XLOC_038295 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038295
Unique NameXLOC_038295
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000237_pilon:59645..72329-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038295 ID=XLOC_038295|Name=XLOC_038295|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12685bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000237_pilon:59645..72329- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTAATACTGATTTTTCAAAACAGCTTAATTGGAACTATCACTTTTTTCG ATTGATTTTTGACTCTCTTGCTTGTCATAGCATCAAAAACAGTCTAGTCA AAGTCTTAATGTTAATAAAATTTATGTACTCAGCCGCAATTCTGACCCAT AAACCTATAAAAAAGAAACCAGGTAACTCAGAGGGTTGAGAAAGATAAAT CTTGCTCAAAGAGTAATAATCGAGCCTCCTAGGGACAGTCTTTATCAGTA TGCATGGTTTTAAGTTTTATCCTAAGGTTCAGGGGGGTGTAATTTTAAAA TAATTTTATGGGAACACCTCCAAGCCATTTTAAATTATAGTTTGGAATTG GAATTGCTACTAAGGGGTGTCCAAGGAGCTTGCCTTTGAGGGGATCAGCT TATTCAATAACTGTATATTGCATATCATTGTAGACATCCCAGTTTATGAA ACTTGCCTTAAAAATGGCAATTATGTTTGTTTCATAGATGAAGTCTTCTA GACTTTCAAAATTCTTTTTTCATTCATTTAGGTCAAACCAAGAGTAGATG TTCACAATATCATGGTTACGAATCATTGGATATTAATGTTGCACCTGTTT GGGAGAAAAACATCACCGGTCAAGGTGTTGTAGTATGTATCCTTGACGAT GGTCTGGAGTATACTCACCCTGATCTGAAACGGAACTATGAGGCACGTGC AAGTCATGATTATAACGGGAATGATAATGACCCAATGCCAAGATACACAT CAGATCGAATCAATAAACATGGCACTAGGTAAGACTATATGGTTTTTCTG TGGCTCTTCTATGGTAGTTGGTCTTTGGCGCTGAAATTTTCATATGAAAT TAAGTTAATTATTTGCTGAATGCAAATGAGAAATTTATAGTGATTGTAAG AATGATTATTCAAAAAGTGGTAATTTTTAATGTAGAATGTTGGCAATCTT 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AACAACTAAAATCTAAGCAAAAGTATTTTGCCATATATTACCGGGCCATT TAATCGCGCCATCTAGTCTATAAAATCTTTAAGTAGACCCCGGGCTAATT CTCCATGGAAAAATCTGACAGCATCAATTTTATAACTTACCTTAACTTAA AACCTCGTTCTTTTTTTGCACCAAAAAAGCACCTGTTTTTTTAGCAAATA TATACTGAGAACAATTATTCCATTTTAGAAAGGGGCCAACCTTTGATCCG TAGCATCTTTCGTGGGACTCAACCGCATGTGATTGGTTCGAAATTATATA GGATTATATAGAATTTTTCTCGAGAGAGAGGGCTTGCGAATTAGGCTGGC AAAAGTTTTTATGGTAAAAAAACTGACGATGTAGGCAAAATTTCTAACCC CGAAAATGATCGATATCATAGTATAAAGCATGAAATTATGAGAAAAAAAA GTATACTGCAACACGTCTTTTACTCAAATATATAAAGAAATCAGGCTTTC GAAGTTCAAAATTCTGTCAGTTAGGGTACGATTGAAGTCAAATTTTGTCT AAAACGTAACAGATTCCACAGTTTTTCCACAGGATATCAAATTTTAAATC GTCATATCTTTCTGTGTGTATTAGTATAAGACCTTTTGTAGTGTACTTTT TGCTTAGAATTTCATGCTCCATCCGATGATAACAATAATTTTTGTTGAAT TCGACTTTTAAAAATCGTCAATTTTTTACTAATCTTGGAGGTTATAAGTT TTGTCCCACTCAAAAAAGTCTCAAAATCCTATCTACTTTCGAAAATTTTT TTTTCTAAAAATCGTCAATTTTTTACTAATCTTGGAGGTTATAAGTTTTG TCCCACTCAAAAAAGTCTCAAAATCCTATCTACTTTCGAAAATTTTTTTT TCTAAAAATCGTCAATTTTTTACTAATCTTGGAGGTTATAAGTTTTGTCC 