAATA
CGGATTCGGTTATTGAGACTTCAGCTTTTACCACAGAGAAAGGGACTTCG
TTTACTTTTGGTAGGACCTTATCAGTGGAGGTATCAGGTACTATTGGTTT
CCTTGGTAGTGGGGTGGATGTATCTGTTGGACTGCAAACGACTTTTGAGA
ACACATGGCATTGGTCATCATCAAAAACTAAAGAAACATCTCTCAAAACG
TCCAGTTCAGCCTCGCAGTCACTTGGATATAAAGGACCTGGAGCAGCGTT
GATCATAGGATATGTCACATATTACAGATATGAAAATACAGATGTGGACG
TTGAGTACGACATAACATGTGACAACGGTCAACATCGAAAACAACGCTCA
AAAGCGTCCTTAAAACTTGATCGATACAGCCAAACACATTTTGTTCAAAA
ACATGGCGCATTTTATTCCAAGCAAAATTGTGACTATGGAAGTAATGATT
GTATAAGAAGCTTAAACGGGAAAAAAACACTGGCGCCAAATAAACTTATT
TCCGATTTCGAACGCTGTATCGAGAAAGCAAATATGAAGCCGACAAAACC
AACGACTGCGACAACGACTACGTCAAGACCGACAAAAATACGACATGATG
TTCTTTCTGACGTCACTAGAGATACGGTTAAACTAAAACCACGTTGGAAA
GATAACAATAAAGACAACATTTTCACTGGATCTGCAGTCACCGTCAATCA
TGTAATCTTAAACAATATTAAATTTATAGTTTCAATTTTACTCTCCATTA
GTATAATTTTTATGTAGGACCTGGAGCAGCGTTGATCATAGGATATGTCA
CATATTACAGATATGAAAATACAGATGTGGACGTTGAGTACGACATAACA
TGTGACAACGGTCAACATCGAAAACAACGCTCAAAAGCGTCCTTAAAACT
TGATCGATACAGCCAAACACATTTTGTTCAAAAACATGGCGCATTTTATT
CCAAGCAAAATTGTGACTATGGAAGTAATGATTGTATAAGAAGCTTAAAC
GGGAAAAAAACACTGGCGCCAAATAAACTTATTTCCGATTTCGAACGCTG
TATCGAGAAAGCAAATATGAAGCCGACAAAACCAACGACTGCGACAACGA
CTACGTCAAGACCGACAAAAATACGACATGATGTTCTTTCTGACGTCACT
AGAGATACGGTTAAACTAAAACCACGTTGGAAAGATAACAATAAAGACAA
CATTTTCACTGGATCTGCAGTCACCGTCAATCATGTAATCTTAAACAATA
TTAAATTTATAGTTTCAATTTTACTCTCCATTAGTATAATTTTTATGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000029_pilon | genome | sc0000029_pilon:106704..113317 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 895-1425:532 |
| Aaloc | 493-891:3439 |
| Aaloc | 367-489:4089 |
| Aaloc | 157-366:5846 |
| Aaloc | 1-153:6615 |
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