MSTRG.11482 (gene) -

Overview
NameMSTRG.11482
Unique NameMSTRG.11482
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000083_pilon:739457..751345+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11482 ID=MSTRG.11482|Name=MSTRG.11482|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=11889bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:739457..751345+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTACAGTGGTGTGTCAGAAAAAGTCTTAAAACGAATCAAACTTTTCTGA TATCGCATTCAAGATGAAAAAGCTAAATTGTCAAACAATTTTCATATTAT GGATGGGAATTTTCGGAGCATTAGCAACAGCAAGACTGACACACAGGTAA CTCATTCTTCAATCGGTAGAACCCAGGTCCCTACAAAGTTTCAATTTATT TATCATCCTGCGGTTAAAAGTgtccttaaaaattaaaatattccgTTGCC GTACACCCGACCGTTACAACCaagctaaaaatgttcttaaaaatatgttc ttatttttgccattttttgagtatttttgttcattttcctatgaaattcg gCGTTCTAGAGTCCACATACTTtagaagccttaaaatgtacttaacttgt tcttaacatttcggtcatcgaagccttatgttcttatagttacagtttgt tcttataaaaaacgcgtaTTGAAGGATTGTGTTCATTTTCTTTAGATATT GTACAGACGGTAGTTTGGAAAGCCTGACGGAGTATTACAGTGTTCGATTA TCGCGCCAAGCAGTATGGTATTATTACTATACATGTTGCAGTACTTCATG GACTGGTGCTTGCAATGGATATTGTCATCAAACACGGTAAAATTCTTTAC GGCTCTCCAAAATGTTTATTTAGTCTAAAAGTTACACTAGGTTCTGGCCG TATTAAGAGTCAAAGagataaaatcttttaaaaaattaggaaaaattcTT ATAGTTAGCCTCTTCACTTAAAggtattgtttttaaataagagtgatatc gtttgcttactcatcaattttataattcacaagctttttcacgttGGATT AACACAGATGTATAAGTAGCAAAATTgtcagaataaaataaaataacata aaataaaataaataaaataaaataacaataggcagacactgtcccggtat gaaatatgtgtctgaaatgaaacgggaacacttatgtgaaattaaaacct ttaaactgGCACACCAGCTGAACTGGAACGATATCATGCAGAAAAAATGA GCCTATGAAGAAAATATACCAAAGGGAGAAATTGAAAAGCCCCTGTTAAA ATTCAATGTTAATCAACaacctctcaccaacttttgctcgtccTTCTGCG CAGCTGCTTTTTTAAGCAAACGCCCACCGCccttatgttcccgccctctg acaaaAACGTTTTTAAGTGACTTAACTTAGGGTTGGAAAGTAGTTGAGTT TTCACAGGAAACTTAAGACTGACGTATAACGTTAAAAGCTTGTGAATGGT CCTACTAGGctaagaatatagcctggaagccattactcccctcccaaatc gaaatatccgtgtaaaaaaagtagaaagtctgaaaatgtcattcttgtcc gaactttaaattttgcaaaaccatgattgtagtataGGTCAGATCTGTCG TGAAGAtgaatcttttcattttttgataatttcagaTATACGTACGACTA TTACTACGGTCAACGTACACGTGCGATATACCGTTTAAGACGATTCTGTT GTCCGGGATATACCCAGTCCGGTACAACGTGTATAGGTAAGTTTCGCAAT GGTTGCTCAGTTTAGTATGTTAGTATTTCCCATCCTTAATTCCTCTGAAA