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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000142_pilon:577583..581677+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014137 ID=XLOC_014137|Name=XLOC_014137|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4095bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:577583..581677+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACAAACAACACCTCTTCCATGGAATTACCATAATATTGTATGTTTG
GTATATCAGTGATGTTACAGCCACAGATTGTGGTCTTGGTAGAAAACTTA
CCCAATGTACTGGCTTAACCAAAATTGCACCTgcttctaaaaaaataaat
aacagaaGAAAACGTTCTTCGTCCCCAATGCGGTCGCAGTCATTTAATGA
AACATCATCGACGGAAACATGCAAATGTTTAGAGGGGCCGTCTCACCATC
AAGCGTATTACGActgtgaaaatcaaaatggcgaatGCGTAGAATCAAAA
GTATACATTTTGAAAGGACGTTGGTGGGATGAGTCGGATAGTCAAAAGAC
ATACGCATGCCCGTTCGGTTATTGTAACTTGGGTGAAGGCAGATGTATTG
GGAGAAACGATAGTGAAAGTTATTGTCTATTTGATAAGACGAGTCAATGT
TCTAAGGGCCGAGAGGGTCGTCTATGTGGAAAATGCGCACAAAATTTGAG
CGTCGCATTTGGGAGTGAAGACTGTAAACAGTGTAAAGACACCAATATAC
TTATCCTGTTGATTTTCTTCGCCATTTTATCGATCCTAATTCTAGCGATT
ATCTATTTCAACGTGAACGCATTTTCAGGATATTTTAACGCGTTTTTATA
TTCATATCAAGTAATGGGGGTTTTTATACCCAAATATGTGGAACTAGACT
TGGATCGTGTTTCGTTGTTTTTCATTTACGCGTTGGGGCTACAAGGAACT
GGTAGTAATCTTGGTGTATGTTTTTACGATGGAATGGATAATCTTGATAA
AATTGGACTTAATTTCGTCATTCCAGCATACATGATAGTTTTCACTGCAA
TAATTGGACGTTTTTTACCGAACCGTGCTTGGCAATTTTTGCTGACTCAT
CAAACGGAAGGTTCGGCACCACGACGCGTGTCAATCGGCCGCGCGTTCAG
TTTTGTAGCTGTAATATGTTATTCACTTATCACAACCATTACGTTAGACT
TAATTGACCGTATCACGATTGATGGGAAGGAGTACGTTTACAAAGCAGCG
TTTGTTGAATATCTCGGAACACCTAAACATGAAGTACTTTTCGCTATGGC
TATAATTAGTCTTATTCTTTTTGTGCTTGGATTCCCAGCTTTATTATTCG
GTTCATTTTGGTTTGCAAGGATATTTCGAGACTGGATACAAATGCACAGG
CTAGAACCCGTATTAAATAGCCTCAAGAATTGTTTCAAACCCAAAATGAC
TTGGTTTGCTTCATTTTATTTCTTATGTCGATTGACTATTCTTTTATTCA
CTGTTTTCATTAATGCAGATATTGTGAGAGCTTTTTGCCTGGCTATGTCG
TGTGGACTATTTCTCTTCATTTTTGCTGTCTGCCAACCGTATAAAAGATG
GCGGTTTAATTTTTGGGACTTGGTCCAAATGACGAACATGTTATTTATAA
GTATAACCGGACTGTTATTGCAGCATCAATCTTCGATGAGACGGAAAATC
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GATCGCATTTTCGAGGACTATCTTCTTTTACACTTTGACGAGAATCAATA
GAAGTCCTTGGTGTAAGTTTGAAATTCTTTTAGAGTTGGTATAAGTGCAA
GTTTGAATAACTGGGAGTTtactgtacatgtttttttctatttatgatat
gcaccactggagagtcttcggagaactttaaaaaattttttaaacatttt
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ttgattgacttctttgctgtccaatattttcgaatatacagggtgtccct
aattaaagtatcgagtcgaaacacaactatgagtagaaagttttatgtgc
gtgttcacaaaattgtattttaagctctccctcTtttttctttgtcatta
cgattaatttatacgttgtaactaccttttgtaataagcctgtgtgatgg
agaacgttcttatattttagcgataacacacacaaacttttctactcaat
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tggaggctacatatttcaaaaattgacgttacacaacaagttcaatgaca
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CAAGAAAGCAAATTTACGagcttataaattggaattatgtttgaaaacaa
gaaatcttttagcgatgaacggataataaaccatttatttggacgcagtc
gaatccaatatgaaaaatattgggctacgagaaaagatattggactcggc
gaagcctcgtccaatattttttctcgcacgcccaatatttttgcatattg
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CTGATTTTAACAGAATAGTTCACCTAGGACGCCTTTTTGTGCACTAATTT
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caaaaattgattttaagaTGAACAAGAATCCTTATTTCAgccataaaatt
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CTTGTTGATCATAAACACCCTCATTATTTTTAAAGGTACAGATATCACAA
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GGTGGAATTACGGTACGCAAGTGTCATCGGACATAGCCCAAATAACAGTA
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CGAAGTATTTTCggtatttgtgattttttgacgAATACCAcccccccATG
