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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000141_pilon:641143..651806- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043843 ID=XLOC_043843|Name=XLOC_043843|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10664bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000141_pilon:641143..651806- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGGCAAGGCACATCTTCAGAGACAGATGCTAAATTGAAAGCATTAGT
ATCCAAGCTTAGCAAGCTGGAGATTAAAGATATTGAAGCAGTTTTCATGT
AAATCTACTCTTTTTAATTCTCTTTAGTATTACACTCTGATGGTAATTTT
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TTGAAAAAGAAGCAATGGGAAAAAAGTATTTTATCAGTGTCATAAAAATT
GTCTTATACAAGCTTTCACAATAAAAAATTAGCTGTAGCTGAATTTTGAT
TCTTAATAGATTCTTCTTCACTCTTTCTCCTATAGGGAGTTATCTACTAC
TACTGATGAAGGACAGTTTGTTATCCAACAACCCTCATGGCTCAATCGTG
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TGTTTGCATGGTGGTATCAAAGAAAAATGTCACTTATTATTCAAGATTTT
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TTCAAAGAATTGAAGTTTTTGATACCAAGACTATTATTTTCGTTCAACCT
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TTTTCTTTTTAGGCTCAGAAAGTAGTTTTTCTGTTTTAACAATGGCTGGC
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GTTAACTTTTGTTACCAGTTCAGCGAGTAACAAATCAAAACTATGATTCA
TAGCTTGCTGACTGCTGATTGCCAATTGTTAGACCAAGAAGTAAGGGCTT
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GGTTTATTTGATTATTTTCAGTGGGGACAAAAATTGGAGGATAATTTTCC
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GCTTTATCCAGAGACTCACTTGCACCGGATTCGCACAATGCATCACAAGA
GTTAGGAACCTCAACAGAAAATATCACCTCATTAGTTCCTCAACATCATA
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TTTTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCTGT
GTTCGTTCGTCCGTCCGTCCGTCCGTTTGTCTGTTACCAACTTTTCTCAG
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GGTGGCCAAAATGTGACGGAGCCTGATTTTCGAGAAAAAAAATTTTTGGG
TAAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGTTTTTTTGGACTTTATG
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TTTTATAGAGAAACTGGATAAATTCGATATTTTTTTATAAGCACATTATC
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AAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAATATTGGATCATTGTTTCTTTC
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GAAAAAAGAATTTTTCAACTCAAAAAAAACGCATCTTTATCTATAAGATA
AGAATCACTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGCCAAATCACTATT
TGTGTTCTGAATGATTGTTTAGCGGTCATGCTCACATAGAGATATCAATT
ATATATGTGTGAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGT
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ATAGTAATTTTAAATTCGCCACTGTAAACCCGCCGGGGGGTATTCAAATA
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GACTTTAGACTAAAATAATTCAATAAACGCCCCCTTCTTTTAAACGCCCT
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ACGTACTACAAACCTGGTACCCTCCGGGCTTCAAACTAATTTTCACTTTT
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CGTCTCCATCCGTCTTGGTTGAGAATCTCATGGTATGATCACTTACTCTC
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CCATGCGTTAAAAAAACCTTGGAATTACAATTAGATACTGAAGTTGAGCA
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ATGAATGTGTTCTTTCTACCGCTTTCTTACAGGGTGATCCAGTGAAAGAC
