XLOC_045617 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045617
Unique NameXLOC_045617
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000388_pilon:40906..53490-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045617 ID=XLOC_045617|Name=XLOC_045617|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12585bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000388_pilon:40906..53490- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TAACTAAAATACGGTGGCCCCTAAGGCTCACAACATACTTCCAGTTCTGA CACAAATCCATTTTGCAAATTTATAAGAACTGAAAGTGTCTTGTGAGCCT TAGGGGCCACCGTAATGAAAAAAACTTTTTTGCTCCTGTATCTACTCATT GAATTACTGTTTATGAAACCAGTGTACAGATTTTTTTATGATATCCGCAA TTTTCTTCTATTTACAGTTGCGCAAAACAGGATCTCAGCTTATTGGTTTG AAGGGAAGGAATTGGCATTTGCATTTGGAGCAACTCTTTCATTCTCCAGA CTGGCAAGTTAATCAAACTTCTTCAAAGATCAAGAAAATTGACTTTACCC AAATACACTAAAATTCGATGACCATGATGATACTGCTGGACAGAAAATAA GGACTTTGTCCCCTGTTTCTCTCTATGATAGCTTTCTAATACCTTTAGAG AACTAATTTTAGCGGGAACTAATTTTTGCGTTGAAAAAAAATTGAATCTT TTAGTGAAAAATGGCCAAATTTGTAATTTGCAGGTTCTAATTTTCACGAT TTTGCAAAAAAACCAAGAGAAAAGCCTTAATCAGCTCCCACGAAAATTAG TTCCTTTAAGGTTAAGATTGTCTATGAGGTCCCTACTTATGTTATATGAT ACCCAGTCAAAATAGCCATATTTAACTTGATTTAACATTCCGCTGACATG ACCTTAATGTAAACTGTTTTGCATTTCTGTTTTATAGGGAAGCATATTAA ACTTTTTCTTGACTAAAGACTTTTCACAGACCTATGGATTGAAATGGACA CTCTGGGGAGGTAAAGATACTTTTAGGAAAGTTTTTAATCTTGACAAATA ATTGATATTTTGTTACAACGGTTATCCTTTTACACCATTACATTTCTTTT GAAAGTTTTTCCCTTATATCTAAACTATCTTTTCAGGTGTATTTCTGTGC 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TTTCGGATTTCGTTGCATTACAACTTTATGAGCATTTTCATTCATATGCT TTTTAGAAAGTTGGTGATATTCGACATTTGAGTTTGCAATTCGTTCTATT GGCAGTCACCACAATGAGTTTCTACAACACTGTCTTCCCTTTTGTGGCTG ACGCAAGGTATCATCAAAATTTCATTATACGGCAACTAATGGGGTCGGTT AAGGCTAAGTAGAAAAATTCAAGAAAAGCGGCACAATATCTTTCTTTTGG TATACAGCTAAGGAATATGCCAGTTCTTCGGGTTGCCCTTTTCTTTGTCC AAGTAATAAAGTTTTTGATCTGTAGAGGTGATTTTGGTATACAGCTAAGG AAAACACCTGGTCACCTTTTTTTTTGTCTAAATAATAAAGTCTTTCAAAC TTCATATGCATATAGGTACAAAAAGTTTAGGTACTTTTTTCTAACCCATA CAATAGATGACTGTAGAATCTCAACTGAATCTTGAACTCCTTTTACTTTA TTGTATTGAAAGTTACAGCCCCTGCAAGTGTTAAAGAAGATTTTGAGAAA CTTAACTTTTAAGAAAGATATAGAGGTTTTTCATGTTTTTTATCAGTTAC GTAACTTCCGTAACGTTCGATTCGCGTAGGGATCACCTCTAAAGATTCGA ACGTTACCTTCCATAATGGCGTTATATAAAGCAAAACATGCAAAACTTTT ATACGTGTTTTTTTGTTTTTGTTTATACAGTCAGTTCATACGTGAGAAAT ACCACTATAGTGATGACAGTGAGATGCCATCTTATTATGCGGGAAGTGTT TACGATGTATCTTTGGTTGCCACTCCTATCCTCGGTATCATTGTGGTGAG TCGAGTCTAAACTTTTTTTAAAGGGGTAATCGTCGGTTAAACAATGAAAT TCAACTGAAAAAATTCTTTCATGGAGAAAAAGTAAGATAATGACCCTTAG AAAAATTCACAATAGAATCAACATTTTCTTGTGATACATGAAACATTTTT TCATCATTTATACTAGCCTTACGATATTCATCTATAACTTAAAACTGTTC TTTTAGTTTTGTGCAGTTTAAAAGGTCAAGAATATTATTCGGCCTAGTGA CTTTATTTTTCTACGTAGAGATGTAATGTTTCACAAAGGTTTTTTTCAAA TACCCAGGCAATTTCAATATTCCATTTCAATTGACCCCTTATGTTAGTAT GATCTGATTGGATCTGATTGAATTCAATCACTGACCTTTATATATCCCTG GACCAAGTCCCTCAATGCCAGCCAGGCAAAATATTATGATCAGAGTTTTT TTGAAATTGATACCCGCGGAGAGAGCGCTAGATCTTGTTTCGCTTGTACA CTAATGATATAGCCCCATTTGTCGTTAGGCAAAGTCTCAAACACTACAAT GGCTTCTTCGTGGGTACCACTTTCAAAAAAACTTCGATCAAAGATGGCGG ATGTAGCTTGGTCCAGCGAGATCAATTTGATTGAAATCATTGAAAACACT CTTCACAATCTGACACTGAAAGTATCATAAAATTCTTTCATTTCAGGATT ATTTGGGTTATCGAGGCCTCTTAGCCTTTGTATGCGCCATCTTCACCATT CCAGTGTATTTGATTCTTGCTTTCACTACCTGGCATCCGTTGTATGGAAC CGTCCTCTTGGGACTCACCTATTCTGCTGCTGCTGTAAGTTCAACCCATT TAGCCAAGGCATCACATGCTAAGGTCGGTCTCCATAAGTGGCTGCCTACC ACCACTTCTTTTCAATCTAAGCTTTTGCTTAGATGTCAGTGGCCCGATTT TGGTGTATATTTTTTTGCATTTTTGCCGGTGTTGAACTCTTTTTAGCGAA GAAAACGCTCGAAGTCCAAAAGGACCGACGACGGCAAGCTTTTTCATAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000388_pilon:40906..53490-

