MSTRG.15004.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15004.4.p1
Unique NameMSTRG.15004.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000129_pilon:592209..637329-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15004.4.p1 ID=MSTRG.15004.4.p1|Name=MSTRG.15004.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=45121bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:592209..637329- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000129_pilon:592209..637329-

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GGATATTTTAGCAAAGTTTTGTGATTCGATAGAAATTAAATATGTTCGCT
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GGCAGTATTGAAGAGAAGATTTATCAACGGCAGATCATCAAGAATAATTT
GAGTGGCACCATTGTCGATTCACTGGCCAACAATAAAGTTCGTTTTTCCA
CAGAACAATTGAAGGCCATGGCACGGATATGGAGAGATGGTCAAAAAAAG
AAAGTACATATTTACCGCCTTCTTGTCAATTGGTATTTCTCTTGAGCTCC
AAAGCTGGTGGAGTTGGTTTAAATCTCACTGCCGCATCCAGGCTAATATT
GTATGATATAGATTGGAACCCGGCTAACGACTTGCAGGTTTTGGATATTT
TAGCAAAGTTTTGTGATTCGATAGAAATTAAATATGTTCGCTTGGACGGA
AAAATGACGGCAGACCAACGACAAAGTTCGATCGATCGATTCAATGATAA
ATCGAGTAATATAAATATTTGAAGATTTATTGGATCATTTACCAGAAGAT
GATGATATCAAAGATTGCTGTAAATTGCAAGTTGTTCATTCCCTCATTAG
TTCCTTTCGAAGAAAGAAAGAAAAAGTCCTTCTTGTTGCACTTTCTACCA
AGTGGAATATGTTGTGTTTGTTCAAATGTCATCGCTCCAAAGAACACTCT
ACAATTCATTGATTCAAAGCACGTTGTATACTGATTGTATGTCAAACCAG
GAGAGCGGTTCAAAACACCTGTTATGTATTGGCGCTTTGAAGAAATTGTG
TAATAGCCCTCATATACTTCGACAGTTCGTGGAAAATAAAACAGATTGCA
AAAACCAGCTGACAGAGATTATGAATCGATTTTGTTTACGTCGAACATCA
GAAGTCAACCAGAAACACCTCCCTCCTAAAGGGACCATTTCGGCCTTTCG
ACGTAATTTCATCGAACCAATCACTCGAGCACAACAACCTGGTTGTACAG
CAGATGAGAAAGAACTTTCAGAAACGTGTCTACAAAATATGGTTACGCGG
TGTATCGATGACATTCGTAAAGTTGCTTTCGATCTGCTTGTTTGTGATGA
AGCACACATACTTAAGAACACTAATGTTAAAATCACATCTATAATTTCTG
GTCTGCAAATTCCAAAATGTATTTTATTAACCGGAACACCCATACAGAAT
AATCTTGAAGAGTTTCATACACTAGCGGATTTGGCTTGCCCAGGTGTTTT
CGTCTACACACAGTGCTATCTGAGATTTGTTCAAGTTGCGAGAAAGTGAA
AGTTGCCATACACATGATCTGTTGCAATGCCAATGTTTCAAGGGCAGTAT
TGAAGAGAAGATTTATCAACGGCAGATCATCAAGAATAATTTGAGTGGCA
CCATTGTCGATTCACTGGCCAACAATAAAGTTCGTTTTTCCACAGAACAA
TTGAAGGCCATGGCACGGATATGGAGAGATGGTCAAAAAAAGAAAGTACA
TATTTACCGCCTTCTTGTCAATTGGTATTTCTCTTGAGCTCCAAAGCTGG
TGGAGTTGGTTTAAATCTCACTGCCGCATCCAGGCTAATATTGTATGATA
TAGATTGGAACCCGGCTAACGACTTGCAGGTTTTGGATATTTTAGCAAAG
TTTTGTGATTCGATAGAAATTAAATATGTTCGCTTGGACGGAAAAATGAC
