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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000388_pilon:210887..219651- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045612 ID=XLOC_045612|Name=XLOC_045612|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8765bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000388_pilon:210887..219651- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCAAGTGAAAGTCAATTAAATGATTGGACAGTCAAACAACTGCAGGA
GGAATTAAAGAAAAGGAAATTATCAATCTATGGCCGTAAATCAGTCCTGG
TATAAAATATAGGCTTTTCATCATTTTTATGATTTCATTCTATTATAATT
TTTTATCTATTTATATTTTTATGTTGGGTGTATGTCTTCTCAGTGAAATG
GTTTTTTTAAGGAAAGTTTTTTTAAATCTATAAAGTTTGTTTTACGACAT
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AAGATGTATTGGATCCAATCAAGTTTAATTCAAAAACATTTTTTTTTGCA
GACAATGAAAATACAGTGAAACATACCCAGTCCTCAGAAGAATTGAAAGA
ACAAAGACACCAAGATAGAGAACAGCGAAAGAAAATTGTCATTTGGAGAA
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AAACAAGAAAAAGAAAGGTGACATTTCTGCTCACAATTACTATTCCAACA
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CTGTAAAATAGTGCCAGGACTCTTTTTATTTTCATAGGATTTTTTTTCTT
CCTTTCACCTATGAAAAACATGAAACAAAAAGTACATCTTGTATATAATA
CAATTTTTACACTTTAATCCTCTTAGCATCAGTAAACATAGGAAGACATG
TTCAATTCTGGCTATCATCAGTTTTTTGGTATTATCAGTGTACACGTGGG
ATGGCCCTCACCAATCATATGTCAGTGCAATCGAAAAGTATCTGTTATGG
TGTGGATATTGGGTTGGCTTAGGTATCTTATCATCTGTTGGGCTTGGTAC
AGGACTACACACATTCTTATTGTATCTGGTAAGTAATCTTTTGTTTACAC
TTTTTCTGGATTTTAAAGGCCATAAAAATTTTGGCTATGAATCCAAAAGC
TAAACACTTCAAAGAGAACATAAAACTTACTGTCCGCTTCTGTAGTAATA
TCGAATGGTTTATTATAACACAATCTCTAACTGAAACTTGAGAAGGGATT
AGTACTTGCAACTATTTTTTATTACGTACAAACGATAAATAAAAAACAAA
TAAAAAAAAAGATTAAAAACAAACTAGTTAGTACCAGGTACTAATCGACA
AATTTTCCTGAAAATCAGGGTTAGTACTCCCTCTAGTCTAGTCTGTCTCA
GATTGTCTTGGATTTTTTCCTGATCTTTTCTGTTTTACCTGCCACAGTTT
AATTCTATTTGTGCAAGGTATTCAAATAAGAATTTTACTCATACAGTATG
TTCGATATTTCTTTCAGGGCCCACACATTGCAAAAGTGACATTAGCAGCA
TGGGAATGTGGATCACTTAATTTCCCTGAACCACCCTATCCTGAAACGTA
TGTTATCCTCCTCACATTTTACATCTGCAAAATGTTTCAACGTTTATTCT
TTATTGAAAACATCTTTAATATCCTATTTGTATTTTTGAAATCCTCCTAG
