XLOC_037068 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037068
Unique NameXLOC_037068
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000086_pilon:638914..652582-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037068 ID=XLOC_037068|Name=XLOC_037068|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13669bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:638914..652582- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CATCTTCATTTTTATAATTATTTTAAAGATATTTTTATTTCAAATTGTTC CACTCACAAATATCTCTCCAACGATACCAAATGTATGAAGATTGAAGAAT TCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTGAA TAGACTTTAATTGATAATAATTTTCGTGCGCTCTAATCCCTTTAATATTA AGCGTCTTAAAACGTCTTGTACTTTCTCTACCAATAGTATACAGTAGACT CTTTGTTTATTCGAACTTCCATTATTCGAATCTTTCAATAATTCGACCTT ATTCCTAGTGTCCATCAAGGAGAAACACTCTTAATATACTTTCTATAATT CGAATCTCTCTGTCATTTGACCAATTAAGATTCACCGTTCGAGTTAGAAT TAGCGAGAGTCAACTGTAAACAGAAAACATCAGGAAACAGTGAAAGATTT TCCAACCACCTCTCTAACGTTTTACGTTTAGGTCAAGAGTTTATTGGATT TCGAATTAGCTTACATCAACACGCAGCATCCAGACTTTATCGGGTTTGCA GAGTAAGTCAAAGCTTGTTGGTTGTATAAAACTCTGTCCATACCCACCCA CGTTGTCAGCTAACACAAAATCTTTTAAATTCTAAGCAGTAATCGAGTAA GAATCTGTAGAATTTATTCGATAAGTAGGAATGTCGCTTCGTTGTCGCAA GATAGTGATTGAGTTTGCGTAAAAAAGGGCGCATGGGCGTTAACGGAAAA AAGCCTTAAATCTTTTGCTCTCTCTGCTCACTATAAAACGGATTTTTCAC CCAACTATTCCCTGTGATCACGCCTTTCTTCTAAATCTCATAATTAAAAC GTGTCGGTGGAATTGTCACGTGTTTTCTGTTACAAATTTTGACATATTTT GGCCCAATCCTTTTTCAGAGCACAGAACCGTGCTTCGGGCACTGCAGGTC AACAACAAGGACGCCGACAAAAAGTCACCAATCAGGTCATCAGAAAGGGA TGGCTACAACTCGGTGGTGGAGGTGTACTGAAAGGCTCCAAAGATTACTG GTTTGTACTCACAGGTAAGTTTTACTCTTCACTCCTGATGCAGTCGGTAA GGAATTTGATAATTCAAAGGTTGTGGATCTTATTCTCTTTCGCCTCCAAC TCAACGAAAAAGTGCTCGATCTCGAAGTTCGATCAAACTTTTTCCTGGTT TTGCCGCTAGCCAACAGATGAGGAAACTCGTGAATTTAGTATTGTTAAAC AACAGTCTGGGGGAATTTGCATTATGTCAATGTGGATTATAACTGTGTTT AACGACGTTATTCGTATATATGAATCTATAAGTACTGGTTCACCAGTTGA ATGTTTTCCCTGTAAATTCCTTAAATGAAGTTCCTTCTGCTTTCAGCTGA AAGTATATCATGGTTCAAAGATGAAACGGTTTGTACATTCATTCAACATT TATCGTCTTCATTCTCCAAGTGTTCTTCGTTGTGCTTTTGTATAACCCTT TTCCAAAACTATATTGTATTTGTTTCCGCGTTATTAATGAAATTTTCAGT GGGGCGTGTGTTCAGATTCATGTTTAAATGTTTGTATTGTTAAAATTTTC GGGCACTTTTTGTTATTCATATTCAATTTTCTAATGCCATAACTAATTTG AACTACTAATTTACAGCTTGCACTTTGATCTTATAAACTTCCAAGCAGTC CCTAAAGATTAACTAACTTAAATTTTCAGACTAAATATTTTCAATACGCG ACACAGTTGCTTTATTCGAATTCTACTAAGTAACATTTCTAAACTCCAAC TAACCATAACTACCCGATAAACTTGTTAAATGTTGAATGTTGCAGGAGAA AGACTTAAAATACACACTTCGATTAGATGGATGTAAACTTAAAGATCTTG 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CGAAGGAAAGATATTTTCATACAGATCATCTCCCTTCTATGTTGTCACTT TTTTGTCAAAGATTCACTTGTAATTTTTTTTTCCAGGCTAAAGAATTCAT TGCTCAAGAACTTTTGGCAAATATTTATGCGTCCGGCAATACTGTAAGTT GTATCATAGTGTAGAAGGGGGTTCCAGGTTCCACCAAAAAAATGAGGTCC CACCACTTCTTAAAACTCCCACCTAAAATCAATGACCAAAGTCCCAGCAC TTCAGGTAGAAAAATTTAAAGTCTGAAAAATAATGGTTCACAAGGTGCCA CGAAATCAAGAGGAAATAAACCTCAGGCTATGCAGGACAAGGACTTGAAA CTGAGAACAATGAAGTATAAGCCCGAAGGGCTAGAATCGAATCTCCTTGG TAGGATTTGAAGCCAACAAATCCTACCAAAGTTGCGCGGCTAGCGCGGCC CGATGTTGGTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTA ACCTTTGTCCGTTCGTTCGTTCGTTATTAGCTTTCCTCGTGATTGGCTCA TTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGTGTAACTATAAACCCCTTG GATGTGACGGAGCCCGATTTTCGGGAAAAAAATTTTTTGGGCAAATTTGG GCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTTTGAAAAATTGGA TCATAAAATTTTTCGGATTTTTTTGCATGAAAGTAGGGTACCATCATAGG TAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTCATAAAAAATTTGTTTGCTCAAAAA ACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACATCAATGTTC TTAGACAAATTACTCAATTTTTTGATGAGATAGATGTTTTTTTTTGCTCA CGAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTTCGAAAGGATGAAATTTAGGTTTC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:638914..652582-

