|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:984726..992276- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031551 ID=XLOC_031551|Name=XLOC_031551|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7551bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:984726..992276- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TACGAGTTTGAATTGGATCCAAGGTATGACCTTTCTTTTTCTTCTATAGT
TTCTCCCTTTTGACCATGTGAGTGGAAAATTCTTTTTTCATCTAGAAATT
TTCAATCTCCTCAGCACTTTTTGTGATGGGATGAAAAACTGATTTAAAAT
CAAACCTTTTATGATTCAGGGCTCGAAATAACGATATTTAGGTGGTCGGA
CACATTGTCCGATCAAAAATTGATTTGGGTCGGACATGTCCGATTGATTT
TTATGTGGGGTATACTTTAAGTCTAATACAAGCTTCTGATAGAATTTCAC
ATTGATCACGAAGAAGCTAAACAAATGCCAATTAATGGTCAGAAGCCCAT
GATTTTTACTTGAAGCATGCTTTCATTTGTTGAGAAAAAGCATCACACAA
AATGAATATCTAACACTAATGATCGCAACTTTGAGAGTTTTTGTGTGTAA
ATAAAGAAGTTACTAATTCTATGTAAATTATAATTTCTTTTGGAAATATC
ACAACGCATCTGACAAATTTTTTGAAGGCACCGAAAGTAATTGGGTCGGA
CATGATGTCCGAATAGAATCTATTTGGGTCGGACATTTCAGCAATTGGGT
CGGACAATGTCCGATGTCCGACCGTTATTTCGAGCCCTGATGATTTGTAA
GACAATAATAGGATAGGAATAAGCTAGGAAAACGCAAGGAAAAAGTTAAA
AAAAGCCAGGAAAAGACTAGGAAAAAGCTAGATAGGCTAGGAAGAAGCTA
GGAAAACGTACAGGAAAAATTTAAGAAAAACTGAGAAAACACTATGAAAA
AATATAAAACATATTTGAAAATTGGATAAAAAGCTTTTCGGCTTATGCCA
TCATCAGTTATCATACAAGTAAAAAGAAAGTAACAAATTTATTGAAAAAA
TTGGAAAAAAAAAAAAAAATGTGAGTAATTAAAAGCAATAAAAATTTAAG
TGACGATAAAATATATTACAGTATAGGGAATTATTAAAAGCTATAAATAT
CATTAAGTCTCACGTGACTCCATTTCTGAAAAGCATAAGGCTACGAGTGT
CTATTTGGTTATTCATAATTATTCATAATTCGTCACTTAAATTTTTATTG
CTTTTAATTACTCACATTTTTTTTTTTTCCAATTTTTTCAATAAATTTGT
TACTTTCTTTTTACTTGTATGATAACTGATGATGGCGTAAGCCGAAAAGC
TTTTTATCCAATTTTCAAATATATTTTATATTTCACAACTTAACATGGTG
AAAATTCATACAACTATGAAAAAACTAGGCAAAAAGGCTAGGAAAAAGAT
GGGTCAATAATGGAAAACTTGAATCTTATTTCTTTTTGTATAATAACAAT
ATTGTAAAATACTACCTTCCATTCAAAAAAAGTTTTAACAATTTTACCAG
AATTTCTAACAAATTCCTTATAGTCATGAACTCTTGAAATTTGAAAGTAC
TGAAAGAAAAACAGTTATTAACACCATCGTCAAAGTTTTTAACTAAAACA
ACTTTAGCACTATGGCAAGAAAATTTCACACCATTTGATAGAATAGAATC
TGCTTTTCAAATTCAAAAATCCTTTTTCTTTTTCAAACACATGAATAATA
TTTACCCTTATCATAGTTACACATTCACATATAAAAGTAAATCTATTTAA
TCAGAAGCACAAGTTATTATTTGAGTAAGAAATTTTAATAAAAGCCAAAG
TTTGAAATATAGAGATTTTATCAACACAAGATCTTTTTAGTACTGACGTC
CATACAATGATGCCAGGCAACTATTGGTTAATAGATCAGAGGTAGGAGAT
TTGAAAGTAATAATATTTTACAGATCAAAATCGACATTGATAATACACAC