ATCCAATGTTACTccggtaaaaaaaattatcggcAAAAACTAGTCGGCTA AAAATGACGAAAGTTTTTGCTGACGAATTTTTTCCTTCCAATGATATTTT TTACCAACGTATTTTCTACCCACGATGTACTATATCGATtcgaaaaaaac attgattcaATCATCGTCCCTAAGTTAGTGCAGCCATATagtgaagaaat aaaaatttctgtccaactatattcactcaggagatatgagtggcagagca gcatatgcctTTCGTCCTTATTAGCACTGCgtactgcatactgcaccctg gctggTTAGATCGATTTAGCCAACATCTCTAAAACCACAAAATCACTTAT GGTTCAAACTGAGAGAAATAGTTTAAGTAAtaatagtttttgatatttgt aTGAAGGCGATGGGACATGGTCAGCTTGGGGTGCTTGGGGCCTTTGCACT CAGGATGGAATCGATGGTTTTCAGAAGAAGAAACGTGTCAGAACGTGCAC AGGTGGAGCATGTTCACACGGTGaagaagaacaattttccaaagagTGTT CAAATACTTGTAAGTCTATATACGTTTTTTAGtcagaacatccaaaattt ttgaagccttgggatgctcttaattttttgagattaagcctaaaaatatt cttaacatgttcttacatTCAACATttcttgagtatttttgtccatcttC CTAaagaatcgggtgttttagagcccgtaaagccttaaaatattcttaac ttgttctcaatattttggtcatcaaagccttatcttcttatatagtttgt ttttataaaaaaacgtgaattaaatctttaaaaactgCTGGTAAGACTAG caaatacacactttttttataagaaccaataatTTTTGGCTCAGACTAGG CTAACTgttaatcttttgaaattttatggcTTCTTGCGATGCTCTTAAAA CGCTTAgtttttttacttaaaacaaaagatggGTTGAAAATATGTCAAAA TGTGTGTAATTTCTGACATCTGAgtctcagattgttcttaatttgtgcTT AGGTTTCGGCCAATTgcaagcctcgtgttcttataaatattttcgtaaaa aaaaacgtgtatctgctttttttGAGACACAGagacgcgggaatagtgct ggCAAAAAacccttataaaaaaacatcgtTGCGGGAAAGTGATTTGGTTT GTATTCAGCGAATGTAATGAGTGTGTGCTACTAGCGTAAATGTAGCAAAT ACAAGGTTTATTTGTTTATAGACTGATATTGTTAAATCGTTTGATGTACC TTGAAGCCTTGGTTGGTTAATTCTGGATAGGTCGGGAGGAATAAAGaaga attaatatttttttgtctcgAGACACAAAAAGGGTTTTGGTAATTTTTAA GATAATAGAAATAATTGGGATGAGAGGTATAATAATTTGAAGACGATATC AGTGCAAATTCACTTCATTTTAGATCTGGGTACTGGGTTCAGTAGACTTC GTGTAATAATTTAAGGTACAGAGAGGTCAAAATACGATATCAGTGCAAAT TCACTTCATTTTAGATCTGGGTACTGGGTTCAGTCGACTTCGTGATCATC CACAATGTGAGGACGAAACATGTAAACCGAAAACTAAACAAGATGGTACC ATTCTGCTTAACTTGTACAGATTCCGCTTGGCTTCACCACTGCGTTCCTT ACAGATGTACATCTTCTCAAAACAAACCACAAACGGCCATTATGGTATGT GCCATATGTTCTCTATCTTGTTGCAAACTATACCTGTTGTTTTTTCAAGA ACACTTTAGCACTTTTGCTAAAACTAAGTTTTGGAAAggttcttttttat ttgaaaatactaTCTTTACATCCTGCCCTTTAATTTCAAAGTGCCATTTT CGTCACTTTATAAGATTTTCCGCGTTGAAAATACTTTTCTTTATACCTAT GCTTGtacagtttagtctccattacTCGGACCTTACTAACTCTAATGTCT CCTCGGCTCTCTCAGTTGACAATACCGAGATTATGTATgcgtgtttttca gcgacggagacggtaaggttctaatttggctagatcctgaccagctgagg