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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000449_pilon:83470..89729- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038661 ID=XLOC_038661|Name=XLOC_038661|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6260bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000449_pilon:83470..89729- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTATCATAATGGCCATAGGCTTTTTCTTCAAGCTTTTGTTTCAAA
AAGACTAATCAAGGAAAAAGAAGCAAAAGATTTGTACATGAAAGTATGCA
ATATTTGTGAAGGTATGAATTTAGTTATTTTTAATAAAGATACAAACTTT
GATGGATTTTCATATTTAAAACTGTCTTCCAAAAAATCAATATTCAGATA
TTGTAGTTGACAAATAATTTTGAACATAATTATTTCTTGAATAACAAAAT
ACCACTTTAAATGTTTACTACACACATTGCAAAATAATAATTTGGTAGTA
AGAAAGGTATTGAATTGTGTCCTTGTGAAATCCTATCATCTTGCAGATGA
GCTCAACTGTAAATTTCAATCTGTTAAAATCCTACGAACTAAGTACTTTC
TTGATGGATGATTTTAATCTGTAGGGTGAAAGCTACATTTTAATCTTCAA
CAAAAGACATCTATCTTTCAGCTGATGGAAATCCTGATGAGTTTCTTGAC
TTTATCAGTTTGATAAATAAACAACTAGAATCGCTTTTCATGGAAATAAG
AAGAGGATGTGCTGAAGATACTGGTCACGTCTATTTTAGCTTGGTATGTT
TCATCTGCATGTTTTTTCATTGATATATAGTCAGACTTACAAAGGTCAAT
TTGTTCCCTGGACATGCACTGTGCCCCAAAGTTCATCTGTATAGATTTTA
AATAACCAGGATTGCTGAAGCTGAACAAAAATAAAAAATTTGACCCATAG
GGATTCCAGGACACAGCATTATCACTTGGATACTTCACAGTGGGCAGGTC
TGTGTGGGTGGGTCTGAAAGAGTTAAAGGACATCATTTATCTCCTTTCAT
TTGCTTAACAGAGAATTTTTAAATGAAAAAAAAGAACTATTTTCACCTCT
CCTGGACGGGGCTCGTAGTCTTGAGAAATAATTTTCTTAGTTTTGATTTG
TCAGAATAAGGGACGCACTGCACTTTCCATATCATCTTTATTACCAAAAT
ATTTTCTTTTAATTTTTCCATACTCCTTAAGGTTAACAAAGCAGAGGATG
AACATTCAAAGTTAGCCACAGAATATCAAGCTCATGAAATTGAACTTATC
AAATTGGCTGTAAGTTTACATCATAATGATTCAAATAATGTCAATTGGCT
GAGAAAGAGGGCCAGGTCAAACCTTTTGTAACATAAGTGTGATATCAAGA
AAAAAAGAATTGATTTGCAATTGCTACAAAGTGGTTTCATGCTGGCGCAA
TCTTCTTGCAGTGTATTGTAGATTTTATTTCAATAAAGAAATTACTCAAT
AATTCCTTCAAATTTTCTTGAGCATTTGGTGATTATATTTATTTCATTGT
ATAAAGTCATCATTGTCAAATCAAAAGGGCCAATTTCAAAATCAGTGTCC
AAGAAGACTAAAGATTTTTCTACCGGGTGCAGCAGAAAAAACTTTGGACG
TTTGGCGAGCCACTGAGGCCGAACAAAGTCTTGTTTAGACTCAAAACCAC
TTTTATTAGAAAGAGGACATGCTAACTTAAATTTTGCGGTATAACTTTTT
AAGTTTGGTCAAGTAGTTGTCAAGTTATAAGCTTTTGAAGTCAAAATTCA
CTTTTCGAAAAGTGTAAAAAACACGTAAAAAAAGGTGTATTAAATTTATG
CAAATAATGAAAAAATAGCTCAGTATTTGACTTATTTAACGACTTTTACG
ACATAATTAATTGTTAAAATACTTTTAAAAGCAGTTTTCGTTTACAACAT
AGTCAGTTTTTAGTAAATAGTCAGTTTTTAGAAATATTTGAAAAAAATTC
TTATCGAAAACGCTTAAAAATGCTTAATTTAATACCCTTTTATTACGTGT