>XLOC_037068 ID=XLOC_037068|Name=XLOC_037068|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4968bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:638914..652582- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTAATCCTGGTAATATGGGAATGGAAGCTCTTATTCCAATTGTGAA
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TTCTTCATAACAAGACCAAAAAGTACACAGATTTTGATGAAGTACGAAAG
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ACAAAAACTTCAGACCTGATGATCCCACAATGAAAACAAAAGCTCTAATG
CAAATGTTGCACAACTACACAAACGATTTCGAGAAGGTCATTGATGGAGG
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CGGCGTCCGTTCTGGTCTTTTCACGCCGGACATGGCCTTCGAAAGTATCG
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GTCCGTTCTGGTCTTTTCACGCCGGACATGGCCTTCGAAAGTATCGTCAA
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AAATATCCAGCATTACAAGATGAAGTTGAGCGAATTTGTATGACACATAT
CCGAGGAGCTGAAATGAGTACTAAAGAACAAATGTCAAAATATCCAGCAT
TACAAGATGAAGTTGAGCGAATTTGTATGACACATATCCGAGGAGCTGAA
ATGAGTACTAAAGAACAAGTCAAGAGTTTATTGGATTTCGAATTAGCTTA
CATCAACACGCAGCATCCAGACTTTATCGGGTTTGCAGAGTCAAGAGTTT
ATTGGATTTCGAATTAGCTTACATCAACACGCAGCATCCAGACTTTATCG
GGTTTGCAGAAGCACAGAACCGTGCTTCGGGCACTGCAGGTCAACAACAA
GGACGCCGACAAAAAGTCACCAATCAGGTCATCAGAAAGGGATGGCTACA
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GGTGGTGGAGGTGTACTGAAAGGCTCCAAAGATTACTGGTTTGTACTCAC
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GTTCAAAGATGAAACGGAGCATGATATGAAATATCAATTACGTTTGGATG
GATGTCAAGTCAAAGATATGGATTCCAATTTCTTGTCCAAGAAAAAAACC
TTTGCTATTTTTAATCCAGATCTAAGGAGCATGATATGAAATATCAATTA
CGTTTGGATGGATGTCAAGTCAAAGATATGGATTCCAATTTCTTGTCCAA
GAAAAAAACCTTTGCTATTTTTAATCCAGATCTAAGGAATTTGTTGAAGG
ATTTCAAACAATTGGAGTTGTCAGCAGAATCATCAGAAGTTGTAGACAAC
TGGAAAGCCTCCTTATTGAGAGCTGGTGTTTTCCCTGAACGAGACACTTC
CGAAGATGGCGATGAAAATGAATTTGTTGAAGGATTTCAAACAATTGGAG
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GAGAGCTGGTGTTTTCCCTGAACGAGACACTTCCGAAGATGGCGATGAAA
ATATGGGTGAACTCGGGAATGTTGATCCACTTGTGGAGCGACAAATTGAA
ACCATTCGTAATTTGGTGGATTCATATTTACGTATTGTATCGAAGAACGT
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GTGAACTCGGGAATGTTGATCCACTTGTGGAGCGACAAATTGAAACCATT
CGTAATTTGGTGGATTCATATTTACGTATTGTATCGAAGAACGTTCAAGA
CATCGTCCCAAAGACATGCATGTTCATGATCATCAATGCTGCTAAAGAAT
TCATTGCTCAAGAACTTTTGGCAAATATTTATGCGTCCGGCAATACTGCT
AAAGAATTCATTGCTCAAGAACTTTTGGCAAATATTTATGCGTCCGGCAA
TACTAACGAATTGATGCATGAGAGCGACGCAGAAGTCCAACGTCGAAATG
AGATGTTACGTATCTATCAAGCATCGAAAGAAGCATTGAAAATCATTGGT
GATATCAATGCGACGACAACTACGACGTCATTGCCGCCACCTGTCGCCGA
TGATGGATTTGAAGTCATCCCGAGAACGAATTGATGCATGAGAGCGACGC
AGAAGTCCAACGTCGAAATGAGATGTTACGTATCTATCAAGCATCGAAAG
AAGCATTGAAAATCATTGGTGATATCAATGCGACGACAACTACGACGTCA
TTGCCGCCACCTGTCGCCGATGATGGATTTGAAGTCATCCCGAGTCGACC
GGCAACTTCATCGCGACCAGCTCCCCCACCGGCAGCAAGTAGACCAGGCA
TGCCGTCTCGGCCCAATCCTCCACCTCCTTCTAATCGACCTGAGAATCCC
TCAATTCCAAGTCGACCGGCAACTTCATCGCGACCAGCTCCCCCACCGGC
AGCAAGTAGACCAGGCATGCCGTCTCGGCCCAATCCTCCACCTCCTTCTA
ATCGACCTGAGAATCCCTCAATTCCAAGGCGACCTGCACCAGGGCGACCC
GCCCCAAGTCTTCCAAATCGCCCTCCACCAGTTCCAAGCCGCCCTTAAGC
GACCTGCACCAGGGCGACCCGCCCCAAGTCTTCCAAATCGCCCTCCACCA
GTTCCAAGCCGCCCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037068XLOC_037068-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086_pilongenomesc0000086_pilon:638914..652582 -
Properties
Property NameValue
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