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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000066_pilon:139190..147226+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_032341 ID=XLOC_032341|Name=XLOC_032341|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8037bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:139190..147226+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGATAATACAGAACTGAGAATTTTGACGTTAATCTTCTTCCCGAC
AGTCGTGCTGTGTGGACGTAAGTGtgtcatagatttataaagcccgaagt
gctagatgtcgtgctttaaaaaaatattgctgctattgttttcgaaaatc
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gacttaggtaagatttcctacctaacctcggcacacttttcagcaaaagt
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AACCACCCGCAACACCCACTGATACGCCCGACCCTAGCTGTAAGTAAATT
CTCTTCATTATTCCATCTTGTAGTCCTCTTACGCCTATAAGCATACGCGA
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TCCCTTTCCTCCCTTTCTCTACTTGCTCTATTCGAAGCTTTTGGgaataa
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TCTTTTCTTTCTCGATATTTTCAATCTTCAACTTTTCTAAAACAGTCTCA
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gggcttttccagaaatagtccgtgccccccccccatgttgaggatatcgg
atatccaggtggttaacgatttttgttcaaaagtggatatccagggggtt
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aaaaaatacgatatccaggctaagcatctttataagagaggatatccagg
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agtaggatatccagggggttcgatacttcgaaaaatcaatatcctcaaca
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TTCTCCAAATGATCTGTCAACtgaaatgaaagatttttcgataagcttaa
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TTATATAGGGTTGTCAACTTTTTTCGCACACCCGGTACGAAACGAAGATA
CTGACTGACATAGTAGAGAAATTACATACTTAACTAGCAGCTTTCTTAGA
ATTTAGACGCATGGAacatttgtactagtaataacatggtttagaaggtg
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gaACGTAGcgagggctattttgaaatgttttcaatgaaacgaggggttat
taatccaaaatcaccttctaaaccatgttattccgcgttaattatatggt
caaaaaaagaattgaagaacaatcaattgttttttttgggagtttttttc
gaaacttataaaaacattcgaaactataaaaaacatttgattgaCACTCT
TATCTAgatttgcttaaaaattttgtgcgatattttgttaaccaatcaaa
atgctctgaagatatcgtacgatacttttcaaccaatagaaattcttgtt
tacatcagggcgattacaaaaaagcggggttattacggatttatcgcccc
gctcatcccttacaaatctaagctaaatgtaatcaaccatataattatgt
TCGAGATTATCTCTTTAGAATAACTTACATGTGCACGTATGAAAGACTTT
CCACAATTTTGTTCGCATGGTATGATTTGATACAAACACTTATTGAGGTG
ACTCTATAATTTACAGAAGAGAACATGAATAAAAAGCCTAATAAAATGTT
TCCCTTTTAAGTGTACTCCGTACCTTAATCTCTACCACCCTGGGTTAACA
TCGGCCTTCTATTATAATCCAATGAATTCCAAATATTTCTGTAGATATCG
GGTTTGATTACTGACAACTTCCAGTTTTTCACTTAAAACGAAAATCTGTC
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agaaaaagcaaagaaaaaagaaaacaatttcatCTTATGGTAAAATTTAG
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TCTTAGTTCCATTTTCAAAGTGCATTGTGATCGATTACGACACCAAACAA
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TCTCCATCCATTCCGCCCCCTCCCTCACTGGCTACATTATTTCATTACAT
TCACtctttcccgggggggggggtacttaggcaaaaataggtgctgggta
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agtctctctaagggtcactttttcactaaaatttggtctctctaagggtc
ggaggtcccgtccgcacatacccctcattcatcaaccctagtaccccccc
