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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000044_pilon:1711844..1714994+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045410 ID=XLOC_045410|Name=XLOC_045410|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3151bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1711844..1714994+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAGGGAATGTCCAAAGTGTCAAATTCATAGGTAAGAATGGTTGGTCCGC
AAATATATTTTTGCTACTAGTAATTGAATGGTTTCATTTTCTCCATTCTC
GGTCCACCTTAGAAggaaggctgtaacttttggtCCTAATTGACGTAAAA
GTTGTGTTTTGAGGTCATTTCCAGTCAAGGGATTTTGCCTGTGGTGTCAG
TTTTTGAGTCCTAAAAAATTTCCCTAGGCCTTAGCAGAAAACCCCTCTTG
CGAAAAACTATTTTAGTACTTCATTCATTCTTTGAAATTGACCAGGTTTG
GTTGCGTCACATAAAAGATGTCACGAGTCCTAAAGGTTTGCCCCTACTAA
TTTAAAATCACTAATATAAAAAAGTTCCTGAAAAGTTGAGATTTTTGCGC
GCACTGAGATACTCTTTCCTTTTCGTTATAGATAATGACACTTTTCCGAT
AACCGGGTTGGTATCCATACGGAACGATCGTTACGGGCGCGTCTCAAAGA
CCGGAACAATCATGATCGAAGCACTGAGATTTGCAATACGTCAGGTGAAT
CagaaaaaccgaaaatttctcCATGGATACCGATTCGGGTTTAACAGATT
TCATGATATATCCGATACAAAAGTTTATGAGATATCTGATATTGTTAAAG
ATCTGTTCTTAGAAGATTATCTATTCCTAGTCGGTCCTCATTCTTCAGAA
ACGTCATACGTGACGGATTTATTATCCGTCCCTTTCGGTATATCCGTAAT
TTCTTACGGCGCGACGTTTAGTGATTTCCCGCGAGTCTCTGGAGAGTCAA
GTTATACGTATCGCACAGTTCCGTCCAATACTTTCCGTATCCAAGCTTTA
GTGGACGTTGTAAAAACATTACGTTGGAATTATGTAAGTATAATCTCATC
TTACGGTTATGACGGAGAAAGAGACGCACGTTACTTTACGCAAGAGAtta
tcaaaatgaagatatgTTTAGGCAACATATACGATTTACCACGTAACACA
AATCAACAACGTTATAAAGACATTCTAGAAGCCGTCGACGAAGACGAAAG
TGCCCGTGTCCTACTTCTCTTCACCAATATCAAAGACTCCATGAATATCT
TAAAAGCCGTCACAAAACTCAAActtgaaaaacgttttttattATTCTGT
GTCCTTGGTTGTTTGCACTATGATGAAGTCATTCGAGGAAACGAAGAGGC
AGCACTTGGGATGTTAAGTCTTGATTTATATAATTACCCTAACTCTCAAT
TCgaagaatatttcaaagctTTAACCCCTGGTAAACGAAACAAGAgttat
tttcgaaatttttgggAACAACATTTTAATTGTGTATTAAATGCTTCCGC
CCCAAATAAATTCAAACGCCCCACATGTACCGGGAATGAAAAAATGACCG
ATGTTGAGTTCCTGAAAGACGTGTCAACACATACGATAATTTCAGCGGTT
TATGCTTTTGCCTGCGCCACAAGAAGTATTGTTCAGAAGTATTGCGGAGT
GAACCATGAAGGTGGAAGTAAGACATGCTCGCAAGGTTTATATCCGAGtt
caacagaaaaatatttcgagaaagtttttgaatcattaaaaaacgTTACT
TTCAATGACGGTACACTTGACCTACATCGAGCCTTTGCGAATGTTAACTA
TAATGCGACCGATTTCGgtgatttcaaagatatttcaaaatacGTTCGCT
ATGATGTCTTTTACTACGGtaacgaaaataaaaacattttgatagGACAA
TGGAAAAAACGGAGAGTCAGAAATCGTAAACGTGGATTTTCATCAACAAC
AGGTTCAagcctatcaaatttttttctcggtgTCCAAGAAAACGACGAAC
GTTTCAAATCAAGTTTCAATTTGATGAATTCTCACATCGTTAAGAACTTA
ACTAATATTGTATGTAGCCCACCTTGTAAACCTGGACATTACCGTGTCCC
ATATGCTAATTTTGCAAAACGTTCGTGCTGTTTCACATGTAGCCCTTGTC
