XLOC_016643 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_016643
Unique NameXLOC_016643
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000730:128210..141539-

Legend: gene
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>XLOC_016643 ID=XLOC_016643|Name=XLOC_016643|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13330bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000730:128210..141539- (Clytia hemisphaerica)
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ATTATGACCGTTTGAAATTTTTGAGTTTTATTGGATTTTAGCTGGGTTTT ACGGTGTATTTCACAATAAGTTCATAAAACCTAAACTAGAGTGTCTATAA TCACAAAAATTCGTACACTTACTCCCTAATAAGATTTATTAAAAGTCAGA AAGTTTCAAATCGTTTCAAATTTTTTTTTTGCTGAGATATAAAGGAAATA ACAGCGGTGTGGTAGATTCCACCCCCTAGGGGCTAATAGGGTTAAACTTG AAAACTCTCTCAAACTCACAGGAAAAGATATTTTACAAAAATGTTTCTAC TTTTTTTCCCAAAACTTCTTTCAAAAGTTTCAGCATCAACAATCTTTTTT AGTCACTTGAAGGCAGATTGTTTTTCATGGCCCCTAATATGTAGGTCAGC TATTTTTATGATTTCTCGAGATATATTTCAGATATGGATACAAAATTTTG ACCATAGTCTGGAATTGTAATTTGAAAGGTCGTGAGTATAAGCTTGCTAG GTAGAATGCTCACAGTTAGACTTGGCCGTCAGAATGCAGGTTTGTGACCC CAAATTGTCGATCTACCTATAGTCCAGTGTTGTTAGAGTGAAAAACCATT GACACGTGCTTGTTCTCTTATAAATATACCATCTGACTGATGTAAAAATT GTTAACTTTCATGAAGGATTTCTGGATTTTCGATAATGCAAAGTCCAAAT CGAAAAGGATAATAAATTTTTTGAAAATGACTGTTTTGTTGAAATGACGC TTTTATTGAATTTTTGAAAACAATTTTAATGCTACTTTTGTGTGCTCAAT TGTAGGGGGATCATTTTCTAATTTTTGGGAAAAGAATCACCCCAATATCA CTTTATAATGACCCCCGTATTATGAAGTTCTCCTGAAAAAGTGCCAAAAC CTTCATTTTCCTAGCTGTTTTTAGACGACTCCCCCATTTTATGATTTTTC 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NNNNNNNNNNATAATTTTTCGTAAATTTTTTTATTGCATTTTTCATCAAA ACACAGCTATACAATTCCCAAATGAGACTTAAAGATCTCTCAAGAGAGTC AAATGCATCAAACTCATTGCTAATGATATGTCGTTATGACGTTTCATGCT GCGAGAAAGATGCGACAAACATGCTATGTATAAGAAATTGAATGTTGACA CCAGAAAATTTCAAACTTCCACCTCGCCAAAACCACCGTGCCACCGCGTG CCTCCAAAAGATTTCCATATCACTATGAAGCCAAGATACTCTAGTCTAAC ATATGTCAATCCTAGCTCTTCCCGGGAAAAAATTGGACAGATATTGCCAA CTTTATTTTCAGCGTCATTCTAGGCTTTTCACTCAATTTTTCTTGTTTGA TGAAGTTTTTTTCACATTTAATTTCATAAATGTATTCGTTAAGCTTTTTT GCTTTCATTTTCAAAGTTGCATCCGGTAAATATACAAAAACAAGAAGTTA CAGGACTTTTTAGAAATGGGATTATTAATCATTTTTCAAAATCAGGGACC TTCGAGCTGCCATGACAGTTGTCCTTTGCGGACAAAGCTAGAACATTGAT TGTTTTCTGAAACAATGGAAATACAATGGTCGCTCTACACTGTTTTATTT GATGTTTATCCAGAGTTCTATGATAAATCCATGGTTTCACTTAATTTATG CTGTAGGTAGATTCCAACTAGCTCACAAACTTCAGCGCCGTCGAACGCAC CCATGGTTACGTCAAACAGGTTACCATTTTTTTTCATCCAAGCGGAGTCG TCGCTGAAACAAGGAGATTTTCGTGCGTGGTTGATAATTCTAACGTCTTT TGCTGACAGAGTAGTGATGGTTTTAGCGAATTCGATAGCGCTGGATACAA GATCTTTAGAGATTGACGGATAAGTCTTTTATGTCAAACACTATGAATTT