acgacggtaaatcagcacttttaccgtcctcgataatgcgggtcagaact gcgggttattccaaatcgcttcagatactctaccgtcctcaaaagtgcaa atacataaactcgctaatgtctCTTGAACTAGAGCCTCAAGCTCGTGAGT GCTCGAGCTATGGAAACTGTTATTAATTCGAGCAAGTTTTCTGGTCCCCT TAGGCGACCGTatcatgaaggtagagcatccagctacggtgcgcaaggtt gtgggttcaatccccagcctggtcataccaaagattcccaaaatggtact tgatgcatctctgcttgatgctcagcaactaaagagacgggtCATGGATA AATGgtgaaatccagggaaaggagtggcaccttcccctaccttcgggtag acagctatacgaaaagggagccttcgggtcgcgcTCGACTCCGaacgcaa acttacttacttacttaggcAACAATGCCTCGTCAACCAGTCTCCATAGC TCGAAAtccccataactcgaacaaatttgcgttccctGTACATGTTGAGA TATACTGTAGTTTATTTTCTTGTAGACTTCAACTTGGACCCAACCAAACC ATCAACGACCTTCACAGCATTATCCAACCTGGAGTTAGGAACAAGCATCA ACTTTTCACCAATTGTACCCAATGGAGACATGATTCTTAGTAGTTTTAAT ATCCCTGAAACcactttgaaaacaaaatcttaTTACCAATCAACAGATAA TGCTATCCAATATGACATCTTCGCTCAAGTAAGTCTCTAGTTCGTCAAGG ATTCTATATTTTCACTAAATTTTTTAAAGGGTTcatcagatgatttttga tatttgggaTACCTATTATGGTTCAGAGAGACACCTCTAAATCTTTTGAA CCCATTTtcttccaaagctgagatatttgactttgaaatctctaaaaatg agtctttacacagtctttacgttgaatttctattgttttcaagtgaacat ttcaaaattcaaagtcgAATATCTCAGCTTTAGAAAATAATTGAGTCAAG AATcataaaaggtatctctaagccaaatatcaaaatcaatctGATAGTCC ctttaaggttttatttttacataaattgtccacgtttcatatcagacaca ggacagtgtctgcctactgttatattgtgctgatatgtttttcttttcct ctttctgaccaatattGCTCCAGATATgcgtcaattcaatatcaaaaagc ttgtgaattaaaattgataagtaaacaaacgatatcacttttattcaaaa taaaacgtcTTTAAccttcaaaattaaatcaaagtgTGGCGCAACGATGC CAGATACTTCTAAAAAAGGACTTGTTACTAACCTTTCCgggtctgatccc ccttcttggcatcccccctaacttttaaaaatacccatccccaaggattt tggacaaaaatagctaacaaatatatgtgaaatatctttagagagagaaa gcgaaatgataaacttttttcttcttttgactcagactactctatAAACA GAAATCTTtctttcatgaagaccaaatttcacaaaagtgattgaaaataa tctacaatatatatgtaagccccccattctcaaactcccctcaaaatccc cccttccttgctatcccccctttttcatgaaaatttctgacccccttctt CATCTTTTCGGAAGACAAAGAGTGTATAAAACCTTTGTTTCAATACACAC TAAATCACTGGAGCGACGTCACctctactctgtaccagagtgtatctcac gattatcgtagcgtagttcctctacggcaatgaattttgaaattagccgt agatattgggtttgtgtacagacaacgtCACCTCTCGATTAACTTTACGC ATCAGAATAAAGTGTATCAAGTCTTGGATAGCCTTTTTCATATAAGCGAA TTTGTGTATGGTGCTTTTCCTGCGAGGTAGACAGCTAGCTTTTGATTTGC CTAGGATCTGATCAACTGGAGACGGCTGTAAACAAGcaattttaccgtcc