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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000088_pilon:907705..915916+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11972 ID=MSTRG.11972|Name=MSTRG.11972|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=8212bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000088_pilon:907705..915916+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTGCATTTCATTTTACTCTTTTGTAGAAGATAtcctttaaaaaataaac
aatcatGCCTGACCATCTTGGTTCTGATCAAAGAAAAGTTAGAAAAGAGG
ATGATAAAGATGAGAAACCTATTCAAGGTATAGTTATGGTTGCTTTAGCT
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TCTttctggattgctccacttacccttgatccttctcttacttgctgagc
atcaagaaaagagacatcaagtaccattttgggaatctttggtatgaccc
gactgggtgttgaacccacaaccttgcgcaccgcagccggatgctctacc
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TCATGCAATTTGATACAACtgcaatgaaaatatttgaaaatgaaaatgga
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gcaatctgactggttaaaaagagtacaaatatatcttgtattttacatgt
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AAGTCCAAGGACTCGCTGAATGTTTTTCACTTAATGATACTGACCTTAAT
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GTCGAAGAAAAACCAGATGTGACGTACGCTGACGTTGGTGGATGTAAAGA
ACAAATCGATAAATTACGTGAAGTCGTTGAAACACCATTATTGCATGTAA
GTGTCTCTCTGTCATGAACCTGTGAAAATGAATTTATCGATTAAATGTAC
TGaaaaaaaGTCCATCGTTGTAGTCTTCTTGATTCAGAATGAATGGAGAT
AATTAGAGTCTATAGAAATAGCTCAATATCCTCTAAAATTTGGttttatt
tctttactttatacTCTTTCCTTTCAGCCTGAACGTTTTGTGAACCTGGG
TATCGATCCCCCTAAAGGTGTTCTGTGTTACGGCCCTCCCGGTACCGGTA
AAACGTTATGTGCAAGAGCTGTTGCCAACAGGAACAGATGCTTGCTTTAT
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ATACACAATATTCATTAATCTGCTTGCTTCAGTTTATTATGCAGTGCTTT
TAGCAGTATGAAATGCTGGTCTGCCACAACACCTTCCCATTTAAAACGGa
cacttttgaattttgttatgcaaaagatgtttttctttcttttttttgat
gGGAGAAATTCATAGTGGGCGTTGAAAGTTTATGGGAATTACTAATGTAA
ATTACCATCcattttttgcctatttttatGTGGAAGATTTATCTTGTGTA
CTTAAACGATCATTAATAAAGTCATAATAACTTGAATTGACTCCTGCTTC
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AAAAAGCTTGCATTATATTCTTTGATGAAATCGATGCTGTGGGAGGTAAG
ATTCTACAATGAAAAATAGTACTAATTCACACATATTTCCTAATTAGTTA
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TATGTTAGAATTGATCAATCAATTGGATGGTTTTGATCCAAGAGGAAACA
TCAAAGTGCTCATGGCCACAAACAGGTAAAacaatatgtaatagttatcg
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ccgtacaatattttccgagcctttaggcgaggaaaatatacggaaaatac
ggaacgagtaaaatatttccatattgtacgagctaatgtctgataactgg
tttatcggtgacccaaaaaatgcactttttgtgttggaataaagcgcagg
gcacttttgtagcaaagtgacgttagattgctgctaccactacaatgcaa
caacatcttttcgtcaatttatatttttacatgtaaaatacaagatatat
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accACTATTAATGTATCCAAGCCCAGTCATCCTCTAGACATTGTTATATT
GCTGTACCGGAGACATTGTCGTTTACATGATTGCTCTTGCAAGTTACTAG
GCTGTCAGCATTTTCGGATTAGTTTTGTTTGTAAAGGGCTGCGAATCAAC
CTCAAAAGTCTTGTCCGCTtagtaattttttcttaaataagTTTTTTGAG
CTGGGAATCGTTACTTACTTAGCAAGCGGGAGCGTTTTTTGGAGTTGGAT
TCGCATCCTTTGTAACAAAACAAATTAAAGAGATGCTCTAAACCCAGCAT
GTTACCTGTTGAGTCGTTTTCAGAAACATTTGTTTTCAATATATCTATTC
TTGTGTTTTAAAGAGTAAAAGAAATTAGTGAAAAAAGCATGTCCCTACCT
GGAACATAGACTCGACACAAATTTCCCGACAATTGTTGTTGCCCTTAGTA
ACGATATCAACTACAAAAAGTGCTGATCTAAGCATTTTACTCAAATACAC
GGGCCGTCTTAAAAgagaaaatactaaaatttcAATATTGGCTGTCATTG
TATAATACAGAATGCTTTGACCGCCATTTATGAGCTTTTTGTTCTGTCAT
GAATTTTATATAAAGTACTTTATTCATGATTATACAATGATTATGAAACA
CGTTGAATAGACTTggatataatttttataaattttaaaagctACTTTAA
GAATTCCATAAAGAAATGCTATGGTATAATGATTGTTCCCCATAAAATGa
