XLOC_045419 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045419
Unique NameXLOC_045419
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000044_pilon:1772572..1781738-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045419 ID=XLOC_045419|Name=XLOC_045419|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9167bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1772572..1781738- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGATCAAATTTGCGTTGCTCACCTTCTTTGTTTCGTCCAGCTTTGC CGATACACTTGGTAAGTAATTGCTTTTTTTATCATCATCATATGAATGGT GTTTTCCCAATTCATCATAAATATTGTTAACCTTTTGGGAGAAATATTAT TCTGAAATATTCTTACGGTATTGTTAGCTTTGGATCCAATCTCAGCCAAA ATCTAACATGTAATACCTAGGTCAGGCAAAAATTTGCCATACTGGGGAAT AATTAGCAATTTAATTGTAAAATACTTTAAAAATGGCATTTTTAGGTTCG GTTACCAAATTCTGTGATGTTGTTATTCTAACCATATTCTTAATTCTTTA GCCAATCTCATCATAAACATTCTTATAAAGTATATTCCTATGAAAAACGT GTATTTGCTTACTCATCAATTTCAATTTACATCCCTTTTCACACTGAATT GAAAGGGATGTGGAGCAAGATTGGTTAAAAAGAAGGAAAGAAAAACAGCT TTATTCAGCACGAAATCAAACACAATATAACAATAGGAGACAACGACCTG AAACAAAACTATAATATAAAGCGGGAACACTTATGTATAAAAACAAAACC TTAGTTTATCGTTACTTATGAGGACGATAACCTATGATAATTCCATCCTC AACGAAAAAATGGCAATTTGCAGCAAGATTTTAGCTTGTCTCAAAAGTTG AAAAATAGTTGTCGGCCAACTTTTAGTGGACCGCTATGAGAAGGCACACT GTAAAAGTGGGATGGGGGAACCAGGGAACCCTAAGTGGGAACCCTAAGTG GGAGCCCCAAGTGAGATCCCTAAGTGGAAACCCTAAGTGGGAACCCTAAG AGGAAACCCTAAGCGAAAACCTTAAATGGGAACCCGAAATGGGAAACTTT AGTGGGAACAATAACATACATACAATATAAAATCTTTTTTCATTCCTCAG 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AGTACTCTACTGTGTTGAGCTGAAAACAATTTGAGACCTCCATTTATTAA AGAGCCTCCCCATTCGTCTTCGCTGTTTAGGACCTTCAGTTTATATAACT TGTGAAAATTGTGGCTTCAACAATTTTCAACGGTTCGCTTTTAAGTTAAA TTAAAATCATTTATTTTTCATGCGAATGTATTTTAGTTTGGCTTGTGATT GTATTGCTAAAGCAAAGAAAGAAGGTTCTAAAGCAATCGCACTCGGTGAT TACGAAGAGTGTCGTGGAACTACTGACACTGCAAAACTCTCATCCTTTTT GAAAGACAACTCACAAGTTAGCAATAAATGTTTCAACGCAAATTACCAAT CATGCACAAAGGGGTCACACTGTATGGGAGAAGCGGGCATTGTTTATATT TATTCCACTGCAGGTTAGTATTGACTGATGCTCCTATCGTCTACACAAGG TCATTTATTTTGCGGACCCGCATTTTCTAGCTCATTGACGTCCTCGAGCA GTGGCGGAGGCGTGAGATGGAACGCTGTACTTACTCTAAAGCTCCCAGTA ACTTTCCGCTGAGATAAGATTACTCAATCTAAAGCTCTAGTATAGACATT CGGCTTTCTGACTTGTCATACCAACTGTTAGAGTAGACAGAAATTGGGCA