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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000079_pilon:554724..567650+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11080 ID=MSTRG.11080|Name=MSTRG.11080|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=12927bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:554724..567650+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttcattttcagatatactACAGTacaataaatagaaaaaaatgtcaagCT
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ttgaaaaagaagaagaaagaagaaaatgaaaaagcagaagtggcggtaaa
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GTAGTCTTTTGCGTAGATCGCTAGGGCAAGCTGGTAATCTCACATCATCC
ACAATAGATAAAAAGTCTTCTATTTCAGGTTATCCACCAAACGGTCTCTT
GAATTTCTAAATAGCTCTATAATGCCCTTCGAATGCCACGACTTTGTGAT
TGTTTGATGAATCGCGACTCGAATCAAAATCCGGCATCTCTATACTACTG
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ATTTCATTTCAATCTTTATTGAACTCATCAGCTGGTTGGAGAGGTCGCCA
GCAACAAATCATGGCGTTGcaacaaaaagtaaaatagTTTGTTAAATCAG
GGGTCACTTTCATTCTTCTGGAAAAATGAATGCGGTAAAAAAGATACGAC
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ttttgagaaaaacgcAAATAAAGGTTTTCAGAGCTAAAAAACCTTATCAA
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GAGTATAGCTGTGCCCATGTGATGTATTACATCTTTAAACAACTCATTAC
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GCAACTGCCACAACACGAACGTGGAAAGAGTGGTTCTACGTCACGCTCCA
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CGCAAAATGGAATTGGAACGAAAAGAACAAGCTGatgtaaatttgttttt
ttaaaccaTTTCAAACGGTGATGCACTAGGTCAATAACGTCTCTGAGGGT
TGCCTCTGCTCTGTAGAAAAGCGTCTAGATATTGGAGCCGAGAAAGTTTA
ACGATAATATCTCTATCAAAGTTCATTTTTATGTGACGAGTAGTTTTTAT
TATTTCAGCCTAAATGGCAGAAAGTTTTTCGTTAGAGGGTGAGCAGAAGC
CTTTTCGGCTATTTATTAGATCTGTATTAATCCGGAATAGAGCATggaaa
ttttgttgttgtttttttcagggTTATTTTCAACAATGTAAACTACTTTT
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tttcgtttttattttttcatctttctgtTTCATTAAAACGTTCTATCTTT
GATTTTCCAGAAATTACAGAAGGAACTGGAAGCGACTGTTCAAGAACGCA
ATTCCTTGAAAGAGAAGAACAATGCTACTAGAGCtagaatcaaaattttg
tcacaAGACAACAAGAATTTGAAAGAACAAATGTCGACACTGATAGAGAA
AGGGAAACATGATGATGAACTTGTCAGTGCTCTTCTGGTAcgatgttttg
tttttctttaaatgacAAACGTCGCAccatttccttgtttttcagCCACC
TCTAGCGGAACGGGGTCTGAGGGTCGGGAAGACGTGTTTgtataagaaaa
tatatacaagTTAAAGAGGTCGAACTATCGaaaaaaaCTTGAACCGAACA
CATTGTAGAAATGTTTGTTAAGAAGATTTATCTTACAATCTCAATGAAAT
GTTACTGTTtacaaaagttttaattttttctctacAAATCTTATGGTAAA
ACATTTATTTGAATGCCACCGCTTATCctctttttttagaaagaacaacA
GATCCTAAAAGCAGACAAcgagaaattgaagaaatcaaaacaacaagaGA
ACTCACAAAAAGGCGAACGTGTTTTGAGAGCGTCCGGCAATTTCGCTTTC
GAAGAAAAAGAACAACATCATCAATCATTGGTCGATAAACTTAAAGAAGA
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aaatcaaaacagcAAGACGATCGCAGAGCCATATCCCCCGGCCACCTGGG
TCAGCTGCGGGCCGTAGAAACGACCCTAGAAGACCCTACAGTGGCAGCAG
GTAGGTTTAGAATTGGATCATATCTCCCACGCTTTGATTtcgtgttttga
ttttttttcagcagGTCCTTTACCATAAAGTTTACTTAATCTTGGCTAAC
CAAGATAGCCCTCGACTAAATGCATGTTACTTTATTTGTGAAAAAAGCAA
TTACATGGTTATCATTTCAGCGTTCCATCAACAGACACTATCGATCAACA
GCTTCAAGAATTTAAATCTTTAAACCAAGCAGCTGGCGTGGAAGTTGAGA
GGTTGAATGGATTGGTCAAACTACTACAAGATAGGTAAAAGTCTTGAATA
CAAAACTTTGGATCAATACTTCAACTTGTCACATAAGTAAATCAGATTAA
TTGGCCAAGGGGACCCAAAATAACTCTTTTCTTTATATTTAGATGAAACA
AAACAGAATTCTGATAATTCTGAAAGGATTTATTTTTCACACTTCACGTT
GAATATCTGCTTACTGTTTGTCTGCTCgcccatgaacatataaacgactg
gacatccatctcctttgtatttttgtagaaagcacGGCTAGCTTCGTAAT
