MSTRG.15141.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15141.1.p1
Unique NameMSTRG.15141.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000131_pilon:820836..840597+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15141.1.p1 ID=MSTRG.15141.1.p1|Name=MSTRG.15141.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19762bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000131_pilon:820836..840597+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTCTTCAAGTCCTCGCTGCATTATGTTTCAATCTTGGATTCGCAGTCATT tattacaacaaaaatctaaacAATAAACCCCATTTTACCTCGTGGCATGG CAAAATTGGATTCTGGGCCGTTGCTATATCAACGTTTCAAACGATGGTGG GGCCATCTTTAATTTACTATAACAACCGGATTTTGAATCCGATGGGTACA TCATTGGCCTTACGGAAGAAAGTACATGGCGTTGTCGGAGCTCTCGCTTT TGTCTTAGGAGATGCGACCATGGTTTTGAGtttgttttccaattttatGG TTAAAAATACCAGTGAGACATCGTGGTATTTCCTCTTAATCTTGAAAACC ATAATGGCTTCTGTAGTTGTTAACCAGGCTAGTTCGAAGTATGTTTTCAA GTCTAAGTGAGACAATAACTAAaggtaaaataaatttttccaaaaaacct gaTTGAGGTAAGCATTTGAAGCTCACGTTGAATGTCAAGTGTTGGTAAAT AAGTTATGATAAACCTAGATTAATAGACAGGTTTTTACAGTACTTTTTAC CATTATCAGAAATATAAATATATACAGATATCACATTCGCATTCAGAAGC AACTATATATGAAATCGGTTATTTATAATTCCTTATACTCGCACCTTATT TTAATATTCTATAACATGaaacaatgtttaaaattttctataaatatgat agattttcttaacttttaacattttttaaacaccatgcataattatttgA TATGTCAAAAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000131_pilon:820836..840597+

>MSTRG.15141.1.p1 ID=MSTRG.15141.1.p1|Name=MSTRG.15141.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2133bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000131_pilon:820836..840597+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGAAATCGTCGTCACGAAGAAAGGGAAATCTGCTGAGAATTATTC
TGCAAAAGACCAAccttcttctttgtttttctgtctTAAGTTTCTGTTTA
TCATGGCTCATATTTTTGCATTTATGCTATGTGCTTTTATCATCTTCCTC
TCACAACCTGGGACGTCTCTGTTCTCATGGCATCCGACGTTGATGGTCCT
TGGGtttggactGTTCATGTTCGAAGCCAtcctcttattttcaccataca
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GGGCCATCTTTAATTTACTATAACAACCGGATTTTGAATCCGATGGGTAC
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GAGAATTATTCTGCAAAAGACCAAccttcttctttgtttttctgtctTAA
GTTTCTGTTTATCATGGCTCATATTTTTGCATTTATGCTATGTGCTTTTA
TCATCTTCCTCTCACAACCTGGGACGTCTCTGTTCTCATGGCATCCGACG
TTGATGGTCCTTGGGtttggactGTTCATGTTCGAAGCCAtcctcttatt
ttcaccatacaGCTCCCTGTTGGGTGCATCTGATCGTCAACTGAAGGTTA
AATATCATTGGATTCTTCAAGTCCTCGCTGCATTATGTTTCAATCTTGGA
TTCGCAGTCATTtattacaacaaaaatctaaacAATAAACCCCATTTTAC
CTCGTGGCATGGCAAAATTGGATTCTGGGCCGTTGCTATATCAACGTTTC
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CCGATGGGTACATCATTGGCCTTACGGAAGAAAGTACATGGCGTTGTCGG
AGCTCTCGCTTTTGTCTTAGGAGATGCGACCATGGTTTTGAGtttgtttt
ccaattttatGGTTAAAAATACCAGTGAGACATCGTGGTATTTCCTCTTA
ATCTTGAAAACCATAATGGCTTCTGTAGTTGTTAACCAGGCTAGTTCGAA
GTATGTTTTCAAGTCTAAGTGAATGGCTGAAATCGTCGTCACGAAGAAAG
GGAAATCTGCTGAGAATTATTCTGCAAAAGACCAAccttcttctttgttt
ttctgtctTAAGTTTCTGTTTATCATGGCTCATATTTTTGCATTTATGCT
ATGTGCTTTTATCATCTTCCTCTCACAACCTGGGACGTCTCTGTTCTCAT
GGCATCCGACGTTGATGGTCCTTGGGtttggactGTTCATGTTCGAAGCC
AtcctcttattttcaccatacaGCTCCCTGTTGGGTGCATCTGATCGTCA
ACTGAAGGTTAAATATCATTGGATTCTTCAAGTCCTCGCTGCATTATGTT
TCAATCTTGGATTCGCAGTCATTtattacaacaaaaatctaaacAATAAA
CCCCATTTTACCTCGTGGCATGGCAAAATTGGATTCTGGGCCGTTGCTAT
ATCAACGTTTCAAACGATGGTGGGGCCATCTTTAATTTACTATAACAACC
GGATTTTGAATCCGATGGGTACATCATTGGCCTTACGGAAGAAAGTACAT
GGCGTTGTCGGAGCTCTCGCTTTTGTCTTAGGAGATGCGACCATGGTTTT
GAGtttgttttccaattttatGGTTAAAAATACCAGTGAGACATCGTGGT
ATTTCCTCTTAATCTTGAAAACCATAATGGCTTCTGTAGTTGTTAACCAG
GCTAGTTCGAAGTATGTTTTCAAGTCTAAGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15141MSTRG.15141Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15141.1.p1MSTRG.15141.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15141.1.p1.exon1MSTRG.15141.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15141.1.p1.exon2MSTRG.15141.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15141.1.p1.exon3MSTRG.15141.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000131_pilongenomesc0000131_pilon:820836..840597 +