|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000024_pilon:282907..291534+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038530 ID=XLOC_038530|Name=XLOC_038530|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8628bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000024_pilon:282907..291534+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atGTTACCCTTAACAAGGACAGATCAATATAAAGGGGATGAGTTCAAACC
AGGAGTCAGAATCTGGTGTCGGAAAATCCTCATATGGATCAAGTAAGTTT
TTATTCTGTCTCATCTTATCATGAGGAGCTATCATTGGTCTTTATTGATA
GTCCTTTAGGCAGTGATACTACCATTTTCGTTTGACGTTTACTTAAGTGt
ttttttCTCGTCAATTTCCATTGTTTCAACAGAATTTCTCTGAAttatta
aaagaacaaaaagaacaaaCCACTGGAGTAACCATCAATCAAAATGATAG
TGCCATCTCCTTTCAAATGATAAATAActtaaaaaatccaaatttcttAC
TGCTACTTCTAGACTCAGCAGCAAATGACTTTCCTTTTAGGTTGCTACCt
aactttttcataaaattctttCAAGTATATTTGACCTCTCTAATATaaaa
aaaCTATTAATAATATGATTTATTCCCTCTTGGAAAAAGAGCTACTACAA
TGACTCTGACCATTGAACGACTTATATGAAAGATAGAGACAGTTATGTAT
ATTATCTACAATTTCTTTCTAGATCCATTTTCGAAGACAAAACATCAAGA
AACATATTCTGTTTTTTAGTATTAAATTTGGTTTTCGCTTTTCTTGAATT
GTTCTATGGTATGTGGACCAACAGGTGAGATATTGtttgcaaactttttt
taatatatttttttctaaataccATAAGCCAAGACTCCTTGTTACAGAAT
CATAAATAATGTATACTTACTTCTTACATGGCCCCATTTAGTACACTAGG
TTCTAGCTATATAGCCCTAGAATGATCAAGACTCCCTCCTCCTTAGTAGC
TAGGTTCTAGGTCTCCAAAAGTAGATgttttgaagttgaaaaatatctGA
ATCTGATACAATTCTTTTGATTGACCAGCATCATCAATTTATTTTCTGCT
CCTTTCGATCCTGGTCACAATTTTAGTTCCTGTGGTACATCAATAACAGG
CAAGAAATTTTTAATGTCACAATACCCTTAATATTTTCATGGCACATTGA
AATAATCTagtttctaatttttctttttactttttagtttgggtttgatt
tcagattcttttcACATGTTCTTCGATTGTACTGCTTTATTGACTGGTCT
TATTGCAACAGTTATTTCAAGATGGGGCAAAAACGAACGCTATTCATATG
GGTCAGTAAATTCTATTCCTTAATTCCTTCCTCTGTCTATTTTGACACAT
TGCTCTTTAAGCTTACTGTATAATatttataataaataaataagaataAG
ACCTTGTTTAAACTATAACTATTGTTGAATTGAATGGATTCAaggctttg
aaatattttcgaaaagttttctgaaatttatattgttttctttgtaattt
ataGCCCACCAATGTAgtcaaaaatggccaaaattatataattatattta
tattttgtcGTTTTACATTACACTCTACGGTGTTGACTTGTCATTGGTGA
TAATCTTCAATCATGTTATTTGTTATTTTCAGATACGTTCGTGCAGAGAT
CATGGCTGGTTTCATGAATGCTCTTTTCTTGATGTTTGTCGCCTTCTTCA
TCTTCTCGGAAGCTGTTGAGGTATATAATATAACCCATGTTGATTCTTTC
GATTTTGTTGGTCAATAGCACAGATACTTTTTTAAAACACTAGACGAACC
TACTCTATCCGTACTGAAGCATATTTTTGAAGGCGTGCCTCTTCTATGCA
ATGACAGAGTTGTCAGAGATCTAGTGCCAGAAACTAAAAGTTCACGGTTC
CAATCCCCAGCTCATTCCGATGTTCAAAGctgagccggctggccgtgaaT
TCTCTGAAAACAGTTGAAAGACTGAAAGTCTtaataccgggtgtgccaaa
aaaataggcctaaaattgaaactttgacgTAACTTTTTCCAGTTAGaata
gaaatttgaaattttacatgcgTCTTAAGCAACCTATTTCGAAGCTTTCC
TGAAAGTTTCATTCTTATAGCTTTAGTAGTTTCAAAGATATGGAGATTTT
