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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:90400..96034- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012900 ID=XLOC_012900|Name=XLOC_012900|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5635bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:90400..96034- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAATTAAAGCTGAAAAAATTAAATGCAATGCAGAAGAAGACTTGTT
TGATAAACTTAATGTAATTTATGTAATTTTAATTTTTGTTAAAACAATTC
TGATGATATGTAGAAAGTTGATATTTTCAAGTTTCAATGAAAATTTATCT
TTCTTAGGTTTTTAAGTCTCACACTTTAGTAATTTTTCATAAAAGACTAA
TTTTGAACTTGAATAGGTGATAAAATTCTAATTATATTAAAATGATTTTA
TCAAAGGTGAAGATTGAAGAGATCCAGCAAGACTATGTTTTGGTTAGTAA
GCAGAAAATGGCTCAGCTAACTCTTGAAATCAATCAGCTCAAAGATGGTC
TTGCCAAGGTTATATATTTAAAAAAAACTCAATTTAATTATTTCTTGTTA
AATTCAAAATTAAAATTTGTCAATATAAAACCTCTACCTTTTTGGTATTA
TATTTCATGTGTTACAAAATTTCGTGGTTACAGTATGTGGCCCCCAAAAT
GACTATCCAAATTGAAATCTTTCTAGTGAATTCAGAAAATAGAGATTAAG
TTAAAAAATTTTCTTGTGAATTAAGCTTCAACATGTCTAGTTTCTTTCCC
AAAAGATAACTTTCTTAGAATAAAGGTTTTTGTATGATTTTTTTTCAGTC
AAAGTTGAGTCCCATTTTTCTAATGGCCCCCAAAACGGAGGTTTAGTTTT
TTCGAAATATCTTAATCAAAAAGCATAGCACCGATATCAAATTACTATCA
ATAGGTATCAAGGCAATGCTTTACGACTTAAAAAAGTCAAAATTTACTTT
TCTCTTTATCTTCGTCTTCATACAAATGGTTGTCAAAATGGATGTTAGTG
ACCCCCAAAACGTTGATTCAATTAAATTGAAATTGTTAAAAACCCATCAC
TTAATCATGTCTCGAATTAAAGACATGATAAAATAATTTGTTTGTTGATA
ATTTTGCAAAAAAAATTCATCCCAAAACAATAAATGTTTCAGGCCAGGCT
GAGTGCAAAATTCTGTGCAAAATACTAGCAATGCCTCCGATGTTAATTTT
ATCGTGCTATATTTAGAATTTTCTGAAAAACTTTGACCTACTGAGTTGGT
ATGTTGGTATATGTTTATACTTTCCAGAGTTACTCAGCTTTTAGGGGTTA
ATTTCCAATCTGACTTTTGACGGTTTTAGTCCAAAAAAAGGAATTTTCAA
AACTAATTTTTGAAAAACAAGGAAGAAGAAAATTAGCCATTTAAAAATTT
TATTATCAAAAATACAAAATACCTATTTGTTATACTTAGTTATTATTTTT
GTCACTAGTTTTGTTACTATTTTTGGTATCTTTATACCCCAATACGTTGC
GTTTCAAGCGAAATCAGTCATTTTCTTGCTTTATTCCCACTTTTTGAAAA
TGCCTTATTTAGTGAATCGTGAAATTTAATACATGCAAAAATTTCCAAAA
ACTGGCAATCGCAAAATTTAGTACACGCAAAAAACATTTCCTCTAAAAAA
TGAGATATAACATACACGCGAAATATAATACCAATAAGGTAATTGGAAAA
AAATCTTCCAAATCTTCAGGAGAACTTGAATTCAATATCTTTTCGCTTTG
ATATTAATCTTAATTTTTCCTAATTACAAAATTTCCATGTAGGTTGTAAA
CAAAGATGTGATTCAATCAACATTCAAACAACACACAAAGCAGCTTGGTA
TGTTTTAATTTATTGAAGATTTTTTTAAATAAAACACTAGTAGTCTCAGA
CAGCGCCCAGACAGCTACATCATTAGAATGTGATGTCTTCTTTCCTAATG
GTTAATACTTTTTGAATTTTCCTACTTTGAATGGTAGCTATTTCTTATAT
