XLOC_023843.2 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_023843.2
Unique NameXLOC_023843.2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000351_pilon:145613..159555+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_023843.2 ID=XLOC_023843.2|Name=XLOC_023843.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13943bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000351_pilon:145613..159555+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGATACAAATGCAGCATGTATTATCTCAATTTTTGAAGCAGCCAA AGAAAAGTTTGATCAACTTTCTGAGTTGATGGACGATAATTTTCTTTGGC TGGAGCAAATTCAGGAGGAGGCTAGAAAAGCTTTTGGAAGGTATGCAAGG ccttcaaatattatgcattatgcaatatgtattatgttttatgcattttg aaccTGCCATTTTGTTGAGTGTCTTTACTGGACATTTTCCTGTGTAACca aattttctagaaatttttGGGAGACAAAATGGCAGACAAAATATTATAAT GTAGACTGCTGCTGCAGCACATCAAATATACTAAAAGTGCACCACCCTTA AAATGGACCAAAAACAGTTTTTgggtataactttttttctggaagtcAGG GCaagctgaaaattttagaTGGCATGGGGGATATTTAGCCTGGGAatcat gctatgatttcttctttgataaactgatggcaaaatgaatagcatggttt gggctgccagtttgaatttcccaacTCCAAATGACAGTTGATGAATTAGC CAATGAATGTTTGTTTTACAGGGTTCAgtcagaccctggaaaacctggaa aacctgggaatatgataaattttcagaaaaatcagggaaactcagggaaa cccagggaaaaaaaaaatttttcccagtctactcagggaaactcagggaa ttttattttttgaaaaatgaatggaaaaacagatttaaaagtttttttag ttttaaagtgtttattcatatgcagtatttgtagctttaatttttacctt aggtttaccatttgatttgtgtgccttttgtttaaagatacatctctttt gactctgcttagtttttatggtttgcttgatactcagggaaaaaaatagg gaaaaaatagctaaaatgaggaatttctcagggaaaaaaccttcgaaaat tgattaaaattcagggaaactcagggaattttattttcgaaggtctgtct gaaccctgttTTAGTTTCTATGCTCAAACTGCTATGGAAAAAAGcgcaat tttttattgtttactcATTTTCATTTAGTGAGTGAGTCCTGCGCTTTTtc aactgtaaaaaatgtgagtccaaaaTTCGACTcgcagctcgaacccgtct tgtgtacatcaaattataaaaaaacaccaacgggtctcctgtctagggAG ATattaccagacgatctcaatcgaacggaatcgacgatcgaaccaaatcg aacgcaatcgaccgattgaaattcgattgtcgaatacaatcgaatctcaa tcaaatactaccgcaattttcagattcgattgatttTCGATTGGTGTTTT ATTGTGTTCGATcatcgattcattgacccccggattgttcatcgcataat ttctacgggaaatcgaaagtaatttcattcggcttgtgatgtttgagagc ttggatgttgggaagctgcaagaataaagccgatgatcgaaccagtcgaa caacaatcgaaccaatcaaatattacccagaattttgacgttcgattgag attcgattgcgttcgacaatcaaatttcaatcggtcgattgcgttcgatt tggttcgactggttcgatcgtcgattccgttcgattgagatcgtctggat