XLOC_013421 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_013421
Unique NameXLOC_013421
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000475_pilon:90098..110030-

Legend: polypeptideCDS
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>XLOC_013421 ID=XLOC_013421|Name=XLOC_013421|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19933bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000475_pilon:90098..110030- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCCTATGCTTTCCATAGAAAGTTCAGCCAAAGGCTTTCGTAATGATGTAA ATTGCTTGCCACGGCTGCCACGAAAAATTGAGCCATAGACTTCACAGTGA TAACTACGCTACGATTGCCACGAGAAATTTAGCCATACCACAGTGTCTTG CTGTGGTCTTTATATTATATGATTGCCACAGCTGCCACGCTTGCCACGAG AAATTTAGCCATACCATAGTGTCTCGCTATGATCTATGTATTATGATTGC CACAGCTGCCACGCTTGCCACAAGAAATTTAGTCGTATCATAGTCTCTCG CTGCCATCCTTATATTATATGATTGCCACAGCTGCCACGCTTGCCACGAG AAATTTAGCCTAGCCATTGTGTCTCGCTATGATCTATGTATTATGCTTGC CACAGCTGCCACGCCTGCCACGAGAAATTTAGTCGTACGCGATTGCTGTG AAATCTATTCAACGCTTGCCACAGCTGCCACGCTTGCCACGAGAAATTTA GTCGTATCATAGTCTCTTGCTGTCATCCTTATATTATATGATTGCTACAG CTGCCACGCTTGCCACGAGAAATTTATTCGTATGCAATCGCTGTGAAATC AATTAAGTGCTCGCCACAGTTGCCACGCCTGCCACGAGAAATTCAGCTAT AGGCTCATGGCATGTACTTAGCCATTACACTTAACCGTGTAATGATAACT GTGGAATGTAGTCCAATATACTATTATAACATTATATGATAATAGTGATG TTATTATTTACGTAGTGGGTGTAATGTAATGAACTGAAAATATTTAATGT ATATCAACACTTATTTCAAACGCACGACAGTCCTTTTCAGAATGACGTGA AAAAGGACGGCAGTTTCAGACACACCATATATCGCGACTTAGCCAAATTT TGAAAATCCGATTTTTAAGGGCCGGAAACGACGTTTCACAAACTTGTGAT CTGCTAATTTTTTCCTGTGATAGATATATTAACACTTTATCGATGTATAC ATTTTATAACAAATACTTTTAATTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTCGAAAAG TATTAACTGATGAATGGCGTAGAAAGCTTCTTATTTATAGGCTATTTTCA TTCTCAGGTTTTTATTATTGTAAATAGATATGTTAAAACGAAAAGAAACT TAAACTTAAGTACAGCAGAAAAGTCGGTCTAGAACCCGGTTTGGCGTCCC GTGCCCGAGCGTCCGCCTCAAAGAGAGAGGGAGAAGAAATGAAGAAAAAA AGACATAATAAAAAAATAAAGTAAATAAACGACAAGTCCGATATTTTTTT GCAATTTTATTTGTAAACAAGGAAAACTCTTGACAGCAGATTTATATAGG GGGGAATAAGAAAAATATGCTTCAATTGATGAGCAATGATACAAATTTAA CCGCATCTTCACAATTCATGTCTACCAAAAGTCCTTTTTAAAATGTCCTT CAGCTTATGAGGCTGAGCACCTAGTCTGGAGACCATACTCTGTTACAAAA ATATTTCTATCCTGTCAAAATCCCAACAACTTCACTGAAATGCAGAGTAT GAAATTATTGACTCAATTCAAATCACTTCAAATCACAAAAGAAAAAACCG TTATCTTTTCAAAACAATTCAAAAGCTCGTGCCACTTCTTGAAACAATAG AGCTGTTTGACGTCATACTTTTGTTTATCAAATCATAGCAATAAAATATT AGCCAATCAAATTCTGCGATTGATTCTTGCATCTTGTATAATTCCTGGCA ACTATACTGGGTCTATACTTTGATATTTTTTTGAAACCACACAGACAGAG AAGTCGGGTCTCCAAGCTACTGAGCACCTTGATCACCTTCTCTTAATTGC CCCCGCAGGAGCGTAGCGATGAGGAGGCACTCA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000475_pilon:90098..110030-

>XLOC_013421 ID=XLOC_013421|Name=XLOC_013421|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=684bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000475_pilon:90098..110030- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATCTTTGAAAGAATCGTTATTATCTGTTGATCATACCTTCAAAAT
GTCATCTTTGAAAGAATCGTTATTATCTGTTGATCATACCTTCAAAGTGG
CTACAAACATTGGGGGATTTCAAACACATGGAGAGGAAAGAGTTTGGGTA
CAGCTTTACAATTCACTCTTTATTGTTATGAATGAAAGAAAAGAAATAGT
ATCTTGGCATTTTACTAAAAAAGAAAAATTTCAGTTTGTCCAAGATCTTT
TGTCAAATATTGGAGACAGGTGTAAAGATGACTTGCAGTATTTTATTTCT
GATACGTGTTGCAAGTGGAAACTCAAAATATTTGAATTGTTTGGAGAGCA
TATTGTGGCTACAAACATTGGGGGATTTCAAACACATGGAGAGGAAAGAG
TTTGGGTACAGCTTTACAATTCACTCTTTATTGTTATGAATGAAAGAAAA
GAAATAGTATCTTGGCATTTTACTAAAAAAGAAAAATTTCAGTTTGTCCA
AGATCTTTTGTCAAATATTGGAGACAGGTGTAAAGATGACTTGCAGTATT
TTATTTCTGATACGTGTTGCAAGTGGAAACTCAAAATATTTGAATTGTTT
GGAGAGCATATTTGCCCCCGCAGGAGCGTAGCGATGAGGAGGCACTCATG
CCCCCGCAGGAGCGTAGCGATGAGGAGGCACTCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_013421XLOC_013421-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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Aaloc1-48:19934