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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000007_pilon:3274224..3281871+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034657 ID=XLOC_034657|Name=XLOC_034657|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:3274224..3281871+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATCAGCTCGGGGTGATATTTTCGTGCAGAATGATTCAGCTTTTGA
GGgtaaaaacaacaaagacaaaatgtGGACAGCATGTTTTGCTGCATTTT
CTGCTGCCCTGGCTACTGTAAATTTTGGATATGCTCTTGGATTCACAGCA
GAAGCAGAATTATCTGAACAATTCAATTCAAACAACTCTGCTATTGATTT
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TTATTACTGGAATTGGTGTGGGTATGAGCTCGCTTGTGGTGCCTGTATGA
GTCTTATTTTAATTAGTTATTTCATTATTCTTGGCTAATATTGAAAAATG
ATTGTTCTGATATAAGAAGGATCATAATTATTGTAAAATTGAagaaacaa
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ACATTTTATTAACCATTCGTTTTACGTTACATGTTCAGGTGTACATTGCG
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GTCAATCAATTTTGGATTTGTTGTAGCCTACATGACAGGATACAAACAAA
ATCTTCCCACAACAGGTTTAAATTTTAATATACCATATTTCCTCTTTTTA
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TTGAATATTTTAGCCAGAAAAAGCTGAGAATGAAACACAAGAGGgaattt
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taataatttttttacaaattatcttcattttttgcAGCTTACGTACCAAT
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TTGTATTGGTTAAGAGGTCCAGACTATCCAGTGGAAgaggaatgttttga
aattgaaggcCATGTTAATTTTGGTATGTGTTACTTCTACTaaaaaaaGG
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TTAGTTATTTTCAGTTCCTACTTCATATTTCATCCACTATCCTTTCTTTC
TTATTAGGCACCCAAGATCAATGGCAATGGAAGGATCTGAAAAGTTCCAC
ATTCTACTGGCCGCTTTTCATTGCACttagtttaatgttttttcAAGAAT
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TCTGGGATAGGTGCACGAGTAAAACCTGAAGATCTAGTTAACTCTAAGAA
GATACTGGAAGCTTTAAAGAATGACTCCAAATTGTATGCCTTGTTTGTCT
GCTcaacacttttcatttttactggAATATCTTGCTTCCTAGTGGACCGA
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ACTGATACCAGTCAGTGTGTATGTTTATCACTACCAATTCAACATGAAGC
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GTATTGCAACTGCCATTGTCACTTTCTCAAACTGGTTATTTGTGTTTACA
ACGACTTCATCTTTCTGTAAAGTCATTTATGGAATCCATATTTATGGTAC
ACTATGGACTTTTGCAATCATTGTAGTTATGGGTTTCTTTTTCACGCTGT
TTTTTGTCCCTGAAACTCAAGGTCGACCACTGGAAGAAGTAGCAGAACTT
TTTATAAGACGGAATTTGCTGCAGGTCAGCATTCCATGGACCAGACACGA
TGCattataatcaatttttttttaagttgctTGAAGTTGCAGACAAATCC
TTacaataattcaaaaatttgatacaGGATACACTGCTTCAACTTTACCG
TCCTATCtaaaagacaaaatattttttaacaaagattttCGTACTGAAAA
CATGCCTTAAGGGAAGAAGATTTGTAAACTCTAGTCAAAATTGAAAGATT
CTTTCAAGACGAACAAAAGAAGATTGCCCAAAAATTCTTTGATTTGAATa
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atatattttgtgttcttttgaagattacttgtttattttaatatcttttt
ataagattctttttttattgaaattttgtaacattttacattaaatttga
attattatAGTATAGTCCTGACAAAGGTAATGGTTTATTTAAAAGAACAA
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AACAAAGAAGTCTTTTTAGAGTAAAGATTAACACTAAGATTAACAATTta
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TTAACACACCtgccttttaaaatttcatttttctaacgtttttctactct
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GGGAACTGGCACTAAGAGGTCAACCTTAAAGAAAAGTTATTACAATAATG
GCATCAGCTCGCGGTGATATTTTCATACAAAATGATTCAGCTTTTGAGGG
TAAAAACAACAAGGACAAAATGTGGACAGCATGTTTTGCTGCATTTTCTG
