MSTRG.10958 (gene) -

Overview
NameMSTRG.10958
Unique NameMSTRG.10958
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000078_pilon:120617..126500+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10958 ID=MSTRG.10958|Name=MSTRG.10958|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=5884bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:120617..126500+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGAATCGCAGTTTACAAATTCTTGTAAACTTGGATCTAAAAGCGTGTTT TCAAAGGGCTTTTTGGTATTTATTGTACATTATACTTTGGTGTTGAAATT TGTCTTGTTAAGAAAGTgcaaaacttttcgaaaaaagatttaattttgac aaatatgGTAGCTTTAGCTGTGTTATTTATAGTTTTGTTGCCGAGCATTA TGGCTCACTCCTGGATGTCGTGTCCACCGTAAGTATTTTTTGCACACCAC CTGTCTAAACCAGTTTCGCATTTGAGCTTGATTCCTTTGGCTGCCATTAT TTCAATTCGCAACCTGATTCCGATATTTTGACTCACTGGAATGATAGATC AGGCAGGGGGTGTTTATACCTGTGGATAgatctatgaaaaaaaatttcaa ctatAACTGGACTTGCTTTGCTTTATGCCATATCATATACTTGCATTTGA AGTTTATACTTCTCATTCTTAAACAatcttttaaaggttttcacGGGGTC TACACTCAGCTGAAGCAGCTATCTATGAACTTAGTGGGACATAGGAAGCA ATGGGGCTCGGTACCGGGAACCCATGGTTTTAACTGGCACTTAGAACACT TGATCGAAGCTGCTCTTTATTATTCGCAAATTAATAAATCTTCAAATTAA CTTATtcataatgggcttttccaaaggaatcgtgcaccccctgttgaaga ggtccatttccgttccaagggggtaaggtttgaattGCAGTAGAATTCCA TAAGGTTAGaagaaaatccgtcaaaaataagcggaattccaaggggataa tgattgaaaatttgtaaaaattcgaaattccagaggggtatgatcctata attgcctggaattccaagggggtaggtcacaaaaggttggacctcctcaa cagggggtgcacggtttttttctggaaaagcccaatcaaaGAATGAACTC CCGTAATACAGGACCGGATCTAAGAGGAtccaaaatttacaaaagagAGT CTCCATTTCCTTATAAGGATTTATTTTACACTTTGTCATGAATTTTGAGC CATCCTCCTTTCTTAGACCCATCACTCAAACATCCAAgggttttaaattt tcgagttttcTAAAATTCAACTTCACTCAATCCATTCAACAGGTCATTCA ATCCATCGATTGGACGTGGTGGCATCATTGGTGCCGTCTGTGAAGCTGAA TGGGGAACCAGTAAGCATATTTTAATCTAGAAGCCGGTGAATTATGACTG AGTCCCTCAGGGCAATTGATTTGAAACGCCCCAAAATAAGACCTTCAAAA TGGAACACTTGCAGTGCAGAGAAGAATTAGCCAaaattgagtaaatttgg gtgaaaaatcGACCCATACGCTGtattttcttggaaatttttgtAGCAAA AATGCTAACACTTCGTTTTACTTCAATATTCTTAAAGTGAACTTTCTCTC ATTTCAACCATTATAGTGTACTTTGCGATGCCTGTAAAACGCAACAATTA TAGATTTTCTTAACCTAATTCATTTAATAGCTCCGGTGACAGAGGTCGAA GCTGGTGATCGATTGAAAGTCGGATGGGTTTCCAACAACCACGGTGGTGG TTACGCAAGAATCTCTTTAGTACCATGGGGCCAAAGGAAAAGTGCACAAG CCTACAAAGATAACGTGATGAAATTTGCTTGTTATGGACATGACGAAAGA CCAGGCAAATTTCAATACGGAGATTGTAAACATCCATGTAATGGAAGACC