XLOC_035078 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035078
Unique NameXLOC_035078
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000486_pilon:45792..55785-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035078 ID=XLOC_035078|Name=XLOC_035078|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9994bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000486_pilon:45792..55785- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCAGTTGGTGAAGGCGGCAAGATGGCGTACGTAGAAAGTGATAAAACGGA TAAAAGTGATATTTCAAGCAGTTTTGAAAATGATGCAAGTTTAAGTGATA ACGAGACAGAGAGCAGAGAAGATCTAATAATAAATGAAGAAGATTTGAGT GGTGGCTCAGATGATGCGCCAACTGGTTGAGATTCCAAACCTTGTTTTTG TTAACGAGAAAAACATCACTGTGCTTGTTGAACAAGACAGTCAACAAGTT CCTGAGCACGTGTTTGGAAAAGCCATAGATTAAGCAAGAAAAGCAAAATT CCAATGCCCCTACTGTGGAGAACTCGACATCAGAGAATTCCATTATAAAA AGCACTTGGATCTGTGTGATAAAAAACGTAAGTCTTAAAATTGTTTAAGA AAGCACAGCTGGATGGAAGAAACGTTTGAAAAGATTTTGTAAATAAAGAA TTTTTGATTTGGTACTTTCAATTAGCAAAAATAATTTTTACAATTACACG CCTTTTCTCACTTGGACATGTTCATAAAAAAAGGCAAGTTTTTGAGGTTT TTGTGACATTTCAGACCTATGTTACAAAATTAGCCTATATTTTTCTAACA GAATTTGATCCTTCTCAAAGAATAACATGATGGTTAGCTCATTAGATTTC TGTTGGCAAATTATGTAACAGCAATTTCCAAAGTTTAGTATATCTCAAGT TATGATAATTTGAATCTTGCCAGAATTCTGGCTAATGATGTAACATTGCA ATTTTCTAAAAAGCTGGCTAATGACTCTAAAACAGCTATTAGGCAATATT CACATAAAAAATGGTACATTGGCATCATTAGGGGGTTGAAGGGGATTCTA TTGGCAATGCATTCGGGTTAAAAAGTTGATCGGCTAATGGTGTAACAAGG CTGAGATGTCCCAATGTGCTGTTCCATTTAAGCCAGATTTTTTTGACATA 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AACCAGTAAACAAACATTGCAGACACAAACAGCTGGTTGAAAGTGAAGAA CATGAAAATGAAGAGCTGAAAATGTAAATGAACTTACCATGGAAAGGTCA GTGCTTAGTTAACTTTTTTGTGTTCTTAAAACATATTCTTTATTTCTTTT TACTTGTGATGCCTTATTTAAGAGCAAAATAGTTATTATCTGAGAATAAC TGAAGGCAGTACTAGGAAAAAAATTAGCAAAATTAATGATCAAAATTACA AAAAAATTAAGAAAATTCCAGCCACACAATAATTATTCTCTTTTATTTTC AGCTCTTCTTCTCAAACAATCAAACAAGTTAACTGCAAGAACATTGGCTG CAAACAAAGCTTCAATTTCCGTATTCAACTGAGCAGACATCTCAGAAAAT GTACTTTTCCATCACCACCAGCACCAACAAAAACACCATTTTTTCGCGAG ACTGCAGACAAAAAATTTCAATGCATAAATTGTGAGACATTGTTCAACCA CAAATCGAGTGTCTCAAAGACAAAAACAAACTAACAAACAATTGTGATGT TTGTGGAAAAGGCTTTGGCCGTATTTCGAGACTTGAGGAACATAAGAAAA GCCACAACACAGAACCTTATGTATGTCGAAAGTGTTATCGTGAGTACAAA AGAAAAGATCACTTTTTGAAACACATCAGAGCTTGTACAGACGTTTTGCC ATCCTTTTCACTTCTAAACATCAATGAACCCCAATCCACAGGATCTGCAT CCAGCCAATCTGAAATACAACCTGATTATACTTCAATTCAACCAACCTCA