TTATGAGAAATGAGTCTTACTTTTTAGATATCTTTGATATAATCTAACCA
CAGCATTGAGTTGTTTTTTTCTCATCATAATGCCTAGGTATGATTTTTAT
CAGTCTTTATTCATATAATTGTATGCATCTTTTTAGTAACAGCTTTCTTA
GTTTTGAAAAAAATGTTGGAAGTGAAGTTTAATTGGTAATTTGAATCTTA
AATTTAACTTTTGTTTTCAATGAATTTGGATACATACCCACTCTTTCCCA
CAGCTCTACTTGAGTTACCAAGAAAGAATACTAGGCCTAAGAAATTAATG
CTTTTTGCCACTAATCAATAACCCACAAAAAGTATTTTGGTCTGGTTAAC
GGTTTGATGGTTATAAATGTAAAATTGTACAAAATTCTTTTTCACTGTAA
AGAGGAAACAGAAACTTTAGAATTTGGTGTGCAATCTTTTAAATCTGATT
AAAAATGGTTAAAGCAGCTATAAGTACTTAGCACTTAGTTCACATCTAAA
ATATCAACAATTGTGGTATCAAATTTTGAGTCACTATTTTCCCATTTCCT
CTCCTTTTCGTATGTTTTTTTTTTTAATCAATTTATACTGATTATAGCTG
AGATCATTAGAAGTCATTAAAAGTGAAATTAATTTGAGTTTTCTTTAACC
ATTTTTTGTACTTTTTCAAAAGTTAATCCTGTGTTAGTTAGAAATTTGCC
CTGTAAAAAAAACACACATCACTATAAAAGCGTTTATTTTTAAGCAAAAT
GTTTCAGACCTTATTTTTTAGCTTTTCTGTGTCTGTTTTGAGAAGGAGAT
AAATAAGGTAAAATATTTTTAAATTGGTCGGACCAAAAAATTTTGTTTTT
TATAACTAATGTTTCTACCTCCACATTAGGTCATTGGGTGGAAAACCTGG
TTCTGTTTCACTGAAGAAAGATAAACAGAACCTCATTGGTATCAGCATCG
GAGGTGGTGCTCCCTTATGTCCATGTCTTTACGTAGTCCAAGTTTTTGAC
AACACACCAGCTGCCAAAGATGGCACACTTCAAGCTGGAGATGAGATTGT
TGGTGTCAACGGCAAATCCATGAAAGGAAAGACCAAAGTGGATGTCGCTA
GAGCTATTCAATCACAGAAGGTTTTGTTTGATGAGTTTAGAGATTTTCCT
TTTTATTTCACTGTTTAGGTCGTCGTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTCAT
TGTTTCTTTAGGAGATTGTGACCATTCAATATGTCAAACTTCACGCTGAT
CCAAAGGAAGGCAAATCACTTGACATTAGTAAGTTCTTATTAGAATAGAA
ATGTCAAATCAACGTCTATGAAGAGAAAACAAAAAAGGATACAGTGTTTT
ACCAGGTTTTCAAAATGCAAGGGATGTTTTTGTGGTCAAATCTATCTCAA
ATTTACTATTTGCAAATTTTACTTGTAGTAGGGGTCCAAACCTTTTTTGC
AAAAGGAGTCCACTGGTAAGGTCTGACAAAATAAGCTGTAAAGGTAAATC
ATAGGTAAACACCAGGTACAATTTTTGAAAGGCATATTCAACAAAAAAAG
TTGGTACCATCGAAAAGAAAATGGAATCTTTTAGCAAAACAGTGAACTAC
AACAAACTTCATACAATCATTAAGTTTTAATTTTGTGTAGATCGTAATCG
TTTGTACCTCTCTTATAGTGATTCTGTTTTGAGTTTCTTTTCTTTCTGTT
TCTTTGTTTACAGTCTTAAAGAAAGTCAAGCACAAGATGGTAGAGAATAT
CAGCTCTGGCACTGCTGATGCCCTTGGATTGAGTCGAGCTATTCTTTGCA
ATGGTTTGTTTTGTGTTATTAATAATCCCCACTGGTTTTACACAAATACA
AAGATACTGAACTATAGATATTCAAGAGAAGTAAGATTTCCAGAACTTAA
TGAATAGGAGCTATGCTCAATATCCTACATAAAACCAATCTGAAAAATTG
TAACATTTGCATGATTTCATTATTTCTTATTTTCTTTTTTCAATACTCAG
ATGGATTGGTGAAAAAGCTAGAAGAGTTAGAGCAGAACTCGTTCATTTAC
AAAGGTAAATCTGATAACTTTTAAAGACACCCCCCCTGGATGCACACAAC
TACCTACCAATAAGTCAATGACAGGTTTTACAGTTGCTTTGGTTCTTGCT