AAGCAATTTGGATTAATGAAATTTGATTACCAAATCCAAATGAACTAGTG
AAAAATGTGGAAAACTTGGGAAAACTAACTATATGATTTTTATATTCCCA
AATTTAAAATTCCAACTATTTTGGGACTCTTGCTCAGCCTAAAGTTGTTA
GAGCCGTTAGAAGTTTCCCCTGGGCCACCAAGATAAGATTGAATATTTCC
TGTACATTTTTAAGATAGTTTTAAAACTTTGTTTTGATATCTCTTTTAGG
ATCTTGTGCCCAGACTCTGTTGCTGATGATTCTTCCACACCCATCAATAT
GTTTTCCATCATGTCAAAAGTTCGCTTAGAAGCTGTCATGTGGGTATGGC
ATTTGTTTTTTTTCATGATATTTCCTATCTGCTGACAAGAGGAAGCTTTG
CACAATGTTGAATACACTCTTTTACATATAAACACAAATTTCAGTTTAGA
ATAAGCTTTTTTATTTATTTTTCTAGGTACTCTGAGCCTCAAGTTAATCT
TATCCTATTCTTATTCTCTGAGTAAAATTGAGTTATTTTAAGGCTTTAGC
TTATTTTTACCACATTGACCCTTTTTGAATGGATTAAGGAATTTTAGGCT
CAGCTTTAATTTTGAATTGTATGTTTATTGTTTTGAGTCGCATTGTCTTG
AAGAATGTTGAGTACACCAAAGTGTTTCCTGTATTGTTAAAGGAAAGTTT
CATTTGATTAATTTATTTGTCTCTCATCTCTACTATTGGTGGATCACACT
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AACTTCCACCTTACTTCATGGCAAGAGCAGGTAAGTTGTAGAGATCTTAG
TTCGCATATTGATGCAATCCAATATGTATTTTTCGATTAAATAGCCCTGT
TAAGAAAGTAAGCCTTCATCAACACTTATCCAGTGTGATTTCTATTGATA
ATATTTCATGTTTTTTTTCATCCACAGCCAGGTTATCAGGGGAGGACGAT
GTGGACAACGAAGATCTCGAAGAATTAGAAGACCTCATCTCCAGTGATGA
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ATCTCATTGGTAGGGTGGGGCGTCAAATGTCAAAGTCAGAAAATTCAAGA
TGTAGTGTTTTGTTATGAAAATTTAACCTATTGTAAGGCATTCTGCGCAA
TTTTTAAGGTCAGAAGTCCAAAATTGGCCGAACCCCCCTGGGGGTACTGA
TTCGCACTAGAGGCTAAAATTGGAAAAAATGGCATTTTCTGGCCTTTTCA
GGCCTGTAAATTTGTCAAAACTATTTCAAATCTTATTTTTATCATTTGCT
GTACTAAATTTTATGAAGAAACAACAAAATAATCTTATTGGGTTGAAAAT
TGTGCCCATTGGAACCCTAAACGAGCCGTTTTAAGCCAATTTTGGGTAGC
AAAATGCTTTTTAAGGCCAATTTTGCAAGTTCATAAACTTTAAGCTGATT
AATTCACATGTCTGAAATTTTCAGAGATGGAAGTCTTCAATAAAGTCTTT
AAGCAAAATGAATTTCAAGTTTTTCACTTTTTTCAAAAATTCATAATGGC
GTTTTCAAAAATCGCTTTTTAGCAAAAAAATTATATTTATCTAAAAATAG
CATTTTTTAATGCAAGCTTCTACAAACTGAGTTTAAAATGCTGGCTGAAA
TTTTTTTTACAGTGATAGTATTCTGGAGATACTCCAGGAAAATCAAAATC
ATTTGGGTCTGGGATGTGTCTATGTCCGCCATTTTTCGGGCAAAAACCCA
AAAATCCTTTGGGTTTAGGATAAGGGTATATTCGCCATTATGGAATTGAA
ATATGTCCTAAAATTTGCTTAAATGCAACGTTTCAAGCGAAAACCCCATT
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TTGAAGTGTTAGTATTCTGTGAATTCTCCTGGGAAAACAAAATCATTTGA
