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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000042_pilon:1931557..1937670+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037278 ID=XLOC_037278|Name=XLOC_037278|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6114bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1931557..1937670+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggcagcAAGACCAAAGGGTTACGGATTAACTGCTGAAGTCAGAGGAAA
AATTGATGGCAAATATGATGGCGAATTAGGTAAGTTGAATCTCATACTTC
ATACAATTTCGAAACGTGTTTTATTTTAACTTCTTCCACTCAACTACCAG
TCAGAGAattccctcaattgcggtatactgtAATCGCGGGAAGAAATAAC
TACCGCGATTGAGAGAATTCCTCGACTGACAACTGTTTTATCGGAGCACC
ACTAATAATAACCACCACTGCCAAATTTTATCAATGAGTAACCTGCTAAA
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GGTATGATACCAATATTGCTCCTTTAGCCATCTCTATCTGCTATTGAAGT
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CGTTTTATGTAAACTCATCAATGCTATCGAACCTGGGTCCATTAAAAAAT
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TTAGACGCTATCGACCAGTACGGTGTTGCGAAATCAGATAGTTTCCAAAC
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TTAAATGCTCGTTATAAAGCGAGATGTggtatcaaaataaaaacctGCTT
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tttctcagagttttccatattttttccaaattccctTACGAATTACCTTA
CGAGGGActggttttttttattttggtgtttttgcggtttttgcgaccct
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ggttcttataaaaaaggtttccatgaagaaaattaataatcaaaaagttt
taacattttGCGGTTACACGCAATCTTATAAAACACGTTTAACCAAAATA
TAACCTCAGCCctctctacacgttttttagataagaacatccagaatctt
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tttttataaaaaaacgtggaTTCACACATTTTCTCTcactattcttttgt
ttttattgccaGGGAATAAGTATATGTAAGAACCTTTTTTGATAACGCAA
GAATAATGCTAGATGTATCAAATCGAATTAGATCAAGATATAATTGTACA
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ATAGAAGGGTGGGTTATGATTTTTCAAGCCTTAATTTCTCAAATTGTTTA
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TGAAGAAAATTATGATGCTTAAGTTTCAAAGATGAAGTGCTTTTTACAGT
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CTGTCAGTGCTATACAGTGTAACTTTTTACTTCTGATTTCGTGGGAGTTT
GCGATTGATGACAAGCTTAAGTAGGTGATGTATTAGTTGTTTTGTGACGT
TTTTTAAAGATGGTCTCAGACATCTTTAATATAGTAATGACGTGTCTTTT
TTGCTCGTTAATTTTTCAGTATATAAACAGTTGTAATTTTGAGACAGCCA
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ATAGTTATTTATTTCTCATacacaaaatatttatttgcacaTCAGTATGG
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tttgaatttccaTCATACGTTCTGTATTTATtttctacacccctgtctca
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TCTGTACAACAGGGGtttttttATTAACCTTATCGGCtttttttACGGCG
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ATATAACgcaaaaacttgtaaaaatcgctattcaggcttcaaaacagtaa
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GGGTAAAAATTGCataattttggccctttttacaacAGCCCCTAGTACGG
CACGagcaaaaataacgccaataagggccggcgtaaaaagggccgataag
gtatttcgACACCACtactaatagacgatatcggctttccgaattctccc
cgaatgattacccatgaTGCATTGCACAAAAAAATTCACGGACAATATTA
ACTTCCCGTGAATTTTTTGCGCAATGCATCATtcatgggtaatcattcgg
ggagaattcggaaagccgatatcgtctattggcaTATAAATGCAGAGAAA
ATAAAAGGAACCTTATTAGACCAAAATAGACTTAAATTTCTAAAATGCTT
ATTTCTTCTCTGTAATTGTACAAAATAAGTCCAGCAGATTGGCCTCTTTT
TATTACCCTCTACGACCTTAAACGGTGAAGTTGATGGAAATGGACGGATg
gtaataatttttattattcattTCATATTTACAGCACGTGAGGCCATGGA
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TTAAACGCTCTCACGCCCTATTCTATCAAGAAATTTAACACttcaaaaat
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ATTATGGTGTTTCGAAAATAGATCTCTTTCAAACGGTGGATTTGTTTGAA
GGTCAGAACATGGCCCTCGTCATAACCACCATCCACGCTTTAGGAAGAAA
AACTGGCGGTAAAGGAAAGCGTGGTATTGGTCCAAAAGAATCACAACAGA
ATAAAAGGGAATTCAGCGAAGAACAATTACGAGCTGGAGAAGGTGTTATC
GGACTTCAAATGGGAACAAATAAATTTGCAAATCAATCCggacaaaattt
tggcaaaactCGAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000042_pilon:1931557..1937670+ >XLOC_037278 ID=XLOC_037278|Name=XLOC_037278|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1236bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1931557..1937670+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggcagcAAGACCAAAGGGTTACGGATTAACTGCTGAAGTCAGAGGAAA
AATTGATGGCAAATATGATGGCGAATTAGatggcagcAAGACCAAAGGGT
TACGGATTAACTGCTGAAGTCAGAGGAAAAATTGATGGCAAATATGATGG
CGAATTAGCACAACAAGCCATGCAATTCATTGAACATTACGTTCCTGACT
CCAACGTTTCTGGAAACAGTACATCAGATGCAGTTGCCGAAAAACTGAAA
GACGGGGTCGTTTTATGTAAACTCATCAATGCTATCGAACCTGGGTCCAT
TAAAAAATTCAACGAatcaaaaatggcttttaaacaGATGGAAAACATCG
GAAAGTTCTTAGACGCTATCGACCAGTACGGTGTTGCGAAATCAGATAGT
TTCCAAACAGTCGATCTTTATGAGAAACAAAACATGCCAGCTGTCATCAA
TGCTATCCACGCTTTAGGACGAAAAGCACAATCTAAAGGGTGTTATGGTA
TCGGCCCAAAAGAGTCGcaagccaacaaacgggaatTTACTGAAGAGCAA
ATGCGTGCTGGTTCAAATCACAACAAGCCATGCAATTCATTGAACATTAC
GTTCCTGACTCCAACGTTTCTGGAAACAGTACATCAGATGCAGTTGCCGA
AAAACTGAAAGACGGGGTCGTTTTATGTAAACTCATCAATGCTATCGAAC
CTGGGTCCATTAAAAAATTCAACGAatcaaaaatggcttttaaacaGATG
GAAAACATCGGAAAGTTCTTAGACGCTATCGACCAGTACGGTGTTGCGAA
ATCAGATAGTTTCCAAACAGTCGATCTTTATGAGAAACAAAACATGCCAG
CTGTCATCAATGCTATCCACGCTTTAGGACGAAAAGCACAATCTAAAGGG
TGTTATGGTATCGGCCCAAAAGAGTCGcaagccaacaaacgggaatTTAC
TGAAGAGCAAATGCGTGCTGGTTCAAATAAGAATCACAACAGAATAAAAG
GGAATTCAGCGAAGAACAATTACGAGCTGGAGAAGGTGTTATCGGACTTC
AAATGGGAACAAATAAATTTGCAAATCAATCCggacaaaattttggcaaa
actCGAGAAGAATCACAACAGAATAAAAGGGAATTCAGCGAAGAACAATT
ACGAGCTGGAGAAGGTGTTATCGGACTTCAAATGGGAACAAATAAATTTG
CAAATCAATCCggacaaaattttggcaaaactCGAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000042_pilon | genome | sc0000042_pilon:1931557..1937670 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 490-618:5986 |
| Aaloc | 82-489:603 |
| Aaloc | 1-78:1 |
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