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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000476_pilon:87036..91262- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_023393 ID=XLOC_023393|Name=XLOC_023393|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4227bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000476_pilon:87036..91262- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACTAAAAATATGGAAGAAATTACATTAGAGGACCTCGAAAATAGCGA
ATTTGAAGAATTTCCAAGAGAACATAATAATTCAAACGTGGTTTGTAAAT
GTTATTTTATATATAATGTAATGGGGTTAATTTCAATATCAACAGTTTTG
CATTGACTTGATTTTAATAAAGTGAAAACAATTTGGAGATGATAATTTTC
AGTTGTTGTGTAGCTTTTTGTTGCCAAACTATGCATACTGGTTGTTGAAA
ACACATTTAACTTTAAGTGTTATTTTGATGTCAATAAACATTTGAAAAGT
TGCTTTTTGATTTCCATTAGGGATTTAATTTTGCAGATAGGTACACCCGT
ATCGGCAAAATTCTGCAAAGCTAATCATGACTTTATTGAAGAATATTATT
CTTCTAGCAAGGCATCTGTCAGCAAGACATTCAAGGCCAAGTTTTCTTTC
CCGAGGCATAAGATCATTATATAATAATTGCAGCATATCAAGATTTGGTA
ATTAAAAATTTGTAAATGGTTAGGAGGGATATCCTAGGAACACGCTTTTG
AAGTCCGTTAATAAGAACAATAACTTTATTGCCATTTTTATTTTTTACAT
TAGATGAATATTACCTTAGAAGAATTGGATGCGTCAGAGTTCACTCTAGA
AGAGATCGAGAATGGAGTGAGTGTTTTAAAAATCTATAACCATGTAAAGT
TAATCCAAGAAAGAAAGCCTTAAATAGAACACGAGTGCGGACCAATCAGC
ATAGATGGTAATAGCAAGTTTATTTTTAAAAAATTGTTTCTTATTTGTTT
TTCTACTTAGATTAATGAACAAGTTGAGACCAGTACAAATGAAACGATTG
AAATTGAAACAGATGAAACAGAAGAAATCGAAACTGATGAGGTAAAGTAA
CTTATCCTTCAAGTTACAATTTTAATTTTTCTGTTATATTTTAAACCTGT
GCATTACCTGCTTACATACTTGATTAATTAATTTTTGTTTCAAGATATAT
TTGACAAGTTTATTACAAATACTTAAATGTTTCTTTTGAAAAGGAGATGA
GCCAAACCATTTTCCAGCCAGTTCAGGCTACTCCGGAACCAGAGGTATTT
TTGTCACATTCTATACTACCTATCATTAAAAGTCCATATGAAAGCGTGAT
TGGGTAGTCTGTGATAGAGGGCACTTGCATATGGACATAACATTAATTAT
TGTTTAAAAAAATGCAATCGCTTTATAAAATAATTATTTTTCCCCGAAAA
GTATTTTCAATCTGATTTAAATCAAAGTATTATTTTTTATGGATATTTGA
ATTCAAGATATTACTTTTAAATGCACATCCTTATTAAGATAAATTTCTCT
TCTAACTTTGTACCTTGAAATAGTGCAACATGACCTAGACATACTTTGTC
GCATTGTGGTAAGGTTGCAAGAAACATGTATATAAATTGTGTTATTTTTT
TATTGTCTGTGTACTTTGGATCTTGCATCTGGTGCATCCGGTGCAGATGG
GTGACTATGGTTTAAAGTAGATTCCTTTTGGAAATGGTGCAATGAATACA
TGTCAGTTTCTTTAATGGTCCAGATAGAGGTGCTTTATGATGTTTTCAAA
CAAGGAAAACTTTAGATTGTCACTTAATCTACCATACTATGCTCCCTTTT