CTGAGCATCATATCTCAATCAACGGAACATGCTCCCAATGTGCAATGACT
GAAAAACAAGTCAACAATCAATGTGTCATGTTACCTCAAATATGGATTGG
CGTGTTAAGTGATATCCCTTCCATCGTATTCAGTTTTCTATCAGTTCTCG
GTGCAATATCAGTCGTTTTCGTAGCTTTGATTTTCGTACGTTTTAATGAC
CATAAACTTGTTCGCGCGTCCGGACGCGATCTCTTCTATATCATGCTATT
TGGTATCTTCTTAACCTTTATCATACCGTTTACGGTCTTAACTAAACCGT
CAAGTGCAGCGTGTGTAGCACGTGGTATATTGCCTGGACTCGCCTTCCTT
ACCTGTTACGCACCCCTATTCCTGAAGACAAATCGTATCTACCGTATTTT
CCTGCACGGGAAGCGGACCGCTCAACCACCGAATTTAATCAGCCCGCAAT
CACAAATTGTTATCTTGTGTGGTATAACAGCTGttcaaattttattatca
aGTGTCTTTTTCGCCTCCAAAACACCGAACCCCGAACTAGAAGTAAATCC
TGAACGTACCCGAATTTTACTGAAATGCAAAGGCGATTCAAGCCCGATCT
TAATGTTGTTGAATCTTATCATATCTGTAGTGTTCATGGTGTCGTGTACC
TTCCTCGCATTCAAAACAAGACATTTCCCTAAAAACTTTAACGAAGCAAA
AGACATTGGTGTTACATTATACATAACATGTgttatctggtctgtatttt
tacCAGCCTTCTTTCTAACAGTACCTTGGAGATTGGAATTTGTTCGAGAA
TACCTTATGAGTGGATTAGCCATCGTGCTTGGTTATACGACCCTATTTGG
ACTCTTTGGGCGTAAGTTAAAGATTCTGTTTACCGGTGATAAAGCAGACG
ATAGTGCGACGCCAAAGGAACACAAGAACGTATGCAATAGTGTCGTGTCG
CGCTTCACGTCAATCAGGCACCGTATTTATTCGGAGACGCCGTCAAACCA
TACGCATAACAATGGCGTcaaatttaaaatgattttaaatgaTTCAAAAT
CTGAATGTTCGTCCGAGAATAATAATGATTGCGAATCAACAAATTGTCGG
ACAGATGTGGATACAGCAATTGAAAGTGTTGTTGAGACGACGGAAACATa
a Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044_pilon:1711844..1714994+ >XLOC_045410 ID=XLOC_045410|Name=XLOC_045410|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5502bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1711844..1714994+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAGGGAATGTCCAAAGTGTCAAATTCATAGGTAGGGAATGTCCAAAGTG
TCAAATTCATAGATAATGACACTTTTCCGATAACCGGGTTGGTATCCATA
CGGAACGATCGTTACGGGCGCGTCTCAAAGACCGGAACAATCATGATCGA
AGCACTGAGATTTGCAATACGTCAGGTGAATCagaaaaaccgaaaatttc
tcCATGGATACCGATTCGGGTTTAACAGATTTCATGATATATCCGATACA
AAAGTTTATGAGATATCTGATATTGTTAAAGATCTGTTCTTAGAAGATTA
TCTATTCCTAGTCGGTCCTCATTCTTCAGAAACGTCATACGTGACGGATT
TATTATCCGTCCCTTTCGGTATATCCGTAATTTCTTACGGCGCGACGTTT
AGTGATTTCCCGCGAGTCTCTGGAGAGTCAAGTTATACGTATCGCACAGT
TCCGTCCAATACTTTCCGTATCCAAGCTTTAGTGGACGTTGTAAAAACAT
TACGTTGGAATTATGTAAGTATAATCTCATCTTACGGTTATGACGGAGAA
AGAGACGCACGTTACTTTACGCAAGAGAttatcaaaatgaagatatgTTT
AGGCAACATATACGATTTACCACGTAACACAAATCAACAACGTTATAAAG
ACATTCTAGAAGCCGTCGACGAAGACGAAAGTGCCCGTGTCCTACTTCTC
TTCACCAATATCAAAGACTCCATGAATATCTTAAAAGCCGTCACAAAACT
CAAActtgaaaaacgttttttattATTCTGTGTCCTTGGTTGTTTGCACT
ATGATGAAGTCATTCGAGGAAACGAAGAGGCAGCACTTGGGATGTTAAGT
CTTGATTTATATAATTACCCTAACTCTCAATTCgaagaatatttcaaagc
tTTAACCCCTGGTAAACGAAACAAGAgttattttcgaaatttttgggAAC
