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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000128_pilon:450440..460367+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14943.4.p2 ID=MSTRG.14943.4.p2|Name=MSTRG.14943.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9928bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:450440..460367+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTAGCTTATTTAAAGAAATATTCATTTTCCTAGAGGTTGAAGAAGAACC
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TTAACTACCTTTACCCATTGAGGATTTTAATTAGTTTACTTAAGTTTCTG
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GACTGACGGGGGTgttccgctgaggttcgaaaaatggaccctacgtggga
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ttaattttaagaaaggattaagaggattttagaagaatattaattttaat
ttattagtGGTTGAGAAGAAGCATGGATTTTATGGGAGATTTatttaata
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tTCACAGCTtatcagagtggtttgaaaaagtactttttagaaagaaattt
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atcttataaattatatacacagagctttgacagacccttgaaaacctgaa
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AATAAGCCGTCATTTTCTCCAAACTTTGGGAACTCAGAGAAAATAACTCg
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atctcccttacctaattttgacataaaaaaCtgtcatacaaacaaataat
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ggggggggtgcgaaaaatattgggccttatgaggggggttcgaaattttt
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ATATTTAGAGGATGGTGGAGAACTCCACCACTTTTGGTTAGCCAGTGTTA
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TAAATTCACCAACCCGGTAGCCAGAATATTTGCTgaggttttcaaaacaa
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acAGACTAGATACTAcccatgatatgcaccattgcaatgtcttccacgga
cccaacagctgattggttgaaagtgacgtattgtaTTGACTAATTttacc
aatcagctgttgggtccggtaatgtcagaagacattgcgaTGATACATAT
CATGGATAATTTCTAGTTTGTAAAATAAGAGAAAGTTTTTCATGTTTGTT
AAGTTGCGTgttttccgccattatggaagcaaacgttcgatttgcGTATG
GGATCGCCTCTACatattcgaacgtttgcttccatgaTGGCTGAtaaagt
tacgtaacttaacaataCATGTAAAAGCTCTAGATATTATGTTGCTGTTT
TTGACCCCATTTTCCGGCCCAAAGCTGAGGGGTCCGTTTAATATTTTGTA
GCCATTTTAATTTCTGTATTGGGAAGATTtcggagaagaaaaaaaaacag
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TATGAGATAAATTTATTTATACTAGCAGGCACGACTCACAGAGTACGATT
GTTAAAGTATTTCCTTTTATTCTCCATATATCAGATTGAGTAATCCCCTT
TCTCTATTCAGGCACTAAACGAAAGTATAGAAGTTTTGAGCTTGAAGTGG
AATTCCATTCGTGGTAAAGGGGGTGTCGCAATTGCGGCCGCCCTCAGTGT
AAGTGAATTTGATTCAAATGATAATTTATTGTCTTAAATAGCAGACCTCT
ACActctctacaaaaccgcagatAATCCAATCTTTAGAAGGGCCACGAAT
TCGTTAGAGGATACCATAAGGGATTCTAAGTATTGTGATCCAAGCTATAG
GGATTTATTTTTCCAGGATTCTATAAAAATGGACCCTGATTGGGGTGACA
TTCAGTGAACATTTTATTTGTATTTGATTCTTCTCTTGTTTTATCCTAAG
GAATATATCCGATGTTTCTTTCTAGAAAAATTCAACATTGAGGAAACTCG
ATTTATCCTGGAACGGCTTGGCTTTCATTGGTTGTTTGGCGATAGGGCgc
catttgaagaaaaattcaacaCTTGAACACTTGGATATCAGGTAACAAAT