ACTGTTGTAGTACTTTGAAAAAGGCCTACTTAAAACCCAATATTTCAGAC
AATACATTTATTAGCAACGGAGATTAGTGTAAAAGTGTTTCTTGTCCTGA
AACTGTGCCTCTTCAATCAATTCTTTTTATTTCTTTTGAAAAATGAAATT
GTGACATGATTATTTGCTATAGGTTATTGAAGTATCATCAGAAGAAGATG
TATTAAGTCCAGAGACATCAGAAAGTGACGACCAAGAAGAGGTTTTTTAT
AAATTACTTTAATCTTTTGAAATTTGGCTACTCTTAGGTGCCAAATAAAC
GGGGGAGGTTCGAATAAACGGGGGGGGGGGGTTGGAAAAAATTTTCAATT
TAAATAAACGGTGGGGACCTAATTACCGGGGGGTTGGAAAATGGACCTTA
AAAAAACCCTAAAAAGGGTCAAAATAGACTAAATTTAGGCTTTTAGAGTA
AAACAAGGAACTTTCCTTTTGGTAGCTGGGAATTTTTTCAAAAATTAATA
AACGGGGGGTCCTAATAGGGTCCAGGGGGGGTGGGGGTGGAAAAAAATCG
AAAAATTAACAAGCGGGGCGCCCGTTTATTTGGCACCTAAGAGTACATAT
CTTATTACAAAACTTTTCTCCTGTGCCGCCTCTTTATACTTAACCAATTT
ACTATCTAAAATGCTCTGACTCGTGATCTTTAAATAGTGGGATAACTTTT
ATAGTTAAAAAAGGTCCACACGATTGCCCATGGGAGTGTCTCACGAGTTT
TGGGAAAAAAATCTGCAAAAAACAAGATTTTAGGGGTCAATCATGCTTCA
TTGATGTTTAAATGATGATATAATACTTCGGATCATTTTTTCTTCCTAAT
GATAATGCACACTCACAGTGAGCAAACTTTATGAACATAATTTTGAAGGC
TTGAAGAGCAAGATGGAAATGCAGAAGGAAACAAGCACTTTTAAAAAAAT
TCAAATTGTAGGTGAAAGGTATTTCGATAGCTATTATTTTATCATAGTGC
ATATGCGTATCTTTCTGTATGTCTTTCTTCATCTGTATTCCCCAAGCAAA
TTTTGGTCTATTACATTTCAGGATTTAACTTTTCTTGGCTCAGATTCAAC
ACAAACAAATGATCAGGTATCTTTTCTCTCCACTCTTTACTTGATGAAGG
CTGAAGGGATTGGAGATTTTTAAAACGTTTTAGTCAGGTGGGAGTTCAAA
CAATTTGGGGTAACCCTTTGCAATCCGGGTTCAAAATTTACAGGTGTGGT
GGTGGGTTCTGAGACTTTGGAAATTTCTTTCAGTATCCAAATATTTTTTT
GAAATAAATTTTTCTTAAATCAAGATGAAAAAATCTTTATAAAGCATCAA
AGCATGCCATGAAATTAAAAAGTCTTCATTAAAGGTATTTTTTTTATGGA
AAGGTCAGAAGATGCTGTGGCGGCAATATCTCAGAAATGCCCACGTATGC
CTAGCCTGGTATTAGTAAGCACATGCTTAGTAGCACTGTTTCCATTTTTA
AGGTGGGGTTTTGAGGATTTTATAAAGTTAAGTATGGCTAGTCAAGCAGG
TTGGCTGGTGGTCTTTAGGTGTAAAATTTTAAAGGGTCGTCTGATGGGGG
ATGCTTTAATGTTTTGTACTTATAAAGAAAGATTATGAGTAATTACTATG
TACTTTTCCATAAACCACCTTTGTTATGTGCAGTTTTGTTGTTTTATGCT
CAGTTTTGTATTCTGTGCACTTTTGTAATTTTTCTGTGCATTTCTTTGAT
TTCTGCGCACTCTTGTAATTTTTCTGCACACTTTTGTAATTTTGAGATGC
ACACTTTTGTAATCAAGTAGCTGCGCACTTTTGTAACTTTGACAAAAAAT
CAACCAAATTTTAACTTTGAAATAGTAGACTAAAATCCTAGACAACAAAG
TTAAGCCTGCAAGATCGCAAATTATATCAAACTGTAAAGTTATACTTACA
ATGGTTTATTGGCTCACTGACGTAAAGATTTATGTTAACGGAGTTAAATC
GAGTTAATCCGAGTTTCGAGTTTTGAAATGTGGCATAAGCCAGATATTCA