attATGAGAAATAACATAGCTAggttggagaaaaaaaatctaaatcagta aaatggccaaaaaattaaaataaaagtagaatttcacctataaaatcacC TGAAAAGGCAGCATAAACGACTACATCTTaacaatagaaaataaaaagac acaaaaaggtcaagctctcacataaaatgaaaaccttggaaaaattacca aaattttgaaaatttggcagtctgtaaagcaatgaaaataaaaatgtact accaaaatcaattttatttttatttaaattttcggaatttcatggtcggt cgggcccgtaaaacaactgatcaaattggtctcgcctaatggGCTATGGG CttttttttCacaaaccccctggaaattttggataacaaactaTCTCCCT GGAAATTGGGGGTTGAcacccctggaaagtgaaattttatgaaaaagggc ctggaaaATGACTACTGTATTGATGTCAGTTTAAGAGGAGagaaccccct tggaaaatcaaagcTCAGACCCCTTGCAAAATTTTGTCAATACCcctatg gtttaaaaatggaatgacccaatATTCTGTCTATATTTTGGACCATTtat taccgtaacttggtctaatgttgacatccctcctctaattccgacaccct ttttatcaagctggaattgatagaaaggttgaaactgtttttctttgctt agtggtcatagaaggaataatcctttttcaatcagtgattcaagctttca tataattcctgtctctaaagaagggtgtcggaataagacaagggatgtcg atattagaccaacttacatagtttctagagggatcaagacccccccccca ttattGTCATTCTAAGGACCCTTTTAAATCTGTTTCTAGGAATATCATAT CACCCTGTCTTGCTGGACAATTGTAAAATTTCAGCCCACTAGAGCAAAGC AGTCAGAGTTATGATCACAAGACAATTTTTTGTTCTTTGCTTTAGGATAA TTTTTTGTCCAACTTTGGACCGCACTTTGATAAGCCTACCATGATAAGCT AGATCAACATGACCTTCAGAATCCAAGTTTCGAACTTTTTATCTTACCAA CAAACAATATTGGAAGTCAAGAGATATCTTTTCATAAGTTGTTATATGAG GGTCGAAATGATGACTGAGACTACCCAAGAGCGGTTGAGGGGGTCAATAA TTCAGACGACAGGTATTTGTAACGTTGATTGAcgtatgttcaaactgaaa ataaaatatgataaactaataagtatttgattgattgatttaaattaaat aaatttgattgacaaagttaagtcttgaaattgaattgattagaaaaata aatattgaaaatgtttgagaaaatctAAGTCCAGATGACCTAACCTAAGC ATGCTgaaaatccaagatggccgcCAAAGCATGctatgaaaacaaaatgg ccacaactgacaggcaaaaagcaaaaggcagaaagaaaagcaaaacaaga aagcaaaCCTACCAGCCTGCCAGCATGAAAGCATTGtgaattttgtctga atttcaaAGTCTGAACTTGACTATTGAAAGTATTGAATGTTGACCATAtt gaaaaaattagagttttaatTTGAGCTCCTTACTCCTTGTGAGCTTGATT GTGAATGACATGAAGAAGCATGCAAGCCCTAGTCTAGCCTCATGTGGACT GGACACCAAAAAGTGATGACTcatcaaaatggtagaaatgtaaacaatgt ataaaatacagacctatattgaaaataaacattaccAAAATGACCTACAT TGagtataaaatgtaaacattgacaaaaatgacctacattgagtataaaa tgtaaacattgacaAAATGACCTGCATTGaacaaatatgataaatttaat gaaatgaaaataacctgaataaattttttgtgtgaattatataatatgaa aattgactgatttttctacACTCCCCCcataaagacaaaaaaaaattttt agttgatttttgaaaagttctttaaagtGTTCTTTCCCAATTCATAAAAC AAATCAACTTCATCGACATGATTGATGATAACTAAATTTCGTGTGGAACG