tcgattttgcgagTCAAAACTGCGGATTATGATTATTCAAGATTATTTCA GTCACTACACTATCCTCGGTGctgatacataaactcgttatAAGTTTATA GCTtgtgtatttgcacttttgaggactgCGGGGTGACTGAGTGATTGGGT AAAACGAGgatggtaaaagtgctgatttatcgtcgtcctcagtcagtcag gatgtagacaaattagaagcttaccgtctccgtcacagaaaaacacGAGA TACATAAACTCCTACAATTTTTCAGTTAACGGCAAACCCATCAACGGATA CGGACGCTTATTACACTGCAGCTTTCAAGTTGTGGAAAGCTGTCAAGGCG GGCGACGTGCGGTATGTCATTATAcagaagaaaacgaaagtgatgcAAGG AAATCTAGGATCAATCAGCATCAGAGAAAAAAGCAATGAACTTGTCTCTA AGACTTTCAATTACCAAGGGTAGGATTATTCTCGTTTTGTTACCCTATTT ACCATAATGAAGCCAATATTAAGATTTAAATATACCTACAATTAactttc gctaattcgaactcgaaatctttttttgttcgaattacagagatatTCGT ATTATTCATAGTAttatagtatttttagcagGTTTCTCCTTGAGGGGAAC TGGAAAAAAGTTTCGTATAGAtcaaaagattcgaataatagaagttcgaa tgaGCGAGAGTTAACTGCAGATTTTTTATCAACAAAGATTATAGCTCGAT TGAAATAATCAGttattcaaaacagaatttcaCCATATTTTCACGGGCCT TTATATCAAACAATTATCAAAAGTGTCGCAATTATTAACATTCAACCAAT TGAAACTTTAACTGGGATTTTATAACggaaaaaaatagataaatCTTTAA GCATCGGTATAGTTAGAACATATGTTTCACATGTCTCTTAATAGGTCTGT CCTGAACTTCCGACCATACGTGTCGTATGGCGGTGAGGAACGAACATATG ACGTCACATTGACATCTCTTGTACCCAATGTTTACGCAAAATGGACTCCA GAGACGACCAGTATTAACGTCGATTCATATTTCAATAGTTATCCACCATC ATACctcactattgaaaaagatttaaacCATGGGCTGCAAAGAATTTACG TAAGCTAGTTTCAGATATTTGTTTCGCTTAGCGAGGGTCGTTTGGTCACT GGTAAGTCGTAATACCATATCTTGAGAAGCAGTACCGATTTTATGTATGT GTGCTTTTACTGCGATGGAGACGGTTAGGTTTTGATTTGGCTAGATCCTA ACTGACTGAGTACGACGGTACAGcatttttaccgtcctcgattttgtggg TCAGAACTGCTGGTTATCCTAAAACGCTTCAGCCACTCCGCCAtctttaa aagtgaaaatacataaactctCTAGTGAGGCACGGCTGGAAGTTTATCTT ATTCCCAAGTCTGAAAATGGCGacacacaaacatcacttcaaacaaacaa acaaacaaacaaactctacaaacttaaaagaacccaaaTTATAGAACCAT AGATAGTGTTTCCAAATTgtagaatcttttttttaacatttaatGCAAGC TCTAAATACTCAAGAAAAGCAAAGATCCATAATTTGAGAACCATCGTGAA GACTTCTGCAACCACGACCACTTCAAAACTCTTTTATATATTTTAGTTTC CATACATCGATCCTACAGTGAGCGCTCAGTCGTTCTCCACATTTTACCAA GCGAAAAACGATGGAGATTTCATGGTCCACCCACGGTTGGTTCCTTCATT CTCCATCACAGGGTTTATGGATGGACAATACTGTAAAGGAGGACCATGTA CTTCATCCAATGAGGGTGTAGTTTCAACGATTAGAGTGATACAACATTTT GAAACGTATGCAACGCTGAGACAGCCTCAAGGTaacatttaattattttg taaaattgttttgaatattcacttcattttcttcaaatcgCAACAATTAG GCGTCGAAATAATTCTtgatatacaccattgcaatgtcttccacggaccc aacagctgattggttgaaagtgacagattttacgtcacttacaaacaatc