CAAAGATGGCAGTTAAGATCTTTGCTTGGAAAAGATTGAGAGAAGTCATT GCATTGACGTCTATTAAAACACCCAACTTCTTTGAAAATGGACTAAAATT CTCACAAAATGGTGAAAATAAGAACATAAAAACACTTTAAGGCTTAAAAT AAAAAGTTAAGAACATCTGAAGACTTCAAAAATTTCAGATTTCCTATTAC AAGTGTGTATGTATTCCCAGCTTCCATAAATTTATTTTGCATCAAGGCTG ACAGATTACCCTTGAATGAAATCATTTTTAAAAGATTTATCATTTTCTCA TATTTTCTCAGTTGATGGCGGTTGGGGAGATTGGTCAAGCTACGGAGGCT GCAGTAAAACCTGCGGAGGTGGTAAAAAAATTCGAACACGAAAATGTGAC AGGCCAAAACCACAAAATGGCGGAGCTAACTGTGTAGGAATCTCATCACA GGCTACATCATGTAACACAAAAACATGTGCAGGTATAGCCTCAATCCTCA GTTGTCGCAGTAATATATTAGACTAATACCTCGAATAGATTTTGTATCGT AAATTATAAATTGATTTTTTACTTATAGATCCATTATGGAAGCAAACGTT CGAATCTGTGGGTGCGATCCTTTACATAAATCCCCAGGGGGGTACTAGGT TTGCGAGGTGACGGGTATGTCCGAGCCGAAAATCGAAAATCGACCCTTTG AACGACAAAATTTTGGTGATTTTGGGACCCTTTGAGAGACTTTTTCCAAA ATTTTGGTCCATTTTTTCCAAATTTTGGTTTGATTGTCACCAAATTTTGG TCAAAATATTTTGAATTCGTGACCCTTTGAGAGAGAAATTTTTGATTTTC GTGATTTTGGGACCCTTTCAGAGACTAACTTTTGAATTTGTACCCCTTTG AGAGACTTTTGAGGAATAAGAAAAGGTACCCTTATGGCTCGCACATACCC GGCACGCATTTTGCCTAAGTACCCCCCCCCCCCCCGGACATAAATCGCAT GTTTGCTTCCATTATGACTGAAATTACGTAATTTAACAAAACATGGAAAA TCTCTCTCTGTCAGCCTCTGTATGGAAAGGGCGCAAAACTGCAAACTGAA TTGAAAATTTGCTGCTTTCTTATCATACATTTGATCATGAATGGGATAAC GACTTTATCTTACACATCCTGTCTCACAGCCCTGCAAATGAGGATAAAAA ATTGCTACTGAAATTCCAATCGGGATGAAAATTCTATTGTTTCAAGGTTT GAAAATCTAGCGGGGATTGTTATAATCAGTAGTCACTATGACATAAACCA TAAGTAGTATAAGAAAGCCGCGGCTGGAATGATAACATCTGAATTTCTGT TGTTCTATCTCTGTCGTTTTTGATGACCATTTGTTGAGCAAGAAATCAGT AATGTAGCATCTTTAATGGTAAATTTTGTTGGTTTGTCGTTAATACTTAC TTCTCAGTGCGTTTTATACATTAATGGTATGTCCTTGCATAATACACTTG CATTATAAAATCATTGTAAAGGAAAGATCAACAATAAGAAATTTAAACGA GCACAAAATGGCTGGGCTAAAAGAACTCAAAAATTAGTAAAGTGCCTTCG AATGCCTTCACAATTTTTCAGTGAAATCTTTTTAGAAATCAATGAAAAAG TTCACCAAGACAATACTGTGAAAATTTCAAGCCAGCACCTTCAAAATTTA TCATTCAAACTGACAGGAAAGTTGTCATCTTGAATATAGTTCTTATAATT TTAATTTTGGCGAAAAACTATCGTTTCCACAAAATACCCCTAAAATATGT CCAAAATTAGTTCAATTGGGTACAGATTCAAAGATATCTAGCAACAAAAA AACTTTTTGTGAAGGAAAATAAAAGAAAAATTTCAAAAACTATCTACCAA TAATAAACTGAGCACTTCATGTTCTTATGAAGGTCGGAGACAGACATAGA ACAGCAATTAACTGAAAAGACAATGCGGTACATATTCCAGCCGCGGCTTT CTTATACTATGCATAAACTAAATAGGGATTTTATTTTTTTTCTATAAATC GTTTTGGACAGTTTTAAGATTGTTCGAATCTAGAGTGTTTTTCGATTTTT TGTAGAACTGTTTTGGGATACACGTTTTTTTTTTAAGAAACACGTTTTTT