TCAAATCAATTGGTTTTCATCCATTGGAATTCATCATGTTTTTACTCAAC
TCTTCAACTTTTTAGGTATTGTGGAACACAGCAAACGTCTGTTACAAAGC
TACTTTCAAATGTCGAATCTTCATAAAGGTAAGGAAAGTTTTATCAGTGT
TCACAGCTCCCAGACGGAAATAGGGTTTTCTGCATTTGAATTAAGTAAAA
TATTTAAAATCTCTTCTCTGTGTGGTATGAAAAACCTTGCTTTGTCTCCT
GGTTTATGAATCTGAAATGGTTTCTGCAACCGTTTTTTGTCTCATGATAT
TTCATTTAAACTAAAATTTTTTAGAATATTTTCTTGCCCAAGCACACAAA
AATGAGTTGCGTAAAAGTGGTTTTGGAACCAGTTTTCAAAGGATTTAATG
ACAACAAAATGAACTCTTTTTTTTCTTCATAGAATTGGGAGACATCTTTG
CTTCAATTGGTGTCCGTGAGCTACAACCCAATGCTAGTGAAGGGTTTGCT
ATCTTTGCAGAATGCCATCGGTAACATTTCATTTTGTTCTTTAAATTGGT
CAAGTATTCTAAACCTGTTCTATCACTGGAAGGATTTTCCTTAGACTTGC
GCTTCTAGATAATATAATCACTTTACAACAGTTTGAAACTCCCTCAAACC
TATGAAGCTAGACATTTCTCAGATCTTCAAATAGGTTGGGTACGTTGGTG
TGTTATCAAAAGGCAGATTTTTTGCCCACCTTTTAGCTAAATTTAGAACC
ATACCCAATGAATTTTGCATTGTTTTGGGAGATTTTGGTCCATAGCACGA
TCCACAGTAATTTTTTAAAAGTATTTACTATTTGTGTTACCTTAACGGAA
CTAATTTTCACTTTGAATCCTGTGAATTACAAAATTGGCTATCCTCATCC
AAGGAAAATAAGGAAAATGAAAGAAATGTGTCCAAAATAGAGCAAAACTG
CATTTGGACTAACAGTATAGTTAACTGCCTGTGAGTTTTATTAGAGAGGT
AAACAATGTGAACAATTTATCTACCTATTATTCAAAAAACATTTCAATTG
AAATGTTTTTTGAATAATAATTAATTTTCTGACTATTTTATTACAACAAT
TTATCTACCATTATTTCATTTTTAAGGGGCTTCAACAAATCTGGTTTTGA
TTTCTTGAAGAAAATGAAACCAATGCTGAGCGATCTTAATACTTATCTGA
CCAAGGTATGTAGATTTTGTTGACAATTTGGAATCTAGTAGAATCTGTTA
TATTTGTGATAATACACCAGCTGTCTACAAAATTTAGAAATGATCCCTTA
TGGTTAAGGTGAAATATTATTTTAATATTTTGAGTTTGTAAGACTTTAAG
GGTAACTTGGGAAAACTAGCCCAGGGTATATTTTGACGTTTTTGAAATTT
TAATAATGAAGTGAGCTGTCTAAGGAATTCAAAATGATCCCTTATTTTTA
AGCTGAAATATTATTTTATGATTTTAATTTTCAGGCCATTCCAGATACAA
AGTTGACCATCCAGAAATATTTAGATGCTAAATTTGAGTATTTGGTAAAA
ACAGAATATTCTTATTCGTTATAATATTCACCAAAATCTTTGAACTACTA
AAGGCCAATTATGTTCTTTTCTGAAAGCCTAAAGATTCATTTGGTACCAG
ATTCCCTATTCCTTAATTGAGTTATCGGATTTAACAGTAGGTCCATTGTG
GAAATAAGTTTTAACTTAATTCATTTCAAACTGACTTCAATTATGGTATT
ATCCCTCGTCTTTGTGCATATTATTTGGAGTATTTATATTTTAAAATGGG
GTTACTTCTCAGCAATTTCTTTGTTTTTTTTCTGTAATGGATATTTTTAA
ACTTGATGTTTTTCTTCTTCTTTTCAGTCTTATTGTTTGAAAGTGAAAGA
AATGGACGATGAAGAATATGGTTATGCTGTAAGTTTTCAAATCTCCCTGG
TGTGTTCGTGATGAGTGTGTTCGTGATGAGTGTGTTTTGTATACATTTAA
ATACCTGTTTTCAATTCTCGTGTGAGCTAGAGATTGGTTTGGTTTCAAGT
TTCAATTCCTGTATTGCTCTTTATTGCTTGCTTTGTTATTTATTATCTTA
ACTTAATCATTGTAATTCTAATTCTAAAATTTTGGTGCTGTTAGCTTGGA
AAGTGATGGGTATCCCTTTAGTTTTTAAAAATTTCAAGTCTAGTTCAGAC
