MSTRG.13837.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13837.1.p1
Unique NameMSTRG.13837.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:863067..876156-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.13837.1.p1 ID=MSTRG.13837.1.p1|Name=MSTRG.13837.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13090bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:863067..876156- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGCGTTCTGGTAGGGAAATAAGTGGCTTCATTTCTAATCCAGAAGTCTAG CCCTTCGGGCTTGTCAATGGTTGGACCATGTATAAATATTTTATGTGGGA GCGTTAATATGTGTTGGCGCACTGTGCTTCACATCGTCATACTGGAACGT TTCCATTCTTCAAAACCATTTTTTTTAGGTGAAACAAATTAACTTTTGTC GTTCTACGGGCCGGACCAACGGATTAGAATAGGTGGATTAACTTCTCTCG TTGCTCCCAAGAGAGATCCATTGTCTTCTCATTGTTACAAGAAAAATCTG TAAATGACTCTGCGCACTCCTCGTTTAATTTTTTCATTGTTTTTATAAGA ACAATTTTCCAATTTATACAGTTTCGAAAACGAATTTGTCCTATGATTCG ATCAATTTTGATGATTTTGAAAATATTTTAAATCCTGCACTTAAGTTTTA GCATCAACAAACGCTAGACCAGTTTTAATGTAAATTTTTAATCTTTTGTC AATGGCAATCTTCAGATAAGTGAAAATTAACGTATGGTCTATAACTAAGA AACTATCGATGGGTCACGAATGGGTTGCATACTGGTGAAAGAAGACTGTA TTTAGAATTAGGAAAATAAATTTCAAATTATTTGGCTAATTTCTGCATTG GATAGAAAGGGCTAAAAAAGTGCATTTTCTTATTTAAAATGTACCACGTG ATACGTAATGACCAATGAAAATGTTGAAAGTAATGATTTTTTACAACTTT TTTACAACTTATCAAGTTTTAATTGCTAGCAAACTCGTAAAAAAGTTTGA TAACCTAACGAGGAGTGTTTTCTATGAGTTCTTAATCCACCTATTCTAAT CCGTTGGCCGGACCAACTCTGTTTTTGATGAAGTAAAAAAATAAACAATA TTCTAACTTCAACACTGCTTTCTTTTTAGCACATCTTACTATACTAAATG AGTTTATGAAAAATGTCTGTAACGCTAGCCCAGTAACATATGTTAAGGTT TCTAAAATTTGAACGCCGCGGCTGGAAAACCTATCCACCTTCGATACAAA AAGTCTCGCGCTAAGTTTGACAAGCGTAGAAAACTCGGATTAGAGAAGAC TCTACACTGCTATTTGTAAAGGAAAAATTTCTGACGTCAATTTCATGAAA AAGTACTGCGACGTCACAAAGTTTCAAATAAAAAGGTGTGGCATTTTTGT TGCACGATTTCGAATTATTTTATATCAACACTCGCAATAAAATCCAACAT TGTTGTTTGATGATTAAACTTCGTCTAACATTATTTAAAAAGGTTTCAAT GTTGGTTGCATTGCATATGCGCCGGTCTTAAGCTGTCCGCATGTGAAGCC AACAAACGGGAAAACCTTCAGTGCTCAATCGCAAAGCGCGAGCCTCTCCT TCACAACTAAGGCTTTTTCTTTCCTAGAAGCAACCCTCTCACCACCTCAG ACACCTTTGGGCGTCTGCAACGACGGGTACCCTCGATAATTTTAACAGGG TCACTATGGCATTTCATTGAACACAAACTTCCGTTATCTTAAAAAGACAT ATCATCGAGGCTTACAGACACAAAATTTTGACTAATGTAGAAAGTATAAT TTTTATTATTGTATTCGGCATTTTAAGCCAAAACGATGTCAGGAATTAAC CCATATTATAGTATTTTAAAGGCTTTTGATGTGCAAGCAAAACCGTTAAC