CCTAAAGGATGTGAAAATGTGTTTGTTTATAGATTGTGCGCTATTTAAGA
TATTgtttatcaatttattttttgtatatttgTAGAGAGCCTTTCACCCA
CCTCATGTTGAGCATGAACGGTTATTGTTGATTTCAGTATTGGGTTTTCT
TGTCAACTTGGTTGGTATCTTTGTCTTCGGTCATGGACATGGTGACGACG
GTAAGACTCTATTCTCCTATGTGATTGTTACCACTATGCCTGGTGGTGTC
AAAATAATGGTTCACTTTTGACTTTTGTTTGGAAAACCTTCTTAATATAA
AACTCTTTTGTGCTTGATTGTAGGGGTGGATGGTTGGTAACTTTTATAGG
AACTAGGTATTAATTGACTAGCCTTAAATTAGCATAACACGTTGAAATCT
TATTCTCTAtgtatttttggacctacctccgggtaccccggtggaggtcc
tatgaattaaccgttgtcttttcgtccgtccgttcgtctgttaccagctt
ttctcgagattggctctttagtttttggcacaaagatgcaaaatggcaat
ggccaaaatgtcggaaatatgccggaaaaactgttttttggcattttctc
gagattttatcattagttttttctgattttttgctcaaagatgcgtatta
acaatgcccaaaacatggccaagttcgatttttgagaacaatttttttcc
ggccagAAATGCCGGAaacatgccggaaatcgccgtttttcaagattttc
attggaattcttccttataattggttgtatttcattcaaaatcatcattt
atagcaatgcccaccatcaagcatgtttcaattttcaataaaatcgattt
ttgaagccggaactatttaaaaattgctggaacaacctattttcgccgga
aagacagtaattcttgaatttctcgagctgtactttatatttttttaggc
aattttgcacactgatgcaaaatgacaatacctaaaatgtgacggagccc
gattttcaaaaactttctggCCGAAAGTGCCAGAAATAtgctagcctata
ctagacgtcacccgcgttttttacgcaattaacgtctattccactttgcc
actttttcgaatgtttggaacCTGGGCTCTctagaaatatgccggaaaac
ctctttttgacattttctcgaattttcatccttagttttttctgattttt
tgcagaaagatgcgtattcacAACGCTCAAAACATGTTTCGGTTGAAATG
ctggaaatgccggaaatcgccgtgtttgcagattttattggattttttcc
ttaaatatttctatgtttttttaaaacaaaaacagtcattattgataaca
atgctcaccatcaagcatgatttaattgtcaataaaactgatttttgtga
ccagaactttctatttattttttccgtACAGCCCTTCCCACTCCCCCCAt
taacaatcaatgatgaatttattgcgttatgcatttttgctaaacgctat
attttctgactgatttttttcatttttctcctcgcattgctatctaactt
ttatcatcaggtaggtctattcagcatctagcttgttttttcaGGACACG
GTCATTCACACGCTGGCTCGTCACATGGACACTCGCACGCTTTTGGTGGC
TCTCACGGTCAATCACATTCTCATGGCGAGGTTAGAAGTTTCATCATTTA
TTTCAAGACTTTGTCCTTAGATCGTTGTACTAAATATTATACAAAGccaa
gaacaaaacattgcttgcgaaaacgaaagtataacaCACAGACAAAATGA
CACACACagtacggctattaatatatagatagacAACATAATGAAAATGT
GTcgtcttcatctttattcaaaattagacTGACGATTTCCACAATGACTT
ccataacaaaaagaaagctgAGACAGGTGACCACGGACATTCACATGGAT
CGCATGGTCACTCTCACGAAGGAAATATTCAAGTATCAAGTAAACAAATC
TTAAATGGTATGTcattttttgttggtttttatGTGTCGATACTTACTGC
CTTATTGACAGTGGTCTTACTTTTTTGCCCAGAAAGGctattttggctat
tttgaaaaattttcagttatttttcCGTAATTGTTCTTCAAATTGACTCG
AAACTgatcctaaaatagcactttcaacccttcaaaattcaaatttcttc
tcttttacccaaccatggtgggtaaCGTCAATCCACTTCAATATTTGGCC
CCCTCACTTCAGCCCTTAAGCCGGGGGCCCAGCCTTAAACCCTCTGAGCA
TCTTGTTATGTTTAATGAATCAGGCCATAATTGAGAGGCTTTTGGCCTTC
CATAAGATTTCAGAATTGTTAAggcaaagaaattgaaattttgttgcttG
