XLOC_036675 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036675
Unique NameXLOC_036675
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000003_pilon:836495..848405-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036675 ID=XLOC_036675|Name=XLOC_036675|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11911bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000003_pilon:836495..848405- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TAAATGTAAGACGGGTTCAAGAAACGAGCTTGTCGGAACAGGTTGACGAG ATAAAGCTTTTAATGCTTTAAAGATTGAAACATAAAAAATAATCAGGAAT AATTAATTGATTTGATTATTGATTGATTTAATTACTGATTGATTGATTGA TTCTCTATTGCTACTTTGCCTAATAAACAATAGTCAAGAGGATACTGCGG ATAAAATTTATCAAAAAGTTCTGCGCCATCTTAAATAGGGCGAAATAGAA ACCAATCCTAGCTAAGGCCCGGACTCCACTCGCCTACGCTTTGATTGTAC TTCTCAAGCAAAATCTTTTATGTTGTTGGTCAAAAGAAAAATAAAGATAT GCCATTGTGGTCCATTCAGACGTACAGTCGAGAAAAGTTGAAATGCGCCT AATTTTTTTTAAAGTGCATAGTACTTTTTCATGATGCAATCTTTTCTCCA AACTAAAAGCTGATTGAATCCATTAAGATTATCGCAGCGCAGACAATGAA GAGACGTGCCTTCAGGAAGCTAGACTTTTTGAGTTTATAGCTATATACTT TCACTTTATGGTGTTTCTGTATGACTGTCTGTGTGCCTAGTCTAACCACC GTTAAATGCCTTCGGGAAGGTCCCTCCTAACTTGGAAAGCCAGAATTGGA GCTATTTCACCAAACTACTGGAGCGCAAGTTATTACGTAGGCTATCACAA CTGAAAAAGTTGAATGTATGCGCCTATACAAACTTTTTTCAGGTTTTCCA AATAGATTTACCACACTGAACAAACAGTGAAAACACTCTAAGTGAGGTAA ATCTATTTTGAAGACCAAAAAAAAATGTTTACATCGATTCACATTCAATT TTGGATTCATATGCTACATTCTACTTTTTTGTACTTTGCCGGTATCTTGT TTTACCGAGTTAAGAAAGATATTCCCGAGTTACGACCATATAATGGTCTT 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AGAACGTCACACGGGAACATCCGCATCTGCACCCCTTGCTGCAGGTATCA TCGCACTCGCCTTGGAGAAAAAGTAAGTTTGTGGTGAAAAACTCAAACCT TTCCTAATTTGAAAGGTTTTCCTATTGGTCATTTTAGAGATCCTTGGGAA ATCTTTATCCTCAATATAAATAAAGATTTCCATTCTTTAAAGGTATTATA CGGTGTTATATACACCCGACTCGTCTGAAACTGATGTCAGCAAAATTTTA ATAAAAGAGTCCTTTCAAATTTGTAAATAAAAGGAAGAAAAAAATCTTGC TCCACATTTTTCTTTATTCATTACAAAAGATTCTATTTATTTCAATCTGC TGAATCAACATACATTATAACTATGTAAAAGGTCAATGGCTTTAAAACCA CAAAAGAAATTATTTTTCAAACTCCAGCCGTAAATTGACTCGAGAGGCTA TAGTACAAACTGTTTTTCTAACCTTTTTTGCAAATCTTAGTCAATCTCAG TGGACAATTTCTTCGTCTATTTCAGCCGAAAGCTAACTTGGAGAGACGTT CAACACTTAGTTGCACACACTGCAAACTGGATTCCTCTCAAGAACGATCC CGATTGGAGAATGAATGGAATCGGGTTACATGTCAACGAAAAATTTGGAT TCGGTTTATTAGATGCTGAACGATTAGTTAAATTAGCTGACCCAGCAACC TTTAAATCTGTTCCCCCGAAACACGAATGTAGTGGTGAGAAAACCAGTAG TACAAAGTAAGTCTGCACTTTTTCCCATTTATTTAAATCAAGTCTAGTTA ACGAAAGTTAATCCTGTGAAAATATATTCTTTACAATTTGAGGGCTTCTA CCTTTGACTTCAATGCTACGAAGAGGTTAGACCTGACACTTCTGGATGGG AAATGAAGCCACTTCCCATCCAAAACGTGTGGCCCACTTGGTTTTTACAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000003_pilon:836495..848405-

