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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1467548..1474566- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045773 ID=XLOC_045773|Name=XLOC_045773|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7019bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1467548..1474566- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCACCACAACAAGCACAGGCAGCACCAGAAACACCTAAAGGAATCAA
TGGAATCCTTCTTGGTCCACCAGGAGCAGGAAAAGGTACCCAGGTAAAAA
GATTTGTTTTTCAATATTTGATTGGCTGTGTGTTTTCAACCGTCATTAGG
ATCTCGAAAATTCAAACTCTCAACCCAAATTCTATTCATTTTGTCATTAG
TATATAGAAGAAGAAATCTCAGCTTGAATCTTCAGGCTATGATGGCAAGC
AAAGGTAAAAATTTTGAAACAAAGCTCAGAAAAGCTCAGTGTTCAAGAGT
GGTTCAAATCTAAAAACTTTGCTAACTTCTAAGAACAAAAGCCGACTACC
ACCTAACAGTCACCCTGGTGTGTATATGATAGAATGCGAATGTGGTAAAA
GATATGTTGGCGAGACCGGGTTAAAGATATCCACATGTGTCAGCCAACAC
AAAAAGAACGTTGAAGATGAAAAATGGGACATTTCGGGTATAACTAACCA
TGCTAAAGACTGTACCCAAGGACTTAATTGGAACGAAGCTAGGCTTTTAA
AGACTGAAGAGAACAAATTTGATAGAAAAGTGCGTTATTTATAAGATGCT
TTGTTGTCTTTTTAATCTTTGTGTAAACTTGCATATGTTTTGCATACTTT
CCAACTAAATCCAACCACGGCATTTTAGTTCCTGTATTTTTGCATACAAT
TCAAGATGGCGGATGGAAAGGCGAAAAGGTCTATTGCAATAAAGAGTTAC
CTTATGACTTTGAATAGACGCCCGGCAGTTACATCAATATGTCAAAAACA
TTTTGTTCAACCACCTTCACTTCAAGATAGGGTACCATAGAATGAACTTC
CTTTTATAGGATGAACCATATTCATGTGGCTTTCAGCCTTGCACTCCATT
GCAGAGGCTAATCAATTTTAATGACTTTTTTGACTAAATTTTTAATTTTT
TTATATTTGAGTATTAAAAAGGCATGCATTCAAATAATAAAGGTTTAAAA
TTTTTCTCTGGGCTAGTTAGTAAAATATCTCAAATAGGCTTTGTGATGGA
GTGCAAGGCTGAAAGCCACATGAATATGGTTCATCCTATAAAAGGAAGTT
CATTCTATGGTGGCCTATCTTGAAGTGAAGGTGGTTGAACAAAATGTTTT
CGGCATATTGATGTAACTGCCCGGTTGTTTATTAAGGGGGGGGGGGAAAT
GACACCTTCCAAAAAAGTGAAGAAGGGGGGATCAGAAATTTTCACTAAAA
AGGGGGGGGAGGGATCGTTTAAGAAGGGGGGTCTTACATATGTTGTAGAT
TATTTTCCAGCACTGTTATGAAATTTAGTCTGCATGAAAGGAAGTTCTTT
ATTTTCACTAAAAAGTGGTATATATTTGCCAGACTTAATTTTTCTTTACT
GTTTCCCATCCCTTTTTACCATAAAAAATTTAGCCCGAAATCCTTGGGGG
ATAGGTATTTTTAAAGGTTGGGGGGATGCCAAGAAGGGGGGGATCGTTTA
