|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000316_pilon:154074..161582+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016331 ID=XLOC_016331|Name=XLOC_016331|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7509bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000316_pilon:154074..161582+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGCTCCATCAAATCTTCCTGTGTTAAACTTTCAATACGAACGGCCAT
TTTTCTTGTGTACCTTTTTGCTGGTGCCGGCATATTTCTCTTATTGGAAA
AGGACGATCAACAACTAGTAAGAACAAAAGCTGACAACGACCTTACGGAA
CACATAAACTCAATGGTGGTCAAATATAATGTTTCAGACGCCGATATTAA
GTTGTTTCGTAATTTAATGGAACGAGCACTGGATGTGGGTGCACTTGGTA
GAAGGAAATATAAAACCGAGTGGAATTTCGTGAACGCCCTTTTCTTTTGT
GGGAATGTCATCACAACGATAGGTgagattatttttatttctattcctTC
TCAATGATATATAATcccaaagggctagaagcgaatctctaacctttctc
aggcaagaaaaagtgaagccttcaaatatgcgccgtatttttgacgataC
GGGTTGAATCTtacaattcctttgttttcgagtgatattttttctcgaaa
tttagcggtaaattttagtttcaatctgtcatttgtgtaaaaaacaggtG
GGTCATGCTACGCCGCGCATCTATGGTgcgatttgttggcttcaaatcct
accaaggagattcgcttTTAGCCGCTCCGCTTTAAGCTTACtgtaagggc
tctgaccatagtcggaaaattgattttaatatctgaacataaaagttatg
ttttagattctttaacacttttaacaaagaattgcctttataaattgcat
tttaatcaaatcccttcagagtaattaagaacttaattgcaaaaatgacg
ttataaactttaaaaagacgttaataatatgttgcatcacctttctttta
taaaaaaaatgctaagttttaatgggtaattaacctttttgtttcgaaat
tttttcaaacagtccgcaaagaattgaactgttttaaatttttcagaaaa
attttctaaattaatgcattaaaagttatggttgtttttctattttcaag
attttgaagcaaataagcttttaagGCCGATGTCCACTTTCGTGCGAAGT
GTGCGAAAGATTTTTCTTAACCGTTTtttcctgaagaaaagattacgtca
taaaaaagtttcgctagaacaaaaaaaaagttgaccgttacgtcaatttt
gaccaatgaaattgcttcttttttcaatcaaccaatgacGTTACAAACAA
CATGAAAAGTTTCACGCGCTTaccgcaaaaatattttcaaaatgtttttt
cttcgccgaaactaagctcttcaaagttgaaatactattcttcgcaaaag
tcttcatttatcaatgagggaaggagagtgagcaataatatcattactgc
ggacatagctagaacatgagaaatcagcaaaaatcagctacttgtatatc
cagtgtataataaatccttggttaTGCCTCTGAATTGTAATTTTAAGTCA
AGTTTCACCTTTTTACAACCTGCTCTTTTCCATGAAAGgtcgggatgagc
tggagtttttacaagatacttcactaattggtcatttgaagtgatagaga
tgacgcgttcattagaaaaagtaacaaaattgctTTATTACTGGTTaccg
accaaccaaatcaaataagagcttgtaaaaactccagcttgtcccgaaaG
GTCCTCGTCAAACATCACAAAAATGTCCCATTTGATGTCTTGATAGGTtg