AACATTTTAATTGTGTATTAAATGCTTCCGCCCCAAATAAATTCAAACGC
CCCACATGTACCGGGAATGAAAAAATGACCGATGTTGAGTTCCTGAAAGA
CGTGTCAACACATACGATAATTTCAGCGGTTTATGCTTTTGCCTGCGCCA
CAAGAAGTATTGTTCAGAAGTATTGCGGAGTGAACCATGAAGGTGGAAGT
AAGACATGCTCGCAAGGTTTATATCCGAGttcaacagaaaaatatttcga
gaaagtttttgaatcattaaaaaacgTTACTTTCAATGACGGTACACTTG
ACCTACATCGAGCCTTTGCGAATGTTAACTATAATGCGACCGATTTCGgt
gatttcaaagatatttcaaaatacGTTCGCTATGATGTCTTTTACTACGG
taacgaaaataaaaacattttgatagGACAATGGAAAAAACGGAGAGTCA
GAAATCGTAAACGTGGATTTTCATCAACAACAGGTTCAagcctatcaaat
ttttttctcggtgTCCAAGAAAACGACGAACGTTTCAAATCAAGTTTCAA
TTTGATGAATTCTCACATCGTTAAGAACTTAACTAATATTGTATGTAGCC
CACCTTGTAAACCTGGACATTACCGTGTCCCATATGCTAATTTTGCAAAA
CGTTCGTGCTGTTTCACATGTAGCCCTTGTCCTGAGCATCATATCTCAAT
CAACGGAACATGCTCCCAATGTGCAATGACTGAAAAACAAGTCAACAATC
AATGTGTCATGTTACCTCAAATATGGATTGGCGTGTTAAGTGATATCCCT
TCCATCGTATTCAGTTTTCTATCAGTTCTCGGTGCAATATCAGTCGTTTT
CGTAGCTTTGATTTTCGTACGTTTTAATGACCATAAACTTGTTCGCGCGT
CCGGACGCGATCTCTTCTATATCATGCTATTTGGTATCTTCTTAACCTTT
ATCATACCGTTTACGGTCTTAACTAAACCGTCAAGTGCAGCGTGTGTAGC
ACGTGGTATATTGCCTGGACTCGCCTTCCTTACCTGTTACGCACCCCTAT
TCCTGAAGACAAATCGTATCTACCGTATTTTCCTGCACGGGAAGCGGACC
GCTCAACCACCGAATTTAATCAGCCCGCAATCACAAATTGTTATCTTGTG
TGGTATAACAGCTGttcaaattttattatcaaGTGTCTTTTTCGCCTCCA
AAACACCGAACCCCGAACTAGAAGTAAATCCTGAACGTACCCGAATTTTA
CTGAAATGCAAAGGCGATTCAAGCCCGATCTTAATGTTGTTGAATCTTAT
CATATCTGTAGTGTTCATGGTGTCGTGTACCTTCCTCGCATTCAAAACAA
GACATTTCCCTAAAAACTTTAACGAAGCAAAAGACATTGGTGTTACATTA
TACATAACATGTgttatctggtctgtatttttacCAGCCTTCTTTCTAAC
AGTACCTTGGAGATTGGAATTTGTTCGAGAATACCTTATGAGTGGATTAG
CCATCGTGCTTGGTTATACGACCCTATTTGGACTCTTTGGGCGTAAGTTA
AAGATTCTGTTTACCGGTGATAAAGCAGACGATAGTGCGACGCCAAAGGA
ACACAAGAACGTATGCAATAGTGTCGTGTCGCGCTTCACGTCAATCAGGC
ACCGTATTTATTCGGAGACGCCGTCAAACCATACGCATAACAATGGCGTc
aaatttaaaatgattttaaatgaTTCAAAATCTGAATGTTCGTCCGAGAA
TAATAATGATTGCGAATCAACAAATTGTCGGACAGATGTGGATACAGCAA
TTGAAAGTGTTGTTGAGACGACGGAAACATaaATAATGACACTTTTCCGA
TAACCGGGTTGGTATCCATACGGAACGATCGTTACGGGCGCGTCTCAAAG
ACCGGAACAATCATGATCGAAGCACTGAGATTTGCAATACGTCAGGTGAA
TCagaaaaaccgaaaatttctcCATGGATACCGATTCGGGTTTAACAGAT
TTCATGATATATCCGATACAAAAGTTTATGAGATATCTGATATTGTTAAA
GATCTGTTCTTAGAAGATTATCTATTCCTAGTCGGTCCTCATTCTTCAGA
AACGTCATACGTGACGGATTTATTATCCGTCCCTTTCGGTATATCCGTAA
TTTCTTACGGCGCGACGTTTAGTGATTTCCCGCGAGTCTCTGGAGAGTCA
AGTTATACGTATCGCACAGTTCCGTCCAATACTTTCCGTATCCAAGCTTT
AGTGGACGTTGTAAAAACATTACGTTGGAATTATGTAAGTATAATCTCAT
CTTACGGTTATGACGGAGAAAGAGACGCACGTTACTTTACGCAAGAGAtt
atcaaaatgaagatatgTTTAGGCAACATATACGATTTACCACGTAACAC
