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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000366_pilon:161026..170390- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014250 ID=XLOC_014250|Name=XLOC_014250|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9365bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:161026..170390- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCTACTAATTGTGTTATTTATTTCCTTTCTTACTGAAGAGACACTGGC
CCAACAAGGAATACTGGGTATGACTTTTTTTGCATTTATTTTTATACCAA
AAGTATCCCCCCACGCCACCACCAGCACCATCAACAATAAAATTCTGAAA
ACAGCATGCTCCAACTGGAAATAGAAATTTGTTCTAAGGAAATTTGGTGA
CCTGGAAAGTGTTGATCTGTTTCTAGTTAGGTATTGGATATAACAGGATG
TACCGTGAAGTCGGGTAACTTGCATAGTAGAAGCAGGGGGGGTCGGTAGT
AAAATCTCAGACATATATGAGTAGTAAAAGGATTTTTATGAATTTTTACA
TACCACCACCCAGACTCTTGGAAGAGGTATTTTACTAACCTGGTAGTAAA
AGTTTTTGGGACAATTTGTCATAAAGACCACCTAATTTTGGTTGCTTTTC
GCACTGATTTTACAAAAAAAGCTAAAAAATGATTATTTCTGTGACACATT
TTTCACTTTGTGCAAAAATTAATGTTTTGCCCTTAGAATTAAAGTCTTTT
TTATATTGACAAAAATCTCGAAAATTTTTTGTTTGCAGCCAACAACTTTC
CAACAGAAAATATTTTCAAGTTATAAAAATTTTCAGATTTTTTTCAGAAA
AGTCATCCAAAAAATTAAAAGAATTACAAAAATAGCTAAAATTTGCTAAT
TTTACCAGTTTTAACTACCCAGGTAGTAAAATTTTTTCAACATTTAACAC
ATAGATACCACCCATTTTAGTATTTAACTACCCTGGGTAGTAAAAATTTT
TTTCGATTTTTCGTCACACCACCACCGTAGTGAACGTCATTATGTCTGAG
ATTTTACTACCGACCCCCCCCCTGGTAGAAGAGGGAAATTTGCATAGCCA
TCAAATGACTGACCAATCAAAGCAGCAAAATTTCAAAACAAATGAACTAC
TGTGAGATTGGGTAACATGCATCAGTGGAGCGGAGGCTAACATGCATCAG
TGGAGGCTAACATGCATCAGTGGAGGCTAACATACATCAGTGGAGGCTAA
CATGCATAGCTCTCAAATGAAAGACCTGGCTGGTCATTAAAATAAACTAT
ATTCAGCTCTGCTCACAGCTCTACTCTACCTTTTTTGTTTTGATTTAACT
TTGTATTTTAATGACCAGCCAGGTCTTTCATTTGAGGGCTATGCATGTTA
GCCTTCACTGATGCAAGTTACCCACTCTCACGGTACACAGCTCTGCTCGC
AGAGGACCCTGCCGATGCACCGGACTGTCCGGTGTATTGGACATGTTCAT
AAAACATAGGGCGAAAGTTTACACATTGAAAAATGGCTTTTTTACATTTT
TATCAATAACTTGGTAAGTATTGCAGTAATCTTGCTGAAAATTGGTGAAA
ATGACGATAATGATGTAACAAAAAGGACTGCATCAAAAAATTTCAAAAAT
ATACTCCTCAAACAAGGAAAATGATAAAATTGTAACTTTGTTACTAAATT
ATCAATTATTAAGGTTCTAATGGATTATTTACAATTCTGTAAAAACAAAG
ATAATTTTGAAGCATTGGTAATGTGGCAGTAGCTTTAGGCAAGTAATGTA
ACACCCTTCCTGAAAAGATATGGGATCAAAAAGTAACTGTTACTTATTTA
TCAGGAATTTATTTGATTATTGGAAAATAAACCAATGTTTCAGTTTTAGC
AATGATTTGACTTGCAATTTAAACTTATTGCAATCAAGTAGACCCAAACC
ATTTCCTTGAAATTAGTGATAAAAATGTACAAAATTTAAATTTCAAACTG
