XLOC_040448 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040448
Unique NameXLOC_040448
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000028_pilon:676652..689952-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040448 ID=XLOC_040448|Name=XLOC_040448|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13301bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028_pilon:676652..689952- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGAAATACCTCAACGAGGCAAGAGATGGGAGGAAAAAATTTAAATGTTAA AGATTCATACATAAAGCGCTAGCTAATTTATTCAATATTCGGAAATTTAT AAAATTAACTACTTGGTACAAGGGTTAGTGTGAGTGAAGTATTATACATT CACCAGGCCCGGTGGAAGCGGGGAGACTGGGGAGACTTCAGCCTCCTCAC TTTTATGGTTGTTCCGCTGGAGATGTTCACTGAAATTTGTGTATTTTGTT TTTATTTTGCATTTTAGTGAAAACAAAAATAAATCCAGAATTTCAAAATG GTGAAGTATACTTTGAACCACTTCAATAAAAACTTCAATGCTATCAGCTT AATATTTCATGCTGCTGGAGTTGAATTCAATGACAATTATATGACCCGAG AGCAGTGGCTGGAAAACAAATCGAATGGTATGTATATTTTTGCCCGGGGA GGGGGTGCACTCAAGGTAAACGACCGTACGTGCGGCCCTTAAGGGTCCCT TTTCCAAGCTTCCCAAAGTGCACTCTAAAGGTTTAAAATTTGGAAAATCT GACGATATTGCCAAAAAATTGGTCAAATTTTTTCGAGAAAATGCATCTTA AGGGTCAATTTTTCGCCCAAATTTACTCAAATCTAGCTAAATTTTCTCTG CACTGTAAAGGTCCGATTTCAAAGGCCTAATTTTGGGCCGCACGTCATCA TTTTTTGAATCGAGCTCCCCCCAGATTTTTTTCTGTTGTGTTCTTTTCAT TCTGTCATTGCTAAAATGTTTTGACACCCGTTACGATCACGATTACGCAA GAATAGCGAAAAATAGTCCTATCAAGCAATCACTGTATAAACAGAGTTAC GCTATCACGCAGTGAAAGAGAAGCCCCACACAGCATCGAGCTAGCCGCTC TGTGGCTTCAAGTCTGTCTTAAGTCTGAAAAGTAGCAACAGACTGTATTA 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TTTTAATTGCATTCGAAATTCATTTTTTGAGAACGAAAATCAATAAACAA CAATAAAAGAAAGACACAGAGAGAAGAGAAAAATATAAAACTCTCAGTGT AATTTCTGTAATTTACTTTCCTAACTGGGAAAAAGTAGTGAAAGCCATTG TGCGATTAGCTCGTAATCACATAATAACTCGTGATTTTTTTGTTTCGAAT TTTCGTCGTCCTTTCGGACTCGGAAAATTAATAACAAAAAAATCACTCGT GCAATTATATTCGAATTGCACTCGTTATCATGTGATTACATATAATATAC TAATCACATGTTTTGACTGCATTGATGCAATTTTGCAACCCGTGTATTGA GACGCCTGGGATAATCTAAATACCTTTGAGATGTGGATATCATGGACTTT ATTCTATTGCTTTTTCCTTCTAGAAAACAAAATTGGAAGAATTTTACGCT TCAGAAAAATACAAGTTATTGATGGGATTCATTTCAAAAACCTTGAAGCG ACACAACGATGGAAAAGCTTTTATCGCAGGAGAAAAGGTAAATTATAAAA