agaaattgactttataTAGGTATTTAAAATCATTCTTTTCTTGATAGCTT
TAGACTGGTTTTAAGACATCCAAAGCCACCCGGGCTTACGCTTTAAACTT
ACAGCCATATACTGGAtccttaaggccggtctcctcTTGCACGCACTGCG
ATCGCACTTTATctagcaaagcttccacgctattggtcaaaagaaaaatg
aagcaattccatttgCGCGATCTAACGttacggttgaaaaaagttaaaga
aattattcaacttttttccGATAACGCGCGcttcatttttatgatgtaat
aTTCTTTGCAGGCAAAAGGGATTGAAGCCAAACGGTACAATCACAGCGCG
CGTTAGTGGAAACTGGTCTTTAGTTAAGGCTATTTTGAGTCCCAAAGAGA
GAATCTGAGCTGATTTGTCTTTTCCATTTCTTCCGAAGCTTTATCTTATA
AATGCTCAAGAAAGTTCTATAAAATTCGAGCGACAcatcaagaaataaag
aactaacttacaattgctacaCGGTGTTTCAGGGTGAGGGTTAGGGCAGG
GAAACAACACTGtgtagcaattgtaagttaGCATATATCAAACATATTTC
AATAATATTAAAAGTCGTCGTCAACAGGGAATTCTCCTAAAACGATGATC
TTTTACActcctttattcgatgaaaatctgtTTCCCCTTGAACATCGAAT
AAGAGAACATCAACTTATGTACAGTAGATTCTTAGCCTATTTGAATTTCT
ACTATTCATGATGTGCACCATAGACTTGTAAACAAGTCGGTTATATTTAT
AATTCCAGGGTACTGGCTAATGGTAAAATCAGGAAAACGTTCACACGGGA
AATTGCGCGTAGAGAGTGAGGAAAATAACCTTGAAATTTGGAAACTCCCA
TCACAAAACAGTTTCCCCGATTTTACCTTCGATCGATATTTTTCCGCGAT
ATAGATAATGTTTATGCTATATCTTTTCAACGACATAGTTCACTAGTCTA
CATGCACCATTGCAATTTCAAGCTGgggtttttacaagctcttatttgat
ttggttggtcattaaccagtaataaaagaatcttattactttttctaaag
aacgcgtcatctctatcacttcaaatgaccaattagtgaagtttcttata
aaaactccagctcatccccactttacatcacggacccaacagctgattgg
ttgtaagtgacgtaaaatcagtcaatacgcgacttacaaccaatcagctg
ttgggtccatagaagacattgcaatggaattcgaatctttccatAATTTG
AAGTAACTTTAAGTTCTCATCAAAGGCATCCCCCCGGGTAAACCCTCCTG
AAATATTTTCTACAATCAGAAtccctctgtaattcgaacaaacaATATtt
ccgttcgagttcgaattagcggaAGTCAACTGTAATAACATTTTCACCTT
GGCACcataaatacaccttttcgactgtagtcgCGCAGttaggcgcgtgc
cactttattattcaattatCCCCCTAAGCTCGATCCAATCcatttttgac
acctttttatATTGTCTATATATGccaaaaaaggactgggacggttttaa
tgagataaagcggacaaaaaatgcctgCACAAGCAATTgctggctacggt
cgaaaaggtgtattgtactGGATGCGGAATTTAACCTTCTATTTCTTAAT
TTGTTAATCAGGTTATGGTCATATCACGCCCCATACGATAGGCGGAAGGG
TGGTTATGATGTTTTACGCCCTATTTGGAATCTCATTGACTGGTTTCTTT
TTACGAACTGTTGGTAACGAGTTAACAAATTTTATCGCGTACTTGGTCAA
AACTTACGAGAGACGAATGATGAATCGAGAAGCCGAAAAACTGGAGATCA
AATGCGCAGTTGTGTCTAGTATATTGGTTCTGGTGATGTTGTTGCTAGGG
GGTAGTGTTTTTTCGGTTGCTGAGGGAAGCTGGTCTTTCTTAGatgcttt
ttatttttgttttgtttccttGACAACGGTGGGTTTTGGAGACATGATTC