GATTTGCGTTCCCCACTAGTCTACACGATAGACAGCTCCAAGCTTTtact
caggtaagttatggcatatctcaaaaacctgaaaattaccataatttttg
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ATTTCGCGAAGACCGCAAAAACCAAGTGCTGCGTCAgcaaacttgttttt
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AATTAATGTTGGTGCATTTTCTTATGTTGGAAATCATGACTTACggctaa
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TTTACCGTGGTTCGAACCTACATGTCTCCGATTATGAAACATGTAGTCTA
TTGCACTGGGCTACGACGGTTGCTGATTTTCCGAAATTCAAGGTTATTTT
ATAGAGTGACATATATAGTATATACGGGTGAACAGACCtcacgagttagg
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AAGGGATAAGCAGGAGACTAAGATGGAGTTTACCAGAAGGTTACGTGTTG
AAATTCTCAAGCTTTTGTATGGGAAAATCAATGTAACGACTAAATACTTT
GGATGTCAATTCTAAGAGTTGATACGATAGTTTGAGGTAATTTGTAGTAG
CAAAACCTTCAATTATTCAAAAcgaaaattctcaatttcagTAACAATCG
AATAGGCTGTGATGGAGCAACAAAGCTTGTAGGCGCTCTTTCAGTACATC
CCGTTTTGGAGACGTTTAAAATCGGATTAAACCCGATCGGGGATGAAGgt
gttcaaaaaatcttgaaagcAATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTATT
GTCATTTGAGGTGAGTTGAACAGTTACCAAATTGAGACTCAACCTTTGAT
GTTTCAGTATGTTAAGAAGCAAAACACGATGGAAGAtttttttCTACGCA
TGATTATCAgacgtagaaaaaaataatttctaaaatAGGTCGTtgacttt
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TCTCTGGCATCAAAGGCTGTAAAATTCTAACAAGTGTGAATTGTTCTTGA
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TAAAGGTCATTATTTCATTTATGATAATATGTCACTTGGCTCACGGGCTG
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TTCTAAAAAACGCACCCACCGCTTACTGCCCTTCTCTCTCCCCTCATTTG
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tATGCATGTAGTTAATTTCTAAGGATGGGCGGGCGTTGTCCGTATATCCT
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TAATATCAGTGCTGATGTGAGCTTTTTCTGAACATGGTAGCAGTCTTTCC
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TCATTTTCCAGCCACCACCAGGGAATATGGAAGTTTTAGTACAGTTTATA
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CAGGTCTGAAAATGGATAAGGTAAGACTCAAGCTTTCGATATTGGTACAT
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TTATCGCACCCGGTAACTAACCTGGTCTTCTTGTGGTGCCAAAAAGAATA
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GCTAAAAACATTAGAATCTTAAAATTCACCAGGTCTTAAAAGCGAAATAT
TTTTATGGTATAGAACAAAGAAACGCAATTACAAGCGTCAACCTCAGTGC
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tttcatattttttttttcacttcagGGGCAGATAACAAATCTGATCGATC
AACTTGACACAAACAATGATGGAGACATAGAGTTTAGGTGAGAAGGGTTA
TTTTTAGATCATCTGCTCAAATCGTTCGTTCATATTTCTCACGTCAATTc
ttactttttctgaaaaacacGTTACGTAATTCACTAAAATGACCAATGGG
AAAGGCTACTTTTCTAGGTACTCTATTTAGCCCGGGCACAGGGTATATCT
GAAGACTTTCTAACATCGCTTCtcaatttcgaaaagaaaattacaTACTA
CAatggaatctccataactcgatcaCGCACATTGCtaaagggaccataaa
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TTGtatatgtttctttttttttttttctttcagtgagATTTTGAGTGGAC
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CTAACATACAAAAAACTGGACACAAGCATGCATAGACATTACATTGTGGC