AGAAGGGGGGATCATACCCCTTTCCGCACTATGTGTAAGCAAAATGATGA
AAGGTGTAAAAAAGGATGAGATATTCCAAAAATATTGATAAAAAACGGGT
TGTCCGAAAGAATGTTTTAAAAACTAATGGATATTATTTTGAGGATGAAA
ATTACATGAGTGTATAGTAAAAAGTGTATCTTTCAGAAAATAACAAAATA
TTCACTGAAAGAGTGACATAGGATGAAATATTCCACTTTTTATGTCACCC
AAAACCGAAAATTGTGGAATTCTTCATCCTTTTCTACTCCTTGAATTTAA
ATTTGAAAATTTATGGTATCATCAATAGATTTCCAAAGAGTTTAGATGGT
AAAGCCGTTTTAAAAAATTGCTATAGTAAAAATCAGAAAATTTTGATTTT
CTAGAATATTTTATCCCAAATATCTTTGAAACCTATATCATTGGAATCCT
CGTGGAAAAATACGTCATTTCTAAAAATAAGGTCCAAAAATTCCTAACAT
CAAAGTAGATATTGCGAAAAAGATGATTTTAAAGATCACTGAAAAGTCCA
TCAGGTACATTCTAAAAAAACACCGACATAAACAAAATTTAACATCTTTA
CAAAAGTTGTCTTTTTGATTTTTCAAACATTTGTTTTGTGCGTTCCCTAC
CACAATCCCGTGAAGTCCGGTAACTTGCATCAGCGTAGGCAAACATGCAT
AGCCATCAAATGACTGACCAATCAAAGCAAAATTTCAAAACAAATGAACT
ACGCAGCTCCGCTTGCAGCTCTACTCTACCATCTTTGTTTTGATTTGAGT
TTGTATTTTAATGACCAGACAGATCATTCATTTGAGGGCTATGCATGTTT
GCCTCCACTGATGCAAGTTACCCGACTTCACGGTAACTTATGTAATCGCA
CTTTCGGTAAGTTGGGTTAGTCATAATCCAAGATAAGAAATTAGAGGAGA
CTAAAAGACGGGGGAGTTAATGTACCGTGAGTTAATGTACCGTGAGTGGT
CCTAAATCCAACAGCCCTGCCTAAATCCGACCCCCCCCCCAAATAACTGC
TATAAAAAAAATTCTATATTTGTTCAAACATTCCCTCTCCAAGTTGAACA
ATAAATTATATTGCAAGGACTCTCGAAACAAAATATCTATAAACAAGATG
ACTAAAACCAGTCAATAAATGTGATCAAAAAAGTTTGAGTTGTAAAAACA
ATTACCTCTTTTATTCTGAATCTGTTGCTCGTGTTTAAAAAACGTTAACA
ATTTTGCAGAATTTTGTAATAAAAAATTATGTTTTGTATAAGAAGCAATT
ATTGTTATTTGGTTCAATTGGTTCAGTGTATCAAATCTCTCAGTTTAGTT
GACACTTTGGTATCTTCATTGCGTCACAGCGAAAGGTTTGTTTCTATTTT
AGTTTGAAATTTTTTTATCTTTGAAATACCCCATCAGATTTAGACAGGGC
TGTCGGATTTAGGACCACTCACGGTATGTAATATTAATTCATAATTTCTT
TATCTTTATTTTTCACGAATTCTCAACTTCAGTTGAGCTAGAATCTGAGA
ATGTCTGTGTGTCTGTCTGTGTGTCTGTCTGTGTGTCACCAAAACTTTGG
GGCAGGCTGGAGACTTCAAAATTGGTCTGATTGGGCTGAAATTTTGCACA
CTTGATCCATGGGCAAATCCCTGGGGGTATTTTTTTCATTTTTTCAAAAT
TTTAATTTTTGAGGCCTGGGGACGAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAA
CTTTGGGGCAGGCTGGAGACTTCAAAAATGGTCCGATTTGGCTGAAATTT
TGCACACTTGATCCTTGGGCAAATCCCTGGGGGTGTTTTTTTTTCATTTT
TTCAAAATTTTAATTTTTGGGGTCTGGGGACAAGTTTTTCGCCAAAACGA