TTACAGTTTTATCATAAAACCATTTTCAGCAGTTTTGAAAAGCTAGAAAC
ACTCCTGAGTTACATTTTTATCATCTGTGAAAGTTTCATAGTAAAATATG
CATTACTTCCAGAGATATTATGTACTTATCATTTTGGGAAAATTTCCAGT
TGTTACATTTTTATCATTTTTCTTGCCTGACTTTGGGAGCTAATATCTTA
AGCCTCGCTTATTATTTAGAAATCTAACCTGGGCAGTTACAAAATATCAT
CTATTTACAATTGAAAACCAAAGTCTTTTGTCTTGAAAAGAATGAGAGAT
AAATCAGTAACAAATTAAAAAGCCATTTTTCAATGTGTAAACCTCCGGTG
TCAGTCCGGTGTTGCATACAGGGAATTTTTGGACGCCGGACATTTATGAA
ACAAAAATTTTTTAAGAAACACCCGGCGCACCACCGGACTGGTCATGTCC
GGTGTTTTGATTGTCCGGTGGGAAAAAATATCTTTCTTCAACACCGGACA
TCCGACTTCCTTAAGTCCGGTGTAGAAATTGTCCGGTGGTGTAAAAATTC
TCATTTTACACCAAACTTTCGCGTGTCTGGTGTTCATTAAGTCCGGTGCG
TTGGCAGGGTCCTGCTCGCAGCTTTTCGCTTTTCTCTACCATTTTTGTTT
TAATTTAATTTGTATTTTAATGACCAGCCAGGGGTCATTCATTTGAGGGC
TATGCATTTTTGCCTCCACTGATGCACGTTACCTGATCTCACGGTAAGTC
AAATCTTTCAACCTGTGCTGCCGACTTAGACAAGAGTTTGGTTATATACT
ATCAGCTAGGGTTAGGGTTGCGTTGGAGGTTTAAGGTCTGTAATCATCAT
TTAGTTTTAGTGTCGTGTCTTATGTTCTCGTTAAGACAAACCATTTATGC
ATTAGTTAGGGTGCCAAAGTTGCTTGCATTTGGTGGTATGCAGTCAGTAA
AAGTTTCCTGATTAGGAAATTATTTCTTTAAAAAGAAATTCTACTTTAAT
TGGATTATTCTTTCTCGAGATTAAATTTTGCGATTTAAAATTTTTTTGTC
ATTTTCGCGAAATTAAAACTCACAAAAATGGGTGAGATTTCTAACTCGCC
AAATTAAATTCATTACAAAACTTTTTTAAATCACATTTTCGGCGGAGAAA
CCATTTCAAAATCACCAATTGTGGTAAAAAATGGCTGTTTTCAAGCTGAT
TTCAACTGATTACAATGAAAATTGAACATAAAATTCTCAAAACTTTCCGT
TCTCCTAAACGACTATTTCACAGGTATGAGAAGATTTTAGAAAACAGCTA
GAAACATTCCAGCCATATAGAAGATTAAATAGAGACCCATCACGAAGGAT
GATATTGTTTGCCAACTAAAAAACTTCTACCTTGAAATTGAGGATTGTGC
AAGGGCCCGAAGGGCCTGTAGTGCAATCCAGATTTTATAAGATAAAATCG
AAGCCAAAGATAAATACTGGAAATCCGCTATGACTCGCAAGAAATAAATG
AAATCGCTCAAATAAATGAAATTTATGAAAATGAATTAGAAGTTAGGCCT
ACGGCTTCGATCCTATCACATCATCGACCCCATAACAAAATGATAATACA
GAAATAGAGCTTTCGAGCACAAAACAATCTGTGATTATAGTGTTAGGGAG
GGCTTGGTGGGCAGTATTTATCTTTGGCTTCAATTTTATCTTATAAAATC
TGGATTGCACTACAGGCCCTTCGGGCCCTTGCACAATCCTCAATTTTATG
ACGATAAAATCTCCGCCAGATAAATACTGGAAATCCGCTATGACTTTTAA
GAAATAAAAGCCATAGCTCAAACCCACATCGACCTCTCTTCAAAGCCCAA
AGTAGAATAACCATCTTGTTCCACACAAAATTGAAGATTAATACACGCGC
GACACTTTTTAAGTTGATCCGATAACTCCTCCTATCTGAGACCTCAAATA
CTTATTTACAATAATAATGACCTTGTTGCCGAAACTCCCGTACTAATTGT
TCAAGTGACTCCCTTCGGGCACTTCAATTCGACTTAATATTTGCAAAGAA
AAGCAAACTTGTAGCCTTTAAAGGTCAAAAGAAGTCCAGGGAACAGGGAA
CCAAGACAAGACTACAGGAGAATAGGAAATTGTTTACTATGAATCCATCT
GCCTGGACTTTGGAAAGTCAGGGAAGATTCTACAGGCTGTTGCTGTCAAA
