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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000264_pilon:185283..193504+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014110 ID=XLOC_014110|Name=XLOC_014110|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000264_pilon:185283..193504+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCACTTTACCAATAAAGGAACCGGACGATGTAAGTAATATTGAGTTTCT
GTATCGGatgatatcgagggcgacggtaaatGAAACCaacgcaaaacaaa
gtcgatgtaaggctctatatcgcctttgctcatctttttttAACCGTTGT
TGAGCAATGTGGATGGCCTTTTGATAGCATtccaactttgctttataccg
tctccttcaatttatctcgaatacattaAAATCGCTAATGAATaaatccc
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TTTTACTCAGACTCCTACtagtaccgggtgacccacgaaaaagttcagac
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tcggcctcaagacgtagggaaacgtctgaactttttcgtgggtcacccgg
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ACCTGTTCCATTTCAAATCTTAATATGTAATTAGAATTTTTTGAGAGGAG
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aaccaccgatctagaatttttaccctgcctacccgcgcgatgtttgacct
atgttttggattgaattggtagtagagtcaaatttcccagttagattaaa
gggttgtttcaggtagggtcaggtagggttagggctagggttggggatgg
gattcaacccctggttagggttttagtccccgggtagagtttagagtaaa
taccatgtttataaggaactttgaactccccaatgcagttgtgactcgat
ggccgagtggttaaggcgctggcgttctaatcataggtgctttgtatata
gtgggttcgaatcccatcagcggcaaaagtttagaaatttcgggaaatgc
atcaaaaccTTTCAAAACATGGCgatacaaagaaagtgtcaaagaataga
agctcagagtggaggatgggaagaaaattttttgcgtcccttaaggaacc
cggtacgaacgacattcggttattgccacgtcagctggaccttcacgccg
ctccggcttcttgttagTTATTAAATTTCAACGTCTTACAATGTGATATC
CGAACTAGGATATCGCCGGGTCTTGCCGGATCTCGCAAActttgatgata
tttttattaCTTAGATTCTTACATAGCTTACATTGATATTTCGATTCATC
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tctttgtcattcgtttattttttgcttttctcaatttcaaattttcttgc
ttctaatttGGTCATAATAGCAAACAGAAAACTTCAAACCAAAAATAAAT
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CCACTTATTCCTGTTCGATTGACGGTTTTGTAAGAATGTAGAATACCAGA
CTTTTAAGTTTAATATATTCCTGGTTAAGCTGTGTGTCATCACTTTGAAG
CCTGTCGGTGGTTCGTCAAACTCATGTGTCACCATAACTCGCTTGGACCC
CAGATTCGGCAAAAAtgtcgtccccggtggaaaaataccctaaattgact
ttgatttcatccctactcgaaattcaatgtttaaaaattggacACCATCC
TCATTGGATTGtgtttaaccttggaacaataaaattgcTATCCCATTAcg
atttcaaaaagaatttttttactttggaAAAGATTTCCCCCaaggttgtg
agacaggggtgtgtatgACGATGAACCATGTTGGTTGCTTCTGAGTGCAT
TCTTATGTAGAAGGCATTGTCCTTTGTCCTCTATTGTCTCTCTTTTTcgt
tcattttctttcttctgtTGAAGAAGGGCTTTCTCGTTGAacataaactt
ttaaaaagggGGACAGGGTTTAGTTTCGAGTAGATATATTGCTAAATTCG
ATTACAATCCCTTTTATCATTAACAGGATTAAAATTATGATTAATTAATA
AGATGTTTAAGTAAAGCATACCTACCTTTTGAACAGAAACAAAACATCGA