TACAGTTAATGCTCTCTTCCCGGCTATATATTAACATTATTAACGCCTTC
AATAAAGTCGACACAAGATGAGCAGCAACCATAATATTTGCTATACTTTG
TAAACTGTTTAAAAAAAACATTTCATTTACTTACAGTCAGCAATTTTTGA
TTTCACTTTTGAAAGTCAGCGGTCTATTAAAGTATCCCAAAGCAAATTTT
TTAACTTATTGATTATGTCCCATACCCTATCAAATGGTCGGTTTGTTTTT
GCTGTTTACTAGCCCTCAAACTCAAAATTTTCTTCATTCTAACAATCTAG
GCACTTCACGAATCGCTGTACAGAGTTGAAACTGGTAACTATGACTACAG
GTGTGTTAAATAGACTTTGCTTGCAGTTTTATGATATTCAGAATATGCAC
TACTACAATGGTTCCTGTTATAGTGTCGTGATTAGTAGAACACTCTGCTC
AGAAAAGTTACATAATTACTTGAAATCATATATCAGGATATATCAGTTTT
GTAAGAAATAAGTAACTCGTATTAATGAGAAACTTCTCGATTTTGGATTT
TTTGAAGAAACATTATCTTGAAATACGTCTGTGATTGGTTGAAACCTTAT
TTTAGCTGAGCTATCCAGTTGTGTATAAGAAAATAAGGAGAATTCTACCC
AATGTCTCATTCTGCGAACCCGTTCAACCTTTTGATCTTGAGTGCTATGT
AAGAATGATATTACCTTTTGGCAAACCTATTCTCATTATTCTATCCAAAC
TATTATTTTAATTGGTTTATCACGTTCTTTGTTAAATTCAGAGTTGTGTT
ACGATGCAGGCAATTAGCAAGAGAACGTTTTGCAAAGCTGCGTTCTGATG
TTTTGGTCAAGTTGGAACTTCTTGATAACAAGCATGGTGAGTGTTTAAAA
GATATTTTGTTTACAAAGCATTTCTCTTTCATTGGTATCATCGCTTCTAC
CCATCACTTTGGAATAAGTATTTAAAGGCATTATTCTCGTGTTCAAAGAC
CTTCATATAGATATATTGTTGTTAAGGATACTGTCTAATTTATTGACTTT
CCTTTTTTTGAAGTCGAATTCAACTAAAAAAATATATATTGACTAAAATT
TAAGGGGGTTTGACCTTCAAAAAACGACCTCCGCCATATCACGGGGGGGG
GGGGTAATGTGTTTTAGAAACACTCAAATAATTTTGTTTCCTTTCCTTTA
TGTTTCAGTGCAAGATTTGGTATTCCAATTACAAAAGATGCTTGAAGCCA
TGACAACGTACCACAATGAATGTGAAGATGAATTATCCAAAGCTACCATC
TTTCCAATTGAAGTGGATCTGTGTGGCGGTGCCATGGCTAGAGATGATTA
A Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:984726..992276- >XLOC_031551 ID=XLOC_031551|Name=XLOC_031551|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2310bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:984726..992276- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TACGAGTTTGAATTGGATCCAAGTACGAGTTTGAATTGGATCCAAGTACT
GACGTCCATACAATGATGCCAGGCAACTATTGGTTAATAGATCAGAGTAC
TGACGTCCATACAATGATGCCAGGCAACTATTGGTTAATAGATCAGAGGT
CATTGGGTGGAAAACCTGGTTCTGTTTCACTGAAGAAAGATAAACAGAAC
CTCATTGGTATCAGCATCGGAGGTGGTGCTCCCTTATGTCCATGTCTTTA
CGTAGTCCAAGTTTTTGACAACACACCAGCTGCCAAAGATGGCACACTTC
AAGCTGGAGATGAGATTGTTGGTGTCAACGGCAAATCCATGAAAGGAAAG
ACCAAAGTGGATGTCGCTAGAGCTATTCAATCACAGAAGGTCATTGGGTG
GAAAACCTGGTTCTGTTTCACTGAAGAAAGATAAACAGAACCTCATTGGT
ATCAGCATCGGAGGTGGTGCTCCCTTATGTCCATGTCTTTACGTAGTCCA
AGTTTTTGACAACACACCAGCTGCCAAAGATGGCACACTTCAAGCTGGAG