GGCAGACCAACGACAAAGTTCGATCGATCGATTCAATGATAAATCGAGTA
ATATAAATATTTGAAGATTTATTGGATCATTTACCAGAAGATGATGATAT
CAAAGATTGCTGTAAATTGCAAGTTGTTCATTCCCTCATTAGTTCCTTTC
GAAGAAAGAAAGAAAAAGTCCTTCTTGTTGCACTTTCTACCAAGTGGAAT
ATGTTGTGTTTGTTCAAATGTCATCGCTCCAAAGAACACTCTACAATTCA
TTGATTCAAAGCACGTTGTATACTGATTGTATGTCAAACCAGGAGAGCGG
TTCAAAACACCTGTTATGTATTGGCGCTTTGAAGAAATTGTGTAATAGCC
CTCATATACTTCGACAGTTCGTGGAAAATAAAACAGATTGCAAAAACCAG
CTGACAGAGATTATGAATCGATTTTGTTTACGTCGAACATCAGAAGTCAA
CCAGAAACACCTCCCTCCTAAAGGGACCATTTCGGCCTTTCGACGTAATT
TCATCGAACCAATCACTCGAGCACAACAACCTGGTTGTACAGCAGATGAG
AAAGAACTTTCAGAAACGTGTCTACAAAATATGGTTACGCGGTGTATCGA
TGACATTCGTAAAGTTGCTTTCGATCTGCTTGTTTGTGATGAAGCACACA
TACTTAAGAACACTAATGTTAAAATCACATCTATAATTTCTGGTCTGCAA
ATTCCAAAATGTATTTTATTAACCGGAACACCCATACAGAATAATCTTGA
AGAGTTTCATACACTAGCGGATTTGGCTTGCCCAGGTGTTTTCGTCTACA
CACAGTGCTATCTGAGATTTGTTCAAGTTGCGAGAAAGTGAAAGTTGCCA
TACACATGATCTGTTGCAATGCCAATGTTTCAAGGGCAGTATTGAAGAGA
AGATTTATCAACGGCAGATCATCAAGAATAATTTGAGTGGCACCATTGTC
GATTCACTGGCCAACAATAAAGTTCGTTTTTCCACAGAACAATTGAAGGC
CATGGCACGGATATGGAGAGATGGTCAAAAAAAGAAAGTACATATTTACC
GCCTTCTTGTCAATTGGTATTTCTCTTGAGCTCCAAAGCTGGTGGAGTTG
GTTTAAATCTCACTGCCGCATCCAGGCTAATATTGTATGATATAGATTGG
AACCCGGCTAACGACTTGCAGGTTTTGGATATTTTAGCAAAGTTTTGTGA
TTCGATAGAAATTAAATATGTTCGCTTGGACGGAAAAATGACGGCAGACC
AACGACAAAGTTCGATCGATCGATTCAATGATAAATCGAGTAATATAAAT
ATTTGAAGATTTATTGGATCATTTACCAGAAGATGATGATATCAAAGATT
GCTGTAAATTGCAAGTTGTTCATTCCCTCATTAGTTCCTTTCGAAGAAAG
AAAGAAAAAGTCCTTCTTGTTGCACTTTCTACCAAGTGGAATATGTTGTG
TTTGTTCAAATGTCATCGCTCCAAAGAACACTCTACAATTCATTGATTCA
AAGCACGTTGTATACTGATTGTATGTCAAACCAGGAGAGCGGTTCAAAAC
ACCTGTTATGTATTGGCGCTTTGAAGAAATTGTGTAATAGCCCTCATATA
CTTCGACAGTTCGTGGAAAATAAAACAGATTGCAAAAACCAGCTGACAGA
GATTATGAATCGATTTTGTTTACGTCGAACATCAGAAGTCAACCAGAAAC
ACCTCCCTCCTAAAGGGACCATTTCGGCCTTTCGACGTAATTTCATCGAA
CCAATCACTCGAGCACAACAACCTGGTTGTACAGCAGATGAGAAAGAACT
TTCAGAAACGTGTCTACAAAATATGGTTACGCGGTGTATCGATGACATTC
GTAAAGTTGCTTTCGATCTGCTTGTTTGTGATGAAGCACACATACTTAAG
AACACTAATGTTAAAATCACATCTATAATTTCTGGTCTGCAAATTCCAAA
ATGTATTTTATTAACCGGAACACCCATACAGAATAATCTTGAAGAGTTTC
ATACACTAGCGGATTTGGCTTGCCCAGGTGTTTTCGTCTACACACAGTGC
TATCTGAGATTTGTTCAAGTTGCGAGAAAGTGAAAGTTGCCATACACATG
ATCTGTTGCAATGCCAATGTTTCAAGGGCAGTATTGAAGAGAAGATTTAT
CAACGGCAGATCATCAAGAATAATTTGAGTGGCACCATTGTCGATTCACT
GGCCAACAATAAAGTTCGTTTTTCCACAGAACAATTGAAGGCCATGGCAC
