XLOC_038499 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038499
Unique NameXLOC_038499
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000176_pilon:313183..333964+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038499 ID=XLOC_038499|Name=XLOC_038499|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20782bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000176_pilon:313183..333964+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ttactttattaggtaaaattgtaagccctgaaaattcatgatttttggaa CGTAAAATTTTCTGGAAAGAAAGTTCGTTCTAGTGTTTCGTAGCTCTTTC TTAAAGATTTTACTCATACTATTCCCGAAAAGAAAGAATATGATTATTAA CAGATTCTTCTCTCTTTCAGGCGATGTTTACATTGAAGCAAAATATAGGT ATCATTGGAGGGAAACCTAATCATGCACATTATTTCATCGGCTTCAATGG TATGTTTAATTGTATGATTGTGAAAATTGACCCCTGAAAACAATATGAAT ACTGTGTGAAAGTCCAAGATTAATGGGTTATACATGTAACATATCGAATC TATACTTGACCGAGCATCCCTATTTATCTTTTAATTACTCTTCACTTTGT TAAGGAACTGGAATCTTAAGCTGATGAATTATTTCCCATATGACATCTGC AACCATGTTGTGTTCATTGCCCTAAACTCGTCTAACAATGCATAGTTAGT TAGTTGATTGGTCAATAATGTAAGGAATCCCggttaaatgtttttttttg ggcGGGGATTGGTAATGAAGGGGTTTCATAACCTAACTTCCGCCATGGAG GAAATGCCTAACCCATTCAGTACCTTGAATAACAATTGTTTGGACCTGGT ACTGAGGTCTTTGAATTTGAAGCTGCCTACTTTGAGATCAACATGATTTT GGCAATTACAAGCTCATAAAATAGAtgtgtgaagaaataagaatttctgt ccaaccatattcactcaggagatttgggtggcagagcaggtTTAGGCGTG TTGTTCTTATTGGGACTTGTCAGCACTACGTACTGCAGCCTGGCTGACCA GATCGATACCCATCAAATCTCCTATATTAATATATTTGGACGGGAATTCT ATTTTTTCGCGTACATATCTTTCGAAGTTTATTGATCCTatgttttccct tttttttagGCGATCGACTATTATACCTTGATCCGCATACAACACAACCT GCTTTACAAATGGAACGTTATAATTGTATCCCTGACACTGTATGAATTCT TCaagttcaaactttttctgtccttttgattcaaaaatatattcttCAAT ATCCTTGCCCACTGATCTTACACAAATCATAAttgaaatcttttctttta GAGCTATCATACTGAAGCACCTTGTTTTATGAACTTTTCTGCACTCGATC CTTCAATAGCCTTGGTAAGATTTAAGTTTaatattattcattattcattt ttttattatattttgtcAATTGTTCCCGACCACCAAACCCCTGAAAATCT GAcgaaagtaaattaaaaaagGTTAAATATACCTCTGTAAAGCGAAAATT TTCTCCAAGTCAATCAAACGCCGGACGACTGCAAACTCAAATATCCagaa caaaaaaactttactcGCACAAATGTAACTATTGGTTCACCGTGTTTTTA GCTGTAAGCCTCCAGGCTAGTATATAAAAATTAATTGACTGTCGAAGtac caatttgaagtttttttgacagcttttcattgatttattacGTAATAACG TAAACTTTTAAGCTTTTGAAGCCTTTCAAATGATTGAATGAGCATGTCAA ATTTCTACTGAATGCGATAATCCAATACACGACTAAGACTTATCACATTA TGTCATCAATAGGGATTTTATTGTCACACAGAAGAAGAACTGAACGATTG GGTGTCCGCAGTCAGAGAGGTTAGTCATTGctgttttctatttttagata aatttttcaaaagaatctaTTGCTCGGAATAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000176_pilon:313183..333964+

>XLOC_038499 ID=XLOC_038499|Name=XLOC_038499|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2130bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000176_pilon:313183..333964+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTAGTTTGGGTAGAACAAGAAATCTCCAAAGAGTGAGAATAGTTTAGTT
TGGGTAGAACAAGAAATCTCCAAAGAGTGAGAATAGAAATGAAAGAGATA
AACGAATATGTATACAATCGTTTATGGTTTACATATCGAAGGAACTTCTT
GCCAATAGAAATGAAAGAGATAAACGAATATGTATACAATCGTTTATGGT
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GCAAATGGGTGTCGGAGAGGGAAAGTCTGTTGGTCAATGGTTCGGACCAA
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ATATGGACACTTGGGGTTGTTATGGAGAGTGTTCGTCCTCACACAATGAA
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CAAGAGGAGGAAAACAAGATTCAGCTCATCTTCATCTAACGAAAAACAAA
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CTGTCGGAAACTAATCCAACATATTTCACCGCGTTAAAGGAAAACTCTGC
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ATGTTAACAAGAGGAGGAAAACAAGATTCAGCTCATCTTCATCTAACGAA
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GTTGGGACTGTCGGAAACTAATCCAACATATTTCACCGCGTTAAAGGCGA
TGTTTACATTGAAGCAAAATATAGGTATCATTGGAGGGAAACCTAATCAT
GCACATTATTTCATCGGCTTCAATGGCGATGTTTACATTGAAGCAAAATA
TAGGTATCATTGGAGGGAAACCTAATCATGCACATTATTTCATCGGCTTC
AATGGCGATCGACTATTATACCTTGATCCGCATACAACACAACCTGCTTT
ACAAATGGAACGTTATAATTGTATCCCTGACACTGCGATCGACTATTATA
CCTTGATCCGCATACAACACAACCTGCTTTACAAATGGAACGTTATAATT
GTATCCCTGACACTAGCTATCATACTGAAGCACCTTGTTTTATGAACTTT
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TTTTATGAACTTTTCTGCACTCGATCCTTCAATAGCCTTGGGATTTTATT
GTCACACAGAAGAAGAACTGAACGATTGGGTGTCCGCAGTCAGAGAGGTT
AGTCATTGctgttttctatttttagataaatttttcaaaagaatctaTTG
CTCGGAATAGGGATTTTATTGTCACACAGAAGAAGAACTGAACGATTGGG
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tttttcaaaagaatctaTTGCTCGGAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038499XLOC_038499-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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