CTGGAGAGTCTCGTGATAATCAAGGTAAGAATTTGATTGGCTCATTTTTG
TTTTAACTCAATTTGATTGGCTGAAGAAATCTTACTCTTTGAGCCTTtcc
agactctaaaacacccgatttcaaaggaaaaagggacaaaaatactcaaa
aaatggcaaaaataagagcatgttaaacatttttaggcttaaagctcaaa
aagttaagaacatctcaaggtttcaaaaaaattttgatgttcttatgaaa
aaaacctTTAGGTAGAATCCAGACAAGTTAATTGGATTTCTGTTTAGACA
ACTAAATTGAGAGGGGATTATCAGATGAGGTTTAGGAAATTTGGCTTGTA
AATTGCTTCAATGGTCCCGAGTTAAAAATATCTTAGCTCtagacacccct
ttctcacagacccactgggttTCCACTGGGTTTCCTTTCTGgacaaattg
gccaaaatatcggcCTCGGTGTAAAATTATAATTTAACTTTTGTCCTTGC
TGAAAATAACCAGATGAGCAAATTCCCACTGCACGATATTGTGCTTTTTT
CCATCCCTAatgaattttttggaaaacaatggaattcaaattccTAGCCA
TAAGAAACATGAGACTATCAATCCTCATCGAgctttggtccgttattttc
acCCCTACTGATGGCTAATTAAATcccatcgggtctgtgagaagggggtg
tatctaGTTTAGACGACTGAATCTCTACCAATTTTGATTGCTAGAGTAGG
CAGTAAGTGGGAAAAAGTGGCAGTTACAATCTTTCATCTATTTGTCAATT
TTAGGGCACGTTGAAGAACTTTTCATCGAATTAACATGTTTAATATATTA
CGTTGTTGGGTTATCGATAATGTCGGGTGTAATCGTGTCCATATCGGGTA
TTATCGAGGAGAAAACGAAGAAACTCGATATTGGGGACCCAATGGATGCA
ATACGAAATTTACGAATCGAGAATTTGAATTCAAAAGCTATGAAGAAATT
AGGATATAAGGTTTGTACCGTAGGATGGCTAAACTTTATCATTCCCGCGG
AAATATTCTTGTCAAACTTCCGAAAATTTTCCTCTGTTTTTCAGGGCATA
CcagcaaaatctttttttatggCAGACATACTCCTCTCTATTTTTTACTT
TGTAGCAAAATTGCTCCTATTTTGTGTAATAAGAATAATGGTGTGGAAAT
CGAGACTAAGTTTCCCTGGGATTGAGAAAGTTTAGCGAGCGTACGGGAGT
GTGGTAATTTGTCCccgtttttgatttttttatagaggattttttttGGC
TCCAGGAAATATATGAAAATTCTAAACATTTTAAATTTGCCAGATTTAAA
ATTTCAGTAAAGTATATAAGTTCGAGAtttttgctaaagtaaaaaaattt
tcttctcccattttgattgtcattttttagattttttaaaaacttcaaag
caataaaatcatCCACATCAACATTTGGTTTTTTAATTCATTCGTTCACT
GTCGAGCTATTCtcggaaatcgaaaatttgaccTCCTGGGACCAGTGGAT
TTTGGCCTTAGTTTTGCTTCAAATACCTTGAAATCTTATACCAATCGATG
CAGAATTTCACGTAgataaaaaatacaacaaaaatgaaagcaaaatttTC
TGTGTCAAAGGTTATGGCCTTTGTATTTTGACTTCTCGATTTACGAGAat
attctattttttctttaagaCACCTTTGTCTCActgccccggtggagctt
tttttctcagtgaggacaaaaatccctattgaaataccaatgaggataga
aattctattgttgcaagcttaaaaaatccagtggagatggttttggagtg
caattttaaacattgaatatcAAGTGGGGGTGAAATCAAAGACAATTTCC
CAGTTGGGATAAAATTCCATGGTATTTTCCCGACGGGGATGAAATTTTCG
ACaaattttcagtggggctggggtcccggcgggtctgtgacacaggagtA
TTTTAAGTgaacatttcaaacaaatttgtgtatTCATAGTTCTTTAATTT
TTCCTCAGGTTGACGAAGGTGTTCGGATGCCACCGAAGATGATGAAAAGT