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ATAGAATTATTTTCTACTTTATTTATAAAGGAGATTTCGAATTAAAGAAA
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AGATGAAAAGAATTGTGCGATTGAATTTCTGTCAAATGTTAAAAGTAATA
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TGTTCAGTAGTGCAGAAGCAGAGTTGAACGCTTTCAAAGAATTTGACGCC
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AGGTATCATTTGTTATTTTTTTCAATTTCTCAGTCTCGCTCAGATGAATT
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TTTCATGCATTATAGTTTCCTTTGAGGATATCCCCCAAAAATGATTTTCT
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TGAGGTCTAAGTTTCGAAAATGACCATAAAAGATAATTTAAACAACTTAA
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TTTATTACATCCACACTATTTCTCTACCTTTAGGAAGTATCGTTCCCTTC
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TAGGTCATCTTGAACAAGGGTTAAGTGAAGATGGAACACAATGGCCGGAA
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AATAAATACGACAAGAGTTTCAAGCATGCTAATTTTTAAAAAGAATAACT
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GTTTGGCAGATTTATGGAAATTAAGACGACTTCGTTTACATTATGCAATT
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ATGAAATAATTCTTGTTGATGTCAAATATTGTTACTTTCACTTTAGGAAT
ACATATTAGCCATTGAACTATACGAAGAATGTGCCAATCTACAACCTGAG
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TGATCCCAAAATGTCCAATAACTAAGATAAATACTGGTTATTCCAGAAAA
TAATATCACTCCCCATGTGCAGGAGACCAATCTTAGTAGGTTAACCCCTG
GATTTCCCCCGAAATTTTAAAGATTTCTTATAGATTTTTTTTCAAAAGAC
ACCTTGGATTCTACACGAAAGTTTACTGACCCTCTGAGATTTTCAAGTTT
TTCAAAGGCACCCCTTGGACGGAAAATATGAAGACAGGGTGATAAAATAT
ATTCTTGAATAGTCCATTAAATGAAAGTCGATGTTCATGATACGAGGTCG
TCGTCCTAATTATGTAAGGTCCCCAAAGTCTCCGCTCCTGAGTACCTGTT
CTGTTTATTCTAAATTTTGATTATAGTTATTGATTAAAGGCTTTTAGAGT
CGACTTTATTGAAATGATGACTTTCTTTTCAGGCATGTAACAACGCGGCT
GTTTGTTTACTTTTCCTTGGCATGGTAAAGGAGGTACGTTCTTCTTCTTC
TTGTTTTTTCTTGAAGGCTGCATCGAATCCTCAAGGTTCTTCTATTTTTA
AATAGGTTGATATCATTTGTTCACTCATCATTCTGAATTACAAGCTCTTT
TGTATTGAATTGATGTGGAGAAGACTGGTTAAAATATAAATGGAGGAAAA
TCTTCTATTTTTACTCAGTACTAAATCAAACAAGATTCATCCCAAAACAT
TGGAACTTAGATGCTCTAGGAGAATGGTCAAACTAGTAATTTATTTAGAT
ATATTGTTCTGATTTCGTGGCATCGATATTGTTGTGGTGACTTAAATTTA
AACTTCTATTCTCCTTTTTCAGGCTAGTAATTTATTAGAGAATATGGTTT
GGAGATCACCCAATCGTTCTTTACACGAAGATATTCTATTCAATCTGAAC
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TGAAATTGAGTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000141_pilon:641143..651806- >XLOC_043843 ID=XLOC_043843|Name=XLOC_043843|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5646bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000141_pilon:641143..651806- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGGCAAGGCACATCTTCAGAGACAGATGCTAAATTGAAAGCATTAGT ATCCAAGCTTAGCAAGCTGGAGATTAAAGATATTGAAGCAGTTTTCATAT GGGGCAAGGCACATCTTCAGAGACAGATGCTAAATTGAAAGCATTAGTAT CCAAGCTTAGCAAGCTGGAGATTAAAGATATTGAAGCAGTTTTCATGGAG TTATCTACTACTACTGATGAAGGACAGTTTGTTATCCAACAACCCTCATG GCTCAATCGTGATAAATTTGCTGAAATATTTGGTTTAAATGATCTGATTG TGGAACAGTTATTTCAAACATTCGACCGTGACAAGGGAGTTATCTACTAC TACTGATGAAGGACAGTTTGTTATCCAACAACCCTCATGGCTCAATCGTG ATAAATTTGCTGAAATATTTGGTTTAAATGATCTGATTGTGGAACAGTTA TTTCAAACATTCGACCGTGACAAGAATGGTATTATTGATCTGCAAGAATT