ACGTGTCTCACGAAATACTTTCTCATTAGCATTCATATAACGTACACTAG CATGACGAGCCAAACCATCGGAACTAAATTCAACATTAACAACCTTTCCA TACTGATACGTTGAAGATATTTcgaatcatttttcaaaaataaaacaata tctCCAATTTTGATTTCATGACTCGTAGTAAACCATTTCTCCTGTTTCAG TAATTTTGGGACGTGTGACAAAAGCCAATTCTCAAACCATGAACTGAATA TCTTACAATTTTCATCACAAGCTTGCTCGGATTGCTTACAAGCTGAACTG GTTCAACTGGTGATCTTTCATTGTTTCGACCAAGCTTGAGGCGATTTGGC GTTAGAATATCGAGGTTTTCCGATCTCCGATTGTACCCTTGATGGCTAAG GGCATATTATTGATGCTGTTGGCGATAGAGGAAGCAAGTGTCTCCCACTG AAGTGTAGATAACTTTTGTCGGTGTTCAACATTGATGGATGAATTGATTT CACGGATCTTTCGTTCAACTTTTGCCGTGTTCGTTATGAGCACCAACAGA ACAAACTTCGAAATCAACTTGATTACTGATGAAGAGTTGATGTTTGACGT CGAGATAGCTGAACCGCATGTCTTGACAGCCTCTAATGAGTTGACTGCCA GCGTCGCAAAGTAGGGTTTTCGGATATCCTACTTCACATGAAAATCTTGT GAAGCCAAGGATGAACGACTGAGTGCTGTAATCGtccataacttttatgt ttgtTGTTGAAGTTGTGGCACAGCAGAAAACGAGAAGCCATATCTTGACT GTAGTGCGTTTGTGGTGTGCTGAGTATGAATCGAATGGTCCACAAAGATC AACTTGAGTTGAATAGAAGGCGGGGGCAATGGTGAGATTGTGTCTGGAGA CCGGTGCCATTGCAACGTCTACGGCTCTTTTCAACAGATAGCGACATCTT TGACATGATCTGCGTACCATCTTCACAAGTGACCGTCCCTCAATGATGTA GGCTTGAAGATGAACAAATCGTAGAGTAGTTTCCACACCGGATGTGTTTT GCGGTGATGTGATACCAATGGATGTTGTTGACAATTGCTACTGCTACTGG TGAGAATTTGTCCAAACAGGTACACGGAATGTTGATGAAGATAAGTCTCT CATTGAATTGGTAAATCTGCCAACAATTGTGATGTCATTAGTGTCAAGAA TCCGACCGGTGTACTTCAGGATACCGTGTTGCTCTGATGTGATGTCCTTG ATTCCTTTTGATGGTAGAAACTTCTTGATCTCTTGGGTGGCTTTTCGGAA GAAATAATTCTTTGCAGATGTTATGTCCTCCTCAACTAGGAAGACAAATG ACGAATCAGCTTTGAGAGGAAGTGGTGAATTGGTTGgcgattttcttctt ttcctcaaTGCTCTGAAATATTTGAAGATGATTGCCATGATGTTCACGAC TTTTCGAAACTGATACTTGAGCGGTGATATCAGGTAGTTGCTGAATTCCA GACGTTTGTTAACTTCATCCATGATCCTTATAATTGGGTTTGACTGCTTG GAGTGATGAACCTCAGAGTGATAAATTTCTACGGCTGCTTGAGACTCTTC AGATTTGGACATCTTGATATCGGAAATCTTGACGATTGGCATTTCCGAAT AGTTGAGTTTCATCCAAGGATCTCCTTTGAACCAACGAGAATCATTATCG ACATCAGGGATTGAAGGTCCTCTTCTAGTTCCAATATCTGCGATCATATG ATCACTTTGAACGTAGAACCATTGATTGGATTGTGTGAAACGTAAACTTT CGATAACTCGGCTACGAACCCATTGTTTCAACGTCTTTTTGTCATTGCTG AGCCAGTGAAGAACGATTTGGCTATCGCAAAATTTGATTGCAGATTGGTG CCAATTCTCAAGTGATTTTCGGACAACTTCGCCAGTGTGTGAATTCAGTA AGGCAGCATATAACTCTGCGCGTGGTTGAGACATTCCTTCTGGGACAATC CGTGATCGCGACAAAACGAGTTGAGATGAGTAGGTTCCGGATTGGCGCTT GAATCTTGCATAAATTGCGACACATACAAGGGATTGGCTTGCATCAGCAA