ATATTGAAACATTTGAACTGTTTAAACATTAGCTCTATATAAACCAATAG
AACTTTTTCTAAACCCTaggcatttttttttaattttcgaaagCTCCAGG
CTTAAATGTGATGGATATCTGCAATACCATATTattaagaaaattaattt
tggcgagcagcagaaatctttgaaaatatgtaaactGGCGAGGAACTTAC
ATTGGCAGAGTAGCGAACTGGTAATTTTGTCGAGAACTGGCACCAATGTC
GGTGTAACGAGATTCTATTTAGCCCAAAAATGAGTATTCTAGACAAACAT
TATGGAATTTTGAAtcgaaaaatatgtaaaaactcacttttagtgacttt
tagaaaaattcgccaaatttggTGCACA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000128_pilon:450440..460367+ >MSTRG.14943.4.p2 ID=MSTRG.14943.4.p2|Name=MSTRG.14943.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1812bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:450440..460367+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTAGCTTATTTAAAGAAATATTCATTTTCCTAGAGGTTGAAGAAGAACC
TTTAGATTCTTACGGGCGAACCGTATATCGTGAAGAATGCTTACGTCAGC
AAATTATACCTATTACGTCATTTATCAAGCAATTACCtgaagaaaaaatg
acattgaaATTTCGAGGATTTAATGAAAAAGCTTCAAATGCACTCTCATC
AGCTCTTTCGGCGAACAGTCGAATCGAGATATGCGATTTATCCAACAACA
ATATGGGATACACAGCTGGCCTAAGTTTGGTTGAAATGttgaaagaaaat
acttttATCACACATCTTgatttaTCAGAAAATCAACTTGGTAATGCAGT
TGGAATCAAACTTGGAGAAATGTTGCTCACAAACATATACATGAAAACAC
TcattttgaaagtGGTTGAGAAGAAGCATGGATTTTATGGGAGATTTatt
taaTTTAGCTTATTTAAAGAAATATTCATTTTCCTAGAGGTTGAAGAAGA
ACCTTTAGATTCTTACGGGCGAACCGTATATCGTGAAGAATGCTTACGTC
AGCAAATTATACCTATTACGTCATTTATCAAGCAATTACCtgaagaaaaa
atgacattgaaATTTCGAGGATTTAATGAAAAAGCTTCAAATGCACTCTC
ATCAGCTCTTTCGGCGAACAGTCGAATCGAGATATGCGATTTATCCAACA
ACAATATGGGATACACAGCTGGCCTAAGTTTGGTTGAAATGttgaaagaa
aatacttttATCACACATCTTgatttaTCAGAAAATCAACTTGGTAATGC
AGTTGGAATCAAACTTGGAGAAATGTTGCTCACAAACATATACATGAAAA
CACTcattttgaaagtGGTTGAGAAGAAGCATGGATTTTATGGGAGATTT
atttaaTTTAGCTTATTTAAAGAAATATTCATTTTCCTAGAGGTTGAAGA
AGAACCTTTAGATTCTTACGGGCGAACCGTATATCGTGAAGAATGCTTAC
GTCAGCAAATTATACCTATTACGTCATTTATCAAGCAATTACCtgaagaa
aaaatgacattgaaATTTCGAGGATTTAATGAAAAAGCTTCAAATGCACT
CTCATCAGCTCTTTCGGCGAACAGTCGAATCGAGATATGCGATTTATCCA
ACAACAATATGGGATACACAGCTGGCCTAAGTTTGGTTGAAATGttgaaa
gaaaatacttttATCACACATCTTgatttaTCAGAAAATCAACTTGGTAA
TGCAGTTGGAATCAAACTTGGAGAAATGTTGCTCACAAACATATACATGA
AAACACTcattttgaaagtGGTTGAGAAGAAGCATGGATTTTATGGGAGA
TTTatttaaTTTAGCTTATTTAAAGAAATATTCATTTTCCTAGAGGTTGA
AGAAGAACCTTTAGATTCTTACGGGCGAACCGTATATCGTGAAGAATGCT
TACGTCAGCAAATTATACCTATTACGTCATTTATCAAGCAATTACCtgaa
gaaaaaatgacattgaaATTTCGAGGATTTAATGAAAAAGCTTCAAATGC
ACTCTCATCAGCTCTTTCGGCGAACAGTCGAATCGAGATATGCGATTTAT
CCAACAACAATATGGGATACACAGCTGGCCTAAGTTTGGTTGAAATGttg
aaagaaaatacttttATCACACATCTTgatttaTCAGAAAATCAACTTGG
TAATGCAGTTGGAATCAAACTTGGAGAAATGTTGCTCACAAACATATACA
TGAAAACACTcattttgaaagtGGTTGAGAAGAAGCATGGATTTTATGGG
AGATTTatttaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000128_pilon | genome | sc0000128_pilon:450440..460367 + |
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