>XLOC_045617 ID=XLOC_045617|Name=XLOC_045617|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3066bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000388_pilon:40906..53490- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTTTTGCAAGACAGTTTTACTGGGACTTATGGAATCAATTGCACAACAAA
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ATTTTTGACGGGGCGTCTTTTATTTGGTTGGTGCAGTGTTCTTCTCAGCC
CTTTGTGTTGTTGGTTCTGCTATCTTTGCATCTGGATATTTCTTGAAAGG
GCGTGGATCAATGCTTGTCTTATTTTTGACGGGGCGTCTTTTATTTGGGG
CTGGAAATGGCTCATTAACAAGGCTGGAAATGGCTCATTAACAATTGCGC
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TTTGGAGCAACTCTTTCATTCTCCAGACTGTTGCGCAAAACAGGATCTCA
GCTTATTGGTTTGAAGGGAAGGAATTGGCATTTGCATTTGGAGCAACTCT
TTCATTCTCCAGACTGGGAAGCATATTAAACTTTTTCTTGACTAAAGACT
TTTCACAGACCTATGGATTGAAATGGACACTCTGGGGAGGGAAGCATATT
AAACTTTTTCTTGACTAAAGACTTTTCACAGACCTATGGATTGAAATGGA
CACTCTGGGGAGGTGTATTTCTGTGCATTCTTGGATTTGGCGGAGCACTT
GTATTATACGTACTGGACAAGAATGGTATGGAGCAAATAGCCCAGGTGTA
TTTCTGTGCATTCTTGGATTTGGCGGAGCACTTGTATTATACGTACTGGA
CAAGAATGGTATGGAGCAAATAGCCCAGCGTGAGCCAGGAGCCAAGAAAT
CGAGAAAGATGCGTGAGCCAGGAGCCAAGAAATCGAGAAAGATGAAAGTT
GGTGATATTCGACATTTGAGTTTGCAATTCGTTCTATTGGCAGTCACCAC
AATGAGTTTCTACAACACTGTCTTCCCTTTTGTGGCTGACGCAAGAAAGT
TGGTGATATTCGACATTTGAGTTTGCAATTCGTTCTATTGGCAGTCACCA
CAATGAGTTTCTACAACACTGTCTTCCCTTTTGTGGCTGACGCAAGTCAG
TTCATACGTGAGAAATACCACTATAGTGATGACAGTGAGATGCCATCTTA
TTATGCGGGAAGTGTTTACGATGTATCTTTGGTTGCCACTCCTATCCTCG
GTATCATTGTGTCAGTTCATACGTGAGAAATACCACTATAGTGATGACAG
TGAGATGCCATCTTATTATGCGGGAAGTGTTTACGATGTATCTTTGGTTG
CCACTCCTATCCTCGGTATCATTGTGGATTATTTGGGTTATCGAGGCCTC
TTAGCCTTTGTATGCGCCATCTTCACCATTCCAGTGTATTTGATTCTTGC
TTTCACTACCTGGCATCCGTTGTATGGAACCGTCCTCTTGGGACTCACCT
ATTCTGCTGCTGCTGATTATTTGGGTTATCGAGGCCTCTTAGCCTTTGTA
TGCGCCATCTTCACCATTCCAGTGTATTTGATTCTTGCTTTCACTACCTG
GCATCCGTTGTATGGAACCGTCCTCTTGGGACTCACCTATTCTGCTGCTG
CTACAAGTTTGTGGCCATCAGCGCCTTTGGTGGTGAATCCTGGCGTTCTT
GGTACCGCCCTTGGTTTGATGACCTCCCTGCAGATGATCGGTATTGGTGT
ATGCTCACTCGTTGTGGGTGCAATCCTCGATAAGTTGAAACAAGTTTGTG
GCCATCAGCGCCTTTGGTGGTGAATCCTGGCGTTCTTGGTACCGCCCTTG
GTTTGATGACCTCCCTGCAGATGATCGGTATTGGTGTATGCTCACTCGTT
GTGGGTGCAATCCTCGATAAGTTGAAGACGAACGATCACAAATGGGAATA
TGTGATGATCTTTTTGTTAGCCAATGCTGTTTTGTGTGTCATCTCTGCTC
TATTCCTCAACATTGTTGACTGGAGAAGGGACGAACGATCACAAATGGGA
ATATGTGATGATCTTTTTGTTAGCCAATGCTGTTTTGTGTGTCATCTCTG
CTCTATTCCTCAACATTGTTGACTGGAGAAGGAGTGGTATTCTGAACAAA
ACGAGGAAAAGAAACTCGCAGAAGATGAAGAAATTGACCGACTCACGGGA
AGCTTTGGTAGGGGATGCGGCCGAAGGTGACGGAGACTCCATTAATTAAA
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TTGACCGACTCACGGGAAGCTTTGGTAGGGGATGCGGCCGAAGGTGACGG
AGACTCCATTAATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045617XLOC_045617-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000388_pilongenomesc0000388_pilon:40906..53490 -
Properties
Property NameValue
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