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ATTACATTTAAAACAAAGAATATGAATTTATAATCCTTTAATTTAGAAAT
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TACAGCCCACACACATTTCCTACATACTCAAGACTTGTTCCGTCAAAAAA
AGATTGGATTTTGGCTTGAAATATTATATACATTTTAAAACTGGCTTCAA
TTCAAAAATTGTGGTCCCAGAAGCATCTTATACCTAAATAGTTTTTACCC
CTGGAGTATTTCCAGAAGACTATCACTGCAAAAATATTTTAGGTTCATGT
CTATTGCCATATTAGAGCGATTTTTAGTCAAAAATTGGGTTTTTGCTCCA
AATGTTGCATTTTAGCCAGTTTTAGCACATATTTCAATTCCACAATGGCG
GATATACCCAAATCCTAAACCCAAATGATTTTGATTTCCCTGGAGTATTT
CCAGAAGACTATCACTGCAAAAAATTTTAGGTTCATGTCTATTGCCATTT
TTAAGATTTTTCAAGTCAAAAATGGGATTTTAGCTTAAAATATTGCGTTT
TAGCAGGAATTTCAATTCCAAAATGGAGGATATACCAAAATCCAAAACCC
AGATGACTGTGATTTTCCTGCAGTTTTTCCAGAATACTATCACAGCAAGA
AAATTCGGGTCCATGTCTATTGTCATTTTAGAGATTTTTTCAGTCCAAAT
TTGTGTTTTTGCCTGAAAAATGGCTCTTAGCAGGGATTTTATTTCCAAAA
TGGCGGACATAGACGCATCCCAGACCCTAATGATTTTGATTTTCCTGGAG
TATCTCCAGAAAACTATCACTGCAAAAAAAATTTCAGTCAGCATTTAAAC
TCAGTTTGTAGAAGCTTGCCTTAAAAAATGCTATTTTTTGACAAATATAA
TTTTTTTTTGCTAAAAAGCGATTTTTGAAAACGCCATTATGAATTTTTGA
AAAAAGTGAAAAACTTGAAATTCATTTTGCTTAAAGACTTTATTGAAGAC
TTCCATCTCTGAAAATTTCAGACATGTGAATTAATCAGCTTAAAGTTTAT
GAACTTGCAAAATTGGCCTTAAAAAGCATTTTGCTACCCAAAATTGGCTT
AAAACGGCTCGTTTAGGGTTCCAATGGGCACAATTTTCAACCCAATAAGA
TTATTTTGTTGTTTCTTCATATAATTTAGTACAGCAAATGAAAAAAATAA
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CCATTTTTTCCAATTTTTGCCTGTAGTGCGAATCAGTACCCCCAGGGGGA
TTCGGCCAATATTGGACTTCTGACCTTAAAAATTGCGCAAAATGCCTCAT
AATAGGTTAAATTTTCATAAAAAAACACTGCATCTTGAATTTTTTGACTT
TGCCCCAAAAATGGCTGTTGACGCCCTACCCTATCATTGGGTTTTGAATG
ACTTTTTAAAAATCTTGCAGTACTGCTGAATCACTGTTCTGCAAAGTAAT
TAAAATATTCTAATTACAGTAATTCTGTGTTAATGTCATCACACACATGA
TAAAAGTCACTATCGGCTTATGGTATTAGTACTAGTAATCGTATGGTTTG
GAGTGCAATTAACGATTAATCACGAGTAACAAAGGAGAAAATAGTAATTT
GCACGAGTCCGAAGGACGAGTGCAAATTACGGTATTTTCTCATTTGTTAC
GAGTGATTAATCGTTAATTGCACGACAAAACATACGATTCCGAGGTAATC
GTCAGTAAATAATCATTAGTAAATCATAGTTTTGAAAAAGAATCTTTTTC
TAACTTTATATTTTCGTAAACATTCGAAAACCTCCTTTTTTTCTTTTGTG
TAAAAAGAAAACATTGCAGTGTAATTTTTCTTTGTTTTCAATTAAAAGAA