CGGCGTTTGCGACGACGGGAACCGTCTAGTTAATTACTAGATGGAATTAC ATTTCGTGAAAGGGCTCTAAAATGTACACAGGCTCAGTGTGATTCAAATT TGAGCCTTGTAATTCTTATAAAAATAATTCTTATAAAAAATGTGTTTTCC ACAACCTTAAAGAGTAAGATTATGAAAACTTTTACTTACTTTTTGAATAC 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ATCAAGATTCTATTCAGCGTGCAATCAACACAGAGAAAAGTAACCATGAC GACCATCCAAGATCTTGGATTAAGTTCAAAGTTGATATTTTTATTCTCGT CGTTGAAAACACAACTTAAAAATATCATCAATGCTTTTCAAAAAGAGTCA GTGATAGAGAATCATTCAATATTTTCACTTTTTAGCTCTACGTCACTGTG TATCAGCCGGTGAACCTCTGAACCCGGAAATCATCGACTATTGGTACCGG ACGACCGGAATATCTATCCGGGAGGGCTACGGACAAACTGAAATGACGTT ATCATGTGGGATGTTTCGCTGTTTGGATATGAAGGCAGGATCAATGGGAA AACCGACCCCAGGATATGATATACAGGTTCAATTTTTACAAGTCTGTTAA ATCGTTTTCAAATCAAGTTGTCAAATTTCGTGCTTAAAAAGTAAGTTTTT TAAGTATACCACTTGGAAATGAAATTACTCTAGCGAAAGTGTGATAGGGT TTTCCATAAAAAATTGCTACCATAAACCAACCTCATCCCCGTGTATCCCA AGCTTTATTCGTGTTTCTTGTGGAAGGTATCAATAAGCATCAAAAAGCTG ATAATACGCAGGGAACGAGGTAGATTATGAACGTGGTAGAAACCTTTACG CTTTGAATACTGATTTAACATTGAGTCCAACTGCTATTTTGAGGTGGTTA ACCCATTAAGTGCCACTAGCATCACATTTTCAATCCTGTACGAGCAGGTT TGGACCTAGGAGCACTGCAACCCATGCAGTACTGTTACTAGTTGGAGTAT GCATTTGAAATCAAAATATATTTGAAAATTTGAAGTTACGTTGTAGTTGC ACTTAATGGGGTAAGAAGCCACTCCTTGCTTATGAAAGTCATTTATTCTT CCAGATCATTGACAACAAGGGAAACAAAATGAAACCAGGTGAGGAAGGGA ATGTAGCTGTTAATTGCTCCCCTAAACCACCTGTTGGTCTGTTCTCAAAA TACGTGGTAAGTTTGACTCGAGTATACTTTAAGAGAAAGAAAGTTTCCTG AATGGGTATATTCGCGAATTTTTTAGCATTTCGCAAATTTAGATCAATCT AAAATGTGTGCCAAAATTACTGTTTGAATTGCTTTAAAGAGAATTTCATG AAAAAAGGCAGTTTTTAGGTAAATTATTTTTTTTGCGAGAATAATCTTTC GCAAATTAGGTTTTCAGAATATTTCGCGGAGTTTGCCCGGAATTTGCGAA AAACGCGAAAGTTTCTTCCCAGGGTAGGAAAATGAAGAAAGATTTTTCAA TTGTTAGAAATAATTTTTAGCAGAAATAATGCTCTTTTCTGGGGTTGTGG TGCATTAAACTTCAAGTCTGGAAGAGGCTAGTAAACATTCTCTTCGGGAG GAAGTAAAGTTCAAATTCTGCCCGTTTTTTTTACCATTGAAAAATGAAAG TCTGTTTCTCTACAATGGTGGTCAGAATATGTTAACATTTCTGGGTATTT TAGCGTTTTGTAGAATTTAAAGTTCGGGCGAGAATGACATTTTCACGCTT TCTACATTATTTTATCGGATATTTCGATTTGGGAGGGCAATAATGGCTTT TGGATCCTAAGCACCAAGTTTTAAGTCTCAAGTTAAAATTCAGAGTTAAC ACTCTGCTTTCCAACCCTAATTAAAGGCACTTAAAAACTACTTGCAGGGA AATCCCTTTTGTGTCGTCAAGTATTATGGTCAACATTGTAGTTCCTTCGG GGTAGGTTGTGTAATAGTTTATGATCCTCATTTGAAAGAAACAAATAAGC AGACGTGAATTTTGGGGTAGCTGTTTTTCGTCGCGGTTTTGCTTACAGCG GCTTTAAAATTTCCCGCACAATATTAATCTTTACATGTACTTTGGGCTTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:863067..876156-