CTGCCCTGGCTACTGTAAATTTTGGATATGCTCTTGGATTCACAGCAGAA
GCAGAATTATTGCTACAGTTTAATCcaaattttaatgtaaattcaacaaa
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TTGCATTAACAACAGCAGGTAGTTGGTCCATTTTTTCTTCGATTAAAAAT
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GGGCGCTTTAGCAGGTGGTCTAATGGGCGGCATACTAATCGATAGAATTG
GACGAAAGGCAACCATCATCTCAACAAGTATCTTCTATGGTCTTGGTTGG
CTTCTGATTTCATACAGTTACTGTTATCCCAAGGGTGCGGAACCGACACA
AACCTGTGAAAACCATTCTCTAAACTATTATTTGAGTATGGTGTACACTG
GACGAGTGATAACTGGCGTTGGAGCTGGGATGAGCTCCTTAGTTGTGCCT
GTAGGTTTTCTCTTACAATAACACAAATAGCTCTATATCTGATAAGAAGT
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TTATGATATGTACTTCAATATGTATCTGATTATGTACACAAGCATGAATA
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GGTGTATGAGATTTAGTcacttttaatatttttatccccataaTTGATCT
CCAaagttttctttattaaaatatcacaaaagattttttctttactCCAT
GTTCAGGTGTACATTGCGGAAATTGCATCAGCGCGCATGCGTGGAGCACT
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TGACAGGATACAAACAAAATCTTCCAACAACAGGTTTTGTACTATTGCCA
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ACAGCTGAGGTCTAGTTATGCCTGTTGAATTATGTCTACCAAACATAATA
CTCAGTTCAAACTGGAGGTCAAGGAAATGTAACTTTTGCATACTTTACCT
TTCAGCATAATTTTCATTCTTACAATTTATTTTAACTGAACCAGATTCCA
AATTATATTCACAACAGCTTACGTACCAATCGGAATCTCAATTCTCAACC
TTATTCTGATGGTTTTCTTCTTACCTGAGACACCGCGATATCTTTTGGCA
AACAACAGACGACATGATGCCATCCTTGCGTTGTATTGGCTAAGAGGTCA
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CTTGAAGAaaggattttgtttttttcctcaAAGAGTTCTTTGATATCAAC
TTTTCTCCAATTTTAGGCTAAGGGTTTTTTCTTAGACTACaatcccttct
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CAAAAATTGATGGGATtgattttcctatttttctaatggctggggatttg
aattcgaTTGTTTGCGAGCCAGAGatctcagtggggatagaaaaagtagc
ataatattttgtacTAAGGATTTGCTtaacactcttttttttataagcaa
acgGGAAATTCAGGTCAAGGCTCAAcatgcttagcaaaatctcattttca
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tttgggtttaagaaaattttgtatttttaagtgGGAATTGATTCAGCTCA
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TCCAAGAAAGCTCAAGCAGCTTTAAAAGcaaccctaaaaaggtcagcgCT
TTAGAAAAACTGCactaatttttgcatttcagcttggaggtatgcttGGA
ATTATGCTTATTTtcaacggggacaaaaattagagtataattttccactg
gggacgatattttggccaatttttcaggTGGGAAGgtgtcccagtgggtc
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TGGTTAACCTTAAcattaaatgaatattttttcaggAACTCAAGAGCAAT
GGCAATGGAAGGATCTGAAAAGTTCCACATTCTACTGGCCGCTCATCATT
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ATTTTACTGCacctcaattttttttgcttctgGGATTGGTGCTCAATTGA
AACCTGGAGATACCCATATATTGGATACTTTGACAAAAGGCTCAGAAGAA
TATGCAATATATGTGTGTTTCACACTGTTCATTTTCACCGGAATTTCCTG
CTTTTTAGTGGACCGGTTTGGACGCCGAAAACTCCTCTTATCCGGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:3274224..3281871+ >XLOC_034657 ID=XLOC_034657|Name=XLOC_034657|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2934bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:3274224..3281871+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATCAGCTCGGGGTGATATTTTCGTGCAGAATGATTCAGCTTTTGA
GGgtaaaaacaacaaagacaaaatgtGGACAGCATGTTTTGCTGCATTTT
CTGCTGCCCTGGCTACTGTAAATTTTGGATATGCTCTTGGATTCACAGCA
GAAGCAGAATTATCTGAACAATTCAATTCAAACAACTCTGCTATTGATTT
GTCAATGTTGAATGGGAATTCATCCAAAGGTTTCTCTATGTGTGATcctg
attttgatatttttgcgATGGCATCAGCTCGGGGTGATATTTTCGTGCAG