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ttttcggtgctttaaagattttttttatatttacgcattttaagtttgcc
tagttattcagtcacaacttaccatcaaatTTAGAAGAACACAAACACAT
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taaaatagacaAAAGGTTTCTCCTGTTTTAGAGATTGAAagaaatttggt
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TGCATACATAATTCaaacttttcctttttcttttttctcttatctttttc
AAGAAGTGAGGATAATGACGTTAAGACAGAAAGACAGAAAGAGTCAAtgt
aatctccgagcagattctgatactgCGCGCATGGCACTTATTGTAAAGGC
CATGGCTCTGTAAGATAAGAGAATCGGCCCAGGTCAGAGCCATAACCCCT
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ATTGATCAGGGACTCTGCTGTGATgggggggAGGGGCTGGTGGGGACTCT
CGTCAtcccaaacaaaaattatttgtaaCTAGTCATTGAAATGACGAACA
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ATCAATATCATTCGATTCCATAATTATAAGTGTGGTTTTCGACGTATGTT
AATGAGGTTGGCCAgcaattagctcaaaaaaaaagaaaaaaaagacattt
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TTCTTCTGGTGTGGTAATCATGACAACAATTAAGCCACAACAAAATGTAC
GGGTTAGTTTTATTCGTATAAGagtttttgacaatttttttaaagtttca
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GCACACTTCTAAATCACCGTAATTTACCTTTAGTATACACATTAGCCCTT
CAACTCACAAAAGATACAAATCAAGAGTTTACAAGAGTGAAAATGGTGTC
AGAATCTGTCTTTCAATGACTTTAGAGATTTGATGTCAATCCTACCTATT
AAATTTGACTCAATCTCCTCACGCTTTAAGGGCTCACACGTGTTTTGACA
ATGGGATCGTCAGCTTGGTTGAAGATAAAATCATGGACGAAAATGATGAG
ACAAGAGTAGAATATAAGCTTCCAGTGGCAATCGGGGGAGGGGTACCTTT
CAATTGTTTTCCTagcattttctagaatttttttaacagcAAAGTCCATT
GTAGattataaacaaaagaatttgaaattttttcaattggtTTCAAAATT
CTTCCATAGAATGATGACGATGACGATATAATGGACATCGTAAAACCAGT
CGTGATCGTTGGATCCATCGTTCTAGTTCTTGTTGgtgtttttgtttaca
ttatGTACAAACGAAGGAAATACATCAAGGAACAGTAagtaaattttcat
ttattaagATTAATGAAATTGGACatttcaaatcattttgttttttgtta
aaattgctCATCTAGATTTCGAATGCAGTTGAGCGTCTCTCTAGTTCGAT
GTTCAAAGATATAAATCTCTTCGATTTAGAGAGAATTTCGAATCACAGAG
AGTGATTTAAACAACCTTCCAGCTGAGGGaagcaatattttagttcgaat
tacagaaggaTTTGAATAACAGAGGTAtaaattaaagaaagttgacTGTA
GATGTATTGAAGGAAATATATAGCATAATCTAGCCTGTCATGTATTTCAT
TTTCGAATTGGACTAATAATTATTTAGAAATTCAAAGTATTTTACCAATA
CTGTGCCAGCATACCAAATAAattattgttattgattacgtGTGCTCAAG
CCAAACGTTGGTCAAAGAAGAAGAATTCAAGATAGAATTGTGTTATCAGT
TGATGATacataattttcaaattagtAAAATACAGAAAACATGTGTTGTT
GTATACAAACTTTCGAATCTTATCTTTTTAATGAGGTGCATTGACGTCAT
ACTTCCTTCCGATAGTGATTTCTAAccaagaaaattgattaaatcGACTT
CTTgattagttaaaaaaaaatggcCAGCCAGTTAATTAGAGAAAATCGAT
AATACTTCGATGTTGCGAAATTTATCTTgactcaaaaaaacaaaaactaa
attatttcaaaaaccctgattttcaaaaccaattttAGGGTATTTGCACC
AAATAAGCAAGACTAAGACTTATCGTAAGCTTGACTGGTAAGCCTTTCTT
TAAATCTATGTTACTTAAAATctccttttattttttcataggaaagaaag
aaagatatcTGAAGCACAAGGTATGTCCGATTTTTCGTTCTATTGATTAT
