MSTRG.12346.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12346.1.p2
Unique NameMSTRG.12346.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:87326..122723-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12346.1.p2 ID=MSTRG.12346.1.p2|Name=MSTRG.12346.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=35398bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:87326..122723- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCCGTTTCTACCACCAATCAACCCTCAAAACCCATTGGAGGAAAACAAAA TCAAATTCATGCAACCTGACAAAAGGCTTTCGTTGCCCGACAATTTATTC GTCTCCACTCACCAAGGTGATAAAAAGAACCGACGACATTCCGACGACAT TCGATCAGTTGTCGAACTATTTTCCATACGTCGAAACACCATGTGTAGCC TGAATTCCGTCATCTCGAACGAGGTCAGTCTAAAGCCAGTTCATTCTATA CAATCTTTTGGGCATCTGTCGATCGCTCATAATATACCCTCAAACAGAGG CGCTCCCACAAATCTAACAGTCATTCAAGTCTATCAAAACCCGACAAATA CCGACGAACTACAACGTCAGTTTCTAAATAAACCACAAACGACGAATTTG ACGAGTGACGAAATTCGGCATATACGAGACAGGCTTTATACACCACTGAC AACTGCACACAAAGATAGCATAATAGCGGACTGTTTACCGTACAACCGGA CGGACTTAGAGCCGGACTTAATCTCAAGTGCAGTTGAATTGAGACAAAGT GTTAGAAATCATGAACTTTATAACTCGATTGAATTGATTGAGTCATTAAG TATCCATAGTACGAAAATTTGAGATAGTGCACCCCTGTATAGAATTGTAA TATGAAGATATCTAATCCACAGATCCAGAACTATACTCCGAACTTACTCA ATAGATTAACAATTTCGCTACAGAGGACCTGGTCAATGCAGTAGCTTCAG GCGGGGGAGGGGGTATTTAACTCCCTTTTTAGAAAGTGATCTGTTTCTAA AACTGACTATTTTCGTTTCTCTTTATCTGAACAAATTCTTTGAGTTTTTA GTTCTAAGGGAAGAAATATTTGCGCAAATTAATTTTGCGGCTCACAGCTT TAAATTTGGAAGTCTCGGTCAGTTTCATTTTGCGGTTGAGAGAGCTTTTT 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AGTTTATTGATGAAATGAAAACATATTTCCGACAGAATAATGAATAAATC GTTTTAAGTAGACGTGACTTGAATGATCGCTTCAGTAGCTTAGATGTTGT GATGCAGCGATATAACCAAGCTTGTAATATTTGATACTTTAAAAATCAAA CAAGCTCAACAATACAAATTTTCAACCGTAGCCGCGAATTGCTGCACGGG TACTTTCGTCCGTTTTACCACCCTAAAAACGTCCCAGTCTTTTTTTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:87326..122723-

>MSTRG.12346.1.p2 ID=MSTRG.12346.1.p2|Name=MSTRG.12346.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1620bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:87326..122723- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAATGATGGTTTAAAAATGACATTCACCAATGAATCGCAACAATGTTTT
GGTCCTGAAGGCAATTGTAATTATTTTGTACTCGAAGTTTATTGAAACTA
TGAGATTTACCCAAATGGACACAACAATCCAAACTCCAGTGAAAGAACTA
ACAGCCGCATCATTTGAAGATGGTCTTGTGCTTGAGAATAATTATCGTGC
GCATGCGTCCTTTCTACGCATGGCTAAAATACTAATGAACTTTGAAACCA
TACGTATGAAATGTGTTCGAAACACAACAGATTTAGTTATACTGGGCAAC
AAAAGACAATCTTCTGATACCGATTTCAATGTTATACGATATTTCTCAGG
AGAAAGTGATAGCCGACCTGTAGAGAGAACAACTTATTGGAGATCCAATC
TGAATGGGGTGCCGAACAATTACCCAATTGATGCAGTCGAAGACCTGTTA
TCTGCTGACAATGTTGAGAAAGAATATCGACCTTTCAAAGATATTTATAT
AGATGGAAAGACCAACGAAAAATTCATATACGATGTTCAGGTAATGATGG
TTTAAAAATGACATTCACCAATGAATCGCAACAATGTTTTGGTCCTGAAG
GCAATTGTAATTATTTTGTACTCGAAGTTTATTGAAACTATGAGATTTAC
CCAAATGGACACAACAATCCAAACTCCAGTGAAAGAACTAACAGCCGCAT
CATTTGAAGATGGTCTTGTGCTTGAGAATAATTATCGTGCGCATGCGTCC
TTTCTACGCATGGCTAAAATACTAATGAACTTTGAAACCATACGTATGAA
ATGTGTTCGAAACACAACAGATTTAGTTATACTGGGCAACAAAAGACAAT
CTTCTGATACCGATTTCAATGTTATACGATATTTCTCAGGAGAAAGTGAT
AGCCGACCTGTAGAGAGAACAACTTATTGGAGATCCAATCTGAATGGGGT
GCCGAACAATTACCCAATTGATGCAGTCGAAGACCTGTTATCTGCTGACA
ATGTTGAGAAAGAATATCGACCTTTCAAAGATATTTATATAGATGGAAAG
ACCAACGAAAAATTCATATACGATGTTCAGGTAATGATGGTTTAAAAATG
ACATTCACCAATGAATCGCAACAATGTTTTGGTCCTGAAGGCAATTGTAA
TTATTTTGTACTCGAAGTTTATTGAAACTATGAGATTTACCCAAATGGAC
ACAACAATCCAAACTCCAGTGAAAGAACTAACAGCCGCATCATTTGAAGA
TGGTCTTGTGCTTGAGAATAATTATCGTGCGCATGCGTCCTTTCTACGCA
TGGCTAAAATACTAATGAACTTTGAAACCATACGTATGAAATGTGTTCGA
AACACAACAGATTTAGTTATACTGGGCAACAAAAGACAATCTTCTGATAC
CGATTTCAATGTTATACGATATTTCTCAGGAGAAAGTGATAGCCGACCTG
TAGAGAGAACAACTTATTGGAGATCCAATCTGAATGGGGTGCCGAACAAT
TACCCAATTGATGCAGTCGAAGACCTGTTATCTGCTGACAATGTTGAGAA
AGAATATCGACCTTTCAAAGATATTTATATAGATGGAAAGACCAACGAAA
AATTCATATACGATGTTCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346MSTRG.12346Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346.1.p2MSTRG.12346.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346.1.p2.exon8MSTRG.12346.1.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.1.p2.exon7MSTRG.12346.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.1.p2.exon6MSTRG.12346.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.1.p2.exon5MSTRG.12346.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.1.p2.exon4MSTRG.12346.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.1.p2.exon3MSTRG.12346.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.1.p2.exon2MSTRG.12346.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.1.p2.exon1MSTRG.12346.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:87326..122723 -