ATAAACCAATCTTTGATGACTAAGTTGTCCAATCCTTTGCATCTGACACA ACATTTGAAACTGATTTTCTATCATCGTCTACTATTGAAGATGGAACACC TTTCAATGGCCTGATATCCATGTGTAGGGATCCAGTTATCAGTGACAATT CTGCAGCAGAACAAAGTACATCGAACACTTTTAATCACAATACCGATCAA ACAGTTCCATACATAGAAATTGACAATGAGGAGCATGATATTGCCATGTC AAATGAACAAAATCATCAATCTGTGCCCTCATCCTCCATTTTATCACCAA AAAGCAACGCCAGACAGCGACAAAGAAAAAAGAGGAGTCTAGACTCAGTG ATAAACGTGTTGAGTGAAAAGCTAGACCCATCATTTATATTTGAAACAGT GAACGATATTGCTAGTATGCATCATGAGGACTTTGAACACATGACAAGTG ACGCTTTTATTGAATACCTTATCAGCATCAGGAACAATGATAAATCATTT GTTATTCTCTTAAAAGACTCTTTTGGTGATAAACTAGATAACCCACAGTT CTTTAATTGGTTGTCAAAGAAATTGCTTTTCAAATTCCCCAGCTACTTAC AAAGGAAAATTGAGCGTTGGGAAAATAATTCCATGAAAGAAGCCAGAGGA AGGGACAGCCTATCACTAGAAGACCGTCAATTTGTTTATAATCTCTGGAT AGAAAATTCAATCCCCTCTGTTGACTTTAGAAATGGCAGGGATAATATCA AACTCAGGTTTGATAAGTATGATCAACGTTTTGCTGGGCTGGTCAATGAC CTGGTTCCTGTAGAAGTAAAAGCCAAACGAAAAACAAAAATTTATGTTGC CTCCCGTCGGGTTGCGACATGTACAGTGCGCAAAATGCAAACTTAAGTCT TGTCAGAAAGAGGACTGCATATCAGTATTGGCCTTCTCTCCAATTTGAGG CCTTTCTTCGTCACAGACCCAACAGACAAAGAGAAAGTCGTGTGTATGTG TAAATTGTGTCTGAACTTTAGATTGAAGTTCAATGCCCTTATGTCACATT CCAAACGTCATGGAGGTGAGAGTTTTGATTCTATTTCAAGATATTATATG GGCTCGTGTGCCTGTAGCAAAGGTGAAAATGAATATTGGACCCTAAAATG TGTAACTGGAAACTGTAACGAATGCAAAAATAAGAAACTCACTGTAGTTC CAAAGCTTGATGAAGGTGAGCTTTTAAGTTACAACTAGTTTACCGTCAAA ACAACGGCTTATATTTGTAAAAAAACCAAAAAACAAAAAAATTCAACCCA AACTGTCAGGGAAGGCCTTCAAAGAAACGTGAGAATGGTTCATGACGAGT TGTTGTCTGAATCAAGTAAATACCTGAAACATCGCTTCCAAATTGAGAAT GATCGATTCCACTGGAAAAATGTACTTTCTCAAAACACTGAAACAATTTT TCACATGGATTATTCTGAAAATGTATCAGGTTCTCCCAAATTTGAGCCCC AAGATGCTCATTTCAGCAAAAAACAAATTTCACTACATTGTACGGTTGCT CATCACGAGGACAAAAATATATACATTTATCACTTGTCTGACAACCGTAA ACATAATTATTGCTTCACCAAAGCTGTCATTGAGGATCTAATCCACCGCT ATCCAGATCAAGAAATTTACAAGTTTAAAAGTGACAATTGTTCTGAACAA TATAAATGTATTCCCCGTTCTCAGCAAACTTTCACAAATTAACAACAAAA CTTTTATTTACTATTATGGGGTGAAAGGGCATGGCAAAGGCTTAGTTGAC GCCATGAGTGGCTTTGGGCTTAAAACCCCATTAAGAAAGGCAATTGTAAC TGAAGACGTTTTCTTTGACAGCTCAAAGGAAATCTATGAATTCATTTCTA ACCTTATGAAAGAAGATGATACAAAGCAATACGAATGTTTGGATGTTATT ACCGTAGACCCAGAAGTGCAGATGCCTGTTCCTGTGACAGTCACATGATG TCCTACTTTCCCTCAGGAGAGATCCAAATGAAAGAGGAGATTTGTTCCTG CCCTCAATGTTCTATTGGGAATTTCATAAGTTGCGAGGATCCCTCTACTG GCAGCAAAGGTCATATCGTGTGTGCTGAGGACTCCAGTGAGGATGACAGT GGGGACGATGATTATGATAGCGAAGAAGATGAAGAAGATGTTGTAGCCCC