>MSTRG.13837.1.p1 ID=MSTRG.13837.1.p1|Name=MSTRG.13837.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=20988bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:863067..876156- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGCCGGTGAACCTCTGAACCCGGAAATCATCGACTATTGGTACCGGACGA
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AGTTTACGCCCCGTGGTGGCAGGGCTCTTGCGTTTTCGTTTATAATGCAC
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TCGGTCACTTGTTTACCACCTACTGCTTATCGCATGTTTGCAAATGAAGA
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AGATGTTGATGTTCCGAATTTGAAAAGGAAGATAAGTGTCGGAGGAGCTG
AACGAGATGGTTGGTTGCCGATGCACTCGTTAATGAGAAATGCATCACCA
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TCCTGAATGGTGGCTGGTTAATATTGCATGTTTGAAAATCGCTTGGTAAA
AGAGATGCAAATCATCCAGCTTTTTGGTGGGTGGATGATGCAGGCAATGA
GTTACAATATTCCTTCTCCGAGCTTCTTGCTCAGTCAAATAAATGCAGAG
GTTCATACAGAGACATGTTGGTAATAAAATCAAGAAGTATGTTTTTCATT
ACAAGACCACCCGTTTAAATACCTCAACACTGAGTTCAGCTGCTGGTTTT
AATAATTATGACGAAGCTGTAAAGAATTATACATGTGAAGTTCCCAATGA
TTTTAATTTTGCTGAACAAGTCTTGGAAGAATGGAAACGAAAGGAACAGA
TCGAGTTTGTTGACAGTTTACCAAAAACGATCAGTGGAAAAATTAGACGT
GTTGAGTTACGTGCCAAAGAATGGAGTTAAGTGATCGAGGCTACATGGAT
GAAGACGGTTATTTATGGTTCGTTGGTCGAGCTGATGACGTCATTATATC
ATCGGGTTATCGGATTGGTCCATTTGAAGTTGAAAGCGTTCTGATTGAAC
ACCCTGAAGTTGCTGAGTCAGCAGTAGTTAGTAGCCCTTGTGATGTGAGA
GGAGAAGTAGTTAAAGCCTTTGTTATCCCAACGAAACCTTTGGACGAGAT
TGATGCTGAAACGTTGACTGTTGAGCTTCAAGATCATGTTAAAAAATCAA
CAGCTCCTTACAAATATCCAAGAAAGGATGATCCTGAAAGAACATCTGCT
GCTTTTTGCGGAAACTTCTATTTGACGGATCATTGACAACAAGGGAAACA
AAATGAAACCAGGTGAGGAAGGGAATGTAGCTGTTAATTGCTCCCCTAAA
CCACCTGTTGGTCTGTTCTCAAAATACGTGCTCTACGTCACTGTGTATCA
GCCGGTGAACCTCTGAACCCGGAAATCATCGACTATTGGTACCGGACGAC
CGGAATATCTATCCGGGAGGGCTACGGACAAACTGAAATGACGTTATCAT
GTGGGATGTTTCGCTGTTTGGATATGAAGGCAGGATCAATGGGAAAACCG
ACCCCAGGATATGATATACAGGTATTGGTTGGACTTGACAGAGAACGATA
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GTTTACGCCCCGTGGTGGCAGGGCTCTTGCGTTTTCGTTTATAATGCACC
GCGATTCGATGCTAAAGAGACGTTAAGAGTTCTTGAGAAATACTCAATAT
CGGTCACTTGTTTACCACCTACTGCTTATCGCATGTTTGCAAATGAAGAC
GTGTCTTCCTATAAATTTAAAGACGTTACCATGTAAAAGTGAGGATCCAA
TGTCTTGGTTCTTCACCAGTGGAACAACAGGTTTACCAAAGATGACTGAA