AGAAACATGAGGCTCAGAATGCCTAAAAACTAAGAAACATCTAAGAAACA TGCCGAGGCTGAGAATGAGAAAATAACATTTTTTAATTTGGTTTTTTCAA CCTTCTAATTCAGTCTTCCATTAGGCTGATTATGTCAAAAAGTTTAGAAA CATGTAAGAAACATTTTAGGCTCAAAAGGCCGATTTCTTAAGAAAAATTG AGGCTGCTTGGTAAAGCTAGTTTCTTTAAAAAACATGTAGGTCAAACCTT TCGATGTTTTGTAGAATTGTTTTGAGATAGATCAAGCCTACGCTAAACAA TTTGTCAACTCATCTTCATCAATAACAAAGTCCTCAAATTATTTTGCTTT TAAGTTAATGGTAACTGGGGACGATGGTCAAGCTACGGAGGCTGCAGTAA AACTTGCGGAGGCGGCTCTAGAACTCGAACAAGAAGATGTGATAGCCCAA AACCTCAAAATGGCGGAGCTAGCTGTAAAGGAAGTTCCACACAATCTGGG AGATGTAATATACAGAAATGTTTACGTGAGTCCTGCATTACATCATTTTT CATAAGAGCTCGGGTAAGTTATGGCATGTCTCGATGTCTCGAAAACTGAA AATTACCATAATTTTTAGATCGCATTAGTCGGTACAAAACGGACCAAACA AGAATAAAGCGTACTATGATGAAGTTTCCAACCTGGTGTGTAACCTAATA TTGTTTTTTTTCGCTGATTTTTGATTATGACGTCACAAAAACTGGAAATT TAATTTCTCAAGAATTGTTTATCCAATTGTCGTCAAACTTTCACCAAAGA TGTATCTCACTAAAGTCGATTATTGAAAAAGAAAATTTTTCGAAATTTTG ATGACATCAGCAGAAATTAGTAAAAACGAAAAGTCCTATTTTTTGCTGAC GTAATCAGAATTTAGACAGAAAATTAGGTTACACATCAGGTTAGAAACTA CATCATAGTACTCTTCATGTTCAGTCATTATATTGGTCGTTTTCTGCCGG CTAATGCGATCTAAAAATTATGGTAATTTTAAGACATGTCATAACTTACC CGAGAACAATTTTATAAAGAGCACGAGGCTGAAAATTGGACAAACCTAAG AACAAATTAAGAATATCTGAGCCTCAGATTTCAGACAGCACTGGTTTAAG AGATTTTAACTGATTTTAAGCCCATTTAAGTTTCTATAATGAAACTATTG AGAATATCATAAGGACGTTTGAGCCTAAATATTTCAGAAAATGAAGAAGA TGAGGGACAAAATTTACTGGTTCTTATTAAAAAGCGTGTAACGTCTTTTT TATTTTGATTTCATGAGCTATTAACATTAGTTACACCCCCCGAACAGAAA CAGCCCCCCCCCCGAATAGGATTAAGTGCTTTTTTAAGGTAGGAAATACA CGCTTTCTTAGCAAGGCTATATAGAAGAACATGATTGGCCAAAATAATAA GAACAAATTAAGAAAATTTTAAGCTTTTCATGCTCTAAAGCACCTGATTT CTTAGGAATATGGACAAGAATATTGACAAAAATAGTGAAAATAAAGAGAT ACAAGGCTTTAAACTAAAAAAGTTTAGAACAACTGAAAGTTTCAAAATTT TTGAATGCTCTTTTTCATAAACAAATTTGGATATTTCGAATCTATAATAA AGGATATTCTCTGAGTTGCATAAGTTTGCATGTGGGGGGGGTAGATTTCG GTTTTCACGGATACTCCGTAGAATTAAGCCGTTTAAAATCCACGCGATAC AGTAATATTATTGTTATATAATAATACAATAATCGCAAGAGGATATTATC AGTTTGTATAAAACGATAACTTCCCTTCCATTATTTTTTGGGATATGTCT CAATTAGTCGTCTAGCATCGTAAATTTGACTTACCCAGCTGGCACACAAC GTTGTTAACGTTCATCTAACGTTATATGGACGTTGTGAACTTTAGATGAA CGTTGAAACAACGTTGTCTGCCAGCTGGGGTACACATCAAGAAAAACATG TTTGTATTATTTTAGCTAATGAAGCCTGCACTTGGGCATACACAAATTGG AATGATGACGGAAAAGGCGGCGCTGTTTATTTGGACAGGCACGACGTTCG