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CATGCGTTCTGGATTTGAAATCAGTGGCTTCGGTTGCCACCAAAGGGATT
TTCCTTTAGCCTCTTTTAGGTCttaaagggctctgaccatagtgaatttt
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TTCAACATCAAAAGCGACGTCTTTTGGATCGTTGCTGCAGCCATCCCGGT
TTCTTTGTCAAACCATTTCAGCAGCTACCAtacttacctataacaatcca
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CAATTACGTCATAATTTTCAACCAGTCAGATCgatttgattgttaaggga
agTTTTAGATTATCATGGGTAAGTAGGGTACTTGTCAGAAATCCCTATTT
GTTCTCCTTACAACTTGCTAACGGCCGTTGTATTGATAATAAGTCATTTC
CAGTTTCCACGATGCTTTTGCTACTACAGACAACAACAACTGTGAAATTC
GTCTCACTTCTCCTGTAAAATATGCGTTGCGATAGAACTTGCAGAGTCGC
GTTATACCTAGTAAAGTTTGTTTACCGTCATTAGAATCAAATTACTTTTA
AATACAAGACTATCACTTTCTTTGGTTGTATgtacagtttttttttaatt
ccgaATATAGCTCACTGGATATTGAATATtactgacgaatatgcaatctc
taATTTATAAGGATCACGCTCGTCCAataggactgggaatgacaacaaag
ttgcgtgattgtgttaaAAAATAAGGCGccgtatcaggaaaatttcGTTT
TAggctttccggcgcacaacaagattctcgttgtagaattttccacgaga
ggactattttcctcagatgatcaattttcaagcgccttcagagttTGCCG
TGCTCGTCATCAGTTTAGAGAAGAGtatatgaaatatattttcatttttg
acataATAGGGGTTTAATAGGGGTTTAATACTAGGACAATTGTacaatag
cccccccccccaggaaatATTCCCCGGCCAATTGTGTAAACATAAtctac
tttttttaattttacagtTGACAAGGATTTCTGCAAGAAACCTCCATTAA
ATGGACAACACATGGGCAACAAAGCGGACCCGAAGAACAGACACTATTAC
TACGCATGCGTCAATAGATACACATACCACATGCCATGTCCAAAAGGGTT
GACATACAATGAACATGTAGATGCCTGTAGACGATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:139190..147226+ >XLOC_032341 ID=XLOC_032341|Name=XLOC_032341|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1110bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:139190..147226+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGATAATACAGAACTGAGAATTTTGACGTTAATCTTCTTCCCGAC
AGTCGTGCTGTGTGGACATGGCAGATAATACAGAACTGAGAATTTTGACG
TTAATCTTCTTCCCGACAGTCGTGCTGTGTGGACaatgttttATTCCAGA
CTTCAAATCTGAAGGCGATATTAATTTGATGCAAGCTCTTGAACCATGCT
aatgttttATTCCAGACTTCAAATCTGAAGGCGATATTAATTTGATGCAA
GCTCTTGAACCATGCTGTTTTGGTAGTTCGAAATGCAACACAAGCGAgaa
tcaatttcattttggaaaGAACTTACGTTTATCGGAAATCAAACCGGACG
TCATGCTTTCCTGCGTCACACCCGGTGTTTTCCATTGCACGCGATGTCCT
GGTGGTCTGTTCTTCTCAGAGAAGTGCAATGCTTGTATGGAGTATTTGAA
AGGTTTTGGTAGTTCGAAATGCAACACAAGCGAgaatcaatttcattttg
gaaaGAACTTACGTTTATCGGAAATCAAACCGGACGTCATGCTTTCCTGC
GTCACACCCGGTGTTTTCCATTGCACGCGATGTCCTGGTGGTCTGTTCTT
CTCAGAGAAGTGCAATGCTTGTATGGAGTATTTGAAAGatgAGCAGAATA
TATGTCCAGATGTCAAACCACCCGCAACACCCACTGATACGCCCGACCCT
AGCTatgAGCAGAATATATGTCCAGATGTCAAACCACCCGCAACACCCAC
TGATACGCCCGACCCTAGCTtTGACAAGGATTTCTGCAAGAAACCTCCAT
TAAATGGACAACACATGGGCAACAAAGCGGACCCGAAGAACAGACACTAT
TACTACGCATGCGTCAATAGATACACATACCACATGCCATGTCCAAAAGG
GTTGACATACAATGAACATGTAGATGCCTGTAGACGATAAtTGACAAGGA
TTTCTGCAAGAAACCTCCATTAAATGGACAACACATGGGCAACAAAGCGG
ACCCGAAGAACAGACACTATTACTACGCATGCGTCAATAGATACACATAC
CACATGCCATGTCCAAAAGGGTTGACATACAATGAACATGTAGATGCCTG
TAGACGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000066_pilon | genome | sc0000066_pilon:139190..147226 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 388-555:7870 |
| Aaloc | 322-384:2876 |
| Aaloc | 136-318:2162 |
| Aaloc | 70-132:1015 |
| Aaloc | 1-66:1 |
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