ACTAGCAATTGGCACTCTTTTAAACTAGTTCCCAATTTTATTTTGATTAT
ATCAGAATGCAGATCAATTGCAGCAGAGAAACAGAAACTCCAAAGAGAAC
TAGAGCTTTTCAATTCTAGACATGAATCAACTTTAGTTGAGTTAGAAAAA
GAGAGACAGGTTTGTAATTTTCCTTGTATTTTCAAGTAAATTTGAATTAA
AGCTCATTTAAATTACGCAGTGAATAAAAAATACTACTCAGCTTTTTTAT
GGAAACTTATACTGAGCTGATTTGAAAGTTTTCTTTTATTCTTAGACTTG
TGTTTTTAAACGAAAACTTTCTTTTGTTTTTAGAAAGCAGCACAACTTCT
AGTAAGTTAATAAAGACAGTGATTATTTTATTTTATTTTATATGAGTGTG
TATGACATGTTTTGAGTGTAGATATGGATTTTAACTGTTTTTAATGTTTT
TATATATTATTTCTTTTAGACCTGAAGATGGACATTATGTCCGAAATATA
TAGTCAAAAATAAAATAATATTAATTGTTGGCTCAACTTTACTTGATATT
TTATTTTAGAAATATGATTTTTCTTCTGTCATCTGAACCTAGTGGACAAT
AGGTTGTAAAATCATTTTTTAGGGCCTGGATTAAATATCAAGATTTTGTT
AAAAGCTTTATTTTATACATAATTGTTCCCGTTTCATATCAGATACATAT
TTCATATAAGGACGTGTTTCCCTATTGTTATATTGTGCTGAATAAACAAA
AAAATTGGTCTTTCTGACCAATCTTGCTCCACATCCGTGTCAATCCAATG
TGAAAAACTTGTAAATTAAAATTGATGAGTAAGCAAATGATATCACTTTT
ATTTAAAAACAAAACCTTGAAGTAAAAAGATTATTTTCCAGAATGTTACA
GTCATTGCAGTATATTGTTTTATTTTCATTTAAGAAGATCGAAGAGATGA
TTGAGACAGCTTCTTTGATTTCATTCTTATGAGTAAAAGTGAGGTCGAAT
ATATAATTTTGAGGTCTAAAACAAACTAATTATTCCTATAGTCTTATTTT
TATTAGCAACAAAGCAAGGACATGTCTGATGCAATGGTTGAACAATCATT
ATTTTGGACAAAGTTTGGCAGTAACGTTTGTACACTTCTCTGGAAAGCCT
CTAATAATGATGAATCTGTCAAAGCTATGCTGAATGGTGTAAGACAGTTT
TTTGTAAAGTGTCTTGCCCCTCTCCTAGTCTAAAGAGTTTTTTTTCTTTA
TCAATATCCCATGGCTTATTTTTTTCGAATCATTTTTCAATAAAGTTATC
CTTATTCAAGAATTTAATCAACCAATTGAAAAACAATTCTCAGATAAAAA
AGGTTTATTTTTTTTAATATTATTGTGGTTATCAAAATCAAAGTTTCATT
TGTCTATTTCTATCCAACCATTGTAAGAAGTGTGACAACTAAAATCTTAG
CGTTTTGATTTCTCTTATTCTTTAGGATTCAGGATTGAAATTTCTAGAGG
TTGCTTCTTATGCTTACGAAAGCTATTTTACAGCTCTTCGTCTTCACAAG
TTTGCCAAAGCCAAAGAACTTTCCGCTGAACATGATTTCATTTTCATGTT
GACTGGTTTTCTAACAAACATGACTGCATCCTCATTTGGTAGAGAGTTTT
TGATGAAAGCGACAGATAAAGATTCTTTGTTGGATACTGCTTCCCAATTA
TTGGTAGATTTATCATTGAAGGACCTTGAATGGGCTAAACTACGGAATTT
ACTTTTGAAAATCTTCTACAATTTAAGGTCAGAAATCATTGCATTGGCTA
TTTTTCTAGATTGTAAGTACAGTGCTGTCAAAGCATGTAAAAAGAAAAAA
AATTTAAGATTTGTATTTAAAGAATAAACGAACAATATAATGTATATGTT
AATTGCACTTAAAGTTTGATATTTATTAATGTCCATAGGCTTTAGCTGTG
GTTTATAAAGTTGACTTATTATTACACTTGTTTTAAAGCTTGTTGTTATA
TCATCATCATTTTAATTAATTTTTAGCTTAAACGAGAGAGGTTTGTTATT
TGTATCTGAACAGCAGAATCTACTGAAAGCTCTTTCCCAATCACTTTCAG
GTATTGTTTTGTTTTCTAAATTCAAAAACATGTAACTGTTGCTTTGCATC
TTTTGCAGTAAAATTACAAGAATTGCTGGGAAAAGGTTCTTAAACCTGAG