gctattgtttaaaaaaaaatttccactttTTAATACAGACATATTATCag
atttatcttttttcttttcttttggaaaaaaatacctTCTGATCTTAATC
TCACGCGCCCTTAATGTACTTTATGCACGTGACCATTGAAACACCATCAG
AAGAAGTGCATTCCACTTCCAAATAAGGAAATACCAGTGAAATGCATACT
CCATCGGTGATGTTCAAATGACTTTTTATCTGACCTGACGATCTAAAGAT
CCAATAAAGATACAATCTTTTTGCAACCCCACTAATAGCTTAATAGCCTC
TTTCTCACCCAATATTAGGTTTGATAAATTTAGAAACCTTTCTCCCATAA
GCTGTTTATACGTGTTTTGAACCCATTGTTCAACTATTGTTTTTTGTTAT
TTCAGACCAGACACATTGGATCCCGCTTTAACGCGTCCTGGACGTCTAGA
TAGAAAAGTCGAATTCTCTCTACCCGACTTAGAGGTCAGCAAAAGTAATT
TATTCTCCGTCCACGCACACACGTTTTCCAACATTTTctgaaattaactt
ttttattcgtTTGAGGATTACGTTTGATCAAATGAACCAATTTTGATAAA
TGACGCatcaaaattttagtttatctttttcttttgcaaTGGACCTCTTC
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ATTTACGGAGGGGTAAAATAATTCGTTATCATATAATTCGAACAAAGTGT
TTCGTCTCCTTCGAACCCCCTTAGATTCAAAGTATCATGGAATTCAAAGA
GACTTACTCGTCCTCTGGACAGTCGAACGAAATGAGTTTTAAAACACTAT
CACTACGGAAGCATTTCGAGTCCGAGGTGTTGCGAGCTAGTCGTGGCATG
ACTTTAAGCTCATTTTCGAGGATTTTTGGACTATTGAAACTAAGGCTGCT
GGACCTACATATCCATTATCTCATGCCAAACTGAAGAGTTATCATCCTAT
GTTATTCTGTTTTTAGGGTCGTGCACACATTTTCAAAATCCACGCACGTT
CGATGAGTGTTGACCGTGATATTCGATACGAATTATTGGCTCGTCTATGT
CCTAACAGTACAGGTAAAAACTCTTAACCATTATTAGTTTCGACCCCAGG
TCCCGTCAAATTCATATATCTCTCTGAAGATTTTTCCTCTTAATTGTCCA
AAAACTACCAACCTTGGCAGAGTGGAGATTATTGTAAATTGATTGTTTTT
AATTAAAGCTGAGATTGCAATTGACCTAAGTCACTGTTTTGTTTATTAGC
GAAAAATTAGCAAATGTAAACTCGGACCTAGCCCTTTTTGTCGTACAGGT
TGGATTTTATCGCTGTATAACAGCTCTTTCACGAACCCTTGGTTTCTAAG
CCTCATTTTTAAAAGACCTCTTTTCGTAAGCTGGCATTCACCATTTTACT
AAACAACTTCTAAATGATTCTTCTTTGTGCTGACAGGTGCTGAGATTCGA
AGTGTTTGTACAGAGGCTGGTATGTTCGCTATCCGTGAACGAAGGAAGGT
ATGTGAAGTTTATATCTCGCCAGTTTCATCTATATTATGCACAAGAATGT
TTCCTATATGTCTCTCTTATGTTAGTCATAAGAACTGTGTTGTTAGAGTT
TTAAATACCAGCTATACCTAACCAAGATGTTTAGTATTAAGATTTTAAAG
AACGGCATGTGTGTTTCTAAGGCAGGAAACATGGTATTagtgattttcaa
aagtttggcAAAGTAGCAAATAAGGTCAGTAAGACAGAATGCTGGTTTTC
AATTCCTAAATGATGAGGCATATGTATTATTAAAAGTTATTATGTCTTGC
TGAGCTTTAATGCTTaaaattcttaacattttatttgaacttttaatctc
tgcattttattttattcaaactAAAATGGTATCTTCACGTTGTTCTATAG
AGATTATCGTTTAATACCTTTTTATACTGTCAGAAAGAAAAAGCATGAAC
CCTTTTGCTGTTAGAAAACTCGCAGTATTAAAAACAGCTATCAGCTTTTC
TAAATACATGCATCACTTTgttagaaaaaatttgattatatAACGACATT
TTCCTGTGACATCAATCCATAGATATTTGACTACCTTTCGCATACCCTGT
CAGTATAATACTAAGGATTGGATGAACGAAAGAAATACCCTGTTAAATTA
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TTTGTACCATCTATCTTAACGCCATGTATGCCGGTATTTCTACCTGAGGA
CTGTAACCTGTTAATAACGAACCTAGTCTATAACCCATGAAATAATCTGC
GAAGATTGTAGGCGCAAAAGTCACTAAGCACTAATATAGACCCGAAGCAA
TGCAGTTAGACGAAAAAGGGTGGATAAGCAAGTATATAAGCTTAACAGAT
AATCACCACACGAGTTTTACTTGAGTGTGCACTTTCAATAGAAGAGGGAT
TAATTTTCATGGCAGTTAGATAGGTATGTATGAAAGACATTTATCAGTAA
GAGCCAGTCTCTTCCCATTATTGAAAACGTGTTCCGTTTGTGATTATTAT
ATTGAAAATACGACTTCATCAAAATTGTGAAATGATAGACGTACATACTA
GTAGTGGTGCaattctttttaataaattttcatgTCTAGCTGTTCTGCTT
TAATTTGCTGCATAAGCAATTTCTGTGTTAGCCAATGAGCATGAAGTTGG
ATTTTAGCTGACCTTgcattttctttccttttcatttctttttaggTTGC
AACGGAGAAGGATTTCTTAAGCGCTATCCAAAAGGTCATCAAGGCGTACG
CTAAGTTCAGTGCCACACCCAAATACATGACGTATAATTAGATAGTGTTT
AAATTGAAACAAGTATTTGCTTATACTTTATAAAAGGTAgtgtttttatt
tctatttttaaccattgtcttttatttattgtaaaattttttagttcaat
ctacTCATTAACCTTtgttaaaaatagaaatatacgatgcaatttttcaa
taaattactATTTATATTCTTCTCTTACCAAGTAAACTACCCAGTGATAA
TTTGTTACGATA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000088_pilon | genome | sc0000088_pilon:907705..915916 + |
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