TGGCTGTGAATACCAAGCTGGTAGGCTCTAGTTACACTTCTAACTGGTAT AAGTCCCGGAAGGGATCAGTTAGACAGATTTGGTATTGGAACAGGCCACT GGTCagatcatagtataagaaagccgtgGCTTTCTTATACCATGGTCAAA TTAACTCtgttaggctctgaagatatctggaaGGAtcccaaatttaattt ttaagatgtgtatctgacagggtcgatttTTTAGTTATTTTCGAACAATT TTCAGGGTAAAATTTACCAagcattcatatctgacagggatCACTTTTCA AAATCCAGTGGCACGTCTGCCGTCAAGGACAGTGCCCCCTCTGGGATAAC GTTCTTCATAATTTTGGTGAACCTCGAATTAAAGTCACGGTGTGCCTGTC GGGTTTTCTCTTCTATCCATTTTCAGTCTGAAATTGATACCCCAAACAAA CTACTTGTCTTATACAAAAGATGGAATTCATTAATTCATTGATTTTCAGA AACCATTCAAAAAGCCCCAGAATATACCTCCGAATGATTTAGATTAGCTA TAAAGTTGAAGAAATACATTAAGCAGAAGCAAGAATCTAATTCGAAAATC CCTTAGCTATTGCCTtaaccaaagatttattatacactggataaacgact cataaaacgatggagagcgaccattgtattttcattgtttcagaaaacaa ttgatgttctagctttgtccgcaaaggacaactgtcatggcggctcgaat atgtctgatttttaaaaatgtttatcagtcttatttttaaaaagttctct agctctttttctttgtacatttgcagaacaaaaagtttgaaagtaaggct agcattccgagctggatacatttgtgaaatataatgtgagaaaaacatca ctagacaagaaattcagacaaagtgcttatagtgacacgaaattttcaat tggaaatatctttccaagactgtccccagaagagctgaaattaacataca taagacttgagtgtcttggctcctctgtggtatgaaaatcctttggaggc acgtggtggcaaagtggtttttttgaggttgaagtttgaaaatttccggt gtcaacatttaagtttcttttacacaacacgtcttttgcatctttctcac agcttgaaacgtcataacggcttataattagcaattaagtgaaagaatct gactctcacatgAAGGTTTTAAGTCTCTCTTGGGAATTGGATGaatgatt ttcgataagaaatgcaataaaaatgcttcgaaaaatcatttattgaggga aggagagtgaacaataatatcattactgcggacatagctagtacacgaga aatcggcaaaaatctgttacttgtatatccagtgtataataaatccttgc cttaactttttgaagaagaaaaacccAATGAAATTACAAAACAACATAAA GATTTTTCCTACTATAAACATTGCATTGCATAAGTTTCACTAATCCAATA TtagcaagaaaaagaaaaaggattGTGAAATCGATAAGCTAAGCTTGatt atctttttatcaaaacttAATGCCTGAGCTCAACATATTAAGCAAGAAGC CATCTATGACGTACGGAATCTAtgcacagatctgtaaagcccgaagggct agatttgcggcttgtatcgaaaagtgaagcctatgtttggaaggatttcc taccaaagtcacgtgactaaaaaatgcaatttcaccggtttgagagatgt gaaatagagtttgccgcctactttttttgatctcgcgctccgaaaacaat taaaatgctagatcctatccatcggcacgaaatttaaaaagtcaaatttt tgcttcacttttttttgctggagaaagcttaaagttgcctatctagtcct tcgggttttacagatatctgtgaatCTATGTCGTGAGTTTTTCGCAAGCT AGCGCCCAAATCTCAAGGCTAACTCTGTCTCGTGAAATTTGACCTGTATG CTGTAGCTTGGGGAGCGGATCTATACCGCGAAATTCTCCAATCTCACGTA ATAGAAATTGATAAGCATGattaatatgaaaaaaaaacaagcatggaatc aaatactaaaatggctaattgaccaaatttgaccaaaattctaTCATCCC