TATTGAAAAAGAAGGTGAAATAAAGATTGCAGATCGGTCGCTTGTTAAGT
TTTAATTTATAGACAAAAACATCCGGCGATGTCTTTATCAATAATGATAA
TGATggggaaaattaaaattttgcagagctccaaagttataaaaattgga
aaagtcAAATTCTCTGTCTCGTGGGTTTCTGAAATTAGATATGAAACAAT
GCTGGAAAAACCTCCTTTTATTACAGCTCTATTAGATGTAAACAGGCTAG
CTTTTCTCGATGTCGAGTTGTTCTTTTAACTGCTTGCTTTTTGGatctac
cccggtggggtggaggtcctatagaataacctttgttcgttcgtccgtcc
gtccgttcgtctgttaccaacttttctcaggattgaatcataggaatctt
ttgatttttggtaaaaaggtgcaaaatggtgatggccaaaatgtgacgga
gcccgattttcaaaaaaaaaaaaaatttgggcaaatttgggccaaaaaaa
ggctaaaaaacgggttttttggagacggagcccgattttcgaaaaaaagt
gtttttgggtaaatttgggccaaaaaacagctaaaaaaaagttttttaga
ctttatgaaatattgtttttttttgcatgaaagtaggtaaaagatggatc
aagtagattttttgtgaaaaagtgaattttcagctcaaaaaacgcatgtt
ttaatatctataagaatcgctattaataagcatacatgaatatgaaagaa
tatttcaagagcatgaaattttggtttctaaacgtttttctataagaaac
aaacgactaatttttatagatcgtcactatttctgttctgaatgattgtt
taatggtcacgctcacgtagatatcaattatatatgtgttaaatgcataa
ccaggtaggtccataaaagtatcacttgtttattttttattttatttcag
gtGTTTTCTTGCACATTTTGGCGGACACTTTGGGTAGTGTTGGTGTTATC
GTATCTTCCCTTCTCatcaaatattttggttggatGATGGCTGACCCAAT
ATGTTCAATGATGATCGCTATCCTCATCTCTCTAaggtatgtttttaaaa
ttctcaCCCAACTCGCTGGAATGTTTTGTCTGTTTTGATCGAGTAATGTT
CACATGAAAAGTAGACAAATAGTCTGAATAGCAGACTTTTACAAAACCCT
TGGTAGGTAGTATttaaggagcacgaatctgttAGTGGATGTAAACAGCC
TAGTAGACAAGGGATGTGCCCTTCTAGGGATAGTCCCTTTTCATAACATT
CTAAAAGCTCTAAAATGGGCAATTTTTGACAACGATTGAAGATAATAGAT
TATTAAGCACTGTTACTTAGGATtattgttaaaggttttattcttacata
agtgttcccgtttcatatcagacagatatttcatatcaggacagtgtctg
tcttTTGtaatattgtgctgatataattttcctctttctggcaaatcttg
ctccacattcgagtctatccaatgttaaaaagctggtgaattaaaattga
tgtgtaagcaaacgatatcagtcttatttaaaaacaaaacctttaaatag
tTTGCTGTGTGCGCAGAATGCATGATCTTTTATACCGGGAttcactttat
ttttctttgcatttttcAGTATCTGGCCGCTAATGATGGATACGTTATCA
GTACTGATGCAACGCACACCCAAAGAAATCGAATATGAACTACCTATCGC
CTACCAAAGGGTTAGAAACATTTTCTATTTGCCCTCTAACGTGTTTATAA
TTCTAAGAAATTTTCATGGCGTCAGCATTTAAGGGCTTTTCACAATTATC
TGTATCAATTTAATTGAATATGAACTATCTACTAAATGGTAAGAAAATTC
ATCACCAAGATGGTGACACAAGCATTGACTgaaaaattaggaaataaatc
aaatgaaaaatgaaaatccaattttctggGTTGGGTTTTTCACAGACGCA
TGTTTTGCCCTTCCTAGTTAGAAATAACTAGTACATTAGTTTGGCCGGTG
TCATCAGTACCCGGGGGTGACTAAATATGAGGAaaaattggaacattttt
gtCGACCCTTTAatattgggacaaatttgacaaaattttgattttttagg
ggtgaaaaattgaaattctccattttTCAATTCCTTAATGGGACTGTTAT
TTAAATTTCTTactttccaacccttacaggaACTGCTCGGTTccaaaagg
cacccttaagggcgacATATACCCGTACCTTCACTTGTGAAAGTATCCCC
TGGGCATCAGTACTTATCATAATCTGAGTaatgaatttcactttttttca
tccCATAGGTAAGCCAAATGGAGGGTGTATACAGTGTTCAAGATCCTCAT