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AATCCTTTGAAATCGGCTCCAGACATTCAATAGATCCGAATTCAATTTCG AAAAAAAGTTTTCGGCCCTTAAAGGTCCAACTAGGAGATTTATCTGGATT TATTAACCAAAATAGAACTGAGTTATAATTTGATAAAATTGATAATATAA TTTCTTTCATTCACAGGCTCGTTGTCTTTTGCGTCAGATTTCATTGATAT TTACAGCAGCTCGTGGGGACCCGACGACGACGGTAAAACTGTCGACGGTC CAGGACCGTTAGCTAAGAAAGCCTTCAGAAATGGTATGTTCAAGCAATTA TTTGAAATTCGAACTGAAATGATTTTTTTTAATGAGAGCCAAACAACGAA AAACTTCTATAAAATAAATTTTTGATGCCTTGAGTTTCTTTCTAATGGAT TTTATTCCTTTTTTCAGGTATCAAGAAAGGGCGTAAAGGGCGTGGCTCTA TCTTCGTATGGGCGACCGGTAATGGTGGCCGATACAGTGATTACTGTTCA TGTGATGGTTACATCAATTCACCTTTCACCATTTCCATTGGAGCTGTAGA TAATTGTGGTCGCAAACCTTGGTATTCTGAAGCATGCCCGGGCACCTTTG CGGTGACGTACAGTAGCGGAGAACCAACGGGGAATCGAGATAAACAGATC TCAACCACTGACTTGAGTGGCAAATGCACGCACACCCATACGGGCACTTC AGCCGCCGCACCTCTGGCCGCAGGTAAGAAAAATGATGGCTTTGATTCTG ACGTTTCCTAATCAGTTCATTGTTGATGTTTTGCTTTCTTCCTCCATTTT CGATTTACTGCAATTTTATACAGCTGTAAGAACTTTATCAATAAAAACTA TCAAAGTATTATTTGCTAACGTTTACCACAAAAACGTATAAAGTTCCATT CAATCGGTTAAATTTCTAATTTCTAGCTACTGTTCCACAAAGAAAACGAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000237_pilon:59645..72329-

>XLOC_038295 ID=XLOC_038295|Name=XLOC_038295|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4896bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000237_pilon:59645..72329- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCACTATTTGGGCGCCTTCTGGAGTGCCCGGCTCAAAAAGTCTAGC
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ATATCATGGTTACGAATCATTGGATATTAATGTTGCACCTGTTTGGGAGA
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AGGAGAGGTGGCTGGTGAACGAGGCAATGGTGTTTGTGGGCGTGGTGTGG
CGTACAATAGTCGTGTGGGCGGCATAAGAATGCTGGATGGCGAAGTAACT
GATGCTGTAGAAGCAGGCTCGTTGTCTTTTGCGTCAGATTTCATTGATAT
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CAGGACCGTTAGCTAAGAAAGCCTTCAGAAATGGCTCGTTGTCTTTTGCG
TCAGATTTCATTGATATTTACAGCAGCTCGTGGGGACCCGACGACGACGG
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GTATCAAGAAAGGGCGTAAAGGGCGTGGCTCTATCTTCGTATGGGCGACC
GGTAATGGTGGCCGATACAGTGATTACTGTTCATGTGATGGTTACATCAA
TTCACCTTTCACCATTTCCATTGGAGCTGTAGATAATTGTGGTCGCAAAC
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GGAGAACCAACGGGGAATCGAGATAAACAGATCTCAACCACTGACTTGAG
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GCGACCGGTAATGGTGGCCGATACAGTGATTACTGTTCATGTGATGGTTA
CATCAATTCACCTTTCACCATTTCCATTGGAGCTGTAGATAATTGTGGTC
GCAAACCTTGGTATTCTGAAGCATGCCCGGGCACCTTTGCGGTGACGTAC
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CTCTGGCCGCAGGTATATTTGCTTTGGTGTTAGAAGCAAACCGTAAACTG