TCAGTCAACACGCAACGCAGAGGGACAATTATTCCTGATGAAGACGAAAG
AGTCAACAGAAGTCGTGCTAGTTTACAACAATTTGCTAACGGTGGCATCA
TGAACACGGTGAGTGTCAATGCTAAATTCACCTTATTTTGCAATGTAACT
ATTATGTGATTatccagacattgtggtgtgctgagacacttagggggttc
tacacctgcgaggacatcAGTTCTCCCGTGTTGTTCGAGTGTAGTGGTAT
ACACTATGACTCGGTAGCTCGCACCTACTCCATCGTGGGTAagacccatt
ccgatgcatcggaaggcatatctatctatctattatgTGATTGATAATTA
TCATGTATAGGTTTTTAAACTCTGATGATGACCTCTTGTAGTGCTAGTAT
ACAACAAACATTGTTAACACAGCGAATAGCCTTTTCGACTGTAACCGCCA
ATTTCTGCCCAAGCATTTTTTCGTCCGCTTTATCCCattaaaaccgtccc
agtccttcgcacctatagacaatagaaaaaagtgtcaaaaaaggattgga
tcgagtttaggggatgACTAAGGTGACTAAGGTCGAAAATGTGTATTATC
ATGTATAGATTTTAAAACTCTGATAACAATGACCTCTTGTAGTGCTAGTA
TACAACAATTTGCCAACGGTGGCATTATCAACTGCATCAATTTTTCTGTC
TTCAATCTAAACTTTCCATTTTTTACTTCTTTCAGAATAACAACAATATC
AATTCCAGCATGAAATCAATCCGATCTGGTCTGTCAAATACAtttaaaaa
cgaaaacgaaattAACCTACCAGACACGCACACAGTTGATGATGAAATAc
atataaataaaaacacggaccagaaaattttacagaatttaCAATCTCCA
GTATCATCAACTCCGACTCAAAAAACATCTTTACAATCCCTCATAGAGAC
AGACGAGAATTCACTGAATGATGAAAACCACGAGAAAATAGAAATGAAAG
AGGAGAGACTAGAAGCTGGGCTatatcatgaaaataaaaatgaatctTCA
GAAAACGGAGTATGTGCTTTTGAAGCTGAGCCGTTAGACCttaataaaaa
ttcaacaaaTGCTAAGCGATACACTTATACAAAAGACCGTCTGTTCActt
tgaaggaaaataactgTTCACAAGAGAACACAGTCCGAACAAATTCTCTA
AGTGATATGAAGTTAGGTATTCATCGTAAGATATCGAACGAACGCACGAA
ACCTAAAAGATTACGTAAACATTCctctttgaaagattttaaaatacaAT
ATAGTAGTAATTTACAATCGGTTAAACGAGACAAAAAGAAAACTCAAGCA
GAAGGTAAGCGAGTCGGATTACCAGCTGAACTATTTGCAAATGATGTTTC
CTTTGTCACCAAGAATCAGCAAAACACATCTTCACCGAAACTCAAACCAC
CCAAATCCGATATTAATGGAAGTTTTTATAGTATTCCGATTGCTTCCCCG
ATTCCGTCGTACACTAATCCGTATTTTCAATCGGATGATCTCATCTTTTC
ATCACCTCTTATACCTTCAACTGCAAGCTCTCTGGATTTGTCTAAGAATA
ACAGAAcagaaaaatgtttaacaatTCAAAGACCAAGTACTGGGAATAAT
AATACTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000316_pilon:154074..161582+ >XLOC_016331 ID=XLOC_016331|Name=XLOC_016331|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3930bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000316_pilon:154074..161582+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGCTCCATCAAATCTTCCTGTGTTAAACTTTCAATACGAACGGCCAT