TGATATGGAGGAAAATGAACTGTTTACACATAGTGATTTCGGGGAAACAA TCAAGCCAGGTCAAATTGTCGCTATCTATTCGAGTGAAGGCTCCAGTGAT CCATTTTTCCTATGTAAAGTTTTGGAGAAAAAACATACCAATGATAATAT TTCCGATAAAAATGATCACCATATTCCTACAGATAATGATTACTTGGTAT GGTATTACCTTGAAAAAGCCTCTCAAGATTTTAGAAAACATTTTATTCAA TATAAATTGAATAAAAAACAAGAAATTTTCATCACATATAATCATGTCAT GTTTTCTGAAATTCCAATTGATGATGATTTAATTTTGAAATTAGAGGACT ACCAGTGGTTGACTGAAATTGGACTCACAATGACTGGTAGACATTAAAAA CTTTTTAAACATATTTATATACTATTTGTAGATTTCTGACAGTGACTTTT CTGATATACAAGTTTGATTTTTCTTCACTTTTCGCTAGGTTTGATATATC AGATCGCTTAGTATGGCTTATTGCTGTTAATCTCAATCTTTATTTTTGAT GGTTACACTTTTAGCCTAATTCCAGCTTTTTTTTATCTTGAAGTTCTAAT TTCATAAATTATCTTGTTCTATAAGCTCATTAGTTTTATTCTATATCCTT TTTAAAGAAGCTGTCAGAAGTTCCGTAGCTTTAGGATTACTTCTTAATAC GTTTTCATTAAAACAACTAAAAAAACTATTAATATTATGTTATGTTACAC TTTTAGCCTATTCCAGTTAAGAATGTTGAAGTTCTTATTTTTATAACTTA TTTTGTTCTATTAAAACTTATTATAGTTTTTATTCTAAATCTTTTTTAAA AGAAGCTTTCAGAAGTTCCAGCTCAGCATTACTTCTGAATTACGACGTTT TCAATAAAACAAAAATATGTTATATACGTTACACTTTTAGCCAGATATGG GCCTATACTGAAAAACTTTGACTTTAAGGCAAGTAATGAAATAATTCTTT ATATTTTTGAATTTTGTTGAACCCAATTCTTTAATTTTGAAACTTTAAAA TTTTGAAATTAGTCGTCGAACACTGTTTTTGTTACATTTTAGCCAAAATG TGTATTTTAACAAGAAATAAGCCAATTTAAGGTATTTCTATTGTTAAGTT TATAGTCTAGATAGTATATGTTAATTGTTTAAGTTCCATAAATTCTAAAT TATTGAAATTATGAATAGAAGTTGATTTTTTGAGCATGTTACTTCTTTAG CCAATATCTTCAGTTTAACGATGTGCAATTTCCGCGAATAACAACAGCGG TTAGGTAACATACAAAAGTTTCATTTTCAAGCCTTGTTCTAATTATTTTC ACCTGAAATAAAAATTTAGGTCATTTATAATGAAAATGTTACATTTTTGG CCATTTTCGGCAAAATAACCTACAAATCCAAAATCTTTCAAGTCTAGTGC CTTTGGACCTTTGTTACCTTTTTAGCCAAAAATTTTTATTGATCTAGAGG CTATTTTGAAGATTTTATCAACATAAAACGAATTTTTCTTAATTTTTGAA TGTCACAGAGCTTGCCTTTTTTATGAACATGTCCACTTGTGTTTCCATGT GTGATTATAATATAGATAACATGACAGCGCAGCAATAAAATTGTCTGAAC AATAAGCTTTTTAAGATGATGCTGTGTCATAAAAAAAAACTACAGTCACA TAAATACAACTAGCTTACTGGCACAAAAAGTATAAAGTATAGGCTTTTTA CCGTGAAGTGGGGTAACTTGCATCAGCGGGGGGAAGCTTGCATAGCCCCA TCAAATGACTGACCAATTAAAGCAGCAAAATTTCATACAAATAAACTACG CAGCTCTGCTCGCAGCTCTTCTCTATCATTTTTGCTTTGATTTTACTTTG TATTATTTTAATGACCAGACAGGTCATTCATTTGAGGGCAATGCATGTTT ACCTCCACTGATACAAGCTACCCGATCTCACGGTACTATTCCAATAAGGC TTTCCTTTGATACTCAAACTTTGCTACTGTTTCAGACAGTAATGGTTTCA ATAACTCTATTTTTTAGATGTCCAAGCCAGGCGTTCTGAGACCGATGCAA ACAATGATCACAGGAAAAAGTCATCAGATCACACAGGTGGGAAAACTTAA ATTCCGACGCCGTAATTTTCAAAAATCAATTTTTGCGTGTGGTTTTATAA ACTGATAAGGTGTGATTGTTTTGTCAGTGTGATTTCCGATATCACACTGC