GGCTAAAACCCAAAATACAATAATTTTTCTTAAGCCATGAAGTTTACAAT
TAGGTCTACGAATGATTTCAAAGATACTGAAGTTGAGCCAGTGCGGTTAG
TCATAATATTGTGCATGCAATTCAAATATTTCAATTGGTTAGTTGTCATT
CGAACTTCTATTAAGTGACAAAAATTAAAGGGAACTTTGAAAAAATCTGC
GAACACAATAATTACGAAGGAGGAGTGGCTGAATTTTAGTTTATCCATGA
TAATTAACAAGTAATAACATGGTCGTTTGGGTAACTTTGGGAATAATAGC
CTCTTGTTTCATTGAAAACATTTCAAATAGCCCTCGCATACGTTTTTGGG
GGCTAAGCTTTCTAGGGGGTGGGCTGAGTTTATGATTTAAGTTTTCAATA
AAAACTTTCAGATCATTTCAAAAAAATGCCTGTTACATATATGTTAATAT
TATAATGCCTGTTATATAATTCATCACTGAATTACTGAAAAAAATAAGTT
GCCTTCTAAGTGTCTTATTAAACTCAACTAAAGTGCTCTACCCAATGAGC
TACATCTCTTTGGCAAAATAGAAACTGAAATGACAGGAATAGAACCGGCT
ACCTCTTCAGCTATTATTCAACACTTAGAAGATAGAAGTGTATATTAATA
TATCGACATTTTGTTGTTATATGCTAAAATTTTGTTAAATTTTTGTTAGC
TTGTCCTTATTGTGACATAATGTTGATCTTTGTTAATTTAAGAAAAACTT
ATTTAGATGACCTTCTTTATTTTGTCTAAAAACTCTCAAGCACAATTTTC
TTTTTGAGTTTTCCTTTCATGAAGGTGGGGGCGCTACATCTGGCTACATT
CTTAGAATTTAGCTGGAGGCTATTTTCGTTAGCCCCCCCCCTGAAAAATA
CTGGGGACTGGACCCCTTTGCATACTATGCAGATTGTAAACAAAAAATCC
TCTCAACTGCAAAATTAAATTCTGTGAAACTTCTGAATTTTGAGCTGTAA
ACCGCAAAATTCAATTCTGTGAAAATTCCTTCCCTTAAGGTAGTATTATT
CTTTGGCAGGGAAATGATTATGAGACAAGGACAAATAATAAATATATTCT
GGTCACACTTGAAATCCTTCTTATCCATTTGACTTTAAAAATGGTGAAGT
GAGGGAGAGTCATAGTTTTGGGCAAAAAAATTTTTGCCTAACTTTGATGA
GCGACAAAAACATTTTTCTACTTTTTACACATTTTCAACCATGAAAGGGG
GAGTGTCTTTGAATTGGATTATATAATAGTCTTTGAAATATATAATACAG
AAATTATTGTTTCTTTTTAGTCTCAACGGTTGATTGAAAAATATTGCATC
TGTCATTTGGCTACTGGAGATTTATTACGAGCTGTCATTGCATCAGGATC
AGATCTTGGAAAGAAAATAAAGGGTGTAATTGATGCTGGACAGGTATGAA
TTTCATTTGATTTGTTTCGTTATATTCTCTTGACTGGGGCATTACATTCC
TGTATATTTATAAAGAGAATTTAGAAGTCAAACAAATTTCATTTTTATCC
TTAGATGTGATTCAAAGTTTCAATCAAGTAGAAAAGTTCAAAAAGTTTTA
TTGAAATACCAAAAAATAAATAATTCGCTTAGAACTCAACTGCTATCATC
GTTTCATCACAGATTCTATTTCTTTCAAGACTGATATCCACAATGCAACT
TGTCTGGAGATTGCGCCAACGTAAAACACAATGTAGCTATTGATTGTAGA
TTCGTTCTTTATTTTCTCCGTATTACTAGCTCTTTATGCTTGTAACATTA
TTTGTAGCTTGTATCCGACGATCTGGTGGTTGAATTGATTGATTCAAATC
