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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000096_pilon:878595..883231+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037305 ID=XLOC_037305|Name=XLOC_037305|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4637bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:878595..883231+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGA
GTTACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCT
ATTGTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAA
TGTCGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGGTG
TGTCAATTATTTCGTGAAATATTGCTTGTGAACTGTTTTAAGTGTCTCTT
TGAGTCGTTgagaaattttgatgttcaGCCTTGCTTTTCCGCTGTTCTCC
CAGTGACGACACTTATGTGTTAATGTATACATTATATGGTTAAGTCCCAA
AGTATCAGTAATCCTGTCAACTTTTCTGACATTAACTGAATGTTGATAAT
TGACAGGCAACTGGAGAACTAATTTTGATCTACCTTATTACAGCAAAATA
AGTAGACACATGATTGGCGGCCTTGAAATTAGCatgcaaaaaattttatt
tgctttttcaaggacaccactgCTGGTTTTCATTAAAAGAGTTTTAATTA
ACACAAAATTTCTTAATTCACGTTAATTCCTTGTCTATTATTTTTGTGTA
ATAAGTTATTTATAAAAAGCTGAGTAGGCAATGTAATAGAACATGCATTA
GTTTAAGTCTTTTGATTGCCTTTTAGAAATACCATCGTATCTCTATACAA
ATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGAAAAGTGATCCTACATATG
ATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGAAATGTTGAAAATAGAAAC
TCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGACTGGATTTTGCATATTGTT
TGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGGTTAGTGAACAAGCTAATGGCTTAT
TTTACTAATTAATTTATCACTTGATAGAAAAACCCCTATTGAAGCTCCct
ttcaaaattctttgaatcCGTACTTTAACTCTCCAGACAGCttttttaaa
aaggattttgagatttttctgtTCTCTATACAAATCAGTATATTTTTAAT
CAAGAATGATGTTAATGTGAAATTTGAATTAATATTCTCGGTATAATTGA
TAATCTTCACTTACTTTGTATTTTTGCCAATCTTTTTGATACAACTTTGT
TTATTCAGATTGTTTCTCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAA
GAAAGTTTGAAATCAAAAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGG
CTTTTGGGTTGGAACTCTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataatt
ttgttaatgCAGGTAGTTAAATTGCTTTTATTTCACATAAGGACATTGGT
TTGATACCCTACTTTCCTTTGGGTCACATATCATTATTTACCAGCCTTGT
TTGTCCCTCTTTTAATAACTTATCAGATAATAAAAGTTTAGACACCCTTC
CCAATAATCTGGTCAGTTCAATACAGATTTCAAAGTTGTATTTTACAGGC
ATCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAGGA
TCCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAACG
AATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTTGG
AGCTACAAGGTGAGAGTATGACCATTTTTGGCAAACAACTTTAAACACCT
AGAGAAATCACCAGCTTTAAGGCTTGTCTcaacttgcgcgcgctgcgatc
gcactttttcgagcaaagcacgctattggtcaaaagaaaaacaaagcaaT
TCCATTAGCGCGATCtaacgtaacggttgaaaaaagttgaaatgtgttca
actttttttcgagtacgcgctacatttttataacataatcctttttccaa
gcaaaaaggattgaagccaaaaagtgtgATTGCAGCGCGCGCAGGTGGAT
ACCGGCCTTTATACTCAGAATATACTCATACGAAAAAATTCCTTcgtttc
atcaattttttgcttCTGAAATATATTGTGCAATGAAATGATTAAAGTCA
CTTTCTTGGAAAGAAATGATAAGATTTACTCTGATTAGTAGTTGAAGTTT
ATCACTATCAGCTCACTAACTCACATCTTTAATCTTCTCATGCTTAATCT
TATtgtatcaaaaaaaaacttactatGATTTTTCACCTTGTTGTAGGAAC
GGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTGCGAGAATTTCCA
CGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTGGGATACTTTCCT
ACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACTATACTACTAAAC
AACTCATCGATTTGGTAAGTGCAacgtaagaacaaactatataagaacat
atctctttaatagccaaaatattaagaacaagttaagaatattttaagac
tttgtggacTCTTAAACACTCGATTGGTGcttcttttttgacagcctttt
tcttcatggatttttccacttaccctttttacttATCGAACATTGAGTAC
CATTTTTGAAGCATTAATTGGGATTGAATCCACAACACTGTGCACCAATG
AAGTATAATCCCGAAGAGCTAGAAtcaaatctttaacctttctcaggcaa
gaaaaagtgaagcctttaaaaatatgcgccgtatttttgatgacggattg
aatctaacgattcctttgttttcgagtgttattattttcgaaatttatgt
gtaagttttagtttcaatctgtcgtttttgtaaaaaaaaatagacAGACC
GCGCTAGACCGCGCAACTTTGTTTCGATTtggttggcttcaaatcctacc
aaggagattcgattctagctcTTTGGGATTATACTTCATTGCTGTGCACC
TCCTGCCTTTAAGATTTCTGCCTTATTCCTTCAAGCTAAGAAGTTACCTC
TTTTTGTACGCACtaaaaaagttgtctttttaatATTAAAGGATGAGAAC
CCAACTGTAAACCAATGGTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCC
TTATGGTTTGATCGCCAAATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATT
GGACCTCACGAGTGGTCATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAA
TTTGCAAAGTATCCTGGTATTGTTTCATCACGTGATGCAAGGTTTGATTA
TTTTACCCATTGTTGGTGTCCCTTTAGAGAACACACAATAAAAGCCTTTT
TATAATATTGACTGGAGGCTCAAGGAATGCAGattttttgttgtgacttt
tgtgattttaagacagtattttataataagaaatattttaattttatctt
cattttatttCAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATACTTTGGTTTC
GTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTTCATTCCAAT
GTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCAGCCCATTTG
ATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGTATTGCTGTAACtcggtctaatgt
cgacatccctcttctaatcccGACactcttctttagagataggaatagta
GAAAGATCGGAATCCACTTATGGGaactatatttctttgcttagcgaccg
gagaggaaaaaatcttttgtctatcagtgattctgaccttactATTGTTC
CCATCTCTAAAActgggtgtcagaattagaagagggatgttgacagtaga
ctaggctgcacgcatcccctctgatatgatttgatataggggatgcgtat
cgtctaaGATATTACTGTCCCagcttacccccgtcttttcttttctcttt
tttgattatgtgtCACATCTGTACAACgacttctctttttctttgtttaa
tgaatgaaaatttataattatgaaagcaataacacaatgacgtcattttt
ctctttctgtgaTTGGATGTaacaaaattatgtaaatttatgcaactttc
ggttaccccaaatttgaggtaactctcggacgagaatttcatacacgtta