CTTTTATTTTGATGAAGTCTTCCTTTGAACAGTTTTATAACATAGCGGAA CATCTTCTTGCCCTTAGAGCATTTTGAATTTAGGTCACATGGGTTTGAAA AAAGGGAGACAATTAATCATATCACTCTGAATGGTCACTTTCTACTAACT GAGACCACGTTACACTCTACGGtaccgtttcgctccgaaaggaaatgaag ccattatattggttaaattcaagttttacgtcacttctaaccaatagtaT GGCTTCATTTCATTTCGGAGGAAAGCGGAACCGTTACGTGTGAACATCTG ATAAACACGTATTTTAAACCTTACGTAATACACACGTAACATCAATTATA TCTTACGCTTTTTCTAACAGACCCAGAAGATGTTGAGCGTTTCGACACCA CTATTGGGATTCCAACCAACCTTGCTGATGGTTATTATTCACTCCAAGTC TCAATGTTGGTTGGTAATGGTGGTGTCTATAACAGCTGTGGTAAAATAAA GGTCACCGGTGGAAACCCTTCTTACAACTGTTGGTCAAGTAACAGACCAG TGACTAATAAATGTTTAAGATCTGGTGGACCAGCAAGATCAGTTATCGAA TCAGGTTGGTGTAATTATTTTCCACATGCTTATTATCATGAGAGCAACAC TTTAGAAAAACATAAGAAAgcctacccagctggcacacaacgttgtttca acgtttatctaacgttcacaaggtctatatataacgttagatgaacgtta aaacaacgttgtgtgccagctgggtaagcgGTGTGAAAAAGGCCCAGCAA TGTTTTGTCAGTTTTGTCATATTTTCGAAGCAGAGTTTCCATTTTAACTT CGTTTTCAACTTGAGTACCCAAGAATTGACATTTCGCTGCGCGCCTTTTT CTCCTTAATATTACATGAAATCCAAAACatctattttttttgttttattt cttatGGTTGTAATATAAAAATAGCTTCTCACATAAATATTTTCTACTTT TAGGAACGAAACGTGGCGATTTTTGTTACGGTCTTGATGGCTCCATTGGA ACCGTCGATGATAACATTTCAGACGTCCCCATCAATGTGGAATGTGACCC CCGTGTTGCGTGCAGCCAATCAACAAACACTGCTCTATGTTACCGTGATT TCCCTTCAATGGCTAAAATCATGGTGagatattttttcgatttttcgatt ttttgataaAGGATAAAGGAAATTCTAATTTGGTTTTTATATATTATGAC CCTAATACCCATGTGTCACAAACCCGATAGAACCCCGCAGCTTAACTGGA AAATTGGGCCAAAATTTCATCCACGTTTGGAAAAAGTACCctataatttc agccccactgggaaattgactttgattttatcctcatTTGAAGTTCTATG TGCAAAATATTGCACATCCAAAACCATCGCCATTGGATATTTTAAagctt cccagctggcacacaacgttgttttaacgttaatctaacgttatatggac gttgtgaacgttagataaacgttgacacaacgttgcgtgccagctgggtt tggAACAATATTGTTTCTATCCCAATTGTGTGATCTCGATATGATTATTA TTCTATAGGTGTaggaaaaggttccaccgggatTCTGAGACTGGGGTGTC CTAATGTTTGAAATTATCTTTATTTTATAGACTGCCTCAAGAAATCCCCG TCAACCAAATTGTAGATCCTACAACACATTACCCGTCATctccaaataaa aatgaaaataacgaTGGTGGAcgtaatatttatttatttaaatttaaaat tttgaaactgttGTAGTTAAGTATCTTCTTTACCATAAACTATGGAAGGA TAATCTGTAATCTGTTTGCAACCTAAAAActtatttatttcttgacatTA AAATTTTCGGATATTGTAAGTACGGGAGTTTgcactttgaaaaatatgaa catAATTCACATGATACAAGCtaaccaatcagat
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10958.1.p1MSTRG.10958.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:120617..126500 +