TGAAGAAACCAGAATGTAAGAATGGATTTCTTTTGGACGGTTTCCCAAGA
ACTGTACCACAAGCTGAAAAGGTAATGTGCTATTTTGTTTTATGTTGTAG
TAGTCAATTACTGATTACTGCTTCTGTGTATTCTTCTTTAGTTTTAAACA
GAGTGTCCCAGCACTTTCTACCTTAGACAGATTGAATTTCTTTTGACCAA
TACCTGTAGGAAAATGAAAGAAATTAGGTGAAAATAAGGCTAATTCGCAA
ATTTTATTCCACGCGAAAATAAATCCAAGTTTAGGGTATTATTTGGAAGA
AAAATATGATTTCACTCCCTCAGACTAGGATATCTTTCTTTAGGGACCAT
TTTTTTCGGATAGTTTACCCATTTGTTAATATGTGTTCTCTAATGTTTTG
ATTTTGTGATTTGTGTCTTTCAGTTGGATGATTTATTAGAAGAGCGAGGC
ACACCACTTGACCGGGTCATTGAGATGAAAATTGACGAAGAAAAACTTGT
GTCAAGAATCGTTGGGAGGTAAAGTTCAGTTGTTATTCCTTTTAACAGGG
TTGTTAGGTTTTATTAAAAATCTTCATCCTTGAATCTCCTTAAAAAATTG
TAAATTTGGAAAATAATTATTATTACCTCATATCTCCTGAAATTCGATTT
TCAAGGGATTTTCATCCCACTAAAGTATCAATACCCTATTGTTTCATGTA
ACCCATCAAAGGGGGTGATGTAAAATTTTATTTTCTACCAGAACCAAATC
ATTCCAAAATATTTCTTCTTTAATTTCAGATTATTCCACATCAAAAGCGG
TAGATCGTATCACGAAGTTTTCAATCCACCCAAAAAAACAATGACTGATG
ACGTGGGTTGATTTGTTTGTGATTGTCTCTTTCTGAGTGTGCTAAATTAA
GTGCGTATCGTGGCTTCGCGGCTTCGTGGGTTCGTGGGTCTGCGAGTCCG
CGAATCCGCGCGAGGAATTTTCAACCCACGGACCCACAAGCAATTTTGGC
CCACGAATCCGCAAACATTAATCACCCACGCACTCACGTGACTTTTTTTT
TACCCATGAACCTGCGGACCCACAAAATTTGGGGACAAGCTGGAGTTTTT
ACAAGCTCTTATTTGATTTGGTTGGTCGTTAAGATGTAATAAAAGAATCT
CATTACTTTTTCTAAAGAACGCGTCATCTCTATCACTTTAAATGACCAAT
TATTGAAGTATCTTGTAAAAACTCCAGCTCATCCCAAAATTTGACCCTCG
AACCCTCGAGTAATTTAAACCCTCTCTCATCTATGTTGTTTGCCAATTGA
ATTATTTCGTTCAGTGTCTTGTTTGATGACCTTATTGAGTGATTTCTGCA
GTCGACCTCTTTTCCTCGTCAAGTGGACAGGGTCCCAAAGAATCAATTTC
GTAGCGGGTTCATTCCCTCTGATGCTTTGACACCACCCTTTTAGTACACT
ACTGACGTTCTCCGCGACCGGATATTTAATATCACCCTTTTAGTACACTG
TACTGACTTTTCTCCATGACTGAATTTTTATTACCATTCTATCTTGAATT
ATCTTACAGATCACCGGTGAGCCATTAACAAGACGATCAGACGATAATGA
AGAAGCTCTCCGCAAACGTTTAGCATCCTTCCACAAATCTACATCACCTT
TAGTCAACTTCTATCAAAAACGTGGAATTCATAGCGCCGTCAATGCCGAC
CGATCCATGGACGCTGTTTTCGCTTCTATATCCGCCATCTTTGATGAAGC
ACGCGACAAAAGATCATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1467548..1474566- >XLOC_045773 ID=XLOC_045773|Name=XLOC_045773|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1416bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1467548..1474566- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCACCACAACAAGCACAGGCAGCACCAGAAACACCTAAAGGAATCAA
TGGAATCCTTCTTGGTCCACCAGGAGCAGGAAAAGGTACCCAGATGGCAC
CACAACAAGCACAGGCAGCACCAGAAACACCTAAAGGAATCAATGGAATC
CTTCTTGGTCCACCAGGAGCAGGAAAAGGTACCCAGTCTCAACGGTTGAT
TGAAAAATATTGCATCTGTCATTTGGCTACTGGAGATTTATTACGAGCTG
TCATTGCATCAGGATCAGATCTTGGAAAGAAAATAAAGGGTGTAATTGAT
GCTGGACAGTCTCAACGGTTGATTGAAAAATATTGCATCTGTCATTTGGC
TACTGGAGATTTATTACGAGCTGTCATTGCATCAGGATCAGATCTTGGAA
AGAAAATAAAGGGTGTAATTGATGCTGGACAGCTTGTATCCGACGATCTG
GTGGTTGAATTGATTGATTCAAATCTGAAGAAACCAGAATGTAAGAATGG
ATTTCTTTTGGACGGTTTCCCAAGAACTGTACCACAAGCTGAAAAGCTTG
TATCCGACGATCTGGTGGTTGAATTGATTGATTCAAATCTGAAGAAACCA
GAATGTAAGAATGGATTTCTTTTGGACGGTTTCCCAAGAACTGTACCACA
AGCTGAAAAGTTGGATGATTTATTAGAAGAGCGAGGCACACCACTTGACC
GGGTCATTGAGATGAAAATTGACGAAGAAAAACTTGTGTCAAGAATCGTT
GGGAGTTGGATGATTTATTAGAAGAGCGAGGCACACCACTTGACCGGGTC
ATTGAGATGAAAATTGACGAAGAAAAACTTGTGTCAAGAATCGTTGGGAG
ATTATTCCACATCAAAAGCGGTAGATCGTATCACGAAGTTTTCAATCCAC
CCAAAAAAACAATGACTGATGACATTATTCCACATCAAAAGCGGTAGATC
GTATCACGAAGTTTTCAATCCACCCAAAAAAACAATGACTGATGACATCA
CCGGTGAGCCATTAACAAGACGATCAGACGATAATGAAGAAGCTCTCCGC
AAACGTTTAGCATCCTTCCACAAATCTACATCACCTTTAGTCAACTTCTA
TCAAAAACGTGGAATTCATAGCGCCGTCAATGCCGACCGATCCATGGACG
CTGTTTTCGCTTCTATATCCGCCATCTTTGATGAAGCACGCGACAAAAGA
TCATAAATCACCGGTGAGCCATTAACAAGACGATCAGACGATAATGAAGA
AGCTCTCCGCAAACGTTTAGCATCCTTCCACAAATCTACATCACCTTTAG
TCAACTTCTATCAAAAACGTGGAATTCATAGCGCCGTCAATGCCGACCGA
TCCATGGACGCTGTTTTCGCTTCTATATCCGCCATCTTTGATGAAGCACG
CGACAAAAGATCATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000035_pilon | genome | sc0000035_pilon:1467548..1474566 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 499-708:211 |
| Aaloc | 427-498:990 |
| Aaloc | 331-423:1347 |
| Aaloc | 217-330:1813 |
| Aaloc | 94-216:2300 |
| Aaloc | 1-93:7020 |
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