XLOC_045471 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045471
Unique NameXLOC_045471
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000371_pilon:184178..191424+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045471 ID=XLOC_045471|Name=XLOC_045471|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7247bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000371_pilon:184178..191424+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaagGAGCATAATAAATTAGAAGATGAAATCCTTGCTTCATGGTTGGT CAAACGCAGAAGAACAACAATCCTTGGTGTCATGCAAAGATCACTCTTCG CATTTGAATATTCTGCTGTTGCTGTGTCAGCACTTTATTACTATCGATAC ACGTTAAAAGTACACGATGCAAAATTGTTTTACTCTTTTAGCATGGCTGT CATGTTTCTGTCTGCTGCTGCGTCTGCCATGTTTATTGGACGATATATGG ATCGGACACGGCATTTAAGACGTATTGCATTTACAACAGCGATGTTCTCA GTAATTGGAAACGTGTTTTATACGATACCGTATTCAAGATACTTTCCGAT TATTGGTCGCACTTTGTGCGGAGTTTCTGACGGAATCCAACCAGCAATGG CAggtaattaaattttttaacaattctGAGACAAAAGTCACAGCtttaat tgtatatttttttacaaaacagaCATTTTTTGTGGCTAGCAACGACATCT TCAGACACACatattgcttctttgtcttttctattgtaaactgttcataa tagaaatccatctctgtccccttgagtgttctgtttttataagaaaaatg aagcagacaaagtattcatacagtacgtttgcacatattttgctatgatg ttcccgcttttcatcaaaataatatttgtagaagataccccaaaagcttc cttgtaaatctgaaatatatttttatcagcgtgtgttatgaatttgagaa gcttttatgatttctctttaaaaatttcggatgtaaatattttgacaaat attgtttcaattgacttgaaatgttttccataatcagacataccgacttg ctatctgaaaatatcagttagaaagtgaggcaccccgcggtgtagcgcgg tatttcaaatgaaaaagtactatttataatcttagagaagaaacttctta 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ATGGATACTCTCACCAACGTCAATCTCCTTGTGTTGATTTTCACGGATGG CTTCATCAGTTACATTGATTCTATGATGGAAGTGATGAACAACATGATCG CTTTGTATAATTTCGGATGGAACATCAATCGAATCAGTGTTTTAACTGGT ATTGCAGCAATCATCTTCAGCGCCGCAAATTTCATCTTTCAACAACGAGT TTTAAAAAGTCGTTTAACTTTTTATCTGTTGTTTATCGTATGTTTTTTAT TTGCAATGATGGAACTTTCTCTTGCAACAATCTCAATTAATATACCTCTC AATGTGGACGCAATTAAATTCACTTTATTTACTTCTTGTATTGGATTGAA TATTTTGTTTGGGTTTGGATCAGGTGTTTATTCAAAATGGTTGATTTTTT CATTGGTACCAGCAGATTCAAAGAGCTTTATAGAATCACAACGATACGTT GTTGCCAAGTCGTTTATGTGTTGCGGATATTTCACCGCTTTTCTAATGTA CCAGGAAAGTTTTTATGGGTTCACGATACTTTCGTGCATTTGCTTTGCTA TCGTCAGCTTCTTGCTCCTGTGGAGACGCAAGTTTACAAACGAATAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000371_pilon:184178..191424+

>XLOC_045471 ID=XLOC_045471|Name=XLOC_045471|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2658bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000371_pilon:184178..191424+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaagGAGCATAATAAATTAGAAGATGAAATCCTTGCTTCATGGTTGGT
CAAACGCAGAAGAACAACAATCCTTGGTGTCATGCAAAGATCACTCTTCG
CATTTGAATATTCTGCTGTTGCTGTGTCAGCACTTTATTACTATCGATAC
ACGTTAAAAGTACACGATGCAAAATTGTTTTACTCTTTTAGCATGGCTGT
CATGTTTCTGTCTGCTGCTGCGTCTGCCATGTTTATTGGACGATATATGG
ATCGGACACGGCATTTAAGACGTATTGCATTTACAACAGCGATGTTCTCA
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GGTCAAACGCAGAAGAACAACAATCCTTGGTGTCATGCAAAGATCACTCT
TCGCATTTGAATATTCTGCTGTTGCTGTGTCAGCACTTTATTACTATCGA
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TGTCATGTTTCTGTCTGCTGCTGCGTCTGCCATGTTTATTGGACGATATA
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TACACGTTACTCGTTTACATTAATGTTACTGATCTGACCAAAGAAGATGG
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GATGGAACATCAATCGAATCAGTGTTTTAACTGGTATTGCAGCAATCATC
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AACTTTTTATCTGTTGTTTATCGTATGTTTTTTATTTGCAATGATGGAAC
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TGGATCAGGTGTTTATTCAAAATGGTTGATTTTTTCATTGGTACCAGCAG
ATTCAAAGAGCTTTATAGAATCACAACGATACGTTGTTGCCAAGTCGTTT
ATGTGTTGCGGATATTTCACCGCTTTTCTAATGTACCAGGAAAGTTTTTA
TGGGTTCACGATACTTTCGTGCATTTGCTTTGCTATCGTCAGCTTCTTGC
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ACACAAAGGAAGAATTTGCTAAAGTGCTATCCATCTATCAAATATCAGCT
TCTGTCATATACGCCCTTGCACCCTGTACACCCGTCCTTTTCAATGGCGT
TCATTTCTACATTGGACCAATAGAAATCAACCAATACAACTGCATCAGTC
TGGTTTTAATCATTTTAGTCCTGGTTTACACGTTACTCGTTTACATTAAT
GTTACTGATCTGACCAAAGAAGATGGTTATCATATTTTTGTAGCTAAATA
TAAGAATGACAATAATGAGGATGATGTTTCTCCGTCCAGCAAGAAGTCTG
ATTGGACGTTAATGGATACTCTCACCAACGTCAATCTCCTTGTGTTGATT
TTCACGGATGGCTTCATCAGTTACATTGATTCTATGATGGAAGTGATGAA
CAACATGATCGCTTTGTATAATTTCGGATGGAACATCAATCGAATCAGTG
TTTTAACTGGTATTGCAGCAATCATCTTCAGCGCCGCAAATTTCATCTTT
CAACAACGAGTTTTAAAAAGTCGTTTAACTTTTTATCTGTTGTTTATCGT
ATGTTTTTTATTTGCAATGATGGAACTTTCTCTTGCAACAATCTCAATTA
ATATACCTCTCAATGTGGACGCAATTAAATTCACTTTATTTACTTCTTGT
ATTGGATTGAATATTTTGTTTGGGTTTGGATCAGGTGTTTATTCAAAATG
GTTGATTTTTTCATTGGTACCAGCAGATTCAAAGAGCTTTATAGAATCAC
AACGATACGTTGTTGCCAAGTCGTTTATGTGTTGCGGATATTTCACCGCT
TTTCTAATGTACCAGGAAAGTTTTTATGGGTTCACGATACTTTCGTGCAT
TTGCTTTGCTATCGTCAGCTTCTTGCTCCTGTGGAGACGCAAGTTTACAA
ACGAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045471XLOC_045471-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000371_pilongenomesc0000371_pilon:184178..191424 +
Properties
Property NameValue
Aaloc406-1329:6324
Aaloc1-402:1