cgcatcccctataacaaaataaattctggggatgcgtgcagcctaacaGT
AGACTAACTTACGATAGTGGTCACAAAGTATCTGTGGTCAGGTAGCTCAT
TTGGTAAAGCATTCGCCTTGCAACCCAAGGGTTGTGTTGTACATCATGCT
CATTTATACATGCGCATAAATGCGAGTTTAGACTCCCCTGTTTGTTTGGT
TAGAAATTTAAATAacgtttttttgtttctgttaatattattgttgttgt
tctCTGTTGAAAATGACCACTACTGGGAGCTTTTCTTTTGCTGCTTTATA
AACCTACTGACTTCTTCAGAGTATGTATAAACTCGTAACGTATTATCGTA
CAttgtaatgtttttattttaatcaaAAGGATGTTCAGAGCACGAAGAGT
TGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACAGGAACTG
AAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTCGTGGATG
GCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000096_pilon:878595..883231+ >XLOC_037305 ID=XLOC_037305|Name=XLOC_037305|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2898bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:878595..883231+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGA
GTTACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCT
ATTGTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAA
TGTCGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGATG
GAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGAGTT
ACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCTATT
GTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAATGT
CGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAATAC
CATCGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGA
AAAGTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGA
AATGTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGAC
TGGATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGAAATACC
ATCGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGAA
AAGTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGAA
ATGTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGACT
GGATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTGTTTC
TCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAATCAA
AAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGGAACT
CTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAGATTG
TTTCTCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAA
TCAAAAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGG
AACTCTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAG
GCATCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAG
GATCCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAA
CGAATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTT
GGAGCTACAAGGCATCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATG
CAGAATTGGAGGATCCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACC
AAATTCCTGAACGAATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTC
TTTTGATATTTGGAGCTACAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTA
TAATGCTTGGTGTGCGAGAATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATAC
CTGTTCAACTATTGGGATACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAA
ACACGAGGAAGACTATACTACTAAACAACTCATCGATTTGGAACGGAAGA
ATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTGCGAGAATTTCCACGTGCA
ACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTGGGATACTTTCCTACCCtt
tttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACTATACTACTAAACAACTCA
TCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAACCAATGGTTGGAGTTTATACCT
TGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATCGCCAAATTTGCATACAACTT
TTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGTGGTCATCATGCATGCTTTCT
TTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTGGTATTGTTTCATCACGT
GATGCAAGGATGAGAACCCAACTGTAAACCAATGGTTGGAGTTTATACCT
TGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATCGCCAAATTTGCATACAACTT
TTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGTGGTCATCATGCATGCTTTCT
TTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTGGTATTGTTTCATCACGT
GATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATACTTTGGTTTCGTCCT
CATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTTCATTCCAATGTTCA
TTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCAGCCCATTTGATGCT
GCTAATAGGCTCATAAAAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATACTT
TGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTTCA
TTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCAGC
CCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGCACGAAG
AGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACAGGAA
CTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTCGTGG
ATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAGATGTTCAGA
GCACGAAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGA
TACAGGAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaac
aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGT
AGTCGTGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000096_pilon | genome | sc0000096_pilon:878595..883231 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1243-1449:4431 |
| Aaloc | 1081-1239:3365 |
| Aaloc | 880-1077:2992 |
| Aaloc | 712-879:2197 |
| Aaloc | 553-711:1501 |
| Aaloc | 397-549:1159 |
| Aaloc | 199-396:678 |
| Aaloc | 1-195:1 |
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