ATGCAACAACGGTCAATATATCAAATATATGAAATTAGAAAGAAAAAAGG CAGGCTGGTTCAATTATCAAATACGTTATAAGTATATATGTTGTCAAAAT ATGGCTTCATGTTCAAGTGTTACTCATTCGACTTTGGATACCTATAATGG TGGTTTTCAAGGAAACGCTGTCTACTTCGATCGCCAAACAGTCAGTTGTG GCAGAAATGGTTAGTATGAGAAATATATTAGCATGACAGACATATATAAA TGCCGGACTCCACTTTCGTGCGAAATGGGCGACAGTTTTTTTCTTAACCT TTTTTGCCTGAAGAAAAGATTACGTCATAAAAAAGTTTTGCGCAAACAAA AAAAGTTGAAGGAAGTTCTACTTTTTTCATCCGTTACGTCAATTTTGACC AATGGGATTGCTTCATTTTTCAACCGACCAATGACCTTACAAAAACGTCA AAAAGTTTTCGCTCATGTCGCTCGAAAGTGGAGACCGACCTTAAAAGAAA TTGAAGCACAGATGATAATAATAATCGAAGAAGTGAACGTTTCATTGATA AAAATTTCCTTTAAAAATCAAATTAAAGAGCATCGACTGTATTTGTATGA TCTGTTAACAAAGTGGATAGAGCGATAGAATTCTTATCGTCCGTCTCCAC AGGTTGAATTTCAGAGAAAACCTATCGTACTCATGGTTTCTCTAGAACGT TAATTTCTCTATATAAAGATTTCAGTTTTAAGTCGTCATTGTGAAAATTC CGGTAGCCTTTATTACTGTTATAATTAAGATTAACTTTGTAAAGCTTTTT AAATATTCCAATACCACAGCTTTGCAACGGGTCAAACTTGTGAGACATGG CAACAATATTCGATATGATTTTACATGCTGCAAAAAAACTGATTCTACAC TAACCACATCATGTTATGCGTCAAATACAGGTATAGATCCCAGATGGCAC ACAACGTTGTTTTAACGTTTAAACAACGTTATTTGGACGTTATGGATGTC ACATGGACGTTGAAACAACGTTGTGTGCCAGCTGGGATAACACAGTAAAT GATCGGTTATTCGCAGGTAGATATAAGGAATGGGTTTGGAAAATTTTGAA GAACCTTTTTGTAGGAAATATGAAACTCGGAAATTTTAAGAATTCGTTAT TTATGTCTTCGTATCGCGTAGATTATCGATTTTATATTATCCATTTGCAG GAAATTCTAGCCCTTTTTGAGAAATTAAGTCCCTGCAACATGATCTAAAA TCTGAAATTAGGTCAAAGTTCCCAACAAATAGAAAGAAATGGGGGGGGGG CAAAAGAGACCAACTTATTCATTTAGGCTACACCTAAATTATTAGTAACA ATCAAATTTAGCAAAAAGAGCATAGCTACTTGCTTCAAAAAATCAATCAA TCGAAAGAGTTCAGTAAGGGAAAATTTTCGTTGCTTTGATTAGCTGAAAA TTTCAAATTTCAATGATACTCTAGGCGATGGTGAAAAATCACTTACTACG ATTGATTGATTGATTTGTATACGAGAAAAAGTTTCTAAAAGATGTAGAGC CCCTGTTTAGCGCCTCTGTAAAAGCCCTGGAGACACCCATAATTTACATC ATGGACCAATTTAATAATTTGACAAAAGATAACACAATAATCACAAAGTT TCCGCTTTTAAAGTGATTTCCAGTATTTTTGAAAAATATCTGATACTATC AAGCCATGTCACTCATGAAAATATCTTTCAATAAGGCCACTCAGCTGGCA CACAACGTTCTTTCAACGTCAATTTAACATTTAACGTTAGATGAACGTTG AAACAACGTTGTGTGTCAGCAGGACAAGCCTAGGGCGTCAGTCGAGACAT GATAATCAGAAGTGATTATATTTTCATTATTTTTTTCTTTGTCATCTTGA AACATCCCAGATCCGCTGGGACCCAAGCCTCCCTTAAAGACTTGGCAAAA TTTCTTCTCCAGTAGAAAAATACCCTGGAAGTTCAGTCCCATTTGGATAT TCAATTCGATTTCATCCCACTCGAAATTTAATGTTTAAGAATTGCACTCC AAAATCATCTGCACTGGATTTTTTAACCTTTCAACAATAGAATTTCTATC