GTCTTTGGTCTCACATCATATTTCATTACATATGCTGATAAAAGATAAAA
GAGAAACAGGGATCAGTAGCTTTACTTCTTTTATTCTTTTATGTTTAGAT
GACCAATGTATGGAAAATAAACTACAATCTATCAGGTATGATTCCAATTG
CTCTTTTGCGGGAGAATTCCGTACCCTAAGTGATAGCATCAAAATAAATT
CCCTTTCAAAAGCCAAACAAGCATATGGGGGTACTGGTTGTTTTTACTTC
ATTTTAATGCAGTCCTGCGCAGTGATCTCTGACTTAAAATATAGCCTATT
CCAACTTTATGTTAAAGACTAGAAAGGCTGGTGTTAAATCTGATAAACAA
CATAAATGAATATATAAATATTTCGTCTTCTTAGAATATTACACTCGATA
CTTTTGGAACCTGGAATGACAAACGCTATCCAACAAGTATTACACTTGGT
GAGATTTTATTTTTTGACGTACATGGGGAGGTCATATAAATTAACCTTCG
TTCCTTCGTTACTAACTTTTGTCGGGATTGGCTCATAGTATTTATTAGAT
TTTTGGCACAAAGATGCAAAATGGTAATGCTCAAAATGTGACAAAAGCCG
ATTTTTGAAAGAAAAATTTCCTGTCGCCAGATCTGGGAATTTCCCGGAAA
AAGCGGTTTTCTGTATTTTCTTGAGATTCTACTATTGGTTTTTCCTGGTT
TTTCTAAATAGATGCGTTTTAGTTTTGCCATCAATGTTTCAAAAACAGTT
TTCGATTTCCCTGTACGATTCTGGAAATACGCCAGAAATCAATGTTTTTT
CCGTAATTCTGTGACAAAGTTTGTTAATCATTGACCGACATTTAAGAAAA
GATTTCTCTAAGGGTTTGTCTTTTTGAAAACCTAGTACTCCGCCACCCTG
GCCGACTGGGCAAGACTACATTCACGTGCGGTGTAATTGATCTAATAAAT
TTATTTATGGTCATTGTTTTTTCCTGATTAGATACCAAGAGAAAAACTAT
CAAGTCATCTACAATACAGTAGTGGAGAGGTAACGATTATCAGCGGTCTT
TTGTTCCCTTAAGTCGTCAACGATTGCAACGATTTTGCTTTCTATGAATC
TGTCACACAGCTGAATTTTGTTTTATACACCCACTTCTCCCGGTAGGATT
TCAGACAGTGGGGATAAAAATAACGGACTGAAACTGGACGGGGATTGATA
TTCTAATGTTTTAATGGCTTGGGATTCCAATTCTTTTGTTTTCAAGTTAG
AAAATTCAGTGGGGATGGCAAAAAAAATATCATAATTTGCAGTGAGGATT
GGTTTATTTGATCATTTTCAGTGGGAACAAAAATTGAAGGATAATTTTCC
ACAAGGGATGATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAAGGGGTCCCAATG
GATCTGTTTTCACGTACTGTATAGCAATTTCAATGTTTCAGTAGGATGAA
TGTAGGAAGAATTATCATAAATGTCCTCTCTTATAATAAAATGAATAAAT
TTCTGTGCTATATTGATGTTTTCAGGTCAAAGAAGCACTTCAAGAATTAG
AAATGGAGTATCGTGTCCATGGAAGAGAATCGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:90400..96034- >XLOC_012900 ID=XLOC_012900|Name=XLOC_012900|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2082bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:90400..96034- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAATTAAAGCTGAAAAAATTAAATGCAATGCAGAAGAAGACTTGTT
TGATAAACTTAATATGTCAATTAAAGCTGAAAAAATTAAATGCAATGCAG
AAGAAGACTTGTTTGATAAACTTAATGTGAAGATTGAAGAGATCCAGCAA
GACTATGTTTTGGTTAGTAAGCAGAAAATGGCTCAGCTAACTCTTGAAAT
CAATCAGCTCAAAGATGGTCTTGCCAAGGTGAAGATTGAAGAGATCCAGC
AAGACTATGTTTTGGTTAGTAAGCAGAAAATGGCTCAGCTAACTCTTGAA