TGTTACTGGTATGGCATTGTGTTTGCATGGTGGTATCAAAGAAAAATGTC ACTTATTATTCAAGATTTTCAATTTGAATGGTATTATTGATCTGCAAGAA TTTGTTACTGGTATGGCATTGTGTTTGCATGGTGGTATCAAAGAAAAATG 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GAATGAAAATGGATTGAGAAGATTATTGGCTGCAGGATGTTGGAGAGCGG CAGTGGACTTTACCACTAAATATCTGACAGCGCACGGCCAAGGGCTTGTC TCCATGGGACAAAACCAAAGATCCAATTTGAGCCCTTCCATTTTACAGGC TGCAGGATGTTGGAGAGCGGCAGTGGACTTTACCACTAAATATCTGACAG CGCACGGCCAAGGGCTTGTCTCCATGGGACAAAACCAAAGATCCAATTTG AGCCCTTCCATTTTACAGATTTGGTTCGTACGAATCGCTCTACTGGTCAA GTTGAGAATGTTCAGTAGTGCAGAAGCAGAGTTGAACGCTTTCAAAGAAT TTGACGCCCCAGATCTTTATTATCAATATTACCCTGAATTATATCAAGGA AAGAAGAAAGATTTGGTTCGTACGAATCGCTCTACTGGTCAAGTTGAGAA TGTTCAGTAGTGCAGAAGCAGAGTTGAACGCTTTCAAAGAATTTGACGCC CCAGATCTTTATTATCAATATTACCCTGAATTATATCAAGGAAAGAAGAA AGGAAGTATCGTTCCCTTCAGTTTACGTTTAATTCACGCTGAACTACCAC AACATAACGGCCGCCCAAATGTTGCTTTAGACCGATTGTATGCCCTATTG GAAAAAGTGGATCAAGTGTTAGGTCATCTTGAACAAGGGTTAAGTGAAGA TGGAACACAATGGCCGGAAACACAAGATGAAAATGAAATGAAAGGAAGTA TCGTTCCCTTCAGTTTACGTTTAATTCACGCTGAACTACCACAACATAAC GGCCGCCCAAATGTTGCTTTAGACCGATTGTATGCCCTATTGGAAAAAGT GGATCAAGTGTTAGGTCATCTTGAACAAGGGTTAAGTGAAGATGGAACAC AATGGCCGGAAACACAAGATGAAAATGAAATGAAAGGTTTGGCAGATTTA TGGAAATTAAGACGACTTCGTTTACATTATGCAATTGGTAATTGTTTTTC AACTATGAAGGTTTGGCAGATTTATGGAAATTAAGACGACTTCGTTTACA TTATGCAATTGGTAATTGTTTTTCAACTATGAAGGAATACATATTAGCCA TTGAACTATACGAAGAATGTGCCAATCTACAACCTGAGAATGAAATTGCT ATATTGTCTGGCATTGGACGCATTTACTTACAGGAATACATATTAGCCAT TGAACTATACGAAGAATGTGCCAATCTACAACCTGAGAATGAAATTGCTA TATTGTCTGGCATTGGACGCATTTACTTACAGTTGGGAGACTTGAGGTCA GCACAGAAATATTTCACCAAAGTTGAAGTATTAACGAAAGATTCGACAAA TGTTAAGTTAAACAATATGGTTACTATGAACAGTTGGGAGACTTGAGGTC AGCACAGAAATATTTCACCAAAGTTGAAGTATTAACGAAAGATTCGACAA ATGTTAAGTTAAACAATATGGTTACTATGAACAGTGGATATCATGCACTT GCAAATGGGAAATATAACGATTCATACCAATTCTTCACTACTGCTATGAA GAACGATGCAGATAATTTCACTTGGATATCATGCACTTGCAAATGGGAAA TATAACGATTCATACCAATTCTTCACTACTGCTATGAAGAACGATGCAGA TAATTTCACTGCATGTAACAACGCGGCTGTTTGTTTACTTTTCCTTGGCA TGGTAAAGGAGGCATGTAACAACGCGGCTGTTTGTTTACTTTTCCTTGGC ATGGTAAAGGAGGCTAGTAATTTATTAGAGAATATGGTTTGGAGATCACC CAATCGTTCTTTACACGAAGATATTCTATTCAATCTGAACACTGTTTACG AACTAGAAACATCCAGGGCGTTACAAAAGAAACATAAAATTTTAGATTTG GTTTGTCAACATAAAGGTGATGGATTCAACACACAATGCTTGAAATTGAG TTGAGCTAGTAATTTATTAGAGAATATGGTTTGGAGATCACCCAATCGTT CTTTACACGAAGATATTCTATTCAATCTGAACACTGTTTACGAACTAGAA ACATCCAGGGCGTTACAAAAGAAACATAAAATTTTAGATTTGGTTTGTCA ACATAAAGGTGATGGATTCAACACACAATGCTTGAAATTGAGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000141_pilon | genome | sc0000141_pilon:641143..651806 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 2632-2823:193 |
| Aaloc | 2581-2631:583 |
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| Aaloc | 2293-2391:2569 |
| Aaloc | 2221-2292:3013 |
| Aaloc | 2029-2217:3580 |
| Aaloc | 1885-2025:4105 |
| Aaloc | 1765-1884:4549 |
| Aaloc | 1648-1764:4933 |
| Aaloc | 1474-1647:5407 |
| Aaloc | 763-1473:7848 |
| Aaloc | 667-759:8501 |
| Aaloc | 574-663:8861 |
| Aaloc | 514-573:9036 |
| Aaloc | 340-510:9382 |
| Aaloc | 238-339:9760 |
| Aaloc | 100-237:10329 |
| Aaloc | 1-96:10665 |
|