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TCCTGATGATTCAGATTGGCAAACCAACGGTGCTGGACACAAAGTCAATG
TCAAATTCGGATTCGGTGCTCTGGACACTAACAAATTGGTAGAAGTTGCA
TCTAGCTCCGATTGGAAAACAGCTAAGAAACAACACATCTGCGAGACGGA
TGTCAAAGTTGTTGATCTGTCTAAATCCGGGTCGACAGACAAAATTACTT
CCTTTATTGAGACAGATTCGTGCGTTGTCGAGCAAGACAAATGCGTGACC
AAAGTGGAGCACGTACATGTTGCTATCACATTACAATTTGGGCGTGGCCG
TGCTTATCACACGCAACGTGGAAAACATTCAATCGTGTTGACCTCACCCT
CAGGTACACGGTCGGATATCTTGAGACAGCGTGCTCGTGATACGTCCTAT
ACTAAAGGATTCGAAAATTGGGAATTCCTCACCGTTCTACATTGGGACGA
ATCACCTAAAGGGAAGTGGAAGTTGACCATCCGTGACGCGTCCAGTAAAG
ATTGGAGTCACAAGGTATTGAAATGGAGACTCAAATTCTCCGGTACTTGT
GATATCAAGAATGTCTTCAACATCAAAATTAACGAAACGGAAATTTGTGG
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GTGTTGATTGTTCACAATACTGTGACTGCACTAGAGGTGAATGCGTTCCA
GCATGTGAGCCGCACTTAGAGGCTGATGACAATTTAAGACATTGCAAACG
TTCTTTGGAATTTAAACATAAAACAGATTCGGACAAGAAACATACCATCA
AGCCGGCTGTTGCCATGCCGCTTTCCGCTAAATTTGCAATCATCTGTTTA
TCGCTTGTTGTTATAAGCCTCATGGTTGCTGGTATAGCATATTTTGCTGC
TAAAATGCCAAGTATCAAGAACTTACCTAAGGGATATCACGCTATGTCTA
AGTATCCGTGTGCGGAAAGCACGGGGGCCCAGGAAGGCGAAGAGGAAGAA
GGCGAAGAGGATGTTGATGCAGATGTTCACACCAAACTGAATATCAAATC
TTGAGTATATTTGCTTTGGTGTTAGAAGCAAACCGTAAACTGACATGGCG
TGATTTACAACATCTAGTAGCTCAAACCTCTAAAGTCATTAGTCCTGATG
ATTCAGATTGGCAAACCAACGGTGCTGGACACAAAGTCAATGTCAAATTC
GGATTCGGTGCTCTGGACACTAACAAATTGGTAGAAGTTGCATCTAGCTC
CGATTGGAAAACAGCTAAGAAACAACACATCTGCGAGACGGATGTCAAAG
TTGTTGATCTGTCTAAATCCGGGTCGACAGACAAAATTACTTCCTTTATT
GAGACAGATTCGTGCGTTGTCGAGCAAGACAAATGCGTGACCAAAGTGGA
GCACGTACATGTTGCTATCACATTACAATTTGGGCGTGGCCGTGCTTATC
ACACGCAACGTGGAAAACATTCAATCGTGTTGACCTCACCCTCAGGTACA
CGGTCGGATATCTTGAGACAGCGTGCTCGTGATACGTCCTATACTAAAGG
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AAGGGAAGTGGAAGTTGACCATCCGTGACGCGTCCAGTAAAGATTGGAGT
CACAAGGTATTGAAATGGAGACTCAAATTCTCCGGTACTTGTGATATCAA
GAATGTCTTCAACATCAAAATTAACGAAACGGAAATTTGTGGAACACACT
GCCGCGAAGGATGTCCGTCACCGAACTTATTCGCAACTGAGTGTGTTGAT
TGTTCACAATACTGTGACTGCACTAGAGGTGAATGCGTTCCAGCATGTGA
GCCGCACTTAGAGGCTGATGACAATTTAAGACATTGCAAACGTTCTTTGG
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GTTGCCATGCCGCTTTCCGCTAAATTTGCAATCATCTGTTTATCGCTTGT
TGTTATAAGCCTCATGGTTGCTGGTATAGCATATTTTGCTGCTAAAATGC
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TGTGCGGAAAGCACGGGGGCCCAGGAAGGCGAAGAGGAAGAAGGCGAAGA
GGATGTTGATGCAGATGTTCACACCAAACTGAATATCAAATCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038295XLOC_038295-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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