TGAATTTTTCAAATAGTTATTTTTACTTTTTTAAATTCGGCGTGTGAAAT CCAATTTAACACTTCTAAACTTCACTGGAAAGGCTTTATCGAAATCACGC GTGTGATTTCTAATTTCCGCAGGCAAATAAAATTTTTCAGTATGTTGTAC ACTATAAATTTTCGGCGTGTGAAATCCAATTTAACACTTTGTCAAACACT GGCAAATATAGTCCAAGAAGTATAAAACTTACACTACAAAACTCTAAAAA CGTAGAAGGACAAGAAAGAAACAAGAAATCGCAGTCATTAGTTCCCACGG GTGGGAAAGTCAAATTAACACGGTGGGAAGGTACAATTCCCACCCTTGTA CTACTCATGCGTAAAGAAAACCACAAGTGAAAATTGGGCCGAAACTGTTC AGATTGCATTCAAATCATAACATTATAAGGGTGTATTCGATCAGTGTGTA ACACAACGCTAAAGGTGAGGCGTCCCGCAAGGGCGGCCTCATTCGTTCGC AATGGACTTGCGTCACAAGGGCTCAGTGGATCGGTGAGACGGGTTTGAGG TCATTAAATTGGCTCTCTAGTGCAGCTCCACTGTTGTGACAAAAGTGCCG GGATTCTCAAAGTAGCGCAAGTACATGACAGAACGAATGGGAGCTATCGA GCCAATGCTCACGAATGATCGAATACAATTTATCAAATACAAATCAAAGC CATTTTCCAAAAACTTGGTGGGGAATCAAAATTTCGGCGTGTGGTTTTCG ATAAGATAAGCGAGTGTAAAATGCTAAATCCGACGTGGGATTTTCAATTT AACACGCGAGGAGAGAGGGCCTGAAGTACGAAATTCGACGTGGGATTTTC CATTTAACACGTGGGATTTTCGATTTAACACGTGGGATTTTGATTTAACA CGTGTATTGTTCGATTCAGCACACAATGTTTAAAGCGTGTGATCCTGCGT TAACCACGTCTGAAATTCAATTATACACGTGTGATTTTGAGGGGTGTGAT TTTGCGTTTCCCACCGGCGTAAAAACGAACCGATTCCCACGCGTGGGATA GCAGTGTGAAATATATACTTTCACACCGTGTGATTTTCACTTTTTCCTGT GGATGATATAAATAGTGACTTACATGATGCTGCTGAAGAGGATGTGTTGG ATTCGTTGTTCTTAACAAAGTTATTCCGATTGAAAAAAAAATAAATTTAA ACCAACCAGTGATCTAGTGGAATTTACAATTATTCAAATTTTCAAAATCA TGTTGTAAAATTCAATTCATGTCAACTGATAAAAATGATCAGTTTTAATT TTTGGTCACCTGTTTGAATAGCAATCTTTAAGTTTTATGCTTCTGACTTT TTCAAATAATAATACAATAAATATTTTCTCGTTTTATGAAATTGTTCAGA GGGGCATATCATATTTGGCAAATGCGTTTGAGGAAGCCATTGGGTATCCT TACTTTAACATGGCTGAACCTGGTATTTCTGTTGGAAAATTACCCCAGTG AAGTCCAAATTACTATCGTTAAAGCAAATAAAATGATGATACAAATGAAA GTGAAGAAGACCAATGTGACGATGCTTGTAAAGCGTTTAGAAGCTACAGT CGCAACCTTCTTGACATTTTCGAGAGTCAACTTGTCAAGGATTCAAAGAA CATCATCAAAAGAACCGCATCCACTTTTCAGAAATTTTACAACTATTGTA CTGATGAGAAAGAAATAAAACGCTGGGACGACTTACATGATTTGGTCATA GCAGCAGACACCATACATACCCAACCATTGTACAACTCCATATACTGAAC TATTTTCTAAGACAGTGCATATCAGCTTTGATAGCAGAAAATGAGAAAAA TATCAGCCTTGAAGAAACCATCTACTATGTGGCAGGATACATAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000486_pilon:45792..55785-

>XLOC_035078 ID=XLOC_035078|Name=XLOC_035078|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1922bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000486_pilon:45792..55785- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCAGTTGGTGAAGGCGGCAAGATGGCGTACGTAGAAAGTGATAAAACGGA