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GATGTTGATGTTCCGAATTTGAAAAGGAAGATAAGTGTCGGAGGAGCTGA
ACGAGATGGTTGGTTGCCGATGCACTCGTTAATGAGAAATGCATCACCAG
AATTCAAGGTGCCATCTTGTGTCCAGGGACTACATCATTGACAGCAAAAG
ATTTGTTTGGACGCCTGAACGCTTCAAGAGCAACATGTATTATAACAACT
CCTGAAATAGCATCTCTCGTTGATCAGAGTGAGCAATATATTATATGGGG
ACCTCGGTATTCAAAAAGGAGAATGTGTTATTGTTGTGCTTCCACGAATT
CCTGAATGGTGGCTGGTTAATATTGCATGTTTGAAAATCGCTTGGTAAAA
GAGATGCAAATCATCCAGCTTTTTGGTGGGTGGATGATGCAGGCAATGAG
TTACAATATTCCTTCTCCGAGCTTCTTGCTCAGTCAAATAAATGCAGAGG
TTCATACAGAGACATGTTGGTAATAAAATCAAGAAGTATGTTTTTCATTA
CAAGACCACCCGTTTAAATACCTCAACACTGAGTTCAGCTGCTGGTTTTA
ATAATTATGACGAAGCTGTAAAGAATTATACATGTGAAGTTCCCAATGAT
TTTAATTTTGCTGAACAAGTCTTGGAAGAATGGAAACGAAAGGAACAGAT
CGAGTTTGTTGACAGTTTACCAAAAACGATCAGTGGAAAAATTAGACGTG
TTGAGTTACGTGCCAAAGAATGGAGTTAAGTGATCGAGGCTACATGGATG
AAGACGGTTATTTATGGTTCGTTGGTCGAGCTGATGACGTCATTATATCA
TCGGGTTATCGGATTGGTCCATTTGAAGTTGAAAGCGTTCTGATTGAACA
CCCTGAAGTTGCTGAGTCAGCAGTAGTTAGTAGCCCTTGTGATGTGAGAG
GAGAAGTAGTTAAAGCCTTTGTTATCCCAACGAAACCTTTGGACGAGATT
GATGCTGAAACGTTGACTGTTGAGCTTCAAGATCATGTTAAAAAATCAAC
AGCTCCTTACAAATATCCAAGAAAGGATGATCCTGAAAGAACATCTGCTG
CTTTTTGCGGAAACTTCTATTTGACGGATCATTGACAACAAGGGAAACAA
AATGAAACCAGGTGAGGAAGGGAATGTAGCTGTTAATTGCTCCCCTAAAC
CACCTGTTGGTCTGTTCTCAAAATACGTGCTCTACGTCACTGTGTATCAG
CCGGTGAACCTCTGAACCCGGAAATCATCGACTATTGGTACCGGACGACC
GGAATATCTATCCGGGAGGGCTACGGACAAACTGAAATGACGTTATCATG
TGGGATGTTTCGCTGTTTGGATATGAAGGCAGGATCAATGGGAAAACCGA
CCCCAGGATATGATATACAGGTATTGGTTGGACTTGACAGAGAACGATAC
AATGTGGAACCTTTCAGATACTGGATGGGCGAAATCCGCCTACTCTTCAG
TTTACGCCCCGTGGTGGCAGGGCTCTTGCGTTTTCGTTTATAATGCACCG
CGATTCGATGCTAAAGAGACGTTAAGAGTTCTTGAGAAATACTCAATATC
GGTCACTTGTTTACCACCTACTGCTTATCGCATGTTTGCAAATGAAGACG
TGTCTTCCTATAAATTTAAAGACGTTACCATGTAAAAGTGAGGATCCAAT
GTCTTGGTTCTTCACCAGTGGAACAACAGGTTTACCAAAGATGACTGAAC
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TGGTTCTTCACCAGTGGAACAACAGGTTTACCAAAGATGACTGAACATAC
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GAACCTTTCAGATACTGGATGGGCGAAATCCGCCTACTCTTCAGTTTACG
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TGGACGCCTGAACGCTTCAAGAGCAACATGTATTATAACAACTCCTGAAA
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GTTGACAGTTTACCAAAAACGATCAGTGGAAAAATTAGACGTGTTGAGTT