AATCAGTTATTAGAAACCATCTTAAATTCAATCTTACCTCTTTAATGAAT
CAACAAAGCTCAATGATGATGCCACTTTTAGTTACTGAGAAGTGAAAAAA
CAACACAGTCTATCAAAAATATCAAAAACGTATCTGTTTTAGGTACAACT
CAGAACAACTCGGACTAACTCTTCATTGTAAATATGACTTATTTGTGATA
TTTTCAGTATAATATGTAAAGTACTGTGATCTATAAATCATATAAAAATT
AAGTAAAGTGCTTTTAAAAAGCTTTTTAAGTATCCTTGACAAAGGTCAAT
CACAAAGAAGACAAATCCGGAAAGAAATGTTGGATAAAAATGTTCGACAT
TTTTAGTGGATTGAGTCTCCCTACCCCAAGATTAATTCTGCAATATACAC
GAGCTTTTAACAAACATAATTATATAATCATAAAGCAAAATATTGTTTTA
TGTTTCATATTTTAAATTTCAATCATAAAACTTTTTAGGTAACAGAATGT
TGTATTTGTATGCGTTCAATAAAATCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000476_pilon:87036..91262- >XLOC_023393 ID=XLOC_023393|Name=XLOC_023393|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=876bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000476_pilon:87036..91262- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACTAAAAATATGGAAGAAATTACATTAGAGGACCTCGAAAATAGCGA
ATTTGAAGAATTTCCAAGAGAACATAATAATTCAAACGTGAAAACTAAAA
ATATGGAAGAAATTACATTAGAGGACCTCGAAAATAGCGAATTTGAAGAA
TTTCCAAGAGAACATAATAATTCAAACGTGATGAATATTACCTTAGAAGA
ATTGGATGCGTCAGAGTTCACTCTAGAAGAGATCGAGAATGGAATGAATA
TTACCTTAGAAGAATTGGATGCGTCAGAGTTCACTCTAGAAGAGATCGAG
AATGGAATTAATGAACAAGTTGAGACCAGTACAAATGAAACGATTGAAAT
TGAAACAGATGAAACAGAAGAAATCGAAACTGATGAGATTAATGAACAAG
TTGAGACCAGTACAAATGAAACGATTGAAATTGAAACAGATGAAACAGAA
GAAATCGAAACTGATGAGGAGATGAGCCAAACCATTTTCCAGCCAGTTCA
GGCTACTCCGGAACCAGAGGAGATGAGCCAAACCATTTTCCAGCCAGTTC
AGGCTACTCCGGAACCAGAGGTTATTGAAGTATCATCAGAAGAAGATGTA
TTAAGTCCAGAGACATCAGAAAGTGACGACCAAGAAGAGGTTATTGAAGT
ATCATCAGAAGAAGATGTATTAAGTCCAGAGACATCAGAAAGTGACGACC
AAGAAGAGGATTTAACTTTTCTTGGCTCAGATTCAACACAAACAAATGAT
CAGGATTTAACTTTTCTTGGCTCAGATTCAACACAAACAAATGATCAGGT
AACAGAATGTTGTATTTGTATGCGTTCAATAAAATCCGTAACAGAATGTT
GTATTTGTATGCGTTCAATAAAATCC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000476_pilon | genome | sc0000476_pilon:87036..91262 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 400-438:40 |
| Aaloc | 355-399:1507 |
| Aaloc | 286-354:2406 |
| Aaloc | 235-285:3185 |
| Aaloc | 154-234:3418 |
| Aaloc | 91-153:3625 |
| Aaloc | 1-90:4228 |
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