TAAAAGTGATATTTCAAGCAGTTTTGAAAATGATGCAAGTTTAAGTGATA
ACGAGACAGAGAGCAGAGAAGATCTAATAATAAATGAAGAAGATTTGAGT
GGTGGCTCAGATGATGCGCCAACTGGTTGAGATTCCAAACCTTGTTTTTG
TTAACGAGAAAAACATCACTGTGCTTGTTGAACAAGACAGTCAACAAGTT
CCTGAGCACGTGTTTGGAAAAGCCATAGATTAAGCAAGAAAAGCAAAATT
CCAATGCCCCTACTGTGGAGAACTCGACATCAGAGAATTCCATTATAAAA
AGCACTTGGATCTGTGTGATAAAAAACTCAGTTGGTGAAGGCGGCAAGAT
GGCGTACGTAGAAAGTGATAAAACGGATAAAAGTGATATTTCAAGCAGTT
TTGAAAATGATGCAAGTTTAAGTGATAACGAGACAGAGAGCAGAGAAGAT
CTAATAATAAATGAAGAAGATTTGAGTGGTGGCTCAGATGATGCGCCAAC
TGGTTGAGATTCCAAACCTTGTTTTTGTTAACGAGAAAAACATCACTGTG
CTTGTTGAACAAGACAGTCAACAAGTTCCTGAGCACGTGTTTGGAAAAGC
CATAGATTAAGCAAGAAAAGCAAAATTCCAATGCCCCTACTGTGGAGAAC
TCGACATCAGAGAATTCCATTATAAAAAGCACTTGGATCTGTGTGATAAA
AAACATGTCCAAGCCAGGCGTTCTGAGACCGATGCAAACAATGATGTCCA
AGCCAGGCGTTCTGAGACCGATGCAAACAATGATGATATAAATAGTGACT
TACATGATGCTGCTGAAGAGGATGATATAAATAGTGACTTACATGATGCT
GCTGAAGAGGAAATTGTTCAGAGGGGCATATCATATTTGGCAAATGCGTT
TGAGGAAGCCATTGGGTATCCTTACTTTAACATGGCTGAACCTGGTATTT
CTGTTGGAAAATTACCCCAGTGAAGTCCAAATTACTATCGTTAAAGCAAA
TAAAATGATGATACAAATGAAAGTGAAGAAGACCAATGTGACGATGCTTG
TAAAGCGTTTAGAAGCTACAGTCGCAACCTTCTTGACATTTTCGAGAGTC
AACTTGTCAAGGATTCAAAGAACATCATCAAAAGAACCGCATCCACTTTT
CAGAAATTTTACAACTATTGTACTGATGAGAAAGAAATAAAACGCTGGGA
CGACTTACATGATTTGGTCATAGCAGCAGACACCATACATACCCAACCAT
TGTACAACTCCATATACTGAACTATTTTCTAAGACAGTGCATATCAGCTT
TGATAGCAGAAAATGAGAAAAATATCAGCCTTGAAGAAACCATCTACTAT
GTGGCAGGATACATAGAAATTGTTCAGAGGGGCATATCATATTTGGCAAA
TGCGTTTGAGGAAGCCATTGGGTATCCTTACTTTAACATGGCTGAACCTG
GTATTTCTGTTGGAAAATTACCCCAGTGAAGTCCAAATTACTATCGTTAA
AGCAAATAAAATGATGATACAAATGAAAGTGAAGAAGACCAATGTGACGA
TGCTTGTAAAGCGTTTAGAAGCTACAGTCGCAACCTTCTTGACATTTTCG
AGAGTCAACTTGTCAAGGATTCAAAGAACATCATCAAAAGAACCGCATCC
ACTTTTCAGAAATTTTACAACTATTGTACTGATGAGAAAGAAATAAAACG
CTGGGACGACTTACATGATTTGGTCATAGCAGCAGACACCATACATACCC
AACCATTGTACAACTCCATATACTGAACTATTTTCTAAGACAGTGCATAT
CAGCTTTGATAGCAGAAAATGAGAAAAATATCAGCCTTGAAGAAACCATC
TACTATGTGGCAGGATACATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035078XLOC_035078-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000486_pilongenomesc0000486_pilon:45792..55785 -
Properties
Property NameValue
Aaloc907-966:61
Aaloc868-906:104
Aaloc811-867:163
Aaloc574-807:397
Aaloc463-570:505
Aaloc424-459:791
Aaloc385-420:2076
Aaloc175-381:9826
Aaloc70-174:9932
Aaloc1-63:9995