GCTATTGTAACGTAAAATTTCTTTGTTCTTTTTTATATTGAAGAAAAAAA
TGTCTTTGTTTTTTATTATATAGTAAAAAAAAGTCTCTGACACAGGACTT
GAGAGAGAAAAGAATAAGGGGACAAAAGTGTCCCCCCGCCGAAGAGTGCA
AAAAGTGGTAATAGTGCAATTAACGATTAATCGCACTCCTCTAAACCAAT
CAGATTCGAGTAATTTTGCACGGCTGACGATTATACTATTTTATCATATA
TTTTAAACCAATGCAGTCCCCAAACAAACTAACTTTCTATTGATTTCTTG
ATTTATTTTTCTTCTCTAGGGACTTTTCACGAGGCTGAAAAAAGCTGTGC
CACAAATTGTCGAACGAGTTGGATTCTTTGGAATCCTGGCTTTTGCTTCT
GTAAGAATACTGTTATTTTTTTTTGTGTGGGGGAGCGCAAAATCTTCCAT
CAAACCATGGTCATATTCATGATGTACACCATTGCAATGTCTTCCGTTCC
ACCCAATAGCTGATTGGTTGAAAGTGACGTATTGACTGCTTTTACGTCAC
TTCCAACCAATGAGCTATTGGTTCTGCGACGTAATGTCAGAAGACATTGC
AGTGGTGCATATCATAAATACATGTGTTCAATTGAAAACTGATGACTATA
TGCTCACTTAGCAATATTAACAAAATAGGTGAAAGAAATTCGATTATCAA
TTTCTGAAATTTCAAGCGAATATGAATTTAATCTTATCTCATGGTTTCCG
TTGCCTTTCCAGATACCGAACCCTCTTTTCGACTTGGCTGGCATAACATG
TGGACATTGCTTGGTCCCATTTTGGACTTTCTTTGGAGCAACCTTAATCG
GAAAATCCATCATCAAAATGCATATCCAAGTAACTTTTTTTATGGTTGAT
AGCTCCATACATTGTTTCATTGAACTTACTTTCTATTTTTTAAATTAATT
GCAAGTTTTATTAGCCATCTTGCCGGACGTGATTTTGAAAATTCTAATTT
TCTAACGAATTTTTTCTCATTTTCTTATCAGCAAACATTTGTTATATTGT
GCTTCAGTAAAAGATACGTCGAACAACTACTCGAATTTTTAAGGTAGGGA
ATGGTTTGTTTGCATAGGTTTGAATCTTTTACTTTTTGTTTAGCAACCCG
AAGCTTACCTTTTCTTTTGGATACTAAGAAATCGAAAACTATTAGTTAAT
CAAGTCAGGGTTTTCTTCCTTCTTCAATCCGGGTCAAAATATATTTCCTC
GTTTTTAGACGTTTAGAGTTCGGGCGAGAAAGTCGCTATTTGTTAAATGT
AATCGAATATTTCAGGGGTTTATATTCTTCCAGACTATATTGTGAGCCTT
ATTGGACCTTTCTTGAACTTTATTTGGATCGTCAGATCCTAAGGTCCTAA
GTCTTAAGCCTAACGTCTTAACTCTACCTTTCCAACCTTAGTTAGAGCGC
TTTTTAGATCGTTTCTGGTTAAGATTTCGTGGGAATTTTTCTCAAATATT
ATGACCTTGATTGTTGGTCTAAGCTTGTGTTGATAGTATATCAACAAAAT
ATGCTTTTAAACTTGGTCAGTGGGGATTAAAATGTTTAAATTTCTTTTTC
ACTACAGTGGTGTGCCTTATGTTGGTTCATATATTCAATATCCGTTAGAA
AGAGCTGTCCGAGCTCAAAAAAGTAAATTACATGGAGCTTCTTCAGGAAA
AGCCGGCGAGGTATAATATTTCTGACTTGTTTTATTGTTTTAGAGATTTA
GTTTATTTAGTTTATTTTAAAAGGTGAATGAAACTTCGTCCGGGTCAACC
TATGCCATGTGAGGGGAGTTGGGTAGTCAGTCCAAGGTGCTAACCTGACG
GGGTGCTCATTGAAAGCGTCTGTAGTTGCGAAAATAGGCCTGAAAGCCTC
CTGCAACTCAACCAAATAGAAGTCATGAGTTTCTTGCTGAGACCCTTAGC
TTATACTTCCATCCAGGTGAAATGCAATTACATTTTTGCTCGTGAAATTT