ATCAATCAGCTCAAAGATGGTCTTGCCAAGGTTGTAAACAAAGATGTGAT
TCAATCAACATTCAAACAACACACAAAGCAGCTTGGTTGTAAACAAAGAT
GTGATTCAATCAACATTCAAACAACACACAAAGCAGCTTGAATGCAGATC
AATTGCAGCAGAGAAACAGAAACTCCAAAGAGAACTAGAGCTTTTCAATT
CTAGACATGAATCAACTTTAGTTGAGTTAGAAAAAGAGAGACAGAATGCA
GATCAATTGCAGCAGAGAAACAGAAACTCCAAAGAGAACTAGAGCTTTTC
AATTCTAGACATGAATCAACTTTAGTTGAGTTAGAAAAAGAGAGACAGCA
ACAAAGCAAGGACATGTCTGATGCAATGGTTGAACAATCATTATTTTGGA
CAAAGTTTGGCAGTAACGTTTGTACACTTCTCTGGAAAGCCTCTAATAAT
GATGAATCTGTCAAAGCTATGCTGAATGGTCAACAAAGCAAGGACATGTC
TGATGCAATGGTTGAACAATCATTATTTTGGACAAAGTTTGGCAGTAACG
TTTGTACACTTCTCTGGAAAGCCTCTAATAATGATGAATCTGTCAAAGCT
ATGCTGAATGGTGATTCAGGATTGAAATTTCTAGAGGTTGCTTCTTATGC
TTACGAAAGCTATTTTACAGCTCTTCGTCTTCACAAGTTTGCCAAAGCCA
AAGAACTTTCCGCTGAACATGATTTCATTTTCATGTTGACTGGTTTTCTA
ACAAACATGACTGCATCCTCATTTGGTAGAGAGTTTTTGATGAAAGCGAC
AGATAAAGATTCTTTGTTGGATACTGCTTCCCAATTATTGGTAGATTTAT
CATTGAAGGACCTTGAATGGGCTAAACTACGGAATTTACTTTTGAAAATC
TTCTACAATTTAAGGATTCAGGATTGAAATTTCTAGAGGTTGCTTCTTAT
GCTTACGAAAGCTATTTTACAGCTCTTCGTCTTCACAAGTTTGCCAAAGC
CAAAGAACTTTCCGCTGAACATGATTTCATTTTCATGTTGACTGGTTTTC
TAACAAACATGACTGCATCCTCATTTGGTAGAGAGTTTTTGATGAAAGCG
ACAGATAAAGATTCTTTGTTGGATACTGCTTCCCAATTATTGGTAGATTT
ATCATTGAAGGACCTTGAATGGGCTAAACTACGGAATTTACTTTTGAAAA
TCTTCTACAATTTAAGCTTAAACGAGAGAGGTTTGTTATTTGTATCTGAA
CAGCAGAATCTACTGAAAGCTCTTTCCCAATCACTTTCAGCTTAAACGAG
AGAGGTTTGTTATTTGTATCTGAACAGCAGAATCTACTGAAAGCTCTTTC
CCAATCACTTTCAGATGACCAATGTATGGAAAATAAACTACAATCTATCA
GATGACCAATGTATGGAAAATAAACTACAATCTATCAGAATATTACACTC
GATACTTTTGGAACCTGGAATGACAAACGCTATCCAACAAGTATTACACT
TGAATATTACACTCGATACTTTTGGAACCTGGAATGACAAACGCTATCCA
ACAAGTATTACACTTGATACCAAGAGAAAAACTATCAAGTCATCTACAAT
ACAGTAGTGGAGAGATACCAAGAGAAAAACTATCAAGTCATCTACAATAC
AGTAGTGGAGAGGTCAAAGAAGCACTTCAAGAATTAGAAATGGAGTATCG
TGTCCATGGAAGAGAATCGTAAGTCAAAGAAGCACTTCAAGAATTAGAAA
TGGAGTATCGTGTCCATGGAAGAGAATCGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:90400..96034 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 982-1041:61 |
| Aaloc | 934-981:605 |
| Aaloc | 871-933:1201 |
| Aaloc | 835-867:1486 |
| Aaloc | 760-831:1759 |
| Aaloc | 457-756:2311 |
| Aaloc | 325-456:2730 |
| Aaloc | 223-324:3729 |
| Aaloc | 166-219:3994 |
| Aaloc | 64-165:5380 |
| Aaloc | 1-63:5636 |
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