MSTRG.17627.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.17627.1.p1
Unique NameMSTRG.17627.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000179_pilon:712308..723655+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.17627.1.p1 ID=MSTRG.17627.1.p1|Name=MSTRG.17627.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11348bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:712308..723655+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCGATGGTCAAGTGTATGTAGTCAGCCTGGCATCTGAATAAATAGTAAGC TATCGATAAAGTATATGATATTCTAATGGGTTTTTGaagaagtaattttt ttctgaccATCGGGTCGTGAATACGTTATTTAGAATTTATGTTGTCAAAT GtatatgaaatttttgatggTTTAGAATCTTGGCTAACATGTATTGTTTT CATGCTTTGCTGCTATTGTTGGCGAGTTTGAGATTGGCAATAGCTACAGG TGGAGATGCACAATGTTTGAAATATGACCGGAAGGTAACGAAGGATTTGA AAACTGGTGAAAAGAACTTTGTCAATTGTTTGGGCCAAACCGTTGAGAGC GGACAATCTGAGCTGGTCATTCTTCTCGATCGTTCTGGTAGTATGTGGTC TTCATCTCAGTTCAAAGGATCATGGACAACCCGTTATGATATTGCAAAGA AGTTCATCGAAGCATTGTTATCAGAAGTTCGTATCTCTTCTAATGCGACT CGAATAGCTCTTGGTACATTCACGAACTCGTATCATCGAGATATTAACTA TATTTGGTACCCTACAAATGATAAGAATAGGTGTAAGTTCGAGAACGAAT ACAAATTACTTAAAGGGCCTTCAGGCGCAACCAACATCAAAGCTGCATTG CAGGATGCTTACGATATCTTTGCCGAACTCGATGATAATCCTCAGGACCA TAGATATCGTCGCAAATCAAATAAAGTGGTACTCCTTCTATCAGATGGTA ATGCAAACGTTTATTATGGTCCTAATCCTGGGAAACCTTCGGACGCATCT TACGAAGCTAATCAGTTACGTAATACCCACCGTTTAGTGTATACAATCGG TGCCGgtgattttggcaaaaatctaatgaaaagcTGGGCCAGTCATCCTA GTGCTTTCTTAGATATCACTGATTTTAGTCGAATGGCAACTCTGGCTCAT 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AACAACTTGTTTTCTCTCTACCATGTTTGCTAATTCTGCTAAATTCATTC ATTCTGTCatttgtttttctctaaaataaatAATAGGAAAACGTGAAACC ATCCTGATACTGTCCATACACATATGACAATATGACATGGATTGACAAAG GTTCATTTACTTGTCAAGTGAACGCTGCAAGTGGGGATTGAACCTCAGTC ACCTCTGTACAGCAACCAAGATTAATGACCACGCCTTAGTGTATATCTAC CAGTGTATATCCCAAAAGAGCAAAAGGTATAAAATATATCTGAGAGGAGC ATAAAGGCTTAAAGCTAGCTAGTAAGGTTGCTACCAAAACCAACAAGAAG CttctaaaaatcaaatcaagcaAAGGTTACACAGAGAAGAAGGTTATACC TGCCTAACTAACCAGTACATAATACTGTAAAAAGACAATGATAAAGCAGT AATTAAACACTTTTATGGTAATTTAATGAACAAATACAAAAAAGACAGCC TTCTCTTTCCATTTTCCATATCCACCAAGAAATGAGAAACTGCAGAATAT TTTTTAGAAACTGCAGAATAGTTTTTAGAAAGGGGAttctgttttgttta caaagGAATCTCCGCCGGTCTCTGCCCCTCCACGGCCATTAGATTTGCTC CGCCTGCAAAATGGCGTCGCGAACTCCGAAATGGcgtattctaattgtga attaaagtggccataaagtgggctgtctaaagtcaatgcattgccctctt ttgacgtcaatgcaatgtcttatttcaatcttttccaagcagaaatttta actgccaactttgtgcTCACTTTTTgtctactctaacaattagaataggc agggcagaaagtcaaccgtctaaactagagctaacttCCATTGTGACGTC AGATGAACGTTCACATGATGTCGTGTTTACTAACTGGGTTCAATACTTAC AATTCTTACTACTAGAATATCACCTATTTTCTAATAAGAAACCATTCTTT AAAAAGGAAGGAGAGTATTCGGTGTAGTTTCAAATGTCTTTTGTCTTGTT GCTCGCAAATCATTGAAAGGATTTTAGGGTCTAGGTCTAGATGCTATCGT ACTTGAGGATAGTAAACGCAGGAAAAACGCATAATCACGGCGGTTTACGG