XLOC_016052 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_016052
Unique Name	XLOC_016052
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000674:14022..23267+

gene from alignment at sc0000674:14022..23267+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_016052 ID=XLOC_016052|Name=XLOC_016052|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9246bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000674:14022..23267+ (Clytia hemisphaerica)
TGGCTATCAATAAAACAATTCTCAACAATCATTGACTACTTTAACGGTaa
tctttgtttcttttgatCCAATACAGTTTGAAATTCTTGTATACTTTGCA
ACCTTTCCAATTATGCAAGGAAAAAACTGGATTGCATGCTGTTGAGAGCT
TAAGTATTCTACCTCTCGTGTGCTATTGTCCGCGTGTTTATACTTGACAA
TGCAAAAAAGTTCTTCTCGACTACCTTAAGGGAGGAAATTTTCACGGGAA
GAAATTTCCGTGGAATTTAAGTGTGCTTACTTTGCTTGATTGTTCGATGC
TAGACAAGACATAGCTCAGGAAGTAAAAAGTATAGTTTGATAAAGCCTCC
CTGCTTTTCCCAGACCTGTCCTCTGTAGTCAAATTTCAGCCTATAATAGA
GGTCACCCTGGTAGCACATTGTATAACACAGCATAAAACTATGACCATTT
AATGATATNATAGTTTGATAAAGCCTCCCTGCTTTTCCCAGACCTGTCCT
CTGTAGTCAAATTTCAGCCTATAATAGAGGTCACCCTGGTAGCACATTGT
ATAACACAGCATAAAACTATGACCATTCAATGATATGATATATGATATAC
AATAAGGAGTAACATATTTAATAAAGTTCCatcaatgtcaattgaatttc
TACAATTGTTCTTCATTCTATTGATTATGGCTCCATATTAttcatttgta
attttttatttcaggaaTATCGGTGCTGGTCAGCCAAAATTCACGGAGAc
gtccaaaattttaaaattgattacaaacaaagaaaacagcatgaaatttc
aaaaaatggaagcatggttactgaaaaaaaaataaagccaGAACTTTACA
TCTCATCAAGGTCTCAGAAAGTTTCATATAAACTAAATGAAGATCATGAT
GTCCAAAATCTGATTGATAAAATGATTTTCTTGAAGTTTATCAGCTACTT
TGTTCTCTATTTAATCACTTTGGCTATTATAAATAAACAACATCTGTACC
TCCCACCACACACTTTTCATCTTCACACCAGGTTTCCATTATCATTACTA
AGCAATTTTTCTGATTCATTCAAGTGTTTCAAGGTATAAGTATgcatttg
cattttttttagaTTCCGATTCCAGTCTCCATAAACCAATATTTACATCA
ATATCAACGTAACGAGAGGGAGTTTCCTTTCTATCTGAACATTACGGCGT
AGACATAAAGGATGTATAATTATTGACTGATGGCATAGCCCTTGGTAATG
AAAATATCCAGGTAAGACAAGACTAGCTCTATACCATATCTCATCCTTAA
TTCAATCTCTTGTCAGTCCTGTGTTTTTTAGCATTCTTTTAATTACAttt
taaatcaataaaaaaatttaaatatatttaataatttaataGTTTATATc
ttttgcattttctttttataaatcttAGTTTAGACGgaaaaacaattttg
taaaattgacgacgaataaatgttaaataaaccagctgcgctggaagctc
cagCTATAAGGATTATTAGCACAAAGCTTTGAACGAAGACAAAGATTGAA
AAGTAAAAACGTGTGCGAATTTTACGTTATAAGAGATTGGATTAAATAGA
TCTAAAATacagaataaaataaagaagGTAGGAAtcaattttggcgagaa
tttaactTGGCTTGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNatcatgtgtttgatttgc
cgagttaaaaaaataaatgacagaaattgaagcttgcaacagatttacac
tggaaatactttggcaCAACAcctatcacatctgacttaccgcttgagcc
gccatcttgaaacactatgatttgtaaaaacaacgcacgctaaaagtacc
caaaaagttaacccgatatcggaagaaagtttagaaatcaaagtgagatc
gggaaattatttttgaagtcttgaaCGCCCGATGAATGATACCCATTTTA
ATGCTCAGCGTGGCTGGagcaataaacaaaaataaaataaaaaacaacga
aTCTCACTGGCAAATACTTATCTTTGCTAACTTTGTATCCTTACTATGTC
TCTTTTAAAggttaatacactttttttataagaacaattttataagaaca
atgaggctcaaaaaatgccaaaaaataagaactatttaagaacagtggag
aggctgaaagtattttaaaagtagtttttttgtttagttacagcaaaaag
aatcactggtttctaaaatcctctaaatagtaaagcaaatagccaaaact
tgttttttaccttatataaaataataacaaaataagaacaattcaaggtt
caaagtgccaaaaaaataagaacagccgagcctcagcaaaaatttactgg
ttcttattaaAGAAAGTGTAGCTTCTCTCTATTTTTCAGAAGATTACTAA
ACAGGTCTAGTGTTTTTGTATCAGTATACAAAATTATTGAACCATTAGTG
GTAGTTTGTATTGACCCTAAAGAATATTTTGTTTCTGGTCCAGCTTGAAA