AGTCCAGGGTCTCAACTTCAAGGTTGATAGCATCAGGTGGTACGATTGTC CTTTGATATTTAAGTTGGTTGATTTCTTGCATCATCTCAAAATTGTTGAT CCAAAGTTTGCGAAGGTGATCAGGAAGCACATCGTCCCAGTCGAACTTTT GGATAACAAGGTCATGAAGATCAAGCTTGAACTGTGCGGTTATGGGAGTA ACTCTTCCAAGAAGATCGAAAACTTCCCCGACTTTTGATGCGCAGTGACG TCTTGTTAGCTTGTCAGGGATGATGTTGGTTGATGATGCTGATTTCTTTC CTCTTCTCTTTGGAGCAAAGTTCATTTCCCCAATGTTCAATGAGATGACA TCTTGCTTTGGAAACCACTTCATTCCTGCAACGGTTACACTCTGTTGATC TTCACTCATTGTCTCTGGTGGATCTTCTCCTGAGATGACGATACCTTTTA ACTTGAATCCACCTTTGTTGACGACTTGTTCGAGCTCCTGAGAGCGTTGA CGTGCAAGTTCGATTGAATTTTCTCCACTGACGCAATCATCTCTACATAT GTATCATTGAGAATGATCTTGGATGCCTCTGGATACAGGTCTTGTGATAG TCTGGCAATTTCTCGGAGGGCATATTCAGATTGATTCCCTGCGGATCGAA CACCGTAAATTAAAGTCTTTATCACCTTTTCCTCTGGTATTCTTTGTGGA TCAAGCTCCTCTTGCCATACGTATCGTTGATAACACCAGTGTTCTTCACA CAATTTGACAGTGTTGTACATCTTGGATACATCTGTGGTGAATGCAGCTC TGTGGATCAAGAAGCGAATAGCGATTTCTTGGAGAAGGTTCATGTTGTTG TGCGACCCTTTGCAATGATGTCGTTTAAACTGAAGCCGGTTGATGTCTGT GATGAGGCGTCAAATACGACTCGGCATGGGGTGCTGACTGATCCTGGCTT CCATACCGCTCGCCATGGGATGAAATGCTTCGTCTGAATCTGAAGTTGAC GTTGAATGTCATTTGGCAAATTGCGTACATAATCGACAAATCCGagattt tgtaactttttttcgGAGTTGATGATATCCTCCTTGTCTTTGAGGTTCTC CTTCCTGTTGAGTTTGCGTAATTGTTGTTGATATACTTTCAAGGCTTTGT CTTTATTGGGTGCAAGCTTTACATCCGGGTTGTGAGTGAATGGAAGTTTT GCTGTGATGATGTTTGTTTCTTCATTGATGTGAATCGACTTGGCAATGAG GTGTTGCTCCACCTCTTCTTTGATGCTGATATTCTCGGTTGCACCGTGGC TCTTGCAATCCTTGCAGTTCCGACAATTAACGCATCGGTATAGAATTTCA CTACCTGTCTTCTCTGCAAGATCGAACATGTGATGTGATGGACTTCTGGG TTGATGTCGAATTTGTCATTACCGTGACCAATGAATGATAGGGATGCAAA GTAGGTCAGCATTGGTAACCTCAGATTGAAGAGTGTGTTGTAATGCTTCT TGTGGATCTCGTCAAATGATGAATGTGGACCACCAAGTACACCTCTACCG TCTGGaccattgaaaacagattcgaATACTGATAAGCCAGTTGACATTTG GAAGATGAGTTTGGGATGGACATTCAAGTACCTGACGCCAATCATGATGT CGACGTCTCCGCCAATGGATTGTGGAAGCGATGGGAGTTTTGATACATCA CCAGTTGTTGAGTAGGCTCTTTGTAGATCTGATATTGCTGGTGTGAGAGG ATACACTGGAAATGTTTGCGTAATCTGATCAAGGCATATACCTCTCATCG GGATCATGTCACCATCGTGCAGAGGTAGGTTGACAAGATAGATGCCATGT GAGGATTGAGTTGATGTTCCACCCACACCACCAATGTTGACACTTCCACT GAAGATTTGGGTAGCATATGATCCTAATCGGTTGACTGCAGATTTTCGAA TGACAAAGTCACTGCAGCCATTGTCGAAGAATACTGTGAACTTCTGATTG TTGACCAAAATTTGTTGTAATAGGTAGATGCCAGGGCTTGAATGATGGAT GTTGTCAGATGGCATGGCATTGATGTGACAGTCAGTGTGAAATGAGACTT TGATCTCCTTGACGAAGGTTGGAAGCTGTTGATTTCGATTGATGAATTTG