>XLOC_036675 ID=XLOC_036675|Name=XLOC_036675|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4950bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000003_pilon:836495..848405- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTGGGCTGAACAACAACATGAATACGTTCGTCACAAGCGAGGCGTTCAT
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GTTATGATCCTACCAACGAAAATAAGATGCAGCAGCGAGTTGGGATGTCA
ATGATAACGACCCCGATCCAATGCCTCGTTATGATCCTACCAACGAAAAT
AAGCATGGGACTCGTTGTGCTGGTGAAGTTGCCGCCCAAGCTAACAATTC
AGTTTGTGGCGTTGGTGTAGCTTTCAACGCCCGAATCGGGGGCGTTCGTA
TGTTAGACGGGCGTGTCACTGATCGAGTCGAAGCAGAATCATTGAGTTTG
AACCCACAATATATTGATATCTACAGTGCAAGTTGGGGACCCTCTGACGA
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ATGGTATTAATAAGGCATGGGACTCGTTGTGCTGGTGAAGTTGCCGCCCA
AGCTAACAATTCAGTTTGTGGCGTTGGTGTAGCTTTCAACGCCCGAATCG
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ACCCTCTGACGACGGGATGACCGTTGAAGGGCCAGGGACCCTTGCCACTG
CCGCTTTTCAGAATGGTATTAATAAGGGTCGTGGTGGTTTAGGATCCATC
TACGTCTGGGCTTCAGGGAACGGTGGGCGACATGATGATTCGTGTAATTG
TGATGGTTACACTGCAAGTATTTATACGTTGTCAATCAGTTCGAGTTCCG
ATCATGGTGAAAGTCCTTGGTACAGTGAAGCATGTGCTTCTACACTGGCT
ACAACTTTGAGTAGTGGAGCACATGGTGAAAAACGAATCGGTCGTGGTGG
TTTAGGATCCATCTACGTCTGGGCTTCAGGGAACGGTGGGCGACATGATG
ATTCGTGTAATTGTGATGGTTACACTGCAAGTATTTATACGTTGTCAATC
AGTTCGAGTTCCGATCATGGTGAAAGTCCTTGGTACAGTGAAGCATGTGC
TTCTACACTGGCTACAACTTTGAGTAGTGGAGCACATGGTGAAAAACGAA
TCGTGACAACTGACTTACGAAATCAATGCACAGAACGTCACACGGGAACA
TCCGCATCTGCACCCCTTGCTGCAGGTATCATCGCACTCGCCTTGGAGAA
AAAGTGACAACTGACTTACGAAATCAATGCACAGAACGTCACACGGGAAC
ATCCGCATCTGCACCCCTTGCTGCAGGTATCATCGCACTCGCCTTGGAGA
AAAACCGAAAGCTAACTTGGAGAGACGTTCAACACTTAGTTGCACACACT
GCAAACTGGATTCCTCTCAAGAACGATCCCGATTGGAGAATGAATGGAAT
CGGGTTACATGTCAACGAAAAATTTGGATTCGGTTTATTAGATGCTGAAC
GATTAGTTAAATTAGCTGACCCAGCAACCTTTAAATCTGTTCCCCCGAAA
CACGAATGTAGTGGTGAGAAAACCAGTAGTACAAACCGAAAGCTAACTTG
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AAACCAGTAGTACAAAAACTTTATCATGGGACCAACCTTTACAATTAGAA
