XLOC_023126 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_023126
Unique Name	XLOC_023126
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001878:17729..26220-

gene from alignment at sc0001878:17729..26220-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_023126 ID=XLOC_023126|Name=XLOC_023126|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8492bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001878:17729..26220- (Clytia hemisphaerica)
GCTCAATCAGCTCAAAAGATTTCCCTTCCAAAGTAACTCGTTTGGTTTGT
GATTCTTTGAAACTTCCATTGAACATTTTTTCGAAGTAAGGTGAAGCCAG
GGATAATATCATGGAATGAACGTGAAGTTCTTTTTCTTCAACAACCAAAA
CTGCATCACTGTTTTGCCATGCTTTCGGAAATGGCCCTTTATAAGCCGCC
TCTTCTTCCTTTTTACTACTCCTGTTTCTTAAAAAACAAATACACGTTAT
TTTTTTATAAGAAGATCCAAAACTTTTAGAACATCCAAAACTTTTAGAAC
ATCCAAAACTTGTAGAACCCTCAGATGTTTTTAACTTAAGTATTAAGCCT
AAAAGTGTTCTTAACATGTTATTAATTTCACCATTTTGTAAGTATTTGTT
ACCATTGTGGAATCCGCCAAGCCTTAGAATGTACCTTCACAATTTCACAT
CATCAAATATGCTGAATTTTTCTAAGTGAATGTTTTTACTCCAAGATGAT
CCTAATTACCCATCATGTCCCGTTCACGTACTCACTCTGAAAGTCATGGC
TTTTCTCAAGCTGGCGTGTCGTTTTAATGATTTTCATTCAGATTTTCGAC
AAACATGATATGAGTTTTGTGAGCATTGATTAGTCAAAACTAACAATCGC
CCCAAAATTAAAAGCCGATCATAAACAATCGCGTTCGCTTGTGTATTAGG
CAAAGACAATGTGATTTAGAATGTTTCTGCGCTAATAAACAACCAAGTCA
GATCTTCACATTTATGTGTTAGTGTGTGAAGAATTGATGTTCTATTTTAA
GATTTCATACTTTCAGTGCCGTAGCAACTGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNACTAGAGCTCAAATTTTCAAAATTTCCCCCCTCGGGCCAAACCATG
GTTGGCCCTCGCGGTGTCACTAAACTTCAGCCCCCCCCCAATATGAAGAT
GCTTCCTACGGCACTGTACTTTTACACATTGATACGTAGAAAATAGATAA
AAAAGACTCCTAGCAATGTTTTTTTTATATAAATTACTTTTTTAAGGAGA
TATTTTATTTTAAGAAAATTATGTTGATCCACACAAATGATCGATGTAGT
GACAATAAACTTTGTTACCGTTGAATCAATCCTTAGGTAAAGTACACGTT
TCTTTTTTATAAGAACGTCAAAAAATTTCGAAGCCTTCGGATGTTCTTAG
TTTTTTGGATTTTAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAATGTTCTTATTTTCAG
CATTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNCGAGATTTTATCATTAGTTTTTTCTGATTTTT
TGCTCAAAGATGCGTGTTAACAATGCCCTAAACATGGCCGAGTCCGATTT
TTCAGAAAATTTTTTTTCCGGTAGAAAATGCCTGAAATATGCCGGAAATC
GCCGTTTTTCTAGATTTTCATTGGACTTTTCCCTATAATTGGTTGTTTTT
TCATTCAAAAACATTATTAATAGCAATGCCCACCATCGAGCATGTTTCAA
TTTTCAATAAAATTGATTTTTGAAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTTTATTT
TTGCAGATTTTCATTGGATTTTTTCCTTATATTTCTATATTTTTCACTAC
ACAAAAACATTATTGATAACAATGCTCACTATCAAGCATGATTCAATTAT
TTTTTTTCATTCACATTGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATT
CAGCATATAGCTTGTTCTTATTTGGCACGCCCTCAAAGAGAGCAATTAAT
CGTTAATCACACTCTTCAATGCGGTGCCAATGTTTACAAAATTGATTTTA
ATGTTTTTTTCTTACATTTTCTTTGTATCGAACGTTTTAATTGCATCCGA
AATTTATTTTGTGAGAAAGAAAATCAATAAACAACATTAAAAGAAAGACA
CAGAGAGAAGAGAAGAATATAAAATTCTCAGTGTAATTTCTGTAATCTAT
ATACTAAAAGTCTAATTCTCTATGAGCCGTGGGGTGGCCATTATGGATTT
TTTTCCAATTTATATTTTAGATCAAGCTCCGAGCGGGAAAACAGTAAAGT
GCTCTTTTTTCGAGGCGGAGTACGTTTCTTTTGAGACACGTCACCGGAAA
ATAGCCTACGGTTCCTTGCCGATCGGGAAACGTCGCGCAGTTCGGAAGCG
TATCTCCGTTTTCGAAATACTACTTTACTGGTAATTTTCGTAAAAGTAAA
TAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGCTTACAATAT
ACAATTTTTACCTTCCCCCACCATCCAAAGGGCTTTTGATGTGTTCAACA
ACACTCTACTCGGCGGGTGCGACGCCGGGTGACGGCTAGTTTACTTTCCT
AACTGAGAAAAAGTAGTGAAAGCCATTGTGCGATTAGCTCGTAATCACAT
AATAACTCGTCCAATTCGAAAATTGCACTCGTGATTTTTTTGTTTCGAAT
TTTATCGAAAATTAATAACAAAAAAATCACTCGTGCAATTATATTCGAAT
TGCACTCGTTATCATGTGATTACATATACTTATTCTAAGCCCAGTTAATA
TGACGAGTTTTGGGGATTTTACTTTATGCAAAAATTTGTGCGCTTTCTTT
GGGACACATCGTAGTGATAAACCAGGTTTTCTACAGAACTTTAAATACAA
GCTAAGTTTTTTATCTTTGTTTAAATATAAACCTCTAATAACTACAGAGT
ACATGCTAAGACTGCAACTTGTTACTTGAGAAAGTGTCTGAATCACCCGG
GGGCTGAATCACCAAGACAAGGCGTAATTATTTTCCAGAAAGATGATCAG
TATCAAAATCAAAATCCAGAAAAGATTTCGCATACCGATTTCACAGCCAA
AATTAGGATAAATGATCTTCAACATTTGTCTGATCAAATCGAAGGACTTT
CCCTCCAAAGTCACTCGTTTGGTTTGCGATTCCTTGAAACTTCCATTGAA
CATTTTATCGAAGTAAGGTGAAGCCAGGGATAATATCATGGAATGAACGT
GAAGCTCTTTTTCTTCAACAACCAAAACTGCATCGCTGCTTTGCCATGCT
TCCAAAAATGGTCCACCTTGTTTTGCAGATGCTTCTGTCATATCTTTCTC
TTTCTGTATCTTTAAAATGAAATATCGAATGTTTGATTACAC

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00038548	TCONS_00038548	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00038547	TCONS_00038547	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00038547-protein	TCONS_00038547-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0001878	supercontig	sc0001878:17729..26220 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.18	0.34	0.09	2.78	5.02	3.64	4.06	6	6.47	7.64	9.56	1.45	18.37	17.16	21.98	13.32	4.96	7.26	15.05	13.02	1.22	0.87	0.82	0.84	4.93	5.82	16.97	16.58	1.05	1.07

You are here

XLOC_023126 (gene) - C. hemisphaerica