TCTTTAAAACGTTGAAGAAGAGTTTGATTGTCATCTGTATCTTTGTGATC ATCACAGACTAATACGTGCTTCTTAACAGTCCATGATGAATGACTTGGGT GCTTGCAGACAAATTCATATTGACACCTTCCATCTCTGTGTTTGCCTTCT GACAATTTTGCTCCGGGTAGTAGACATTGGAAGCACAATCCTTTGCGCTT CAGAGTTGACAGTCGTTCACGTGGAGTATTGTCGACAAATTGTTTACAGG CAAAATATTGAGTTACCATCTTCCCCCATGGTCCTCTTGTTTGAATATGC TCAGATGGACATTTGCCGTCGCAGAAGTAGCAAGCTGGTTCAGGGTCTTG ACTTGGTGGGACATGATGACTTCCATATCCTGATTTGCCTGATTTTTGAC TTGCCATCTTTATCGTCTTTGTTGGTTGGGAGTTTGATGAGTTGCTTTTG CTGGAGAAGTTTGACGTCCTTCTCCAGGAAGATGATGAGATTTGACCACT TTTGTTTCTCAGTGATCTCTTCCTCACAGATTGTTGCTAGCCATTTGTCC AATCTGGTGTCGTCCAAGAGTTGGTACACTTGATCCAAACAATCGCCGTA GTAaagttgattttcaattttagttgCTCAGCAAGAGAAATTAAGTCTCT CAGTACTTTGATCAGTCCAGTGATAGTTCGTAAGATTTTGGCAGGATCGT GTCTGGTTTTGATTGGATCCAACTTCTTTATGTCAGCAAGTTTACGAGAT ACAAGCATTTTGGAGTTGCCATAAGCTTCAACTAGGCGATTCCAGATAAT TTCAATGTCAGTTAAGCCTTTAACAAGTGATAAGGCAGGTTCAGATAAAT GATTGTTTATAAGTAAATCAGGTAAGAGTTTCTTTGGCGTATTTCGTAGA TgaactttctcaaaatttgatcTGAACGTATAAATGTCTATTGATTcata ccctgaaaatttttcaatcttgatGTTGAGGTTGGATTCTTTGAAAGATT TGTACTTTTCAATCTCTCGATCTGTAAACTGTTCATTGAGGTAATCAATA AAGGTTCCTTTTAGGTTGCTCAACTCAATGTACTTCTCACCAATTTCTGA TATTTGAGATTCCAATTCCACGTTGGCTGATGGTGTTTTGAGAAGTTCTT GGTATTTTTCGGAAATAACTCGTAATGATTTGTCGTGATCTGATAGCTGT GATTTGAGATGAAGAATTTCTGTGTCGGACATCACGTTAAGATTCTGGTT GAAAATCACTTCAAGTCTGTTCAGAAGAATGTTTGTGTCATCAACAATAA ATTGCtgtgatttttcttgtaacttgGTTTGATCACCCAATGCCTTCTCC ATTTGAGCCTGATGAGTTGTCTTGTGATTTTTGCATTCAATAATGAACTC ACCGACTTCCTTTATGGTTGAATCATAGGTTTTAGAGTGAACGTCATGAA CTTCTGGATTGAGGACTTTTAGTTGGTTCATATGATGGCGGATGTCACGA CGAAGATCTTTGAGTGATTGTATTGTTTCATTGTTATCAGAGTCTGAGCT TGTACTGATATTGTGTTCATTCATGATATCGGTAAGTTCCTCTAATCCGG TAAGTACATCAGTGATGAGTGCTGTGGAGTTGACATGGTGAAGTATCTCT TCCTTTGTTGGACTCTGATCAGTCATGATGGTTTGATAATTTGAAGATAG GTTGTGATCTCCAACTGATGAATCAATTTTCTCGACAATACGTCCTGTGT TGTTGAACATGGAGTAGTGAATGTCTTTACGTGTTGAACGCCTTGGTCGT GTAGTCATAGGTGAACATATGCTGTTTGAATGTTGTTATATGAGGGTCGA AATGATGACTGAGACTACCCAAGAGCGGTTGAGGGGGTCAATAATTCAGA CGACAGGTATTTGTAACGTTGATTGAcgtatgttcaaactgaaaataaaa tatgataaactaataagtatttgattgattgatttaaattaaataaattt gattgacaaagttaagtcttgaaattgaattgattagaaaaataaatatt gaaaatgtttgagaaaatctAAGTCCAGATGACCTAACCTAAGCATGCTg