AGAAAAATAGTGAccgtagagtttggaacaaacagATATCGTCTACACAG TAAACACCTCCACCACTACTGACCCGCACACGGTTAACCTCCATTTCCAA ATTCATCCTGTTTCCTAGCCTAAACTAATGACATTTTCAGTGACCTTGTG TAGACGACAGGATCGTCTAGTCTGGGACATAAAATTCTATGTTCCGATAG CGGAACGAGCTCGGGAAGGCTCAGTTGAcattagcctatactagacgtca cctgcgttttttctacgcaattaacgtctattccactttgcgactttttc gaatgttttgagcccgggttttcgggctctaaacattcgattttttgacg tcacttttagctttcgaagctcttgcagtagcgaaataatcgaatttgcg tcaaaacacttgaaaggcttctatttttcgaaaattgtcaaagtggaact cactaagaaacgagataaaaaatcccggtttttagtgagatGCTCGCTAA GTTGACATAAATGACCATTCAAAATTACGTTACCCTTTGCATTCGGAATC GTAAATCAAAATTTCCCCTCTTATCTGATTTAGATGTCACTGACCCTGTT TTTGAAAGGAAGGATGAATGTAACACTGGTATTACCATTCGAAAGGATAC actagaagatcaaaattatgCCTCTATTAATTTTGATACTATCAGAGCTA CAGATAATAGCGGAGAAAGACCAAAAATGTCTTGTGTGACTGAAAGTAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:712308..723655+

>MSTRG.17627.1.p1 ID=MSTRG.17627.1.p1|Name=MSTRG.17627.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=30510bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:712308..723655+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATTGTTTTCATGCTTTGCTGCTATTGTTGGCGAGTTTGAGATTGGC
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TTGATGGTGATTGCACCAAAAAAGCTGTTCAGCAATCCATCATTGCAAAG
TTCGCTAGCAATGCTGGTATCCCTCCAGATCTCCAAGATGGCATCCAATT
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GGTAATGTGAAAGAGGTATGTGGTGGCGAAGGACAAGTCGAAGGAACACA
GTTCGACCCTCGTGTACCAAGATcaaatatattacaaaaatGCGGTAAGC
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GAAGGTAACGAAGGATTTGAAAACTGGTGAAAAGAACTTTGTCAATTGTT
TGGGCCAAACCGTTGAGAGCGGACAATCTGAGCTGGTCATTCTTCTCGAT
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GTGTAAGTTCGAGAACGAATACAAATTACTTAAAGGGCCTTCAGGCGCAA
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GATGATAATCCTCAGGACCATAGATATCGTCGCAAATCAAATAAAGTGGT
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GTTCTTTCCAATGCGATACCGGGTTCAAGTTAACTCAACAACTCATTGAA
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TGGAAGTTCTTGAATAAAGGTGTTGGTGCTTTACAATCGGTTAGATCAGA
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GGGAAACCTTCGGACGCATCTTACGAAGCTAATCAGTTACGTAATACCCA
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GGAAAGATACAAGTCCTGCCAATGCTCCTGTACCGTTACCTGATTGCTTG
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CAGTTCGACCCTCGTGTACCAAGATcaaatatattacaaaaatGCGGTAA
GCAGTTCTTC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17627MSTRG.17627Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17627.1.p1MSTRG.17627.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.17627.1.p1.exon10MSTRG.17627.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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