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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000111_pilon:781866..791948+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13762.2.p2 ID=MSTRG.13762.2.p2|Name=MSTRG.13762.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10083bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:781866..791948+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CACTCATTAATAGAGAAAATTCATTAAAACTAAACTTAAATTATCAAACG
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TCGTTAGTTCACTTGTGACCTTTtccaataaagaaaaaatatcccTTCAC
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ATCTCGGAAGTTGGGTTTACAGACTATCTGCAGCACAGCGTAAGAATAAG
ACTTTTTTCTATTCTTCTGagattacatcatggacccaacagctgattgg
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ttgggtccgtggaagacattgcaatggtgcatagcATGAACTGGTTTAAA
AACAAGCTTTTAACTAAACTTTCAAACTCATGtagaaaaaatgatgaata
attatgacgtttgacCTCATCTCAAATTAAAGAATAACCCGAAAAATATC
TCTAAtttgtttcactttttaaataaataagcAATTTCAAGGCGAATATA
AACGAACTAGGCCCTCAAAttttagcctggagatccatgctatgatttct
tcttttatatactgatggcataatgaatagcatggtttgggctgtgagtt
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TTTTATTGTTCCACTGGCCatactttcttagaaaaaacgcaactttttta
agtttaatCTTTTAACTCAATTTTAGTAAGTGTGCGCTTATTTCGAATTT
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GTATTACAAGTGTGTAAGGATAAATATTCACTAGTCACTGGTACTCACTA
GTGACTCACTTGAGCGTTCTTCAACTGGTGGGATAAAGTGATAGAGCTAA
ATGCTAAACATTTCTCaatatttctttcaatttgGAAGTTTGTCCAACCT
GGCGACTAGTGAATATTTATCCAAGGGCtgcatacactacacaatatagt
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agggggattgtttacagaaaggaaattcctttttataatagagcacctgt
tatttacttcgtacattatgGTCCGAAAACGATATTGACAAATATTgatc
gtcaatatattgtgtagtctaagtattAGGCCTTTACGCTTGTAATCATG
TTACCATTCTGTATTTCAATAACTTTAGATCGACAAGTGGAaagcaaatt
cgatttttgtgAACACGATACCGACAACATAAAATGTACATGGCGTCAGG
CGGCCATCGAATGCATTGAAGAAGATTGCAAAAAGGTGCAGGGAGGAAAC
GGATTCTTCCTTACTGGCGGACGACGAAGAAGAAGATCACTATCAACTGA
GGAGTTACAGAGTCGTTCAGATAGGTTCTGCGAATATCGTGACGATGGCG
AATTCGTATTCCCTTTGGATTGTAGGGGTTATTTTATTTGTGATGGTGGG
AAAGTCTCATTTGCTTCATGTCCTGAAGGTCAACATTTTCATCCAAAACT
TCGAACTTGTGTTGTGGAATCGCAATATTCGTGTCTGTCAAGAATGCCAA
TTCAGAAAGGTATGATTTACTATTCAGAATGTTCCAGAAATGCATGTATA
AAGGGCAAACCAAAGACTGACAAGTAACAGGCTTCAAgttcctattcatg
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TACCTTTATACTACCAATTACTTTAGAAAATGTAGAAGATATATCTTCAA
AGATGACTATGGACGTTCTTATAGTGATATTCACTATTACTATGATCCTA
CTATACCAATACTGCAGTTGCTTCATGTTTCAAGGCTAGGATcttattaa
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TGCTGTTTATAATGCTCCGTTTTTCCTACCAACTCAATACCAAACACCAA
GTATCTTGATGGAGAGAGGAAGCACGAAACTAAAGGTTAATttaatgata
tgcaccattgcaacgTCTTCCGCAGaccaaacagctgattggttgtaagt
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ttttttggggtcaatcacttgttaactttgtatcataactttgtattgaa
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tttttatttcaaattgttccactcacaaatatctctccaacgataccaaa
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agtgcacacttatcgtgaatagactttaaaactATCAATTTGGTAAAGTT
GCAAGTGGCGTAtcgactgattttacgtcacttacaaccaatcagctgtt
gggtctgcgttgtaatgtcagaagacattgcaatggtgcaaatattgaag
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gaatagactttaaaaatattatttgcaTGGTGTCGCACTTTAAAGATATC
AGtgtattgatttcaaatttgtctttacagcacctgaccccgagaatgca
gtaaaccccgagaatgtaggtttctcattttttagcgtTGTAGcgctaac
gatagttcaacttcataaaaagttgtatCAGAGCCTGCTGTTACATATTA