ATGAGATTGTTGGTGTCAACGGCAAATCCATGAAAGGAAAGACCAAAGTG
GATGTCGCTAGAGCTATTCAATCACAGAAGGAGATTGTGACCATTCAATA
TGTCAAACTTCACGCTGATCCAAAGGAAGGCAAATCACTTGACATTAGAG
ATTGTGACCATTCAATATGTCAAACTTCACGCTGATCCAAAGGAAGGCAA
ATCACTTGACATTATCTTAAAGAAAGTCAAGCACAAGATGGTAGAGAATA
TCAGCTCTGGCACTGCTGATGCCCTTGGATTGAGTCGAGCTATTCTTTGC
AATGTCTTAAAGAAAGTCAAGCACAAGATGGTAGAGAATATCAGCTCTGG
CACTGCTGATGCCCTTGGATTGAGTCGAGCTATTCTTTGCAATGATGGAT
TGGTGAAAAAGCTAGAAGAGTTAGAGCAGAACTCGTTCATTTACAAAGAT
GGATTGGTGAAAAAGCTAGAAGAGTTAGAGCAGAACTCGTTCATTTACAA
AGGTATTGTGGAACACAGCAAACGTCTGTTACAAAGCTACTTTCAAATGT
CGAATCTTCATAAAGGTATTGTGGAACACAGCAAACGTCTGTTACAAAGC
TACTTTCAAATGTCGAATCTTCATAAAGAATTGGGAGACATCTTTGCTTC
AATTGGTGTCCGTGAGCTACAACCCAATGCTAGTGAAGGGTTTGCTATCT
TTGCAGAATGCCATCGAATTGGGAGACATCTTTGCTTCAATTGGTGTCCG
TGAGCTACAACCCAATGCTAGTGAAGGGTTTGCTATCTTTGCAGAATGCC
ATCGGGGCTTCAACAAATCTGGTTTTGATTTCTTGAAGAAAATGAAACCA
ATGCTGAGCGATCTTAATACTTATCTGACCAAGGGGCTTCAACAAATCTG
GTTTTGATTTCTTGAAGAAAATGAAACCAATGCTGAGCGATCTTAATACT
TATCTGACCAAGGCCATTCCAGATACAAAGTTGACCATCCAGAAATATTT
AGATGCTAAATTTGAGTATTTGGCCATTCCAGATACAAAGTTGACCATCC
AGAAATATTTAGATGCTAAATTTGAGTATTTGTCTTATTGTTTGAAAGTG
AAAGAAATGGACGATGAAGAATATGGTTATGCTTCTTATTGTTTGAAAGT
GAAAGAAATGGACGATGAAGAATATGGTTATGCTGCACTTCACGAATCGC
TGTACAGAGTTGAAACTGGTAACTATGACTACAGGCACTTCACGAATCGC
TGTACAGAGTTGAAACTGGTAACTATGACTACAGAGTTGTGTTACGATGC
AGGCAATTAGCAAGAGAACGTTTTGCAAAGCTGCGTTCTGATGTTTTGGT
CAAGTTGGAACTTCTTGATAACAAGCATGAGTTGTGTTACGATGCAGGCA
ATTAGCAAGAGAACGTTTTGCAAAGCTGCGTTCTGATGTTTTGGTCAAGT
TGGAACTTCTTGATAACAAGCATGTGCAAGATTTGGTATTCCAATTACAA
AAGATGCTTGAAGCCATGACAACGTACCACAATGAATGTGAAGATGAATT
ATCCAAAGCTACCATCTTTCCAATTGAAGTGGATCTGTGTGGCGGTGCCA
TGGCTAGAGATGATTAATGCAAGATTTGGTATTCCAATTACAAAAGATGC
TTGAAGCCATGACAACGTACCACAATGAATGTGAAGATGAATTATCCAAA
GCTACCATCTTTCCAATTGAAGTGGATCTGTGTGGCGGTGCCATGGCTAG
AGATGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:984726..992276 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1015-1155:142 |
| Aaloc | 919-1011:560 |
| Aaloc | 868-915:1052 |
| Aaloc | 817-867:1675 |
| Aaloc | 757-816:2068 |
| Aaloc | 679-756:2425 |
| Aaloc | 592-675:3118 |
| Aaloc | 529-588:3485 |
| Aaloc | 475-525:3700 |
| Aaloc | 385-471:3987 |
| Aaloc | 316-381:4491 |
| Aaloc | 76-315:4822 |
| Aaloc | 25-72:5811 |
| Aaloc | 1-21:7552 |
|