TTTTCTTGTGTACCTTTTTGCTGGTGCCGGCATATTTCTCTTATTGGAAA AGGACGATCAACAACTAGTAAGAACAAAAGCTGACAACGACCTTACGGAA CACATAAACTCAATGGTGGTCAAATATAATGTTTCAGACGCCGATATTAA GTTGTTTCGTAATTTAATGGAACGAGCACTGGATGTGGGTGCACTTGGTA GAAGGAAATATAAAACCGAGTGGAATTTCGTGAACGCCCTTTTCTTTTGT GGGAATGTCATCACAACGATAGATGGGCTCCATCAAATCTTCCTGTGTTA AACTTTCAATACGAACGGCCATTTTTCTTGTGTACCTTTTTGCTGGTGCC GGCATATTTCTCTTATTGGAAAAGGACGATCAACAACTAGTAAGAACAAA AGCTGACAACGACCTTACGGAACACATAAACTCAATGGTGGTCAAATATA ATGTTTCAGACGCCGATATTAAGTTGTTTCGTAATTTAATGGAACGAGCA CTGGATGTGGGTGCACTTGGTAGAAGGAAATATAAAACCGAGTGGAATTT CGTGAACGCCCTTTTCTTTTGTGGGAATGTCATCACAACGATAGGTTATG GTCATATCACGCCCCATACGATAGGCGGAAGGGTGGTTATGATGTTTTAC GCCCTATTTGGAATCTCATTGACTGGTTTCTTTTTACGAACTGTTGGTAA CGAGTTAACAAATTTTATCGCGTACTTGGTCAAAACTTACGAGAGACGAA TGATGAATCGAGAAGCCGAAAAACTGGAGATCAAATGCGCAGTTGTGTCT AGTATATTGGTTCTGGTGATGTTGTTGCTAGGGGGTAGTGTTTTTTCGGT TGCTGAGGGAAGCTGGTCTTTCTTAGatgctttttatttttgttttgttt ccttGACAACGGTGGGTTTTGGAGACATGATTCCTGGAGAGTCTCGTGAT AATCAAGGTTATGGTCATATCACGCCCCATACGATAGGCGGAAGGGTGGT TATGATGTTTTACGCCCTATTTGGAATCTCATTGACTGGTTTCTTTTTAC GAACTGTTGGTAACGAGTTAACAAATTTTATCGCGTACTTGGTCAAAACT TACGAGAGACGAATGATGAATCGAGAAGCCGAAAAACTGGAGATCAAATG CGCAGTTGTGTCTAGTATATTGGTTCTGGTGATGTTGTTGCTAGGGGGTA GTGTTTTTTCGGTTGCTGAGGGAAGCTGGTCTTTCTTAGatgctttttat ttttgttttgtttccttGACAACGGTGGGTTTTGGAGACATGATTCCTGG AGAGTCTCGTGATAATCAAGGGCACGTTGAAGAACTTTTCATCGAATTAA CATGTTTAATATATTACGTTGTTGGGTTATCGATAATGTCGGGTGTAATC GTGTCCATATCGGGTATTATCGAGGAGAAAACGAAGAAACTCGATATTGG GGACCCAATGGATGCAATACGAAATTTACGAATCGAGAATTTGAATTCAA AAGCTATGAAGAAATTAGGATATAAGGGCACGTTGAAGAACTTTTCATCG AATTAACATGTTTAATATATTACGTTGTTGGGTTATCGATAATGTCGGGT GTAATCGTGTCCATATCGGGTATTATCGAGGAGAAAACGAAGAAACTCGA TATTGGGGACCCAATGGATGCAATACGAAATTTACGAATCGAGAATTTGA ATTCAAAAGCTATGAAGAAATTAGGATATAAGGTTGACGAAGGTGTTCGG ATGCCACCGAAGATGATGAAAAGTTCAGTCAACACGCAACGCAGAGGGAC AATTATTCCTGATGAAGACGAAAGAGTCAACAGAAGTCGTGCTAGTTTAC AACAATTTGCTAACGGTGGCATCATGAACACGGTTGACGAAGGTGTTCGG ATGCCACCGAAGATGATGAAAAGTTCAGTCAACACGCAACGCAGAGGGAC AATTATTCCTGATGAAGACGAAAGAGTCAACAGAAGTCGTGCTAGTTTAC AACAATTTGCTAACGGTGGCATCATGAACACGAATAACAACAATATCAAT TCCAGCATGAAATCAATCCGATCTGGTCTGTCAAATACAtttaaaaacga