AAATCTTAAtgatatacctcttgggaatactttgctaacaacgtcaaaat
ttcgacaaaagtctctgttgttctactttaAAATACAGACGGCAACGAAG
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CGCCTAGAAACTTGTAACTGTCGGGGAGCCTTGGGACAAGTTTTACACAT
ACAGTTTTGAATAGGCCTCTGACTTGTATCTGAAAGCTTACAATACGCTT
TTGAGTTTGGGAATTTTTCTCTTTAGAAACGGTGAACTTGTGAAGGACTC
GTTAGAGAAAACGATACAAATCAATGAACGAAAACATCAGAATGCTCAAC
TCGagaaagaattggaaaaaaCGTTACTCAGCCAACGAAACAATAAAAAA
GCCAGCCTTTCACCGAGGAAAACCGATCCTGCTAAAGACCTGCTAGAAAT
GGAAACGAAGTAAGACTGTCAATTTTTCAcctctgtctcagtgacccagt
gGGTACGCCACAGAGGATTCAAATGTAATGAAAAGTCTCTAGCTTTCATC
GGGTGGGAATTTCAAAGTATAATTCTTATAGCGCaaaaaaaGCTTTGGGA
TCCTCTTAGGATTTTTGAGTCCTGTTAACATTTCTAATTTAAGGGTTGGA
CGATTTTTCAAGATTGTAGGAGAATCTACAGGCTCTTTTTAACACAGGGC
TGTTTTTGAAGTCTGTTGAAAGGATTTAGTATGTTGAACATTGTTTGTAG
TTCCATTCTTTAAGGGGTAAATTTTCGTCATGTTTGTCGAAACCCTGTGA
GTTCAAGAATCTGACTTATTTTTCTTGATCGatagatcttttcataaatt
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TTAAAAGAAGCGTTGAACGCAGCGTTGGAATCAAAAGAAGaagatttgaa
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AACgtcattgattgattgatttcatCAGCTGGTAAAACGAACTTTTATAC
AGTATGTACAGGAAAAACAAAACGGCATTTTAtaaattgcattgaaaata
cTTGATTAGGGTACTTTATTTATATAGGATACTGTAGTAGATTTTCGGTG
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atttttaccaagatattaattttcagttttatcatattttttctaaaaat
taattttactgCTAAAGAGGTTGAATGggttatgttttagattttgtatc
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ATCGTCAATACTATAGAAAACTAATTTATGAAATAATCAAATATCACGTT
ATTagaattttatttgtaaatatctttttatcatCAGTGTACAAATTTTG
TAAGtgattaatttaaaaaaaaaatgtaaattatcaaaatttttaaatct
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TTCGCGGGACACGCATTCccctagcctatactagacgtcacccgcgttta
cgcaattaacgtttattccactttgcgactttttcgaatgttttgagctt
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GCATTTGACGTCATCACGGAAAGTGCGATGAACCAATAGGATGGTCAGAA
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CTGTGCGGTATTTAGCCCAAATCATATCTGGCTTCTTACCCCAGATCAGA
CATTTACCTCCAGTCTCACGGAACACCTGGCGTTGATAATCAGCTTGGTA
ATTGATGAAGATTGACGCAGCTCCGGCAACAATGAAGAAGGCGGTCAACT
CAATACCAAGTTTCACTGGATGCGCAACCATGTACAAACTACATAATGTG
TAAAAACCAGGTACGTAGACAAGACACCCCCAACAGATGTAGAAACCAGC
TCGATCAACAGAGATATCCATGGTACGCATGTAGCCTCCTTCCCACCAGA
AGAACTTTGTCAAATAGATCATCTGCAATAACCAGCATACGAACATACTG
TCAACAAAACCGTACAGTTCGTAACTCTTCAGAAAACAAATGCTAATAAC
CAACGCCCAAATGGTTAGACCAAATCTGCAATTAGTGAATACTTTGATGT
CAATACCGAAGACGCGTGGATAGAGTTCAGTACCCCAGTAATAATCAAAG
ATGAAGTTTCCACTAGATCCGTTATCAGATGTCGAGGGCGCCAACCACCC
TTTCAGATACAACAATACACAAATGAATAAACTGTACAAACTCAACCACG
CCAATACTTCTCCGTAATGATCAAACACGATAGTTGGCGTCATTCCGTAC
TTCGTCTTCATGACGTACGTTAATCCACCAAACGCTACCATGGTGATGAC
GTAGCACGAAAACCCGTTATCCTTGTACACTGGTGTGTTCCCTTTGGCTG
TCAGAGGGCCTTCTAGTCGTGGGCCAGGAACGATAACTTGCAAAAGACCA
GCCCATAAGCTGTACCCGAGAATGAAGACATGTGCTTTAGATTCCCACGA
GAATGCTGGGCGCCACATTGCCAACAAAAATTCTTTCGGTTGCACAGTTA
GGATTTTATCATAAAATTGCATAAAGCTTCCATCACACTGACTCACGATA
TACCATAAAACGAGCACGAAGTTTGGCATGATGGATATCAGCAGCAAGGG
TACAATGGTGTACGAGAAAAAACGCTTCAAAAATTCCAGCACcatctttg
actttttttttttcctgAaaGAGATAGATAAAGAAAGAatAaaccagctg
cgctggaaGgtcagcctaaattgcttaatatgattagaaagatatgttgt
taaaaattgatatgaaatactaaaacgagagtaaaaaaataatcaaattt
acgtttgtatacaatatggattaacgaaaatatgccatgttacaatctgt
gtgacagaataattattcgtctcttaa
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000079_pilon | genome | sc0000079_pilon:554724..567650 + |
|
