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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000024_pilon:227759..235963+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038528 ID=XLOC_038528|Name=XLOC_038528|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8205bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000024_pilon:227759..235963+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGCTTACATTATCTACAATACTCTTTAACAAGATCACAAGGCCAGTGGT
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aaaatactcGATCTCTATATACATTATACTTATAGCCGACTCTcaatcta
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CATCATCAAAGCTATCAAacaatcttttgataaaacaaagaggGGAGGTT
GCCCGGTTTAAGATGATGACGATAGGGAAGGTGAActctatctttttttt
taaaggaaatttaaaACTCGAAActagttttcttctttttaaaacatCTT
ATTTGAAAGGGTAATTTACGTAAATTTAAGgctttttcctttttgaaaaa
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ACACCTATAAAACTCAAATGCTTTtcatttatgaaatatttttattgttc
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GAAAAGAGTTATTGGGAATCGGttatttgccaaattaaattcccatcaAG
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TCGTCAAATTTGATCCGCTTAAGATGGATTCACTTATTTTTTGGGAGGCT
TAGATCTAAAGAATCTTGAAAGGATCTTTTGAGATTCGATTTTAAGATTG
ATTTTGTTTTAAGTTACTTCCCATTTTATGACTCTAAAATATGTTAAATT
TTTCGCATAGGTTTTTTCCATCATTTGCTTGGATTTTCTTAATAATAGGC
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ATAAAGACAATTTAGATGGCTGGAACAAATTAATGACCGGAAAAGTCAAC
GTCATGGGTGTTCTTTTCTTCAACTGTCCCGAAGATGTGAGTCCTTATTT
TTGATGGGATATCTAGATACCTAATTTTGTAGGGCTCTCAATGCCTGACT
TTGGGTATCGACTTGCAGATACTTGGGTTTACATATAAGGCTTGTACAAA
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ATTTTATCTTCATGAATACTGTAGAGTCTCTTTTACTCAAACTGGCACTA
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TTTATagaattaatttatttttgtgacCCTTTTAAAGATTATTATCTCCT
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CGTTACTTTGGCAACTTTTACGTACAAAGATGGTGCGGTTTTGTACATAC
CTTTAAAATTAGGAGGAAGACCTAATGAGATATTTGTTTTACGTTGAAAT
CAACATTGGTCTCTCATGGTAATTTAATTAGAGACATTTTTGGAATTATT
TAAACAAATGAGATGGGAGTTACAGTTACGCAGGGTTATCGGTTAATGGC
AATATGGTTGGCTATTTCTAGTCGCATCAAAGGCATAATTAGGGAATGTA
CTGTATCTAAAAGATAAATATAATAGGGAGTATTTCTTTTACTTGGTGAA
TTAAAGATCGTAtttttttgctggaaaaaaaaaacagaaaaattctaaCG
GATTTTATCATTAACTTTTCCATGGGAAAAATAATTAATATCTTCTTGGG
GGAATTTCACACCCATGTGTCAAAGACCCACTGGAAAGTTTGGCCAAAAT
GTTTCAATACCCTacattttagccccactggaaaattgacttagACTTCA
TTCCCagttaaaattcaaaagattttttgacctgaGAACAATTgaatttc
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GGGTTTTGTGCCTTATTCTAGAGGTAGTCCATAGGGGATAGTGATAAGCT
AATCCTCAAAATGGGGAagatttaacaaaatttaataTGGGTATATTATT
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CAAAATAATAGGGAGAGAATTGAAGTAAAAAACGAAGTGTTTGAAACTaa
caaattttttccatttaaatTTCTTGTTCAAAATATCAACCTTCTGAATg
tcctttttttctatttttaagttTCCAATCTACTAACCGACGCTTTGGTA
ACTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000024_pilon:227759..235963+ >XLOC_038528 ID=XLOC_038528|Name=XLOC_038528|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1446bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000024_pilon:227759..235963+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGCTTACATTATCTACAATACTCTTTAACAAGATCACAAGGCCAGTGGT
TTCGGCAATTTCATCATCACAAAATCTTTCAACTTCAAGTGACAAAATGA
ACCATGATGAAGAAGCTGATGAAGATCTTTCAACCGTTATGTTTGTTCTT
GGTGGACCAGGTGCTGGAAAAGGGACACAGTGTACTAACTTAGTCAAGaT
GCTTACATTATCTACAATACTCTTTAACAAGATCACAAGGCCAGTGGTTT
CGGCAATTTCATCATCACAAAATCTTTCAACTTCAAGTGACAAAATGAAC
CATGATGAAGAAGCTGATGAAGATCTTTCAACCGTTATGTTTGTTCTTGG
TGGACCAGGTGCTGGAAAAGGGACACAGTGTACTAACTTAGTCAAGGAAT
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AGTGGTTCGAAAGATGGTGAACTTATACAACATTATATCAAAGAAGGAAA
AATCGTCCCTGTAGAAATCACCATCCGTCTACTAGAGAGGGAATATGGTT
TCGAACATTTATCGGCAGGTGATTTACTACGAGCTGAACGTAACAGTGGT
TCGAAAGATGGTGAACTTATACAACATTATATCAAAGAAGGAAAAATCGT
CCCTGTAGAAATCACCATCCGTCTACTAGAGAGGGCGATGAACGACAGtc
ctaaatcaaaatttctgatcgaCGGTTTTCCACGTAATAAAGACAATTTA
GATGGCTGGAACAAATTAATGACCGGAAAAGTCAACGTCATGGGTGTTCT
TTTCTTCAACTGTCCCGAAGATGCGATGAACGACAGtcctaaatcaaaat
ttctgatcgaCGGTTTTCCACGTAATAAAGACAATTTAGATGGCTGGAAC
AAATTAATGACCGGAAAAGTCAACGTCATGGGTGTTCTTTTCTTCAACTG
TCCCGAAGATGTGTGCGTCAAACGAATCATGAAACGAAGCGAAACGAGTG
GACGCGCTGACGATAACGAAGAAAGTTTACGCAAACGGTGTGCGTCAAAC
GAATCATGAAACGAAGCGAAACGAGTGGACGCGCTGACGATAACGAAGAA
AGTTTACGCAAACGATTTCGAACATATTACAACGAAACGATGCCGATTAT
CGATTCATTCAAAGCCAACGGGCTCGTCATGAACGTCGATGCCACACCCA
CACCTGATCAGATTTCGAACATATTACAACGAAACGATGCCGATTATCGA
TTCATTCAAAGCCAACGGGCTCGTCATGAACGTCGATGCCACACCCACAC
CTGATCAGGTCTTCGAAAGCGTCAAGAAACTTCTCGACAATAGGTCTTCG
AAAGCGTCAAGAAACTTCTCGACAATAGttTCCAATCTACTAACCGACGC
TTTGGTAACTAAttTCCAATCTACTAACCGACGCTTTGGTAACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000024_pilon | genome | sc0000024_pilon:227759..235963 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 682-714:8173 |
| Aaloc | 646-678:6806 |
| Aaloc | 550-645:6359 |
| Aaloc | 472-546:5758 |
| Aaloc | 334-471:5349 |
| Aaloc | 190-333:4853 |
| Aaloc | 106-189:115 |
| Aaloc | 91-105:88 |
| Aaloc | 1-87:1 |
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