CAACATGTCCTGTCATTGAAGACGCAAGTATCATCGGAATTTTTCGAGTC
TATATTAGTGGGAAGCTACAACGGCAAAATTTACTACCGGTAACTCGATT
AGAGTATCTAGTACACGAATAAATGTGAAATCAGTGGTATGCATCGCTAA
GTACTATACCTGTATGTATACATACTACTAGGGCCTGTCTTGTAACAATA
ATCATCTTAAACACAGAACTTACGAAGTACTTCAGATCGGCGACGAGAAC
AGCCCAATGGAATGTTAGATGACGTCTAAATTATAGGCCTTAGGTAATAC
CTGGATTCCAGCCAAATTTTTACAGGTGTTGGATCAGGAGCTAGAAATGA
AACTTTTTCCAACCCAGAGACCCTCTAACTAGAGTTAACTATCAAGGACT
GTCCTTTATCAATCTATATAGCAACAATCGAGGGACAGGACAGGACTCCC
ATTATAAGATAAGAAATCTCAAAGTAAGAAAGAAATGAAATGCATATATT
ATTTCTGGAAAAAAAATGTTTCTTCAGAAAAAATACATATTTTGAATATG
AAACATTCAAAAACTTTAATGAATCACTAAAGATAAATCCACGTTATGGA
AACAAGAATAGCCATCCAATATTATTGGTTGAAGCCTCAATGCTGCATAC
ATAGAGTTTTGTCATGTTAATGAGTCGCAACTCAAAGTGTACCAAATAAA
TGACAGTTACGTTGGTTGCAATGCATTATCAACAGACTGAAAATGTTCAT
AAAAGTCATGTAAAACTCATTTTGGAGAAAATCTACTTTCAGGGTCCATA
TATGAACTCTCCTATCCATCAGTGAGAGACATAAAATTGAATCATATGAA
CAAATTTGTATTCAACCATACAGGAGGTACGGGATATGACTTTAAGGTTT
TAACCTGAAATCCTTTAACTATCCATCTACTAAACAGGAATGTAGCAACA
GTTCTGGAGCAAGTTATTCTCGTGAACATTACAACACTACTCAGTGATTA
TACTACTCAGTGATTGGTGGTAGCTAAGTGTTCGACCCACTCAATTATCT
GGGTTTAGAGCTAATAGTATCTTGTCTAGTGCATCTGCTTTGTTCTTCCT
TTGTTCCCGTCAAAGTTAATATGGATATTTCTTTCAGCTGTAATGGTTGG
TACAAGGTATCCTCTTCACCTACAAATAATCAAAGAAGCTTTATGTACAG
TACATCTAATCACATGACTGAATAAAACTCAGTGATTCTCATCTCATGGT
ATTGATGTTGATAGTAAACAATCCACCTATCCCATGGACATGTATGTGTG
AAAAATAAAGCTTCAAGCCGCATCTTGAGATATAATAAATAATTTAGTAA
TCCTCAGTCTATTGAAGGTGCAAAAATAAATTCATATGTGAAACTTGCAA
CATTCTGTTAGTTGGAAGATCGTTATCGAACACTGGTATAATCAGAAGCA
GTATTCACTGGGTCTTAGAATGCCTAGAAAAAATATGTGAAAAACAACAT
TAAAATCAAAAGTTAATGTTGGTAACCTTGCCAAAAAATATGGAAGGGAA
AGAATCTTTTTTGTGTATTAAGTTCAAATCATCTGCAATGGCAGACAATT
GAAGGGTAATTTAAATGAATGTTCATATCACCCCCATGCAATGAGAAAGA
GTTATTTGACATCGACAGAAGCAATAAATGTCAAATAACGTCAACCGAAG
GAGAAAGAAATCCTTGAACAAGTACTGAGTATTGCAAATAGTATTTCTCG
ACTCAATTCTTATCAAGAAAGGAAGAGGTAATTTTTAACCAATCTACCGG
GCCATAGGTAACCCAAATTTTAAGGATTTGGACAGAAACTGCAATAAACA
GATATCTACAGTGCCAGATTAACACTTAAGGATGGTATTTAAACCATATC
ATATGTATTGAATCCGGTCCCTTTATATTTTATAACAGAAAAGGATTGTA
TCAGTAAATTTTTACACCCCATCTTGATTTTTACACCCCAACAATTTGAT
ATGGAAGAAAATTAATTTTAATTTATATAAAAAGAAATTCAAGATTGGGA
ATTTTTATGTAAAATCTCTGTCAGGTAATTACTGCAAGATCTTCAACTTA
ATTCAACTAATATAGAAATTTTTTATTGTATTGTTCCTCTCTGTCACATA
TTGACAGCAAGGTAAAAGAAATTCAACTAGTTTGACATTTTACTGTATCA
TCCTCATCATGTAATGACAGTGAGGCTCCTAATAATGATACAAATGGTAC