AAATCAACAACGTTATAAAGACATTCTAGAAGCCGTCGACGAAGACGAAA
GTGCCCGTGTCCTACTTCTCTTCACCAATATCAAAGACTCCATGAATATC
TTAAAAGCCGTCACAAAACTCAAActtgaaaaacgttttttattATTCTG
TGTCCTTGGTTGTTTGCACTATGATGAAGTCATTCGAGGAAACGAAGAGG
CAGCACTTGGGATGTTAAGTCTTGATTTATATAATTACCCTAACTCTCAA
TTCgaagaatatttcaaagctTTAACCCCTGGTAAACGAAACAAGAgtta
ttttcgaaatttttgggAACAACATTTTAATTGTGTATTAAATGCTTCCG
CCCCAAATAAATTCAAACGCCCCACATGTACCGGGAATGAAAAAATGACC
GATGTTGAGTTCCTGAAAGACGTGTCAACACATACGATAATTTCAGCGGT
TTATGCTTTTGCCTGCGCCACAAGAAGTATTGTTCAGAAGTATTGCGGAG
TGAACCATGAAGGTGGAAGTAAGACATGCTCGCAAGGTTTATATCCGAGt
tcaacagaaaaatatttcgagaaagtttttgaatcattaaaaaacgTTAC
TTTCAATGACGGTACACTTGACCTACATCGAGCCTTTGCGAATGTTAACT
ATAATGCGACCGATTTCGgtgatttcaaagatatttcaaaatacGTTCGC
TATGATGTCTTTTACTACGGtaacgaaaataaaaacattttgatagGACA
ATGGAAAAAACGGAGAGTCAGAAATCGTAAACGTGGATTTTCATCAACAA
CAGGTTCAagcctatcaaatttttttctcggtgTCCAAGAAAACGACGAA
CGTTTCAAATCAAGTTTCAATTTGATGAATTCTCACATCGTTAAGAACTT
AACTAATATTGTATGTAGCCCACCTTGTAAACCTGGACATTACCGTGTCC
CATATGCTAATTTTGCAAAACGTTCGTGCTGTTTCACATGTAGCCCTTGT
CCTGAGCATCATATCTCAATCAACGGAACATGCTCCCAATGTGCAATGAC
TGAAAAACAAGTCAACAATCAATGTGTCATGTTACCTCAAATATGGATTG
GCGTGTTAAGTGATATCCCTTCCATCGTATTCAGTTTTCTATCAGTTCTC
GGTGCAATATCAGTCGTTTTCGTAGCTTTGATTTTCGTACGTTTTAATGA
CCATAAACTTGTTCGCGCGTCCGGACGCGATCTCTTCTATATCATGCTAT
TTGGTATCTTCTTAACCTTTATCATACCGTTTACGGTCTTAACTAAACCG
TCAAGTGCAGCGTGTGTAGCACGTGGTATATTGCCTGGACTCGCCTTCCT
TACCTGTTACGCACCCCTATTCCTGAAGACAAATCGTATCTACCGTATTT
TCCTGCACGGGAAGCGGACCGCTCAACCACCGAATTTAATCAGCCCGCAA
TCACAAATTGTTATCTTGTGTGGTATAACAGCTGttcaaattttattatc
aaGTGTCTTTTTCGCCTCCAAAACACCGAACCCCGAACTAGAAGTAAATC
CTGAACGTACCCGAATTTTACTGAAATGCAAAGGCGATTCAAGCCCGATC
TTAATGTTGTTGAATCTTATCATATCTGTAGTGTTCATGGTGTCGTGTAC
CTTCCTCGCATTCAAAACAAGACATTTCCCTAAAAACTTTAACGAAGCAA
AAGACATTGGTGTTACATTATACATAACATGTgttatctggtctgtattt
ttacCAGCCTTCTTTCTAACAGTACCTTGGAGATTGGAATTTGTTCGAGA
ATACCTTATGAGTGGATTAGCCATCGTGCTTGGTTATACGACCCTATTTG
GACTCTTTGGGCGTAAGTTAAAGATTCTGTTTACCGGTGATAAAGCAGAC
GATAGTGCGACGCCAAAGGAACACAAGAACGTATGCAATAGTGTCGTGTC
GCGCTTCACGTCAATCAGGCACCGTATTTATTCGGAGACGCCGTCAAACC
ATACGCATAACAATGGCGTcaaatttaaaatgattttaaatgaTTCAAAA
TCTGAATGTTCGTCCGAGAATAATAATGATTGCGAATCAACAAATTGTCG
GACAGATGTGGATACAGCAATTGAAAGTGTTGTTGAGACGACGGAAACAT
aa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000044_pilon | genome | sc0000044_pilon:1711844..1714994 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 34-2751:434 |
| Aaloc | 1-30:1 |
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