GGATATGGAGAGATGGTCAAAAAAAGAAAGTACATATTTACCGCCTTCTT
GTCAATTGGTATTTCTCTTGAGCTCCAAAGCTGGTGGAGTTGGTTTAAAT
CTCACTGCCGCATCCAGGCTAATATTGTATGATATAGATTGGAACCCGGC
TAACGACTTGCAGGTTTTGGATATTTTAGCAAAGTTTTGTGATTCGATAG
AAATTAAATATGTTCGCTTGGACGGAAAAATGACGGCAGACCAACGACAA
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ATTTATTGGATCATTTACCAGAAGATGATGATATCAAAGATTGCTGTAAA
TTGCAAGTTGTTCATTCCCTCATTAGTTCCTTTCGAAGAAAGAAAGAAAA
AGTCCTTCTTGTTGCACTTTCTACCAAGTGGAATATGTTGTGTTTGTTCA
AATGTCATCGCTCCAAAGAACACTCTACAATTCATTGATTCAAAGCACGT
TGTATACTGATTGTATGTCAAACCAGGAGAGCGGTTCAAAACACCTGTTA
TGTATTGGCGCTTTGAAGAAATTGTGTAATAGCCCTCATATACTTCGACA
GTTCGTGGAAAATAAAACAGATTGCAAAAACCAGCTGACAGAGATTATGA
ATCGATTTTGTTTACGTCGAACATCAGAAGTCAACCAGAAACACCTCCCT
CCTAAAGGGACCATTTCGGCCTTTCGACGTAATTTCATCGAACCAATCAC
TCGAGCACAACAACCTGGTTGTACAGCAGATGAGAAAGAACTTTCAGAAA
CGTGTCTACAAAATATGGTTACGCGGTGTATCGATGACATTCGTAAAGTT
GCTTTCGATCTGCTTGTTTGTGATGAAGCACACATACTTAAGAACACTAA
TGTTAAAATCACATCTATAATTTCTGGTCTGCAAATTCCAAAATGTATTT
TATTAACCGGAACACCCATACAGAATAATCTTGAAGAGTTTCATACACTA
GCGGATTTGGCTTGCCCAGGTGTTTTCGTCTACACACAGTGCTATCTGAG
ATTTGTTCAAGTTGCGAGAAAGTGAAAGTTGCCATACACATGATCTGTTG
CAATGCCAATGTTTCAAGGGCAGTATTGAAGAGAAGATTTATCAACGGCA
GATCATCAAGAATAATTTGAGTGGCACCATTGTCGATTCACTGGCCAACA
ATAAAGTTCGTTTTTCCACAGAACAATTGAAGGCCATGGCACGGATATGG
AGAGATGGTCAAAAAAAGAAAGTACATATTTACCGCCTTCTTGTCAATTG
GTATTTCTCTTGAGCTCCAAAGCTGGTGGAGTTGGTTTAAATCTCACTGC
CGCATCCAGGCTAATATTGTATGATATAGATTGGAACCCGGCTAACGACT
TGCAGGTTTTGGATATTTTAGCAAAGTTTTGTGATTCGATAGAAATTAAA
TATGTTCGCTTGGACGGAAAAATGACGGCAGACCAACGACAAAGTTCGAT
CGATCGATTCAATGATAAATCGAGTAATATAAATATTTGAAGATTTATTG
GATCATTTACCAGAAGATGATGATATCAAAGATTGCTGTAAATTGCAAGT
TGTTCATTCCCTCATTAGTTCCTTTCGAAGAAAGAAAGAAAAAGTCCTTC
TTGTTGCACTTTCTACCAAGTGGAATATGTTGTGTTTGTTCAAATGTCAT
CGCTCCAAAGAACACTCTACAATTCATTGATTCAAAGCACGTTGTATACT
GATTGTATGTCAAACCAGGAGAGCGGTTCAAAACACCTGTTATGTATTGG
CGCTTTGAAGAAATTGTGTAATAGCCCTCATATACTTCGACAGTTCGTGG
AAAATAAAACAGATTGCAAAAACCAGCTGACAGAGATTATGAATCGATTT
TGTTTACGTCGAACATCAGAAGTCAACCAGAAACACCTCCCTCCTAAAGG
GACCATTTCGGCCTTTCGACGTAATTTCATCGAACCAATCACTCGAGCAC
AACAACCTGGTTGTACAGCAGATGAGAAAGAACTTTCAGAAACGTGTCTA
CAAAATATGGTTACGCGGTGTATCGATGACATTCGTAAAGTTGCTTTCGA
TCTGCTTGTTTGTGATGAAGCACACATACTTAAGAACACTAATGTTAAAA
TCACATCTATAATTTCTGGTCTGCAAATTCCAAAATGTATTTTATTAACC
GGAACACCCATACAGAATAATCTTGAAGAGTTTCATACACTAGCGGATTT
GGCTTGCCCAGGTGTTTTCGTCTACACACAGTGCTATCTGAGATTTGTTC