ATCGAAAGTGATGGCTGTCAAAACACCGGAAACGAGATACGCTACATAGA
GCAAGTTCAACTTCTTTTAAGTATCGATTACACCAGGCGTGGTGACTTAA
CAATATTCTTGACGTCACCTATGGGAACTAAATCATGCTTACTTCCAATC
CGTAGTGAGGACTCTTCAGACGAGGGCTTCCATAGATGGCCTTTTATGAC
TACGCATGCGTGGGGTGAAGATCCACGTGGTAAATGGATCCTGGAGATTA
AAGATGGCGGAGAATCACGTTCGAAAACTGGTTTCCTTAAAGATTGGCAA
TTAGTTATTCACGGTACTAAGGAGAAACCAGATCATCAAAATATCACACA
TCCTGATATCCCTACACATAAAAAAGCGGTCTCCGATGATACCCATAAAC
CTGAAAAATCATCAGTTCAAATCACACAAATTACCTATAGTTTCGGTGCC
AATCAACCTAGTTCCCAGCCTTCTTATACTCCGACCCATACCGCTGAACC
AGTCGCAACAGAACTTCAACAACCCGTACAAACACAACAACAACCTTCAC
CTAGCCAAGTAGATTACACACAACAAACTGCTCAATCATTTCCATATACA
ACTAGCACTGCAACAGATTATACATCAAGGACTAGTATCCCAAGCTATAC
TAATAATAATTATCCGAATATATATAACCCGCAAGTCAACATGGGTGCTT
ATGACCAAAGCGCTGTATTGCGTTCACAGACCTATCAACAACCTTACGCG
CCAGCCAGTGCTGATACAGCAGCAGCTAATAGTAATTTATGGGACTTTTT
TGGCCGAATGAATGGACGACGAGCGATCCCTGAAGACGACGAATATTATG
GTCCAGTGGACGAATGGGCTGATTCGAATAGTTTTGTTCAATTGTTGCAA
CGTTTAGAAAAAATTAATAGGGGTTATGATTAGAACTTTATCATGGGACC
AACCTTTACAATTAGAAATCGAAAGTGATGGCTGTCAAAACACCGGAAAC
GAGATACGCTACATAGAGCAAGTTCAACTTCTTTTAAGTATCGATTACAC
CAGGCGTGGTGACTTAACAATATTCTTGACGTCACCTATGGGAACTAAAT
CATGCTTACTTCCAATCCGTAGTGAGGACTCTTCAGACGAGGGCTTCCAT
AGATGGCCTTTTATGACTACGCATGCGTGGGGTGAAGATCCACGTGGTAA
ATGGATCCTGGAGATTAAAGATGGCGGAGAATCACGTTCGAAAACTGGTT
TCCTTAAAGATTGGCAATTAGTTATTCACGGTACTAAGGAGAAACCAGAT
CATCAAAATATCACACATCCTGATATCCCTACACATAAAAAAGCGGTCTC
CGATGATACCCATAAACCTGAAAAATCATCAGTTCAAATCACACAAATTA
CCTATAGTTTCGGTGCCAATCAACCTAGTTCCCAGCCTTCTTATACTCCG
ACCCATACCGCTGAACCAGTCGCAACAGAACTTCAACAACCCGTACAAAC
ACAACAACAACCTTCACCTAGCCAAGTAGATTACACACAACAAACTGCTC
AATCATTTCCATATACAACTAGCACTGCAACAGATTATACATCAAGGACT
AGTATCCCAAGCTATACTAATAATAATTATCCGAATATATATAACCCGCA
AGTCAACATGGGTGCTTATGACCAAAGCGCTGTATTGCGTTCACAGACCT
ATCAACAACCTTACGCGCCAGCCAGTGCTGATACAGCAGCAGCTAATAGT
AATTTATGGGACTTTTTTGGCCGAATGAATGGACGACGAGCGATCCCTGA
AGACGACGAATATTATGGTCCAGTGGACGAATGGGCTGATTCGAATAGTT
TTGTTCAATTGTTGCAACGTTTAGAAAAAATTAATAGGGGTTATGATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036675XLOC_036675-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000003_pilongenomesc0000003_pilon:836495..848405 -
Properties
Property NameValue
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