CTTATCATTTATAGACATAAAATTTAAACTTGAATTAGTTTTTTCCAACG
GAAATCTGAATCAAAGTTGATCGGATACAACCTGAATTGAggcatttttt
gaataaatcttctctaaatcgaaatctatgggaattaagttatgatgata
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ttcaaaatttattgttctaagtcagatattttgacgaaaatgtttgacct
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tgaaagtactacctgagagatgattgatgttgacattttgagctGTTTTG
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TGTACCCGTTGTGGGAAAAGTTCCAACGGGGCTATGAGGCAGGGGTATAG
TTAcgttattcacatattttaacaaaatattttcaacctacaaaataaaa
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CCTTCCATCCGTACAGACTCTGCTAGCCCTCATTGCTTCAGATTCTTCCG
AAGTCTAACTTTAAACCAGCCCATCACCTTGGAGATAAGCAGAAAACGTG
CGACCTCCATTGGTACAGATCTAACAATCAATGTTAGTGGCTCGCAACGA
TTTTCAGTGAAATTCAACGATAAGAATCCACCACAATATGCTCAAGATGT
GAATATGTATCTGTCTGATTATTGGATGCCTGCATCTAATGTTGTTCTTG
AAGCTTATGAATTCACATACGCTGCACCTaact Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:781866..791948+ >MSTRG.13762.2.p2 ID=MSTRG.13762.2.p2|Name=MSTRG.13762.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2016bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:781866..791948+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTGTTCATTGGAAGGCTTGTATCTTCTTGGTTCAATTCTTAATAAT
TTTCCAAGTTTATGGTGTACCGGATTTGGTAAAACTAAATGAAGGAGATG
CAGTTGATGGCAATGCAGAAGAGCAATTTGGTCATACTGttttcaatatc
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TGTCAAGGATGGCTGCGGTGTGTATTTAGATGATATACCAGGCATGAGAa
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GGAGGTGGTAGTGGAAGAGCTCGgTTACACTTTAACGGCTTCTTATCCTT
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ACCAATCTATCTACGGATTGTTTTTGAGACATCCAAAATTGAATAATAAT
TATCTTGCACCTTACTGGATGAGGTATTTCGAAGGTTCAGTGCACATTTT
CAAATTAGAAGGTACAACACCAGAACGTTCTAGATATCGAAACAACATAA
TGAATGACTTAAGAGAAGGAGGATTTTTCACTGGTAAAACACATGATAAT
GCTGCAAAAATATTCGTCATTACTTGGTTGCGAATGGCTTCAGATGGAAC
TCTTCAAGACGACACAGAGTAAATGGTTGTTCATTGGAAGGCTTGTATCT
TCTTGGTTCAATTCTTAATAATTTTCCAAGTTTATGGTGTACCGGATTTG
GTAAAACTAAATGAAGGAGATGCAGTTGATGGCAATGCAGAAGAGCAATT
TGGTCATACTGttttcaatatcaaaaataatGATGGCAACTGTTTAAAAA
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GATGATATACCAGGCATGAGAaatgaattttcagattttgaatttttctt
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ACTTTAACGGCTTCTTATCCTTCGGAGCGGACGCTCAAAATTCAGCCAAC
AAAGGAACTTGCTTGCGTTGGGACCAATCTATCTACGGATTGTTTTTGAG
ACATCCAAAATTGAATAATAATTATCTTGCACCTTACTGGATGAGGTATT
TCGAAGGTTCAGTGCACATTTTCAAATTAGAAGGTACAACACCAGAACGT
TCTAGATATCGAAACAACATAATGAATGACTTAAGAGAAGGAGGATTTTT
CACTGGTAAAACACATGATAATGCTGCAAAAATATTCGTCATTACTTGGT
TGCGAATGGCTTCAGATGGAACTCTTCAAGACGACACAGAGTAAATGGTT
GTTCATTGGAAGGCTTGTATCTTCTTGGTTCAATTCTTAATAATTTTCCA
AGTTTATGGTGTACCGGATTTGGTAAAACTAAATGAAGGAGATGCAGTTG
ATGGCAATGCAGAAGAGCAATTTGGTCATACTGttttcaatatcaaaaat
aatGATGGCAACTGTTTAAAAACTCCCATTGGTGATAAACGATTTGTCAA
GGATGGCTGCGGTGTGTATTTAGATGATATACCAGGCATGAGAaatgaat
tttcagattttgaatttttcttacgTGATTTTAATAAAGATGATGGAGGT
GGTAGTGGAAGAGCTCGgTTACACTTTAACGGCTTCTTATCCTTCGGAGC
GGACGCTCAAAATTCAGCCAACAAAGGAACTTGCTTGCGTTGGGACCAAT
CTATCTACGGATTGTTTTTGAGACATCCAAAATTGAATAATAATTATCTT
GCACCTTACTGGATGAGGTATTTCGAAGGTTCAGTGCACATTTTCAAATT
AGAAGGTACAACACCAGAACGTTCTAGATATCGAAACAACATAATGAATG
ACTTAAGAGAAGGAGGATTTTTCACTGGTAAAACACATGATAATGCTGCA
AAAATATTCGTCATTACTTGGTTGCGAATGGCTTCAGATGGAACTCTTCA
AGACGACACAGAGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:781866..791948 + |
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