TCATATATTCTACAGTATATAGTCAAAATTATGTTTTGACCTTTTCGGAA
AAGATATTTACTACTCGATTTACTATAGGCCTATTGTATTATACgatttt
tcaatcatttcagCTCCGCTACCCGGCTGGATGAATCATGCAGCAAGAAG
TGCTGGTATGTATTACTTGAAATATTTCTACTCCCATATATACCACGGCG
CCTAGCGCAtcgaatatcttttcaaaatagtttttgCTTTAGTaataatt
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ACTCAGTGAAGACGTATTATACGAACAACCGaacgaaatttccataaaag
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GGGAAGattttttaaccctattagccccaagcttttttgacttttgtatc
cccaggtttttcaatttcaatgaagagtttttcttaaaatctatgctgaa
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attttcaaaaattttctttatattctttaaatttgtattatcaatgccta
tcacgtgtcaaaatttgaaaatgattgaattaatagtttagaagttatca
gcactttaaaattttgagttttcagtgattttagctgggttttatgtcat
gtttcacaataaagtcataaaacctgatctggacaacttATGACCctaaa
attttgcacaaatactcttaataagattttattaaaagtcagaaagtttc
aagtcgtttaaaaaatttttctttgagatataaacaaaagaactccagcg
tggtagattctacccccaccccctggggctaatagggttttAAGTTTTAA
CTTTTGAGAAGCGAGCGGAAGAAAAAAGAAGTTAttttttttGGTTACGG
CCTTAACGATTGAAGGTTTACAGAATATGGATACAGTTAGAtaccggcgt
aaaaagggtcgaTAATGTGCACAAATTGTCTCATGTCTTCCTTTAAATTC
AATTAAAGTATTTACCATAAGTAACTTATTCCATTCCATTCGATTCCTag
tgttgatatttttgttattaTGTCTGTTTTGTTACTTAGCATTGAACTTT
GTGAGCCAACCTTCATTAAGTGAGTGACCGCCTATAACTCTCTCATCGTC
TAGTAACCAGGAAACATCATCCGTAATTTCCACTAATCTACTAATATCAC
CAAATTAATTACTCAAATTACATACACCGCTTAATTATTGATGTTTATGC
AAAAAGTTCCTTGTATTTAATATTTGCGCAATATCTTTACGCAAACAAGG
TAAATTTTCACCGCTAATTCTTCTACTAACGTTTGCTgctatttcaaaac
ttttgactGTTTTCAATAATCAAGAGTAGGGTTGAGTGATGGTATacata
tttttgataatgtttcaTGAGCTGTAAAAACTCATCTACTATTCGCGGAT
CTTAGGGgggttcaaaatttatgacagTAGCCGGGGGAACTAGGGGGTTT
AACCCTCCCAATAACGTTTTAAAAtggtttttcattgatttccaTTCCAT
TCATTGATTTTCGAATCTTCAAATCGGGCAAAACTATGACTGGCCCTCGC
AGTGTCACTAAATTTCAGCAACCCTCCCCCCAATATAGagtgcttcctac
ggcactgtatgATGGAGATTCTTCGTTCCCTTATAATAGGCAGTATGGCC
CACTATGAAACATTCTCCGTCATCAATTTTGAACCCTCTAAAATCCGTCA
TTATGACTACTCTATCGTTGCTGATAACTTTTGTTCTTTCCAATCAAACG
ATACTATTGACATACTGACCTTTTAATTTTCCCAGGATTCCATCTCTAAC
AAATCGACTAATGaccaaaacaacaaagacaatacAACTAATCATATtca
taataacaataataatggCAGTATCAAAAAAGATGATTCCCCTAAAATTG
AAGATGTCGAGCTTAAGGAATCTCCTAAGACAAACAATATCTCAAATGGG
CATGTAGTAACACCACTTAAGGACGGTTCAGTAGACAGCCCATTTGATCA
GCTTCAGGAGACGCAGATCTCTAATGATACTGTAGATAGCCCACTTGATC
ACACTGAAGAGACTCTAATACCTGACGATACTGTAATTCATATTCCCGAT
AACGATGACAACGATGATAACGATTCAGATTCAGAGATTGGAGAACCGAT
AGGAAATTCAACTAGACAGTCAGATGAAGATAAAGATGAAGATGCAAAAA
CAATGGTCCATGATATCAGTGGATCTTCCTTACCATCTCTGAGTGGCTCA
TTAGTTAATGATGATTTTTTCGGACAAATGATGAATGAATACGATCGTAT
AAATACGTTACCGAGGAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000264_pilon:185283..193504+ >XLOC_014110 ID=XLOC_014110|Name=XLOC_014110|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1764bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000264_pilon:185283..193504+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCACTTTACCAATAAAGGAACCGGACGATCTCACTTTACCAATAAAGGA
ACCGGACGATAATGATGACGATGACGATATAATGGACATCGTAAAACCAG
TCGTGATCGTTGGATCCATCGTTCTAGTTCTTGTTGgtgtttttgtttac
attatGTACAAACGAAGGAAATACATCAAGGAACAAATGATGACGATGAC
GATATAATGGACATCGTAAAACCAGTCGTGATCGTTGGATCCATCGTTCT
AGTTCTTGTTGgtgtttttgtttacattatGTACAAACGAAGGAAATACA
TCAAGGAACAgaaagaaagaaagatatcTGAAGCACAAGgaaagaaagaa
agatatcTGAAGCACAAGCTCCGCTACCCGGCTGGATGAATCATGCAGCA
AGAAGTGCTGCTCCGCTACCCGGCTGGATGAATCATGCAGCAAGAAGTGC
TGCAAAAATGTCAACGGTGACGATACTCAGTGAAGACGTATTATACGAAC
AACCGaacgaaatttccataaaagcCGATGCATTAGCCAATCACAACAAA
GCTTTTGACGAAGACGAAGAGCAAAAATGTCAACGGTGACGATACTCAGT
GAAGACGTATTATACGAACAACCGaacgaaatttccataaaagcCGATGC
ATTAGCCAATCACAACAAAGCTTTTGACGAAGACGAAGAGGATTCCATCT
CTAACAAATCGACTAATGaccaaaacaacaaagacaatacAACTAATCAT
ATtcataataacaataataatggCAGTATCAAAAAAGATGATTCCCCTAA
AATTGAAGATGTCGAGCTTAAGGAATCTCCTAAGACAAACAATATCTCAA
ATGGGCATGTAGTAACACCACTTAAGGACGGTTCAGTAGACAGCCCATTT
GATCAGCTTCAGGAGACGCAGATCTCTAATGATACTGTAGATAGCCCACT
TGATCACACTGAAGAGACTCTAATACCTGACGATACTGTAATTCATATTC
CCGATAACGATGACAACGATGATAACGATTCAGATTCAGAGATTGGAGAA
CCGATAGGAAATTCAACTAGACAGTCAGATGAAGATAAAGATGAAGATGC
AAAAACAATGGTCCATGATATCAGTGGATCTTCCTTACCATCTCTGAGTG
GCTCATTAGTTAATGATGATTTTTTCGGACAAATGATGAATGAATACGAT
CGTATAAATACGTTACCGAGGAAATAAGATTCCATCTCTAACAAATCGAC
TAATGaccaaaacaacaaagacaatacAACTAATCATATtcataataaca
ataataatggCAGTATCAAAAAAGATGATTCCCCTAAAATTGAAGATGTC
GAGCTTAAGGAATCTCCTAAGACAAACAATATCTCAAATGGGCATGTAGT
AACACCACTTAAGGACGGTTCAGTAGACAGCCCATTTGATCAGCTTCAGG
AGACGCAGATCTCTAATGATACTGTAGATAGCCCACTTGATCACACTGAA
GAGACTCTAATACCTGACGATACTGTAATTCATATTCCCGATAACGATGA
CAACGATGATAACGATTCAGATTCAGAGATTGGAGAACCGATAGGAAATT
CAACTAGACAGTCAGATGAAGATAAAGATGAAGATGCAAAAACAATGGTC
CATGATATCAGTGGATCTTCCTTACCATCTCTGAGTGGCTCATTAGTTAA
TGATGATTTTTTCGGACAAATGATGAATGAATACGATCGTATAAATACGT
TACCGAGGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000264_pilon | genome | sc0000264_pilon:185283..193504 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 736-873:8085 |
| Aaloc | 514-735:7857 |
| Aaloc | 346-513:7686 |
| Aaloc | 229-345:6081 |
| Aaloc | 187-225:5916 |
| Aaloc | 157-183:5743 |
| Aaloc | 31-153:4760 |
| Aaloc | 1-30:1 |
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