aaaatccaagatggccgcCAAAGCATGctatgaaaacaaaatggccacaa ctgacaggcaaaaagcaaaaggcagaaagaaaagcaaaacaagaaagcaa aaCCTACCAGCCTGCCAGCATGAAAGCATTGtgaattttgtctgaatttc aaAGTCTGAACTTGACTATTGAAAGTATTGAATGTTGACCATAttgaaaa aattagagttttaatTTGAGCTCCTTACTCCTTGTGAGCTTGATTGTGAA TGACATGAAGAAGCATGCAAGCCCTAGTCTAGCCTCATGTGGACTGGACA CCAAAAAGTGATGACTcatcaaaatggtagaaatgtaaacaatgtataaa atacagacctatattgaaaataaacattaccAAAATGACCTACATTGagt ataaaatgtaaacattgacaaaaatgacctacattgagtataaaatgtaa acattgacaAAATGACCTGCATTGaacaaatatgataaatttaatgaaat gaaaataacctgaataaattttttgtgtgaattatataatatgaaaattg actgatttttctacAGCAGCTCAAAATATAACCATGACTGAAAATGGTGC AAAACATCCATTTCTTGTACATTTGATTTGACAGTGTCCTGATCTTTATc aggaaaatattttgggaaatgAGTGAAAACTCTAATCTTGTCTCAAAAAT GCCAATGTCAAATTCCAAAAGCAGGATTTTATTTAGTTCCGAAAACAGAG CTTTTTTATCTCCTTTTGGTCCATACCAGTCTTTCCCACTCAATACAGTC AAATTGATGATTAATCTATCACCTATCTATTGATTGGATAGGATTGGATA TCAATTGATTCCAATAATCGATAGACAGTATCTTTCTTTCccttaaattc tttaaaatgacccAATTTCGCAGCAAATACaggcaaaacttttcaaagct atataaaaaattcagtttttagAACTaaaaaaaTGTCCAATTTGATTAGA CTAATGTTGATATGGCTATTTTTGTAAGAAATGCCTCAGGTAATCCAATC ATGCCTTGACTTTGAGTAAGGCtctcaacattttcaaattgtCAATTTGC AGCATTCAGATTAAGGGTCTATATGTGTTGATACATTTTGTAAAACAGAG aatattactcttaggttccaaataaacggcccccccccccttgttaattt ttcgaaaattttccaatcaaaaattttcaatcttctcAATAATAGCCCTA GAATAGTATCGAAAGAAAAGGATGCAGCCCTAAAACCTGAAGCAATCTTC TCATAACTGGATATGAATATCAGCTTAGAATGTTAAGACTTTTGTCTCTT TAGAGCTTTTTGTTTCATAGATTTACGTATTTTTGTGAGCCCTGTGAACA AgttaaaagttattctaaaactttttattgattttttcctaTAATTGGCC TATTCTGACAGATTACTGTGAATCAGAAGTTtatttgtatatgtaatcac atgataacgagtgcaatttgagaataattgcacaagtgatttttttgtca ataattttccgagtccgaaaggacgaggaaaattcgaaacaaaaaatcac gagtgcatttttcaaattgtacgagttattatgtgattacgagctaatcg cacaatttGTTTCACTACTACACTGaaagttttacatttttctcttctct ttaagttttccttttattgttgtttatagattttctttttcacaaaacta ATTTCGAAAggaattaaaacgttcgatgaaaaaaaaaacataagaaaaaa cattaaaatcaattttgtaaaattggcgcggcattgaagagtgtgattaa cgattaattgctctctaaaagatgcaattaacgattaattgctctctttg aaggcgcgccaaataagaaaaaatagctcatcgtgcgattaagcCCAAAA GCCTTCAGTTGACCATCTAAAAGCACTTAAGAAAGTGTTACATAACCTTT AGCTAACCTcaacaaaatcaaccaaaaatgCCCAAGAATTCAGGCAATTA TCATAGTTGTGATTCTAAGCCTCAAAAACTCTCCCAAATTATTGCCTTAA