TTTAGCGGTTAAAAGGATATAGAATGTATGTATTTAATGTCACCTTTGCG CGGGGGTTCTGCTGAGACCTGTTTAAAGTTTTTGTAGGTCAAAGTTTGAC ATGACAGGCACAACTATTGACGAAAAACATAGGGAAATTGACGAATTTTG AAATTGTTTTTTAACGAAAAATGACCCATGCTCAAACACATGAAGAAATA TGGGTCTTTTAAGATTTTAAAATTTTAAGAGACCTTTAGTCTAGTTTACA AGATGCTAAAGTCGAGCCAGTACGCTTAGCACACTGGAAAGTTGTTTGAT TAAAAATATTTCCATCTAGTTTGTGATACAGGGGTGTCGGTGGCATGCTA TGAAATATATTCTTTGCTGGTCTAGCATGATAGCCCCCCCCCCCAGCGGT TTGCGTGAATGCGTGAATGGGCATTTTCGGTTGCGTGAGTGCGTGAAAAT TGAAAAAAAAATGCGTGAATGCGTGAATTGAAAAAACTTGCGTGAACGTG AAAATCCACTTTATGATTGCGTGAATGCGTGAATCTGGGCTATTTCGTGC GTGAATATGTGAATTTTCACTTTTTTCCACCGGTTGTATGCAGTGTTCCT GATTTTCCAATGTTTCCCCGATTTTTACTGAAAATTTTCTGATTGGGTTA TTGCGTGAAAATCGAGGAAAATTTGCGTGAATGCGTGAATTACGAAAAGG ATTGCGTGATTGCGTGAATTGAGAGTCCGCTGGGGGGCCTCGTGATATGA CGCCATTTTAGGGAGATTTATGTTTTCTGCAAATGACATGGTACAGGCGA GTAAAATATTGAGTTTTATTCCCTCTGTTGAAGGGTTCCCCCTTGATGAA AAGAACTTTCGAACGTTTTTCTTCATCTTATTGATGAACTCTGTATTCTT TTTAAGCTTTCGTTGGCTGATTTCAATCTTGTTGGAATGTTATGTTTCAT TGAATTAGATTTGAAAGAGTTTCCAGAAATCTCAGCTCTTCGTGAACGAG TACTTAGCGTTGAAAAGATCAAAAAATTCATGGAAACACAAAAGGAATAA TTTATTTTAATAATGTTTTGTAAGTATATAAAACAATATTCTCGCCGGAA CCGTTGGTTGGACCTTGGCTTTCCAACGGTTCTGGTGGCTAGTCAGAAGA CGACATGAAAGCGACTGTATTCGCTTCATTTTAACAATATTTTGTATAAT TTTGTATAGGTTTTTATATTTTTTTAGATAAATTTATGAAATTTTTGCAG AACATCAACTTTTAAAATTGCATTCCGAAAAATTAAAAGTTAAAATTTCG CGATTGCCAGTTTCTGGAAATTTTCGCGTGTATTTAATTTCGCGAAATTT GGCCTAAAAATCGCGAAATTAAGTACCCGCGAAATATAATACCTATAAGG TAAGTAATACTCCCAGCATATTTTTATAGAGGTTTGTAGAAGGGGTTTTC ACCTTTTCTATCCATACAAGCATGTCTTCCCTTCACAATGGGATTTCACA TTTTGTTCTCTTCAAAAAATGTTAGTGGGAATTCGGCAGGTGGAAACTCT GACAATAAGATATCCCTTTCTTCTCTTTTTTCTTGAAATTTTAAAAGAAA TTTCATTTCTCATTTGAAACAAGAAATTGTGATTTTAAACCTGAAACTTT AGATTTTTGTTTTACAATCATTTTCACATCATGGTATGAAATCTTAGTTT CTGAGTGCTTCGGTTCGTTTCAAAGTTTTTTTTGACCTATAAAAACAGTT TTATGTTTATGTTATGAAAATTCTGTTGGCTGACATACTTTCAAAAAAGC GTTGTATATAAAGAGTATAGTATTAAAGATTATCAATCAATATCTTCTGT TATTAAAATCTTTAATTCTCTTCTTTGTCGGATGTCAGAAACAGCCAACT ACCATTTAATTGAAGTAACACTCGATGAGTGGGTGGTTTGAACTAGTATA GTCTAGAATGTTTGAACTACACGTTTTTTATAAGAGCATCCAATATTTCA GATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCTTAACATGTT CTTATATTCACAATTTTGTAAGTATTTTTGCATATTTTCCTAAGAAATTA GGTGTTTTAGGGGTTGGAAAGCCTTAAAATGTTCTAAATATTTTGGCCAT CGAAGCTTTATGTTCTTATAGTTTGTTCTTATAAAAAAGTAATTCATGGT CTAGATCATTCTAGAATGTTCTCCTTCTAGAACAAATTGTTTTATAATTG TTTATGTTTTTTTCTTTATAAGCATTGTGTTTATAAGCATATCTAGGATC ATATATGGCGAAAATTTAAGCATGTGCTAAACATCACCTTGAACCTTCAT TTTTAGAACTTGTTTGTTTTTAGCTCTAAAATTTTGCTTAAGATATAAGC ATCCCTTAAAGCATTTTTCAGCTTTGTAAATCTCTCGATCTAAGCATTTC CGAGCCAACTTTTGGATTTTTGTATGCTTATAAAAAAACATGTAGTGGTT ATTAATTGTTTGTAATACGATATGTTGCTGAAGTAATCTAATTCGTTCTT GTATAAATAGACGTGTTAGAGAAAGGGGAGGCATCTCATTTCAGTTCGAA CTTTCTACTTACGTGGTCTAGTGAAGAGAAAAATACTGAGCAGATTTCAA AATGGTCAAGTACACATTGAACTACTTTGATACAGCTGGACGTGCTGAAT CAATCAGGCTGATGTTTCATGCCGCTGGAGTTGAATTCAATGATAATAGA ATATCTGGAGAGGAGTGGGCCAAAAATAAAACAGATGGTATGTTCTTATT TTTTATGTCTTTTTATTATTCTGCTTTGCAGTTACACACCATGTCTCGTT GGTCAGGTACGTCAGGCCCCAGGCCAGACATTCTGGCTATTTGTAAGTCT AGTTGTTCTAAGTTATTCGGATCTACTTTAGCAATTTATCGTAAGAAATA AGTTCATTTTCATTGTTTGGTTCACACCTTTAATCTTTGACTTCAAGTTG TTTATTTTCCTTTTAGGCAAAAGATTTCCACTTCACCAAATGCCAACTTT GGAAGTTGATGATAACGTCATCTGTCAATCAAGTGCTATTGCTCGATTCG TTGCTAGGGAACTTGGCTTCTATGGCAACAATTCTCTGGAACAAGCTGTG ATCGATCAAGTTTGTGAGACGTTCAGTGATATTGGAGCAGAGTTGATCAA AATTATATTTGGAGGGAATGACGAGGAAGCAAAGGTACCAGAAATTTTCC TTATTTTTAAATCTATTGCAAAACGCTCAGCCAACTCTCAAAAACATTTT TTCACAGCTTGTAATTTGTCAACTTGAAATATATAGCTTTTATTGCTCAT TCTTTTCAGAAAACAAAATTGCAAGAATTTTACGCCTCAGACAAATACAA GTTGTTGATGGGATTCATTTCAAAAACCTTGAAACAACACAACGAGGGAA AAGCTTTTATTGCAGGAGAAAAGGTAAAAATGCGTTCTTTTTAAACGATT TTATATTGCTTCTTTTAGCAATTATTTCTCTTGATGCCCATAAATATTGC AAAACCTGTTTCGCATCCCGGTGTCGCAGACCCACTGGGACCCCAGCCCC ACTGGAAAATTTGGCAACAATTTCGTCCCTGTTGGGAAAATACCCTGGAA TTTCAGCCCCACTGGGAAAATAGCTTTGATTTCATCCCCATTCGAAATTC AATGTTTAGAAATTGTACACCAAAACCATCCCCACTGGATTTTTTAATCT TTGGAACAATAGAGTTTCAATAGGAATTTATCCCCATTGAGGAAAAAAGT TCCAATGGGGCTGTGAGACACGGGTGTTGTTTCAAAGAAAATATAAAAGA TGTCAAAGTACTGTTTTTTTCCTTCATCAATTCTTTGCATCCTAAAACTG TTTAAGTGTTCTTTCCCCTTTAAAACTTACGTACTGCTCCCCGTGACCCC ATACGTATTCATGCCAACCTTAGCTGCGACAGCTCTTGAACAAAAACGAT AAAGTTGACTTTTTTTACAAGTCTTTATTTGAGTTTGATTTTCTGTCTCT GTTTTAGATTTCCATAGCTGATTTCGTCTTGGTTGGACTTTTATGTATGA TCGAATTAGATTTGAAGGAGTTTCCAGAAATCTCAGCACTTCGTGAACGA GTATTAAGCATTGAAAATATCAAAAAATACATGGACACACAGAAAAAATA A