AAGACATTCAACTAATTTGAAATATTGTACTGCAACAGCCATCCCTCTCT
GTCATATTGACATCAGGGTCTTTATCATGATAGTATAAATTAAAACTGAT
ACAGTACTGGATATTCTTGATTTGTTCCTCTCTCACTCAATATGACAACA
AAGGTCCTTCATAATGGTAAAAGAAATTCAACTCTCAGAAAACAGAATCG
TATCAGCTCTCTCTGTCACTTAACGACAGCAAGTTAATCTATAATGATGA
AGAGTTTAAACTATGAACTGATCAAAAGTACTTCTCAATATTCCTCTCCC
TGTCACGTAATGGCAACAAGGTTTTTATAAGTAGTAAAATGAAAACCACT
AGTCTGAAATGCTATTGTATCAGCCCTCTCTTTCTTTGTCTTGTGATGAC
AGCAAAGTTCTTTACGATTATATACTATATAGAATCTCTCTGTCACGTAA
TGGCAGCAAAGTTCTTTATGATGATATACTATATAGAATCTCTGTCACAT
AATGACAGCAAAGTTCTTTATGATGATATGCTATATAGAATCTCTCTGTC
ATGTAATGACAGCAAAGTTCTTTATGATTGTATACTATATAGAATCTCTC
TGTCACGTAATGGCAGCAAAGTTCTTTATGAATATATATACAATATAGAA
TCTCTGTCACATAACGACAGCAAAGTTCTTTATGATTATATACTATATAG
AATCTCTCTGTCACGTAATGGCAGCAAAGTTCTTTATGATGATATACTAT
ATAGAATCTCTGTCACATAATGACAGCAAAGTTCTTTATGATGATATGCT
ATATAGAATCTCTCTGTCACGTAATGGCAGCAAAGTTCTTTATGAATATA
TATACAATATAGAATCTCTCTGTCACGTCATGAAAACAAAGTTCTTTATG
ATGATATACTATATAGAATCTCTCTGTCACGTAATGACAGCAAAGTTCTT
TATGATGATATACTATATAGAATCTCTCTGTCACGTAATGACAGCAAAGT
TCTTTATGATGATATACTATATAGAATCTCTCTGTCACGTAATGACAGCA
AAGTTCTTTATGATGATATACTATATAATGAATTCCACTAAATGGAAATA
CTATTGTATCAGCCCTCTCTCTGTCACATAAATGACAGCAAGGTGTATCA
GCCCCTCTCTGTCCCGTAATGGACAGAAAGTTTCTTGTAAAGCCTGTCTT
GTGATAATCTAAGACTCTTCATGCTAATGTTCTCCTAACCCCATCTACAA
ACTAGGTGAAGGGTGATTTACGACCACAATTAGTGCTAACTAAACCAATT
TTTGAAACAAACAAATATTGCTTGGAGTTATGTTGCTCTATCTAGTATCC
ACCGAAATATGGAACATTAATAAGCATTTAATCCCCTATCGAGTAACGAT
AGAAAGAAAAGTCATTAAGCTCACTGCTTCAAATAGCATGATTCATACGA
TAAATCTAGATTAAAAATCATAAACATTATTACTTACATTTGTTAGACAT
CTTGTTTTTTATAGCGAGAAAGCGAAATGAGGTCGATGTGGGTTTGAGCT
ATTGCTTTTATTTCTTAAAAGTCATAGCGGATTTCCAGTATTTATCTGGC
GGAGATTTTATCGTCATAAAATTTAAAACTGTTTTTGAGGTTGACCTGTT
CTGATCAGAGAGAGTTTCCTCATTTTCAAACATTTTAAAATTTGTTTTCC
TACAAACCAAGAGAAACAGTTTTTAACCTAAATCCAGCTAAATCAAGGAT
CAAATTAAATGATCAAAATAAAAATTTCTGGCCATTTAATCAAATAAAAG
GATCTTATAAGCAATTTGTATCAAAAAAATCTTTTTAACTCCTATAATGA
AGGTTTAGATTAAAAAGATATTTTACATACTATATACATCCCCTTAAGAA
AGCTCAGTTTCCCTGCTTTGTTTAACATATAGAATTGAATGAACTGCAAT
CATGGTCAAAATAATTGAGAATCCCGGATCAAGATTTAAAGTTCCGGCGA
GAAAGTTGATTTTGGGCTTCCTTTCTCTTTAATTTAATCAAAGTTTTCAA
TTTGGGATGGGTTGGCAGACTTCTAGGCTATATTCTGAGCCTTATTGGAC
TGTTTTTGAAGGTCCTAAGTCTAGCGTTAAAACTCTATCCTTCAAACCTA
CTTTAGAGCACTTACAAATCGGTTGTGGTTTCAAAACTTCCTGGGGAATT