TTTTCACACTTTTCGAAAAGTGAATTTTAACTTCAAAAGCTTATAACTTG
ACAACTACTTGACCAAACTTAAAAAGTTATACCGCAAAATTTAAGGTAGC
ATGTCCTCTTTCTAATAAAAGTGGTTTTGAGTCTAAACAAGACTTTGTTC
GGCCTCAGTGGCTCGCCAAACGTCCAAAGTTTTTTCTGCTGCACCCGGTA
TTTTGCTGACCATACATTTTGATATTGGCCCTTATTCATGTAGATGAGAC
CTTCCTCACTATGTAGAAAAGGTTCAATCTGAAATTTAAGGTTAGCTTAA
CAGGAAGTTTCTTACTTTTCTTGGACACTAATCTTGAGACTTGCCCACAA
CGAAGTGTAATGTAACTTATTTCCAGCTGAATTTGATTATTGAATCACAA
AATGGTTCAGTATCTTCTCTGGATCTCGTCAATCTTGGAATGGATCTTAC
AAAAAGGATTCCAGCTCAAGCTTCCGAAGTAAGTCTTTTAAAGCATGTGC
ATGTGCAAAGAATTACAGTTCTTGGTTAAGTTGATTTATTTGTGATATGC
ACCATTGAAATGTCTTCCACAGAACCAGCAGCTGATTGGTTGTAATTGAC
GTATTGACTTATTTTACGTCACTTACAACCAATCAGCTGTTGGGTCAGTG
ATGTAATGTCAGAAGACATCGCAATGGTGCATATCATGAATTCCCTTTCG
TTTTGCAATTATACATTAATTACAAAAGCTTGTCTTACTACTATTTACCA
CTATCTTCCATTTGTCAAAACATTATTATGTTATAAGCTAACTGTTTAAA
CCAGTGTTTTCAAAACATCATAATTATTAATATGAAAACTTGGTAAAGAA
TTCATCTATTTTTAAAGAGAACTTATTTTCGTGGGAATTCTTTGAAAAAT
TTGAAAAGTCCCCATTCCCCTGTTACTTGCTTTACGACTTATAGCTGATA
ACTTCATTAGTGTCAATAAATTCGAACCAATCAGAAATAAATGTCATGTA
ACAAGCGCATACAATTTTTGAGTAAAAGCGTGATTTGTCTTCAGACTTTA
ATTTTGCAACCTGTGTATTGCGGAAATTAGTTCCCGCTTCAATTCAATTT
AATTCAAAGATAATTTATTTGCCTGCATAACATTAGATTACTAGAAATTT
ACAAAACTTGAAACTTTCTTATATAGATAAATTTGGGGAGCAGGCCAGGC
TGGCCATCCATAAAGAGGTTTAACCGGACTATAATTAGTTCCCTTAGGGT
AGGTAGAGCTCACCATGTGATGATTATTGTGTGTTGTTCAAATATTTTTC
ATGAACCTTTTTTCAACACTTATAGGAGCTGATTATGAAACTTGTGGAAG
ATGGTTGGCTAACAGAAGTATACAGATATTTCTTTTATTTTTGAAATTCT
TTAGACCCCTGTAAATCTGAAATAGTACACCTATAAACCTTCAGCAGCAC
GGTTGGCTTTTTAGGGGTCTGCTGTGAGGAAGATTTTATTCTCAGCAAAC
GACATTTTTGGGCTCAAACTAAATCAAACCAGGCATATTGCTGCCAAAAC
TCTAAAGAAACTTTCCCTAAGTCTTTACGGTTGAGTGCAAACAATTTTTA
GCATTTGAATAGCTTAACTAAATCAACGTTAGTTTATTGCTTTAATACAA
GGGTATTTTACATTTTTCACAAGTGCACTTTTCTTCACATGTGTTTTCTA
TATACGTCATTGAGAAGCATTTTTGTTACCAGCTAAGCTGCTAAGAGTTG
GTAGGTGTATAAGGCTTTGGCCCAAGTCATGAAGAAAAAGGACTTTTGCT
AATTTTAATTTATATGCAGCCTTTTCTAATTTAGATTTATTTGCGTTGGC
AAAAAACTCTGGATTCTAAAGTACAGTAAGCACTATTACGTCGGCAAAAG
CCAAATTTACGTTGGCATTTACGTCGGCAATAGCCGAATGCCGATGCAAA
TTAGAATGGCTGATATGTTTTTTATATACTTGAATACTTGAAACTTTGGG
TTTTTAGAAAGATGGTAAAGTATTCTTTGGCCCTCGAACAACAATTGAGC
TTGGCCAATACTTGAGGAACAAATACAAAGAACAAATTGGTGAATGTCCT
CTATGTCATGATTTTGTTGTTATGGTATGTTTTTTTCTCTATTTTCTAGA
AAAAATATCGGTTCATGGGAGATTAAAGATAAAAGTGACCAGGGGTACTG
AAAAAATTCATATAACTGAAATGTCCATAGGGCGGATGTGTTAAATGTCT