aaacgaaattAACCTACCAGACACGCACACAGTTGATGATGAAATAcata taaataaaaacacggaccagaaaattttacagaatttaCAATCTCCAGTA TCATCAACTCCGACTCAAAAAACATCTTTACAATCCCTCATAGAGACAGA CGAGAATTCACTGAATGATGAAAACCACGAGAAAATAGAAATGAAAGAGG AGAGACTAGAAGCTGGGCTatatcatgaaaataaaaatgaatctTCAGAA AACGGAGTATGTGCTTTTGAAGCTGAGCCGTTAGACCttaataaaaattc aacaaaTGCTAAGCGATACACTTATACAAAAGACCGTCTGTTCActttga aggaaaataactgTTCACAAGAGAACACAGTCCGAACAAATTCTCTAAGT GATATGAAGTTAGGTATTCATCGTAAGATATCGAACGAACGCACGAAACC TAAAAGATTACGTAAACATTCctctttgaaagattttaaaatacaATATA GTAGTAATTTACAATCGGTTAAACGAGACAAAAAGAAAACTCAAGCAGAA GGTAAGCGAGTCGGATTACCAGCTGAACTATTTGCAAATGATGTTTCCTT TGTCACCAAGAATCAGCAAAACACATCTTCACCGAAACTCAAACCACCCA AATCCGATATTAATGGAAGTTTTTATAGTATTCCGATTGCTTCCCCGATT CCGTCGTACACTAATCCGTATTTTCAATCGGATGATCTCATCTTTTCATC ACCTCTTATACCTTCAACTGCAAGCTCTCTGGATTTGTCTAAGAATAACA GAAcagaaaaatgtttaacaatTCAAAGACCAAGTACTGGGAATAATAAT ACTTGAAATAACAACAATATCAATTCCAGCATGAAATCAATCCGATCTGG TCTGTCAAATACAtttaaaaacgaaaacgaaattAACCTACCAGACACGC ACACAGTTGATGATGAAATAcatataaataaaaacacggaccagaaaatt ttacagaatttaCAATCTCCAGTATCATCAACTCCGACTCAAAAAACATC TTTACAATCCCTCATAGAGACAGACGAGAATTCACTGAATGATGAAAACC ACGAGAAAATAGAAATGAAAGAGGAGAGACTAGAAGCTGGGCTatatcat gaaaataaaaatgaatctTCAGAAAACGGAGTATGTGCTTTTGAAGCTGA GCCGTTAGACCttaataaaaattcaacaaaTGCTAAGCGATACACTTATA CAAAAGACCGTCTGTTCActttgaaggaaaataactgTTCACAAGAGAAC ACAGTCCGAACAAATTCTCTAAGTGATATGAAGTTAGGTATTCATCGTAA GATATCGAACGAACGCACGAAACCTAAAAGATTACGTAAACATTCctctt tgaaagattttaaaatacaATATAGTAGTAATTTACAATCGGTTAAACGA GACAAAAAGAAAACTCAAGCAGAAGGTAAGCGAGTCGGATTACCAGCTGA ACTATTTGCAAATGATGTTTCCTTTGTCACCAAGAATCAGCAAAACACAT CTTCACCGAAACTCAAACCACCCAAATCCGATATTAATGGAAGTTTTTAT AGTATTCCGATTGCTTCCCCGATTCCGTCGTACACTAATCCGTATTTTCA ATCGGATGATCTCATCTTTTCATCACCTCTTATACCTTCAACTGCAAGCT CTCTGGATTTGTCTAAGAATAACAGAAcagaaaaatgtttaacaatTCAA AGACCAAGTACTGGGAATAATAATACTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000316_pilon | genome | sc0000316_pilon:154074..161582 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1042-1965:6586 |
| Aaloc | 892-1041:5809 |
| Aaloc | 688-891:4557 |
| Aaloc | 325-684:3414 |
| Aaloc | 1-321:1 |
|