TCCCTTTTTTCTCAAATATTATTTTTACCTTGATTGTGCTCTATCAAAAA
TGTTGCTCAAATCGAACATCAGCGTTCTTTTGTGTTGAAATAGTCGGCTA
ATAGTAATAAAAACCTTTCTTTTTGAAAGCCATTGGATGTTGATATTCAA
TTAATTGGTGTACCTTAAGTGGATAAATTTTCGCGTGTACTAATTTTTGC
GAGGTGAGAATTTAAAGATTTCGCGTGGATTAAATTTTGCGAAAATGGCC
TTCTTTATTTAATTTCGCGACTATACAAATTGTAACTAGAAAAGAGATGT
GTGTTTTTAATCAAACAAAGACAGACAAAGTCACTCAAAAGCTTTCAAAA
AACTTCAAAGAAAGTACTTTTAGGAGGTTACTAGAGTTTAAAATTGAAAT
GATTTCTTTCTTTCATTTCGCGAATTTTTTTTTTCGCGATTGTAAAATTC
CAAATAATTTCTTGTGGTCTAATTTTCGCAAATCAATGGCCTTCAAAATT
TCTGCGTGGACTAAATTTCGCGAAAATGTCCAAAATTCGCGAAAACCGCT
TTTATACGAACCCCTTTTATATGATTTTGCATGGCTTGTTTTAAATAATG
TCTATATATTTCCAATTAGGTTTTACCATCCAGCCACAGGACAGAATCAT
TATTTTGGGAACAAGAAATGTGTCCATTCCATGCAATGCTACAAGCAATT
CAACAAGTGGAACAGTTATTATTCTTTGGAAGCATAACCAAACAACGATA
ACCGATTATACCAATAAACATTTTATGAAAGACCAAAATGGGTCTATCGT
TTTTGAGCAATTTCTACAAAGAGATGTTGGTACATATCAATGTGTTGCTA
TTCTTTACCGTGAAAATATTAAACAAAAGCAAATAGAAAGCCGCTTAGCA
AGAATTCAAGCTGCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000366_pilon:161026..170390- >XLOC_014250 ID=XLOC_014250|Name=XLOC_014250|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=726bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000366_pilon:161026..170390- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCTACTAATTGTGTTATTTATTTCCTTTCTTACTGAAGAGACACTGGC CCAACAAGGAATACTGGATGCTACTAATTGTGTTATTTATTTCCTTTCTT ACTGAAGAGACACTGGCCCAACAAGGAATACTGGGTTTTACCATCCAGCC ACAGGACAGAATCATTATTTTGGGAACAAGAAATGTGTCCATTCCATGCA ATGCTACAAGCAATTCAACAAGTGGAACAGTTATTATTCTTTGGAAGCAT AACCAAACAACGATAACCGATTATACCAATAAACATTTTATGAAAGACCA AAATGGGTCTATCGTTTTTGAGCAATTTCTACAAAGAGATGTTGGTACAT ATCAATGTGTTGCTATTCTTTACCGTGAAAATATTAAACAAAAGCAAATA GAAAGCCGCTTAGCAAGAATTCAAGCTGCTGTTTTACCATCCAGCCACAG GACAGAATCATTATTTTGGGAACAAGAAATGTGTCCATTCCATGCAATGC TACAAGCAATTCAACAAGTGGAACAGTTATTATTCTTTGGAAGCATAACC AAACAACGATAACCGATTATACCAATAAACATTTTATGAAAGACCAAAAT GGGTCTATCGTTTTTGAGCAATTTCTACAAAGAGATGTTGGTACATATCA ATGTGTTGCTATTCTTTACCGTGAAAATATTAAACAAAAGCAAATAGAAA GCCGCTTAGCAAGAATTCAAGCTGCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000366_pilon | genome | sc0000366_pilon:161026..170390 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 70-363:295 |
| Aaloc | 1-66:9366 |
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