GTGGTTCTTTTTATCATGTTTTGCTTTGAACCATTCGATAACCTCATCGG TGTTCTTCCATTGGTTTATGTTCTTTATGGGCTTTAAGTTCGTTGTTGAC CCTATCGAGGATCGATTTTGCGATACGGCCGATCTCGTTTTTGGTTGGAT TTAATAAGCGTACCTTTGGATTGTTTTCGAAGTTATTCTTGTGATATTTG AGGGTTATGAAAGCCTCGTTCTCGCCATTTATAAGCATTATGTCGAAAAC TTTCATGTCTTTTACGATTGTTTTACCGGTTGAGATGATCTTATGGTGAA CATTCTTGTTGACTTTTTTGTACGTTGACGTGACGGTATTATTCAGAAGC ACGTTGTGGTCTTCTTTCGACAGCTTATATAAATTAGACGTTTTGTCAGT GAAATGTTAGCGTTGTATCAGTGTTTTTTATCGTTTTTTAAAGTTCGTTG GAACTTGTTGTGGTATTGTCGGAACTTATTTTCAATGTCTAAAGAGCTAG AGAGAGTTTTTGGCAAATTTTGTTGCAAACTTTTTTGATTCAGAAGTAAA TATAGCTTCTTCATATATGTTTTAGACCACTAAAAACATGTTTTTTCTTA AAAAAGGAATTCTAACCTACTAAAGATAATCAAAATCATCTTCTTACGAC TAATCTATAGGTCAGAATTCTCATGTTGGAGACCACCTACATTCTGGGGG CCATATACTAAACCTCAAAAATGGTATGTCTTGACGAGGAATGGACCGAT TTTGATAGATGACTCTCCTTTCTTTTTCTTCCGTTACCCTGTATTGAGGC ACAAAAATTATTTATAAAATCCTCCGTCATCTCTACCCTTAATTTGACTA TTTCACTAGAAATTTAGGGTTCGAAGGCTTAAAAACGCAATTGCAGTTAT ACAACCCTTAGGGGGGGGTTAAAACGACTGGAATTTGTAATTTTTACGCC 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GAAAAATCATCTTAAAATATTCTTAAGGCTTTCTTATATTCGTCAATTTT AAAGCCATACTTTAATAATACAATACCAAAGAGGATTTATTGCAATTTCT AGAAATAATACTATTTCAAGGTGGCAAAACCTTGAAATTACTGAAATTTT TTGTGTAAATTAAGAAAGTTACGGTCACAAGAAGATCAAAATAGAAATTT CATGATGGCAATTCTTAGGACATTCTTAATTTTTCGCCCAATTTCATCAT GAATATTCTTATAAAGTATATTCTTATAAAAAACGTGTAAAACAAACGCA TGCGCATTTTTTTCTTTGTTTCTCCACCATCTTGACACTTGTTTTACCTG CACCAGGTAACAACATCTTTTGGGAAATATTTTCCAATTCTACCTGATTT GTGAGAGAGCGGCATGCGGATTGTTGAAAAATATGTTCCGATAATCGGTA ATATTGATTGACTATTTTTTACTTTCAGCCACGGAAGAAGAGTTAAGGAT TGCTCCATTGCGGGCGCATTGTGAAAATGAAAAATATGAAAATGTCAACG AATCTCGACTATGCCAGATGGTGATGGGAGGATCAAATTTTTACATTGGT TAAAGTTCTAATCATTAAAAATGGAACGTTACGGACGTTAAATGGACGTT GAAACAACGTTGTGTGCCCACTGGGACCATCGCTTGTGTGAAAATATTAT CAAAGAACAAGGAAATTATTTTATTAGCAAATAAATACCGACATTATAGT TTGCGAAACTGGAAAATTTCATCAAACAGTTAGAGATTTAAGATAACGAT TCGGTTACTTTGATGTTTTTTATTCATAATTTTACTAGAGATTTTAGTTA TCTATATAAAAGTTTTAAACCTTCGGGATTGTTTTAAGGGAAGAATGACT AAGGCGTGGTGTTTCAAGTCAAATTTGTTAACGGAAGGGGTGTTAATAAA TAGAAATGGATGTTCTTTTCGCGACAATTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00029231TCONS_00029231Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00029231-proteinTCONS_00029231-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000730supercontigsc0000730:128210..141539 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.08 0.04 0.04 0 0.12 0.16 1.37 1.89 2.94 3.2 2.56 2.63 0.12 0.1 0.1 0.14 5.05 4.5 0.1 0.21 3.5 3.66 2.22 10.79 14.57 7.64 0.18 0.27 0.15 0.05