AAGTTGCGAGAAAGTGAAAGTTGCCATACACATGATCTGTTGCAATGCCA
ATGTTTCAAGGGCAGTATTGAAGAGAAGATTTATCAACGGCAGATCATCA
AGAATAATTTGAGTGGCACCATTGTCGATTCACTGGCCAACAATAAAGTT
CGTTTTTCCACAGAACAATTGAAGGCCATGGCACGGATATGGAGAGATGG
TCAAAAAAAGAAAGTACATATTTACCGCCTTCTTGTCAATTGGTATTTCT
CTTGAGCTCCAAAGCTGGTGGAGTTGGTTTAAATCTCACTGCCGCATCCA
GGCTAATATTGTATGATATAGATTGGAACCCGGCTAACGACTTGCAGGTT
TTGGATATTTTAGCAAAGTTTTGTGATTCGATAGAAATTAAATATGTTCG
CTTGGACGGAAAAATGACGGCAGACCAACGACAAAGTTCGATCGATCGAT
TCAATGATAAATCGAGTAATATAAATATTTGAAGATTTATTGGATCATTT
ACCAGAAGATGATGATATCAAAGATTGCTGTAAATTGCAAGTTGTTCATT
CCCTCATTAGTTCCTTTCGAAGAAAGAAAGAAAAAGTCCTTCTTGTTGCA
CTTTCTACCAAGTGGAATATGTTGTGTTTGTTCAAATGTCATCGCTCCAA
AGAACACTCTACAATTCATTGATTCAAAGCACGTTGTATACTGATTGTAT
GTCAAACCAGGAGAGCGGTTCAAAACACCTGTTATGTATTGGCGCTTTGA
AGAAATTGTGTAATAGCCCTCATATACTTCGACAGTTCGTGGAAAATAAA
ACAGATTGCAAAAACCAGCTGACAGAGATTATGAATCGATTTTGTTTACG
TCGAACATCAGAAGTCAACCAGAAACACCTCCCTCCTAAAGGGACCATTT
CGGCCTTTCGACGTAATTTCATCGAACCAATCACTCGAGCACAACAACCT
GGTTGTACAGCAGATGAGAAAGAACTTTCAGAAACGTGTCTACAAAATAT
GGTTACGCGGTGTATCGATGACATTCGTAAAGTTGCTTTCGATCTGCTTG
TTTGTGATGAAGCACACATACTTAAGAACACTAATGTTAAAATCACATCT
ATAATTTCTGGTCTGCAAATTCCAAAATGTATTTTATTAACCGGAACACC
CATACAGAATAATCTTGAAGAGTTTCATACACTAGCGGATTTGGCTTGCC
CAGGTGTTTTCG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15004MSTRG.15004Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15004.4.p1.exon11MSTRG.15004.4.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon10MSTRG.15004.4.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon9MSTRG.15004.4.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon8MSTRG.15004.4.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon7MSTRG.15004.4.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon6MSTRG.15004.4.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon5MSTRG.15004.4.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon4MSTRG.15004.4.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon3MSTRG.15004.4.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon2MSTRG.15004.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15004.4.p1.exon1MSTRG.15004.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15004.4.p1MSTRG.15004.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000129_pilongenomesc0000129_pilon:592209..637329 -