CGGCCAAATTTCCCTCCACAAAGATGACCCTGGTTCTAATACTAGTTTTG
GTCCGTTGGTTTTGATTAAAAAACCTTTTCTTTTCATTTTCAAAAAACAA
TGAAAATAAAGCGTTTGTAGAAAATTATTATCCAGATGAAAGTGGACGGA
TGGACTTATAGTATGATAATTTTTATTCCATTTTTTAGGACGGTAATATC
CTTGGGTTTATCTTCGAGAAGTTTGTCACCATCATGGTTGTATATTTCAT
CATCTCTATCGTGAACTCGCTAGCACAATCCTACGCTAAGAAAGTCGATG
AAACTAAAAGACAATTAAATAATGGTGTCGGTGTTGTTCCACCAAAAGCT
GACAAAGCTGATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000388_pilon:210887..219651- >XLOC_045612 ID=XLOC_045612|Name=XLOC_045612|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2760bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000388_pilon:210887..219651- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCAAGTGAAAGTCAATTAAATGATTGGACAGTCAAACAACTGCAGGA GGAATTAAAGAAAAGGAAATTATCAATCTATGGCCGTAAATCAGTCCTGA TGTCAAGTGAAAGTCAATTAAATGATTGGACAGTCAAACAACTGCAGGAG GAATTAAAGAAAAGGAAATTATCAATCTATGGCCGTAAATCAGTCCTGGT TGAAAGGCTTCTTGATCTAGCCAAAACTGAAGAAGTTCGGTTGAAAGGCT TCTTGATCTAGCCAAAACTGAAGAAGTTCGTAATCGGAATTCTGAGATGA TGTCAACAGTAATCGGAATTCTGAGATGATGTCAACAGACAATGAAAATA CAGTGAAACATACCCAGTCCTCAGAAGAATTGAAAGAACAAAGACACCAA GATAGAGAACAGCGAAAGAAAATTGTCATTTGGAGAAAACCTTTGCTCAC GATACATTATTTCATATTGGAACTCTTTGAGCTTATAAAACAAGAAAAAG AAAGACAATGAAAATACAGTGAAACATACCCAGTCCTCAGAAGAATTGAA AGAACAAAGACACCAAGATAGAGAACAGCGAAAGAAAATTGTCATTTGGA GAAAACCTTTGCTCACGATACATTATTTCATATTGGAACTCTTTGAGCTT ATAAAACAAGAAAAAGAAAGCATCAGTAAACATAGGAAGACATGTTCAAT TCTGGCTATCATCAGTTTTTTGGTATTATCAGTGTACACGTGGGATGGCC CTCACCAATCATATGTCAGTGCAATCGAAAAGTATCTGTTATGGTGTGGA TATTGGGTTGGCTTAGGTATCTTATCATCTGTTGGGCTTGGTACAGGACT ACACACATTCTTATTGTATCTGCATCAGTAAACATAGGAAGACATGTTCA ATTCTGGCTATCATCAGTTTTTTGGTATTATCAGTGTACACGTGGGATGG CCCTCACCAATCATATGTCAGTGCAATCGAAAAGTATCTGTTATGGTGTG GATATTGGGTTGGCTTAGGTATCTTATCATCTGTTGGGCTTGGTACAGGA CTACACACATTCTTATTGTATCTGGGCCCACACATTGCAAAAGTGACATT AGCAGCATGGGAATGTGGATCACTTAATTTCCCTGAACCACCCTATCCTG AAACGGCCCACACATTGCAAAAGTGACATTAGCAGCATGGGAATGTGGAT CACTTAATTTCCCTGAACCACCCTATCCTGAAACGATCTTGTGCCCAGAC TCTGTTGCTGATGATTCTTCCACACCCATCAATATGTTTTCCATCATGTC