XLOC_022320 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_022320
Unique Name	XLOC_022320
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001655:33789..40274+

gene from alignment at sc0001655:33789..40274+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_022320 ID=XLOC_022320|Name=XLOC_022320|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6486bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001655:33789..40274+ (Clytia hemisphaerica)
AATCGATCCGTAAAGAAAAACTTGTCGCCGAGCTTGGCCTAACCGATGAA
GATTTCCAACAAACAGCACTGCTTTCACCCCTTGAAAGGTTGTATCAGGA
TTTCAAATGCAATCTTTATAATGAAGGCACGATAGCTTGGAGAGAAAACG
GACGATTTAAGCAATGCCTCTTTATGAACGATTATGATTCAATGAGTGGA
AAATTCAAGGTATTATATCTCGACTTAGGTCTCTCTGTTCTCTCTCAGAA
CAAATTGACTGACGGCATTTGCATGAGTTCAAGGTGTGTCATTCAAGGTT
TTCGAAATGGAATGTGGGTGGGACTCGACTGTAGTAGATTTTGGATGATG
TCAGTAAATTATGTGTAAATCTTCTATATAAGCATTGCTTTGTAAGCTAA
AGATCTGAAACAAGCTGCCTTGTTCACACCAAAAGATCGTTTTTTCTTTA
CTGAGTGtaattttatctttattttagtTCAACAACTTCGTTATCGTGAG
GAGAATAGGCGAAACAACAAAATGTACATGTGGAATCCACAGAGCCTTCT
CTCTTTCACTATCAAAAGTGATGAATGGGATGGAATCGATTGTTGCCATG
TCCGTGCATTGAATGATATCTATTCTGAGGTAAAGACTAGCTTATGTTAC
TTAGTTGATGCAGAAAAAACTtcctttttcttatctttttttattttcta
tcagCTCGCGATATTTAGTGTCTTTTTAATGCATaatgtttatcaaagaa
aataaCATTCCCCAATGTACACAATTTTTAAAGCAATCCTTGGTGCTAGA
TAATGCCAAAAATACCACTTTtctagaaatttttgttttttttcttattc
tcaaGTGTATGGTTGAGCCCTTAGCCCACCCTCagcaattaaaaaatata
ttttattttttagtttaaCATTGGACCTTCTGGGTCAGATGATGTACATT
CCTACTGTCAACCTGCCGATGTTGTTGGTATTACAAATACTATAATGTCG
GAGAAGATCACTACTGGATTGAATGCTGTTGTGCAAGATGTTCTTCCACA
GCAATCAAAAAATGACAAAGTGGAAAAGTTTGCTGTGAGAGCATCTACAC
ACAACATCGTCCACTTGTTTAAAGGTAACAAAAACGGTCACATTTACATC
AGATGCTGCTCATGGCTATGCGCCAGTACGTGCAGGAGGAAAGTCAACTT
ACGAACCCTTGACGAGAAGACTGCCCTCACACGGAATTGTTTAAAAGTTA
CATGTCAACCAACTGGGACAAGCACAAGCTATCGAGAGAGGTGCGTACAG
TTGAACCAACTGGGGATGAAACTGTTGACGAGGCTCCAAATGATGATTCA
AATGATGCGGATTTATGACTATGACGGCGATGATGATTTAAGCCATCAAT
TTCActtccatattttttttctagataTTGTAGTCAAATACTAAAATCTT
TGACCAATCCTTACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAGACTAGCTTATGTTACTTAG
TTGATGCAGAAAAAACTtcctttttcttatctttttttattttctatcag
CTCGCGATATTTAGTGTCTTTTTAATGCATaatgtttatcaaagaaaata
aCATTCCCCAATGTACACAATTTTTAAAGCAATCCTTGGTGCTAGATAAT
GCCAAAAATACCACTTTtctagaaatttttgttttttttcttattctcaa
GTGTATGGTTGAGCCCTTAGCCCACCCTCagcaattaaaaaatatatttt
attttttagtttaaCATTGGACCTTCTGGGTCAGATGATGTACATTCCTA
CTGTCAACCTGCCGATGTTGTTGGTATTACAAATACTATAATGTCGGAGA
AGATCACTACTGGATTGAATGCTGTTGTGCAAGATGTTCTTCCACAGCAA
TCAAAAAATGACAAAGTGGAAAAGTTTGCTGTGAGAGCATCTACACACAA
CATCGTCCACTTGTTTAAAGGTAACAAAAACGGTCACATTTACATCAGAT
GCTGCTCAGGGCTATGCGCCAGTACGTACAGGAGGAAAGTCAACTTACGA
ACCCTTGACGAGAAGACTGCCCTCACACGGAATTGTTTAAAAGTTACATG
TCAACCAACTGGGACAAGCACAAGCTATCGAGAGAGGTGCGTACAGTTGA
ACCAACTGGGGATGAAACTGTTGACGAGGCTCCAAATGATGATTCAAATG
ATGCGGATTTATGACTATGACGGCGATGATGATTTAAGCCATCAATTTCA
cttccatattttttttctagataTTGTAGTCAAATACTAAAATCTTTGAC
CAATCCTTACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAA
AGACTAGCTTATGTTACTTAGTTGATGCAGAAAAAACTtcctttttctta
tctttttttattttctatcagCTCGCGATATTTAGTGTCTTTTTAATGCA
TaatgtttatcaaagaaaataaCATTCCCCAATGTACACAATTTTTAAAG
CAATCCTTGGTGCTAGATAATGCCAAAAATACCACTTTtctagaaatttt
tgttttttttcttattctcaaGTGTATGGTTGAGCCCTTAGCCCACCCTT
agcaattaaaaaatatattttatttttttagtttaaCATTGGACCTTCTG
GGTCAGATGATGTACATTCCTACTGTCAACCTGCCG

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00037560	TCONS_00037560	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00037560-protein	TCONS_00037560-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0001655	supercontig	sc0001655:33789..40274 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.03	2.01	0.19	0.38	0.46	0.91	1.1	0.41	0.72	1.07	0.17	0.8	0.68	0.24	0.68	1.78	1.54	1.32	0.36	1.14	0.5	0.48	0.2	0.36	3.13	3.12	0.24	0	0	0.19

You are here

XLOC_022320 (gene) - C. hemisphaerica