TTCTGGACATTGTGCAGGTACGTTAAATTTTCCAGCAGTCATAATTTCTT
TTAGTGGtttgataccttatcggggaaaacttcgtcggggaaaagtgacg
aaattttggacaagtgacgaatattttccccgacgaaaattttccccggc
cttaatgcgtttaccaactaccagcaagtgacgaatttttccccgacgaa
aattttccccgtcgaaaattttccccgacgaagttttccccgataaggta
ttttcaTTCATGAGGGTTTTCTTTAATATGAGGTCTCGAATTCAGTTTTC
AGAAAAGCTGTAGTCTAGCAAACTAGatgactaattcagacataattgaa
ataagcaaaaagtaatggagggaacaattttagtttatacaaattaaatc
ccgtaacaataattgtattatcatataacgcctatactactgtattacac
gcattataaacgactccagtctagaaaCAGCTAGAAAAGTTGGTACCCTA
TTACCGTAATGTATTACCTTATCggtcaaaacttagtcggccttaatttt
agtcggccctaattattagtcggccctaattttagtcacctcgtcaaaat
ttagtcacaagggccgactaataattaagttttggtcatttataaatttt
tagtcggccctaattttagtcaccaagccaaaatttagttacttagggcc
gactaagttttggccgataaggtatttttaGGATTTCAGTACTTATTAGG
TTACCAGGAGTATAAACAAAACCATTTATTTCAGAAGCTCAACATTTTAG
TGCTTTGCGTTTAAGGAGATATAGGGAAAATTAGCGTGAGTGAAAGGTcc
gaaaattagaaaatgtcaCCAAAATGTATAGTTTTAGAATGAAGTTTAGT
GTGCACAATacaatgtcaattttttttcttatgtaaTGTTTTTCTCTTGA
TTTCAGTAAAAATTACATCGGAAACCTGAGGTTACTCATTTCTCCGAAGG
CAGATGCTGCGTCTATTCTCAGTCAAACACATGCGATCTTTACTCAGGTC
AGTCAATGTAATTTTAAGGCGGATTTAAGGGTTTGGCATCATCCGTGAAA
AAATGATATTCAATTTAAGAGCACATTCTGAAGTCGAAGAAAATCGGGGG
TCGATGCAAGGGGGTCGATGCAAGGGGGTCAGGCTTCCATTTAGATTCTA
CCTTGCCGTCAATTTTCCCCTGTTTCCGTTACACCCGGCTAAATAAGAAG
AAGATTGCTTTGAAACTCAAAGTTTATGTAAATAATTCCGAAATTTTTCC
GGACTAAGTTAGACCAATTTTTCGTCTCGGATTCTGGACCTAATTCCCAT
AATTCCGGCAACAATATGCGAATTAAAAGACAAACATACGGTTTAATAGA
GAAACCTTTCGTTGGGTGGAACTACTTGCCACccacccccccccacttat
taagttttggggaaatgtttttgaaaattccctctTTTACCCTAATCCTa
atgtattagcctccttttcaaaagttttccacttaggacatttttattcc
aacctgACTCCCGCTcattaaaattttgagaatgtTTCCACCCACCCCGC
TTATTCCGAACCCCCGCCCTCTCCCGTTTataaggtacccgagagtagat
atTACACTGAATTGGGATAACGAGTTCTTCGTGATGTAATTATTGGAAGG
CCTATTAatttgtgttttgatttttttttacagctTGGAGTAAAACAATT
GTACGTACAGATTGAGCGATCGTACTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000024_pilon:282907..291534+ >XLOC_038530 ID=XLOC_038530|Name=XLOC_038530|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2298bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000024_pilon:282907..291534+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atGTTACCCTTAACAAGGACAGATCAATATAAAGGGGATGAGTTCAAACC AGGAGTCAGAATCTGGTGTCGGAAAATCCTCATATGGATCAAatGTTACC CTTAACAAGGACAGATCAATATAAAGGGGATGAGTTCAAACCAGGAGTCA GAATCTGGTGTCGGAAAATCCTCATATGGATCAAATCCATTTTCGAAGAC AAAACATCAAGAAACATATTCTGTTTTTTAGTATTAAATTTGGTTTTCGC TTTTCTTGAATTGTTCTATGGTATGTGGACCAACAGATCCATTTTCGAAG ACAAAACATCAAGAAACATATTCTGTTTTTTAGTATTAAATTTGGTTTTC