AATGCTCAATCCAATAAGGGGTCAACAatctcccaactccttttcaaact caagATATCCTTTTTGAAGTTTTCCCCAAATCTATGATGTTATTGGGTCA TTTTACCTTTGCAATTAAATGGTACCTTGTGCCCCaaggtccaaaaaaca aaattgtgcCAATTATTTACCAGTGGTATGAAAATGAGTCAAATTTTATG ACACCTTTACTGCCAATATTGTCATCATCTTGATGtatccaaaattttat tttaatttgaagCTAGCAGtttgttaaaagttttatttttcagaagCTAC TATTAACATTAGTAATGTTaattaatatatatttttaattttcaggaaCT CTCTTTCCCTTTTACCAAAGACCCCTGGTGTCAAGCGCAAAAGACCTGCA TTATCATcacaaaatgatcaaatcaaatcacCAAGTAAATGCTCATCCAC CTTCGTGGACGAGTCTGAAAACAAGAAATTCAAGATTGATGACATGTCTA CAATTGCTGAGATATCGGATGTGTCAGTTTTTGACAACACTCAGAACACA TCAACAAGATCATTAAGGcctagaaaaaagaaatcagCGCCAAGGCCCTT AAAAAAGTCAAAGCGCATTGCCAAACAAAGAGCAAGTAATTTGAATAAAA GTATCGAGAACAAAAAGAACTCGACAATTGTACTTGACACACCAAGCCCT ATACTTGGAGAATCAACTCTTGCATACAATGATGCAGCAGACATTGTTGA TGACACCATATCTAAAATTTCTCCTATCAATCACCCTATACAGCCTCATG TTGCCTCTGTTATCAAACTACTAGCAAAGAGTACACAAAAGGTTACATCC AAAAAATCGATTTCACACCCCACCAACATGTTAGATGATGTCAAAATAAG TTTGTTTGGATACCAATTAGCagatgatgaaatgaaaatgtcaaggtatt tatttttattttaactacatttattactgatattattaGGGCGATAATCA AATAGTAAAATTTAgggttttttcttgaaattataTTTGGataacttttt ctgaaaaattcatctattttaggctttttgcacaaagtcaggtcattttt ctttaaaatttagtACGTATTCTTCTAGGTACCTTTTTATGTGTAATATT GGCAAAAATACTAAATCCAAAAACTGATTGTATTTATATATTATTtacaa atgaatttaaaaatactTCTTTGTGTGCTTGTACTTGTTGtggtattttt tttctccagaATTTTTGCTTATCATGCTTTATCCGATAacattgattgtt tttattattaCTTTACTTACTAGTCTTGATAGCCTGCAATGTTAGTCTTT TAACCatgaaaaatttgccaaatcttTAACATCTGATTCCTCTCGAATGT GCATTATCTATGATTGTGTCTTAGAAAAGGTTTCAAGGATCTTAaggttt tacccccccccccctctaatAGAGCTATTgtgaaaacaaaatcaatttaa cataaacattgtttttatctttttagcCCATCTGTATCTCTGATCCCACG GGCTGAATCAGTTTCAACTCCAATAGAAATGGCTTTAGATCCCCAAAGAA GCAATTCTGTGTCCACTCCTAAAGAAGCATCCCTTGATCCAAAAACTCCA AAAACTATCACTAAGTCAAAGAGTGTTTTGAACGACATTAGATTTGATGT GCTTGAACAAGATTCACCTGATGAAATTGAATCACCAAGGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000351_pilon:145613..159555+

>XLOC_023843.2 ID=XLOC_023843.2|Name=XLOC_023843.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1914bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000351_pilon:145613..159555+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGATACAAATGCAGCATGTATTATCTCAATTTTTGAAGCAGCCAA