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000028_pilon:676652..689952-

>XLOC_040448 ID=XLOC_040448|Name=XLOC_040448|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1224bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028_pilon:676652..689952- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGAAGTACACATTGAACTACTTTGATACAGCTGGTCGTGCAGAAGC
AATCAGGTTGATGTTTCATGCCGCTGGAGTTGACTTCAATGATAACAGAA
TGTCCAGAGAGGAATGGCTAGAAAATAAAACAGATGATGGTGAAGTACAC
ATTGAACTACTTTGATACAGCTGGTCGTGCAGAAGCAATCAGGTTGATGT
TTCATGCCGCTGGAGTTGACTTCAATGATAACAGAATGTCCAGAGAGGAA
TGGCTAGAAAATAAAACAGATGCTCGAAGATTTCCACTCCATCAAATGCC
AACTTTGGAAGTTGATGATAACGTTATCTGTCAATCAAGTGCTATCGGTC
GATTTGTTGCTAGGGAACTTGGCTTCTATGGAAACAATTCTCTGGAACAG
GCTGTGATCGATGAAGTTTGTGAAACATTGCATGATTTGGGTTTGGAACT
GATCAAAATTATATTTGCCGGATACGACGATGAAACAAAGCTCGAAGATT
TCCACTCCATCAAATGCCAACTTTGGAAGTTGATGATAACGTTATCTGTC
AATCAAGTGCTATCGGTCGATTTGTTGCTAGGGAACTTGGCTTCTATGGA
AACAATTCTCTGGAACAGGCTGTGATCGATGAAGTTTGTGAAACATTGCA
TGATTTGGGTTTGGAACTGATCAAAATTATATTTGCCGGATACGACGATG
AAACAAAGAAAACAAAATTGGAAGAATTTTACGCTTCAGAAAAATACAAG
TTATTGATGGGATTCATTTCAAAAACCTTGAAGCGACACAACGATGGAAA
AGCTTTTATCGCAGGAGAAAAGAAAACAAAATTGGAAGAATTTTACGCTT
CAGAAAAATACAAGTTATTGATGGGATTCATTTCAAAAACCTTGAAGCGA
CACAACGATGGAAAAGCTTTTATCGCAGGAGAAAAGATTTCCATAGCTGA
TTTCGTCTTGGTTGGACTTTTATGTATGATCGAATTAGATTTGAAGGAGT
TTCCAGAAATCTCAGCACTTCGTGAACGAGTATTAAGCATTGAAAATATC
AAAAAATACATGGACACACAGAAAAAATAAATTTCCATAGCTGATTTCGT
CTTGGTTGGACTTTTATGTATGATCGAATTAGATTTGAAGGAGTTTCCAG
AAATCTCAGCACTTCGTGAACGAGTATTAAGCATTGAAAATATCAAAAAA
TACATGGACACACAGAAAAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040448XLOC_040448-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000028_pilongenomesc0000028_pilon:676652..689952 -
Properties
Property NameValue
Aaloc469-612:145
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Aaloc139-354:12629
Aaloc1-135:13302