ATTGTCGTAACCCGGCcgaattttttggacctacctccgggtgccccggt
ggaggtcctatgaattaacctctgtctgttcgtccgttcgttcgttcgtt
cgtctgttaccagcttttctcgagattggctcattagttttttctgattt
tttgcacaaagatgcaaaatggcaatggccaaaatgtgacggagcccaat
tgtccaaaacttggccgagtccgatttttggccggaaatcgccgtttttc
tagattttcattggacttttccatataattggttgttttttcattcaaaa
acgttatcaatagcaatgcccaccatcaagcatgtttcaattttcaataa
aattgagttttgaagccggaactttctaaaaatcgccggaacagccgatt
ttcgccggaaaaacggtatttcttgaatttcttgagctgtactttatatt
cttNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNgatacctaaattgtgacggagcccga
ttttcgaaaaacatctttttccggccgaaaatgccggaaatatgctggaa
aaactgtttttttggcattttctcgagatttatcattagttttttctgat
tttttgctcaaagatgcgtattaacaatgctcaaaacatggccgagtccg
ttttttaagaaaaaattttttccggcggaaaatgcctgaaatatgccgga
aatcgccgtttttctagattttcattggacttttccatataattggttgt
tNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNgctatattttctgactgat
ttttttcatttttctttttgcattgctatcaatgctaactaactttcatc
atcaggtaggtccattcagcatgttgcttgttctcTTTGAACtttccatt
tttttccaaattttccattTCAACATTTTCTACGCAAACAAGTGATCTAA
ACAATCTCTCCATATTTTCCATTCTGTATGATTTTGTTAATGCTTTTGAT
TTTACTTCTCAGGGTCAAAAGTTGTCTTCGACGAAATTTACTGTATCAAA
GCGATGATATCCCAATTAAAACAAACGGATCAGTTTGACTTGAACAGCGT
TACAAAACAGCTTGAAAGAATTATGGTACAAGCCTCCCTTATAATTCATA
ATAACAGAAACAATTTCTAACTGTAGGTTTGATCTCTCATAATTTCAACA
ATATCATCATATTCATCTAAATTGAACTACATAGGGTCACCCAAGTTGAC
AAACAACGTCGTTTTTCTTGGCTGCTAAACTTTTCTGAACAATTTAAGGA
AAAAATTTATATATGTTGGGGAGTGGCGTTTTTTTAGAAGATTTTATTCT
CACTTATTGAAAATTGTCaaacaatgaaattaatttattctgattttatt
tttttagatgagaaaattcttttttgtccAGTTTCGCCCTCAAAATTCAG
GAAATGTTTGCTGCAGAATCGGAAGAAGTGAAAGAAAATACTGTCTAAGG
GTAAGGaattaattttacaaaattaaaaggaaaaaggaaacaaattaatt
acaatattttgttcatacacgtctttttttttttaagaaactagttttac
caagcagcctcaatgtttcttaagaaatcggccttctTNTACTTCTCTCA
TGAAATCAATCTAGAAGAATTCTGCATAAAAGGAAACCGGGTTAAGATTC
ATCATATTTGAATGCTTTCAAAGGTCTGAAACGTTTAAATTGACTCTGTA
ATCTTTCGTCTTCGGACCATCGGACGCAATTCTCTGTTAAGGTCGATAGG
TGTATGAGCAATTTCATGATCGTAATGAATCTTGCTCATACTTCGTATTG
ATTTAACGATTTGAAAGTCTTCAAAAGTGAATTTACTATTACAGAGCAAC
TAGTTTCCATTCCCCCTAATTTATTGATTcattcaattctgttttgataa
TCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNtactgcagtgacgtaggaaaaaatcatgtactgaaac
catgtactgaaaaaaatcatgtactgaaatcaggccaccggggcactgag
acaggggtgttatagaGGTTCAACTGGCGAAAGATAATGTTTCCATTCAT
CCAACTCTTCTTGAAACTGTCCGGTCACGGTGCTATCACTCTTCCTATCA
TCCATCAGCCACGACTGAAAACGAGAAAAATCAACATTGAACTGGTACCG
TTACGTTTCCATGGATGTCTTATTCATGCATGGTGTCTCTAGGTCTTTAC
TCTGAGTGTCCTGTTTGACATGACTTATAATGATTGAAATGAATAATCCA
TCAGATACATCACCCCGGCTTCGATATTACGGGCTGAACTGATCTG

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00028330	TCONS_00028330	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00028330-protein	TCONS_00028330-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000674	supercontig	sc0000674:14022..23267 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.46	1.26	0.73	0.4	2.09	0.73	0.74	0.7	0.79	1.47	0.12	0.5	0.68	0.28	0.35	0.47	0.52	0.57	0.43	0.26	0.18	0.36	1.23	1.29	0.45	0.99	0.63	0.32	0.92	0.71

You are here

XLOC_016052 (gene) - C. hemisphaerica