AGAAAAGTTTGATCAACTTTCTGAGTTGATGGACGATAATTTTCTTTGGC
TGGAGCAAATTCAGGAGGAGGCTAGAAAAGCTTTTGGAAGATGATGGATA
CAAATGCAGCATGTATTATCTCAATTTTTGAAGCAGCCAAAGAAAAGTTT
GATCAACTTTCTGAGTTGATGGACGATAATTTTCTTTGGCTGGAGCAAAT
TCAGGAGGAGGCTAGAAAAGCTTTTGGAAGgaaCTCTCTTTCCCTTTTAC
CAAAGACCCCTGGTGTCAAGCGCAAAAGACCTGCATTATCATcacaaaat
gatcaaatcaaatcacCAAGTAAATGCTCATCCACCTTCGTGGACGAGTC
TGAAAACAAGAAATTCAAGATTGATGACATGTCTACAATTGCTGAGATAT
CGGATGTGTCAGTTTTTGACAACACTCAGAACACATCAACAAGATCATTA
AGGcctagaaaaaagaaatcagCGCCAAGGCCCTTAAAAAAGTCAAAGCG
CATTGCCAAACAAAGAGCAAGTAATTTGAATAAAAGTATCGAGAACAAAA
AGAACTCGACAATTGTACTTGACACACCAAGCCCTATACTTGGAGAATCA
ACTCTTGCATACAATGATGCAGCAGACATTGTTGATGACACCATATCTAA
AATTTCTCCTATCAATCACCCTATACAGCCTCATGTTGCCTCTGTTATCA
AACTACTAGCAAAGAGTACACAAAAGGTTACATCCAAAAAATCGATTTCA
CACCCCACCAACATGTTAGATGATGTCAAAATAAGTTTGTTTGGATACCA
ATTAGCagatgatgaaatgaaaatgtcaaggaaCTCTCTTTCCCTTTTAC
CAAAGACCCCTGGTGTCAAGCGCAAAAGACCTGCATTATCATcacaaaat
gatcaaatcaaatcacCAAGTAAATGCTCATCCACCTTCGTGGACGAGTC
TGAAAACAAGAAATTCAAGATTGATGACATGTCTACAATTGCTGAGATAT
CGGATGTGTCAGTTTTTGACAACACTCAGAACACATCAACAAGATCATTA
AGGcctagaaaaaagaaatcagCGCCAAGGCCCTTAAAAAAGTCAAAGCG
CATTGCCAAACAAAGAGCAAGTAATTTGAATAAAAGTATCGAGAACAAAA
AGAACTCGACAATTGTACTTGACACACCAAGCCCTATACTTGGAGAATCA
ACTCTTGCATACAATGATGCAGCAGACATTGTTGATGACACCATATCTAA
AATTTCTCCTATCAATCACCCTATACAGCCTCATGTTGCCTCTGTTATCA
AACTACTAGCAAAGAGTACACAAAAGGTTACATCCAAAAAATCGATTTCA
CACCCCACCAACATGTTAGATGATGTCAAAATAAGTTTGTTTGGATACCA
ATTAGCagatgatgaaatgaaaatgtcaagcCCATCTGTATCTCTGATCC
CACGGGCTGAATCAGTTTCAACTCCAATAGAAATGGCTTTAGATCCCCAA
AGAAGCAATTCTGTGTCCACTCCTAAAGAAGCATCCCTTGATCCAAAAAC
TCCAAAAACTATCACTAAGTCAAAGAGTGTTTTGAACGACATTAGATTTG
ATGTGCTTGAACAAGATTCACCTGATGAAATTGAATCACCAAGGTAAcCC
ATCTGTATCTCTGATCCCACGGGCTGAATCAGTTTCAACTCCAATAGAAA
TGGCTTTAGATCCCCAAAGAAGCAATTCTGTGTCCACTCCTAAAGAAGCA
TCCCTTGATCCAAAAACTCCAAAAACTATCACTAAGTCAAAGAGTGTTTT
GAACGACATTAGATTTGATGTGCTTGAACAAGATTCACCTGATGAAATTG
AATCACCAAGGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_023843.2XLOC_023843.2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000351_pilongenomesc0000351_pilon:145613..159555 +
Properties
Property NameValue
Aaloc742-957:13728
Aaloc142-738:12547
Aaloc1-138:1