AAAAGTTCGCTTAGAAGCTGTCATGTGGGATCTTGTGCCCAGACTCTGTT GCTGATGATTCTTCCACACCCATCAATATGTTTTCCATCATGTCAAAAGT TCGCTTAGAAGCTGTCATGTGGGGAGCAGGCACAGCTATCGGAGAACTTC CACCTTACTTCATGGCAAGAGCAGGGAGCAGGCACAGCTATCGGAGAACT TCCACCTTACTTCATGGCAAGAGCAGCCAGGTTATCAGGGGAGGACGATG TGGACAACGAAGATCTCGAAGAATTAGAAGACCTCATCTCCAGTGATGAC CAGCCAGGTTATCAGGGGAGGACGATGTGGACAACGAAGATCTCGAAGAA TTAGAAGACCTCATCTCCAGTGATGACCAGGGACTTTTCACGAGGCTGAA AAAAGCTGTGCCACAAATTGTCGAACGAGTTGGATTCTTTGGAATCCTGG CTTTTGCTTCTGGACTTTTCACGAGGCTGAAAAAAGCTGTGCCACAAATT GTCGAACGAGTTGGATTCTTTGGAATCCTGGCTTTTGCTTCTATACCGAA CCCTCTTTTCGACTTGGCTGGCATAACATGTGGACATTGCTTGGTCCCAT TTTGGACTTTCTTTGGAGCAACCTTAATCGGAAAATCCATCATCAAAATG CATATCCAAATACCGAACCCTCTTTTCGACTTGGCTGGCATAACATGTGG ACATTGCTTGGTCCCATTTTGGACTTTCTTTGGAGCAACCTTAATCGGAA AATCCATCATCAAAATGCATATCCAACAAACATTTGTTATATTGTGCTTC AGTAAAAGATACGTCGAACAACTACTCGAATTTTTAAGCAAACATTTGTT ATATTGTGCTTCAGTAAAAGATACGTCGAACAACTACTCGAATTTTTAAG TGGTGTGCCTTATGTTGGTTCATATATTCAATATCCGTTAGAAAGAGCTG TCCGAGCTCAAAAAAGTAAATTACATGGAGCTTCTTCAGGAAAAGCCGGC GAGTGGTGTGCCTTATGTTGGTTCATATATTCAATATCCGTTAGAAAGAG CTGTCCGAGCTCAAAAAAGTAAATTACATGGAGCTTCTTCAGGAAAAGCC GGCGAGGACGGTAATATCCTTGGGTTTATCTTCGAGAAGTTTGTCACCAT CATGGTTGTATATTTCATCATCTCTATCGTGAACTCGCTAGCACAATCCT ACGCTAAGAAAGTCGATGAAACTAAAAGACAATTAAATAATGGTGTCGGT GTTGTTCCACCAAAAGCTGACAAAGCTGATTAGGACGGTAATATCCTTGG GTTTATCTTCGAGAAGTTTGTCACCATCATGGTTGTATATTTCATCATCT CTATCGTGAACTCGCTAGCACAATCCTACGCTAAGAAAGTCGATGAAACT AAAAGACAATTAAATAATGGTGTCGGTGTTGTTCCACCAAAAGCTGACAA AGCTGATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000388_pilon | genome | sc0000388_pilon:210887..219651 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1204-1380:178 |
| Aaloc | 1102-1203:758 |
| Aaloc | 1039-1098:1335 |
| Aaloc | 922-1038:1604 |
| Aaloc | 841-921:2047 |
| Aaloc | 766-840:5387 |
| Aaloc | 712-762:5588 |
| Aaloc | 619-711:6116 |
| Aaloc | 538-615:6549 |
| Aaloc | 337-537:7189 |
| Aaloc | 172-333:7563 |
| Aaloc | 142-168:7845 |
| Aaloc | 100-138:8050 |
| Aaloc | 1-99:8766 |
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