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GGACGCCTGAACGCTTCAAGAGCAACATGTATTATAACAACTCCTGAAAT
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TTGACAGTTTACCAAAAACGATCAGTGGAAAAATTAGACGTGTTGAGTTA
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AACGTTGACTGTTGAGCTTCAAGATCATGTTAAAAAATCAACAGCTCCTT
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CAAATATCCAAGAAAGGATGATCCTGAAAGAACATCTGCTGCTTTTTGCG
GAAACTTCTATTTGACGGATCATTGACAACAAGGGAAACAAAATGAAACC
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GTCTGTTCTCAAAATACGTGCTCTACGTCACTGTGTATCAGCCGGTGAAC
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ATCCGGGAGGGCTACGGACAAACTGAAATGACGTTATCATGTGGGATGTT
TCGCTGTTTGGATATGAAGGCAGGATCAATGGGAAAACCGACCCCAGGAT
ATGATATACAGGTATTGGTTGGACTTGACAGAGAACGATACAATGTGGAA
CCTTTCAGATACTGGATGGGCGAAATCCGCCTACTCTTCAGTTTACGCCC
CGTGGTGGCAGGGCTCTTGCGTTTTCGTTTATAATGCACCGCGATTCGAT
GCTAAAGAGACGTTAAGAGTTCTTGAGAAATACTCAATATCGGTCACTTG
TTTACCACCTACTGCTTATCGCATGTTTGCAAATGAAGACGTGTCTTCCT
ATAAATTTAAAGACGTTACCATGTAAAAGTGAGGATCCAATGTCTTGGTT
CTTCACCAGTGGAACAACAGGTTTACCAAAGATGACTGAACATACCCATG
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TTCCGAATTTGAAAAGGAAGATAAGTGTCGGAGGAGCTGAACGAGATGGT
TGGTTGCCGATGCACTCGTTAATGAGAAATGCATCACCAGAATTCAAGGT
GCCATCTTGTGTCCAGGGACTACATCATTGACAGCAAAAGATTTGTTTGG
ACGCCTGAACGCTTCAAGAGCAACATGTATTATAACAACTCCTGAAATAG
CATCTCTCGTTGATCAGAGTGAGCAATATATTATATGGGGACCTCGGTAT
TCAAAAAGGAGAATGTGTTATTGTTGTGCTTCCACGAATTCCTGAATGGT
GGCTGGTTAATATTGCATGTTTGAAAATCGCTTGGTAAAAGAGATGCAAA
TCATCCAGCTTTTTGGTGGGTGGATGATGCAGGCAATGAGTTACAATATT
CCTTCTCCGAGCTTCTTGCTCAGTCAAATAAATGCAGAGGTTCATACAGA
GACATGTTGGTAATAAAATCAAGAAGTATGTTTTTCATTACAAGACCACC
CGTTTAAATACCTCAACACTGAGTTCAGCTGCTGGTTTTAATAATTATGA
CGAAGCTGTAAAGAATTATACATGTGAAGTTCCCAATGATTTTAATTTTG
CTGAACAAGTCTTGGAAGAATGGAAACGAAAGGAACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13837MSTRG.13837Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13837.1.p1.exon12MSTRG.13837.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.13837.1.p1.exon1MSTRG.13837.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13837.1.p1MSTRG.13837.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000112_pilongenomesc0000112_pilon:863067..876156 -