agctattgggcccatggaagacattgcaatggtgtatatcGTGAATAGac ctaacagctgattggttgtacgTGACACAAGATTAGACAATACGTCATAT ggaaccaatcagctgttgggccCGTGATGTAAtattagaagacattgcaa tggtgcatatcttTAATAAGTTTGAGCTCTACCTTTTACGGTTGCAATAT GAGTCCAGTTGAAAATGTCAATAAATGTCGAGGTTACTCCCTATGTGAAT ATGATCAAAATAACAAAGATGAGAGACGGTACCGCTCTAGAAATTGAGAG TTGGTCgcttaaatatttgaaatttcttgaaatttcagGCTCATTCCGTA TCAAACAGATGAATAGCGGGCGTTGTTGGGCGAGTGACGAAACAAACCAA AACGTGGTCTTGTCCTCAAAATGTACAGAACTTTTTCGATTCACCAAAGA TTCTGGTTTGGTCCACGAGGCTACTGGAAAGACAGTTTTCGAAGAGAATG GTGCCTTTTCTTTGGAATCCGATAGGTGTGTACCAAAAATTggtcataaa aaataaagcTGACaatctctaattcgattttcaagtgGATTTAGATTTTC GTCGAATaaaggagcgtatcgaataggaAGGtcctttttgagattttttt gtagGTAGTGgctttcaatatcatcgaataGAAAAATGTCATTAGAGAGT GTATAATACTGACAATAATTTAACGACTCAAAACTGAAGGATAAAAAAGC ATAACTAAATTGAACGTTAAAGATATATGGCAATCATCTATCAGAGTTTT ACATAGTCCAAACAAAGATAGGAGAGGTAAAGCTCAGTTCAGTAGTTTTA ATTACAGGTCAGTggatacagttgactctctctaattcgatctttaagag ACAAAGAATtcttttcgaattatagagagtattttacgaGACATTGCCCT TGACGGAAACTGAGAActagttcgagttatagaaagattcgaatattgGA AGTTCAAATTGGCACGAGTTCACTGTATGATAAATCTTAATGTTAACTTT TTAGCTCCAGCACGGCTTTCCATACATCACGCGGGAACGCGATGGTGCGT ACGATTGATACCAAAACAGCAGCCTGTGTGATTGAGACCACAGACAGTAG TAACCAGTTAACAGTTGATACTACAACTTTCGATATTATGAATACAAACA ACACGTGTGATGGTGATGCGAAGAACCTCATTAAGTTACTTCCAGGTAAA GAGCTACTGATTGTTATTTgaataaacattcgaaaaatacTCCCTTCAGA GCTTGTCCAAAATAAGTGTGTACTTATTAACTTCCATGGGGAGACCATCC TTAAAGGAATGAGTATCATTCCACTGAAATAGTTTCATTGAAGACAAGAA AAACCTCCGTTATACATAATGAATCTTATACAAATGGCTCtcatccaaaa aaaaatattttgtcattgTCTACATCTGATTTctagaataaaaaatatta caatcTGGATGTGAATTTCgtattacacatttttttttaagaagcaCGCT TTAAAGAAACataaggctcagaatgcctaaaaactaagaaacatataaga aacatgctgaggctgagaatgagaaaataactttttgtaattcggttttt ttaaagaacttttcaatccagccttccataaggctgattatgtcaaaaag tttagaaacatgtaagaaacatttaaggctcaaaaggccgatttcttaag aaacgtCGAGGCTgtttggtaaaactagtttcttaaaaaaaaaaaaacgt gtattacgtATTATCATAATCCCGTTTTTCTGTTTCAGCATACTCAACAG AGCTTTCAGAAAAGATCAAGCTGAAAAGCATATTACAAGCTAGTGTACCG TCCTTTGGAAATGTCATCATTATTTGCGAATCTACACAAGATCTGTAAGT TGGGACAAAAAGAATAATCAAGCCTATATCGTCTCATCCTCTTTTGTGTA Tgagctaccttatcggccctttttacaccggcccttattggcgttatttt tgggctcgtggcgtaataagggccggtgtaaaaagggccgataaggtaat