AGGGGGTCGAGTCCAGGGTTGAAACGTGCGTTCAGGGGCTGAAAATTTGA
AATAGTCAGGGGTAGGTTATTGAAAAGATAATCTTCCACTCTACCTAACT
TTCCGTATTGCCTCTGTTGACGCTTAAATTAGGGGAAATGGCTTTGGAAA
GCAAATATTTTTCTGCCTCCATGTGTTGAAATTATCAAATATTAAGCTGG
GTGTTTTTAAATCAGAGCTTATCATTGTTTGAAGGTCTCCAACCTTTCAT
AAGAAAGAACAAATGGTGCCTTAAAGTTTGCGCCACATTTTGGATGAAGG
AATGAATCTAGCACTGTCTTCTTTTACGTTTCATATTTTTTGCTAATATT
GTATGAAAAGTGGATCGAGCAACTTCTAAAATGAGCGGTGTCCTATCCTA
AATGGGAGACTGGACAATAGCTTTTGGCTATACCTAATTGGCTAATGAAT
ACTCAATTGGGCTCTTCCAGAAAATTTTTGTACATGGGGGGGGGGTGGAT
ATTTTGTCCAGGGAGTACTGTAGTGAAAAACTTTGCCTTATTTAGGGTTA
ATTATGAATGTCCAGGGGGTCAACTGATGCTTGTCCGAGGTTAGGATCTG
TTGTCCAACAGACAAATTTCCAAAAACTGTTATATCCTCCAGCCTCCATA
TTCAATTTTCTTTCTGGAAGAGCCCATTCCTCAGTTAAATCTTACAAACT
GTGTCATATAAGAAAACTTTATAATTGCACTTTATTGTTTTACAGGGTGA
TATATGTGAAGAGTGTGATGTAAAACTACACAAATATTGTGCTGCATTGA
GCTTTCAAAAATTGTAAGTTTAAACATTGAATGAAAACTATTTTGATTGG
AAAAATTCTTGTTTTGTTATTTTTGTTATTTCTCTTTTAGAGAAAAAATA
TAACAACAACATATGAATGTACCAGGTGTGCCAGAAATAAGTTACTCTCT
TTGACATGATGTTGTAGACAGTAGAATATAAATTTTTCAAAGATTGTTTC
AGAATCACTCAGCGGAAAGCCTAACTTAAAATTTCATTTGTTCAAAAGTT
ATGTTCAAAAACCTTAAATATCAATCTTAAAAAATGTCAATGGCACACCC
GGTAAGAAAAGCCACAGTAAATTCTCTCATACAAGGAATGATAAGTTAAG
GGAGACTTTCCTTTATGAACAATTATTTGACTTCTGTTAAGGAGACCCCC
CAAGCCGTTTTCGTGATGATTTTTGCAGCGTGATTACGTGATTTGGAAAT
TTTTTCTCTGTGATTGCGTGATGAGAGGTTAAAACGTGATCATGATTTGA
AAATTTTTTGAGCCGTGATACACGATTTGGACTTTTTCAAAGGGATGCGT
GATTGTCCATTTTTTTGCTAATTTGCGTGATTGTAATTGAAGACAAAATA
TTTCGTGATATCGTGGCTGGAGGGGCTCTGTTAAGGTTATGAATCTGAAA
GATCTATATCAAGACCTATATTTCATGATAATAATTATATCATATTTTTA
TTTTGCAGGCCAGCTAACAAGAGGAAATGCCCCAAATGCAAAACCGAGTG
GACTCGAACTATCATCAAGCTGTCAAAACCCAACAATAACAATAATAGCA
TCAACTTAGGTATTGATAGAATTTTACAAAGTTTAGCATTCTTTTGACAG
TTTTACATTAAACCTTAAGTGTCAATTTTAGTGCCAATCGTTTCTGAAGA
CTTTCGATAAATTTTTTTAATCCCTATGGCAACCAATGCCACCATTTTAT
CAGTTGCCAAGTTAAAGGTTTTGTTTTTACATAAGTGTTCCCGTTTCTTA
TCAGACACATGTTTCATATTAGGACAGTGTCTCCCTATTGTTATATTATG
TTGATAAAGTTGTTGTTCTTTTCCTCTTTCTGACCAATCTTGCTCCACAT
CCGTGTCAATCCAATGTGGAAAAGCTTGTGAATTAAAAATTGACGACTAA
GCAAACGATATCACTCTATTATCTAGAAAAAAACGATCGGCTTAGAGAGG
ACCTATATGGGCCTGAAACCGTATTCGTTATAATAAAAAAACACCTTAAC
TTCATCATAAATTTTGTATTACAGAGGAAACTGTGGTAAATCATCGTAAT
GTACCTACATCCAGTCAACAGCCCTCAACATCTAGTGGTAAAAAGCGTGC
AAGAAGGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000449_pilon:83470..89729- >XLOC_038661 ID=XLOC_038661|Name=XLOC_038661|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1656bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000449_pilon:83470..89729- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTATCATAATGGCCATAGGCTTTTTCTTCAAGCTTTTGTTTCAAA
AAGACTAATCAAGGAAAAAGAAGCAAAAGATTTGTACATGAAAGTATGCA
ATATTTGTGAAGATGGTTTATCATAATGGCCATAGGCTTTTTCTTCAAGC
TTTTGTTTCAAAAAGACTAATCAAGGAAAAAGAAGCAAAAGATTTGTACA
TGAAAGTATGCAATATTTGTGAAGCTGATGGAAATCCTGATGAGTTTCTT
GACTTTATCAGTTTGATAAATAAACAACTAGAATCGCTTTTCATGGAAAT
AAGAAGAGGATGTGCTGAAGATACTGGTCACGTCTATTTTAGCTTGCTGA
TGGAAATCCTGATGAGTTTCTTGACTTTATCAGTTTGATAAATAAACAAC
TAGAATCGCTTTTCATGGAAATAAGAAGAGGATGTGCTGAAGATACTGGT
CACGTCTATTTTAGCTTGGTTAACAAAGCAGAGGATGAACATTCAAAGTT
AGCCACAGAATATCAAGCTCATGAAATTGAACTTATCAAATTGGCTGTTA
ACAAAGCAGAGGATGAACATTCAAAGTTAGCCACAGAATATCAAGCTCAT
GAAATTGAACTTATCAAATTGGCTCTGAATTTGATTATTGAATCACAAAA
TGGTTCAGTATCTTCTCTGGATCTCGTCAATCTTGGAATGGATCTTACAA
AAAGGATTCCAGCTCAAGCTTCCGAACTGAATTTGATTATTGAATCACAA
AATGGTTCAGTATCTTCTCTGGATCTCGTCAATCTTGGAATGGATCTTAC
AAAAAGGATTCCAGCTCAAGCTTCCGAAGAGCTGATTATGAAACTTGTGG
AAGATGGTTGGCTAACAGAAGAGCTGATTATGAAACTTGTGGAAGATGGT
TGGCTAACAGAAAAAGATGGTAAAGTATTCTTTGGCCCTCGAACAACAAT
TGAGCTTGGCCAATACTTGAGGAACAAATACAAAGAACAAATTGGTGAAT
GTCCTCTATGTCATGATTTTGTTGTTATGAAAGATGGTAAAGTATTCTTT
GGCCCTCGAACAACAATTGAGCTTGGCCAATACTTGAGGAACAAATACAA
AGAACAAATTGGTGAATGTCCTCTATGTCATGATTTTGTTGTTATGGGTG
ATATATGTGAAGAGTGTGATGTAAAACTACACAAATATTGTGCTGCATTG
AGCTTTCAAAAATTGGTGATATATGTGAAGAGTGTGATGTAAAACTACAC
AAATATTGTGCTGCATTGAGCTTTCAAAAATTGCCAGCTAACAAGAGGAA
ATGCCCCAAATGCAAAACCGAGTGGACTCGAACTATCATCAAGCTGTCAA
AACCCAACAATAACAATAATAGCATCAACTTAGGCCAGCTAACAAGAGGA
AATGCCCCAAATGCAAAACCGAGTGGACTCGAACTATCATCAAGCTGTCA
AAACCCAACAATAACAATAATAGCATCAACTTAGAGGAAACTGTGGTAAA
TCATCGTAATGTACCTACATCCAGTCAACAGCCCTCAACATCTAGTGGTA
AAAAGCGTGCAAGAAGGTGAAGGAAACTGTGGTAAATCATCGTAATGTAC
CTACATCCAGTCAACAGCCCTCAACATCTAGTGGTAAAAAGCGTGCAAGA
AGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000449_pilon | genome | sc0000449_pilon:83470..89729 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 745-828:85 |
| Aaloc | 643-741:652 |
| Aaloc | 574-639:1416 |
| Aaloc | 457-573:2404 |
| Aaloc | 415-456:3086 |
| Aaloc | 313-414:4035 |
| Aaloc | 235-312:5230 |
| Aaloc | 115-234:5788 |
| Aaloc | 1-111:6261 |
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