AATGATTCAGCTTTTGAGGgtaaaaacaacaaagacaaaatgtGGACAGC
ATGTTTTGCTGCATTTTCTGCTGCCCTGGCTACTGTAAATTTTGGATATG
CTCTTGGATTCACAGCAGAAGCAGAATTATCTGAACAATTCAATTCAAAC
AACTCTGCTATTGATTTGTCAATGTTGAATGGGAATTCATCCAAAGGTTT
CTCTATGTGTGATcctgattttgatatttttgcgtCAGTTGTGGCACTAG
GCGCTCTAGTTGGTGGTCTCTTGGCTGGCATACTGATTGATAAGATTGGA
CGGAAAACTACCATTATCTCAACAACTATTTTCTACTTTCTTGGATGGGT
TCTCATTGCAAACAGTTATTGTTATTATGGTAAGCACGGAGGCATTGGTG
ATCCAGAATTTTGTCGAAAACACTCAAAACAATGGTATTATAGCATGCTG
TATTGTGGACGTGTTATTACTGGAATTGGTGTGGGTATGAGCTCGCTTGT
GGTGCCTtCAGTTGTGGCACTAGGCGCTCTAGTTGGTGGTCTCTTGGCTG
GCATACTGATTGATAAGATTGGACGGAAAACTACCATTATCTCAACAACT
ATTTTCTACTTTCTTGGATGGGTTCTCATTGCAAACAGTTATTGTTATTA
TGGTAAGCACGGAGGCATTGGTGATCCAGAATTTTGTCGAAAACACTCAA
AACAATGGTATTATAGCATGCTGTATTGTGGACGTGTTATTACTGGAATT
GGTGTGGGTATGAGCTCGCTTGTGGTGCCTGTGTACATTGCGGAAATTGC
ATCAGCGCGCATGCGTGGAGCACTTGGAAACATCAATCAGTTGTCAATCA
ATTTTGGATTTGTTGTAGCCTACATGACAGGATACAAACAAAATCTTCCC
ACAACAGGTGTACATTGCGGAAATTGCATCAGCGCGCATGCGTGGAGCAC
TTGGAAACATCAATCAGTTGTCAATCAATTTTGGATTTGTTGTAGCCTAC
ATGACAGGATACAAACAAAATCTTCCCACAACAGCTTACGTACCAATCGG
AATCTCAATTCTCAACCTTATTCTGATGGTTTTCTTCTTACCTGAGACAC
CGCGATATCTTTTGGCAAACAACAGACGACATGATGCCATCCTCGCATTG
TATTGGTTAAGAGGTCCAGACTATCCAGTGGAAgaggaatgttttgaaat
tgaaggcCATGTTAATTTTGCTTACGTACCAATCGGAATCTCAATTCTCA
ACCTTATTCTGATGGTTTTCTTCTTACCTGAGACACCGCGATATCTTTTG
GCAAACAACAGACGACATGATGCCATCCTCGCATTGTATTGGTTAAGAGG
TCCAGACTATCCAGTGGAAgaggaatgttttgaaattgaaggcCATGTTA
ATTTTGGCACCCAAGATCAATGGCAATGGAAGGATCTGAAAAGTTCCACA
TTCTACTGGCCGCTTTTCATTGCACttagtttaatgttttttcAAGAATT
CAGTGGCACCCAAGATCAATGGCAATGGAAGGATCTGAAAAGTTCCACAT
TCTACTGGCCGCTTTTCATTGCACttagtttaatgttttttcAAGAATTC
AGTGTGGACCGATATGGACGCCGGAAACTCCTCCTATCCGGTAGTGTGGG
AATGTTTATCTCACTGATACCAGTCAGTGTGTATGTTTATCACTACCAAT
TCAACATGAAGCAAATAATTGATTTCTtatcaaaacaagaaaacacAACA
TATGCCATTTTAGCTTTGGTGTGTATACTCAGTTTTATTGCAATGTTCTC
AATTGGATGGGGTCCGCTGCCATGGTTACTCATGTCTGAATTATTCCCAA
TCAAGACAAGAGGTATTGCAACTGCCATTGTCACTTTCTCAAACTGGTTA
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TATTGGACCGATATGGACGCCGGAAACTCCTCCTATCCGGTAGTGTGGGA
ATGTTTATCTCACTGATACCAGTCAGTGTGTATGTTTATCACTACCAATT
CAACATGAAGCAAATAATTGATTTCTtatcaaaacaagaaaacacAACAT
ATGCCATTTTAGCTTTGGTGTGTATACTCAGTTTTATTGCAATGTTCTCA
ATTGGATGGGGTCCGCTGCCATGGTTACTCATGTCTGAATTATTCCCAAT
CAAGACAAGAGGTATTGCAACTGCCATTGTCACTTTCTCAAACTGGTTAT
TTGTGTTTACAACGACTTCATCTTTCTGTAAAGTCATTTATGGAATCCAT
ATGGATTGGTGCTCAATTGAAACCTGGAGATACCCATATATTGGATACTT
TGACAAAAGGCTCAGAAGAATATGCAATATATGTGTGTTTCACACTGTTC
ATTTTCACCGGAATTTCCTGCTTTTTAGTGGACCGGTTTGGACGCCGAAA
ACTCCTCTTATCCGGTAGGGATTGGTGCTCAATTGAAACCTGGAGATACC
CATATATTGGATACTTTGACAAAAGGCTCAGAAGAATATGCAATATATGT
GTGTTTCACACTGTTCATTTTCACCGGAATTTCCTGCTTTTTAGTGGACC
GGTTTGGACGCCGAAAACTCCTCTTATCCGGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000007_pilon | genome | sc0000007_pilon:3274224..3281871 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1312-1476:7484 |
| Aaloc | 1060-1308:2141 |
| Aaloc | 955-1050:2045 |
| Aaloc | 856-951:1760 |
| Aaloc | 670-852:1390 |
| Aaloc | 541-666:939 |
| Aaloc | 268-540:472 |
| Aaloc | 1-267:1 |
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