cagAGTGTATTTACTAACTGATTGAACAGGCATTTTTACCGTCACAATGA TGGATGGAGAATTAAGGCTGATTACAATCAGCAACTTTCTGTTACATTTT CGCAGCAGGAAGGTATCCTTAGTCTTGCTTCCCCATGATACATTGTGCCC GTTAAAAAGCCTACACTAGAGAACCATAATTGTGATTACGAATACTCAAT ATTCGCTTGTTTATTTTCAGTGCGAGGAAGAGCAATTGCAGATATTCAAT CGACAAGGGCGTTCGATGGATAGGTAGggcattaaattttgtttcgtgaa aactttttgtttgaTAGATTGTGACAAATCTGTTAGacaaaaaccgcttt tttattaCGCAGTCAACTGGCTCGATTCTGTTTTCGGTCaaaaaaaaTCT AGCAAATTCAACTCCCAAAAGAAAATCACAAGGCAAAATAACTATCTAAA ACGTTCATCATTTTTCAGCCATCTCACCTTTCATCACCGCGGTGACATAC TACATCCCCTCAGATGGCGTATTTTACGCCCGCTGCAACAAAGCCATGTT TTATTGCACGTGGAACATGTCCACCAAATGGATCGCATACATCGAGAAAA CGACTTTCGAAAGTAAATTATTGGATTTGCAAATCGTTCAACCAGCCGTT ATGGATGAACTGGAGTTACCATTGACCTCACCAACCAATCCGCTAGATGA TCCAAGTATTGGAGGTAATGAATTAACTCATTCATGGCCCCGTAGACGAG CGACCAGGGGCGCAATGCCCTAAATTTGTTTCGAAAACCTGTTTTCATCC AATTAAATAGCGTTTTTATATCTTTAGGAggtgcaaaaagtgaaaaaaaa attcttagaaattataaacaaactatataagagcatagaTTTCGAtagcc aaaaaaaacaaaaacaagtcaAGAACAGGCCCGGCGCCGGAAGcagggag actggggagacttcagcctccccactttagagcaaatgagatttttctct caatttcctagcgaattttatctcatttttaaggctttgtgggctttaaa atacccaatttcttagaaaatgacAACCCTTTAACACAATTTGTCCTCTT TAGCTACCTCCAATGGCGTTTATAACGATTTGTCTGGCACATGGAACAAA TTTTACATTTGGATGAATTAAATCGATGTCATATGTCAGATGGAGAGAAC GAGAAGCTTTAGGTCATTGGATATCAATCGCCTTTAAATTTAATTCAAAG ACAACGAAAAAGTCAATAAAGGGCATTACAGAAACTGTATGGCATTATGT TAAGGAGAATGAGGTTGATGTCAAggccaaaataaaataaattcaaattt acagatAACCGCGTCGGTATTCCTTATTCAGTCAAGAACACCATCAAATA AACCTATCATAAGCTGCTTAGCCTATCATAGGGTaattagactattttat atagtcTAATTAGCCGGGAAAAATgtgcctatgataggctaatttgatgG TGTTCTTGACTGTTATTGTCATTACAGGAAATTCCAACTGCAAATTGccg actttttttttcaaaaaccgaaacgccgatgtcaaaaagggaaaaaccaa catttcgaaaaacCCCTACGCTCTCGTttgattttcaacaaaatatcaTA TAATGGGTTCAGATACGTAGGAGCATAAATATTTGGTGTTACTCAATTTT AAACATTGTTACGAAATTTTATAATATCATCATTGTATATATTTAATAAA CGACTATATGATAAAACTTGTAACATCATATTGAATATATAAtttaaccg tacatcctgtgtccaagttcaggagttgccataaagctattatggtaata accgggagggcacattgctatacattgtatacattgaat
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11482.1.p1MSTRG.11482.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000083_pilongenomesc0000083_pilon:739457..751345 +