GCTTTTCTTGAATTGTTCTATGGTATGTGGACCAACAGtttgggtttgat ttcagattcttttcACATGTTCTTCGATTGTACTGCTTTATTGACTGGTC TTATTGCAACAGTTATTTCAAGATGGGGCAAAAACGAACGCTATTCATAT GGtttgggtttgatttcagattcttttcACATGTTCTTCGATTGTACTGC TTTATTGACTGGTCTTATTGCAACAGTTATTTCAAGATGGGGCAAAAACG AACGCTATTCATATGGATACGTTCGTGCAGAGATCATGGCTGGTTTCATG AATGCTCTTTTCTTGATGTTTGTCGCCTTCTTCATCTTCTCGGAAGCTGT TGAGATACGTTCGTGCAGAGATCATGGCTGGTTTCATGAATGCTCTTTTC TTGATGTTTGTCGCCTTCTTCATCTTCTCGGAAGCTGTTGAGAGAGCCTT TCACCCACCTCATGTTGAGCATGAACGGTTATTGTTGATTTCAGTATTGG GTTTTCTTGTCAACTTGGTTGGTATCTTTGTCTTCGGTCATGGACATGGT GACGACGAGAGCCTTTCACCCACCTCATGTTGAGCATGAACGGTTATTGT TGATTTCAGTATTGGGTTTTCTTGTCAACTTGGTTGGTATCTTTGTCTTC GGTCATGGACATGGTGACGACGGACACGGTCATTCACACGCTGGCTCGTC ACATGGACACTCGCACGCTTTTGGTGGCTCTCACGGTCAATCACATTCTC ATGGCGAGGACACGGTCATTCACACGCTGGCTCGTCACATGGACACTCGC ACGCTTTTGGTGGCTCTCACGGTCAATCACATTCTCATGGCGAGacTGAC GATTTCCACAATGACTTccataacaaaaagaaagctgAGACAGGTGACCA CGGACATTCACATGGATCGCATGGTCACTCTCACGAAGGAAATATTCAAG TATCAAGTAAACAAATCTTAAATGacTGACGATTTCCACAATGACTTcca taacaaaaagaaagctgAGACAGGTGACCACGGACATTCACATGGATCGC ATGGTCACTCTCACGAAGGAAATATTCAAGTATCAAGTAAACAAATCTTA AATGgtGTTTTCTTGCACATTTTGGCGGACACTTTGGGTAGTGTTGGTGT TATCGTATCTTCCCTTCTCatcaaatattttggttggatGATGGCTGACC CAATATGTTCAATGATGATCGCTATCCTCATCTCTCTAaggtGTTTTCTT GCACATTTTGGCGGACACTTTGGGTAGTGTTGGTGTTATCGTATCTTCCC TTCTCatcaaatattttggttggatGATGGCTGACCCAATATGTTCAATG ATGATCGCTATCCTCATCTCTCTAagTATCTGGCCGCTAATGATGGATAC GTTATCAGTACTGATGCAACGCACACCCAAAGAAATCGAATATGAACTAC CTATCGCCTACCAAAGGTATCTGGCCGCTAATGATGGATACGTTATCAGT ACTGATGCAACGCACACCCAAAGAAATCGAATATGAACTACCTATCGCCT ACCAAAGGGTAAGCCAAATGGAGGGTGTATACAGTGTTCAAGATCCTCAT TTCTGGACATTGTGCAGGTAAGCCAAATGGAGGGTGTATACAGTGTTCAA GATCCTCATTTCTGGACATTGTGCAGTAAAAATTACATCGGAAACCTGAG GTTACTCATTTCTCCGAAGGCAGATGCTGCGTCTATTCTCAGTCAAACAC ATGCGATCTTTACTCAGTAAAAATTACATCGGAAACCTGAGGTTACTCAT TTCTCCGAAGGCAGATGCTGCGTCTATTCTCAGTCAAACACATGCGATCT TTACTCAGctTGGAGTAAAACAATTGTACGTACAGATTGAGCGATCGTAC TAActTGGAGTAAAACAATTGTACGTACAGATTGAGCGATCGTACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000024_pilon | genome | sc0000024_pilon:282907..291534 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1105-1149:8584 |
| Aaloc | 1015-1104:7808 |
| Aaloc | 955-1011:6809 |
| Aaloc | 865-954:6121 |
| Aaloc | 730-861:5403 |
| Aaloc | 598-726:3928 |
| Aaloc | 514-597:3647 |
| Aaloc | 397-510:2136 |
| Aaloc | 310-396:1534 |
| Aaloc | 196-306:1089 |
| Aaloc | 94-192:574 |
| Aaloc | 1-90:1 |
|