GATACTCTTAAGAATTGGCTTGAATTTTTTATTACCTTGGATATACGGCG
CTTTTTATGTTCATGAATGAAAAGCACCGTACACCCAGTGACAGTCAAAA
GTTATTTTCTGATATCCTCAAATAGTAGTGTCTGGAAAAAACCAGAGTGT
ATTAATCTtaagtttgttgtttgttaaaaTCGTTCTTTACTCAAAAACAc
gaatttttataattattttatttgtttcttttatcGTGTAGATGGGCGAG
CAGGTCATCCTCCTACACCCCAACGTGTGATGGATTCTTTTGAAAGGAGT
TCCTACCAAAACTCACAAGCTTCAATCGCAAGCTCAGGACTTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000142_pilon:577583..581677+ >XLOC_014137 ID=XLOC_014137|Name=XLOC_014137|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3570bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:577583..581677+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACAAACAACACCTCTTCCATGGAATTACCATAATATTGTATGTTTG
GTATATCAGTGATGTTACAGCCACAGATTGTGGTCTTGGTAGAAAACTTA
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AACATCATCGACGGAAACATGCAAATGTTTAGAGGGGCCGTCTCACCATC
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GTATACATTTTGAAAGGACGTTGGTGGGATGAGTCGGATAGTCAAAAGAC
ATACGCATGCCCGTTCGGTTATTGTAACTTGGGTGAAGGCAGATGTATTG
GGAGAAACGATAGTGAAAGTTATTGTCTATTTGATAAGACGAGTCAATGT
TCTAAGGGCCGAGAGGGTCGTCTATGTGGAAAATGCGCACAAAATTTGAG
CGTCGCATTTGGGAGTGAAGACTGTAAACAGTGTAAAGACACCAATATAC
TTATCCTGTTGATTTTCTTCGCCATTTTATCGATCCTAATTCTAGCGATT
ATCTATTTCAACGTGAACGCATTTTCAGGATATTTTAACGCGTTTTTATA
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AATTGGACTTAATTTCGTCATTCCAGCATACATGATAGTTTTCACTGCAA
TAATTGGACGTTTTTTACCGAACCGTGCTTGGCAATTTTTGCTGACTCAT
CAAACGGAAGGTTCGGCACCACGACGCGTGTCAATCGGCCGCGCGTTCAG
TTTTGTAGCTGTAATATGTTATTCACTTATCACAACCATTACGTTAGACT
TAATTGACCGTATCACGATTGATGGGAAGGAGTACGTTTACAAAGCAGCG
TTTGTTGAATATCTCGGAACACCTAAACATGAAGTACTTTTCGCTATGGC
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GTATAACCGGACTGTTATTGCAGCATCAATCTTCGATGAGACGGAAAATC
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GATCGCATTTTCGAGGACTATCTTCTTTTACACTTTGACGAGAATCAATA
GAAGTCCTTGGTATGAACAAACAACACCTCTTCCATGGAATTACCATAAT
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GTAGAAAACTTACCCAATGTACTGGCTTAACCAAAATTGCACCTgcttct
aaaaaaataaataacagaaGAAAACGTTCTTCGTCCCCAATGCGGTCGCA
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ATTCTAGCGATTATCTATTTCAACGTGAACGCATTTTCAGGATATTTTAA
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TTACGTTAGACTTAATTGACCGTATCACGATTGATGGGAAGGAGTACGTT
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TTTCGCTATGGCTATAATTAGTCTTATTCTTTTTGTGCTTGGATTCCCAG
CTTTATTATTCGGTTCATTTTGGTTTGCAAGGATATTTCGAGACTGGATA
CAAATGCACAGGCTAGAACCCGTATTAAATAGCCTCAAGAATTGTTTCAA
ACCCAAAATGACTTGGTTTGCTTCATTTTATTTCTTATGTCGATTGACTA
TTCTTTTATTCACTGTTTTCATTAATGCAGATATTGTGAGAGCTTTTTGC
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TGTTATTTATAAGTATAACCGGACTGTTATTGCAGCATCAATCTTCGATG
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TGTACCGCTGGTGATCGCATTTTCGAGGACTATCTTCTTTTACACTTTGA
CGAGAATCAATAGAAGTCCTTGGTGTCGAATGCGGATTTTGAACCGGGTG
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GCGGATTTTGAACCGGGTGGAATTACGGTACGCAAGTGTCATCGGACATA
GCCCAAATAACAATGGGCGAGCAGGTCATCCTCCTACACCCCAACGTGTG
ATGGATTCTTTTGAAAGGAGTTCCTACCAAAACTCACAAGCTTCAATCGC
AAGCTCAGGACTTTGAATGGGCGAGCAGGTCATCCTCCTACACCCCAACG
TGTGATGGATTCTTTTGAAAGGAGTTCCTACCAAAACTCACAAGCTTCAA
TCGCAAGCTCAGGACTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000142_pilon | genome | sc0000142_pilon:577583..581677 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1684-1785:3994 |
| Aaloc | 1615-1680:2831 |
| Aaloc | 1-1611:1 |
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