CCAATTTGGATTTTGATAGAAATTTTTATACGCACTGATGAAAAAAATCT ATCGGGGCTGTGAAACAGGGGTGTCTTAAATGTTCTTTCAATTTTAGGTT TCAACGATGATGGTCGTGGCAATGCAGCTTACCTTGATCGACACGCTATA AGCTGCAGTAACAATTACTATCTTACATATTTTCACTTGAAACGGAATTC TGCTCACAACAAATATCGTTATGATTACCAATGTTGTAAAATTAATCCAC CATCACCAAGAAACTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044_pilon:1772572..1781738-

>XLOC_045419 ID=XLOC_045419|Name=XLOC_045419|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2640bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1772572..1781738- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGATCAAATTTGCGTTGCTCACCTTCTTTGTTTCGTCCAGCTTTGC
CGATACACTTGATGATGATCAAATTTGCGTTGCTCACCTTCTTTGTTTCG
TCCAGCTTTGCCGATACACTTGATTGTGGAGGATCAGCTGGAAGTGTGAA
AATCGCTGGATGTTACAAAAAACCAGCTGGTTTATTTAACAAAATACTGA
TCAGAAGACCAATCTACCAAGAAGGATCCATTAAAAAATTGTGGAGGATC
AGCTGGAAGTGTGAAAATCGCTGGATGTTACAAAAAACCAGCTGGTTTAT
TTAACAAAATACTGATCAGAAGACCAATCTACCAAGAAGGATCCATTAAA
AATTTGGCTTGTGATTGTATTGCTAAAGCAAAGAAAGAAGGTTCTAAAGC
AATCGCACTCGGTGATTACGAAGAGTGTCGTGGAACTACTGACACTGCAA
AACTCTCATCCTTTTTGAAAGACAACTCACAAGTTAGCAATAAATGTTTC
AACGCAAATTACCAATCATGCACAAAGGGGTCACACTGTATGGGAGAAGC
GGGCATTGTTTATATTTATTCCACTGCAGTTTGGCTTGTGATTGTATTGC
TAAAGCAAAGAAAGAAGGTTCTAAAGCAATCGCACTCGGTGATTACGAAG
AGTGTCGTGGAACTACTGACACTGCAAAACTCTCATCCTTTTTGAAAGAC
AACTCACAAGTTAGCAATAAATGTTTCAACGCAAATTACCAATCATGCAC
AAAGGGGTCACACTGTATGGGAGAAGCGGGCATTGTTTATATTTATTCCA
CTGCAGTTGATGGCGGTTGGGGAGATTGGTCAAGCTACGGAGGCTGCAGT
AAAACCTGCGGAGGTGGTAAAAAAATTCGAACACGAAAATGTGACAGGCC
AAAACCACAAAATGGCGGAGCTAACTGTGTAGGAATCTCATCACAGGCTA
CATCATGTAACACAAAAACATGTGCAGTTGATGGCGGTTGGGGAGATTGG
TCAAGCTACGGAGGCTGCAGTAAAACCTGCGGAGGTGGTAAAAAAATTCG
AACACGAAAATGTGACAGGCCAAAACCACAAAATGGCGGAGCTAACTGTG
TAGGAATCTCATCACAGGCTACATCATGTAACACAAAAACATGTGCAGTT
AATGGTAACTGGGGACGATGGTCAAGCTACGGAGGCTGCAGTAAAACTTG
CGGAGGCGGCTCTAGAACTCGAACAAGAAGATGTGATAGCCCAAAACCTC
AAAATGGCGGAGCTAGCTGTAAAGGAAGTTCCACACAATCTGGGAGATGT
AATATACAGAAATGTTTACTTAATGGTAACTGGGGACGATGGTCAAGCTA
CGGAGGCTGCAGTAAAACTTGCGGAGGCGGCTCTAGAACTCGAACAAGAA
GATGTGATAGCCCAAAACCTCAAAATGGCGGAGCTAGCTGTAAAGGAAGT
TCCACACAATCTGGGAGATGTAATATACAGAAATGTTTACCTAATGAAGC
CTGCACTTGGGCATACACAAATTGGAATGATGACGGAAAAGGCGGCGCTG
TTTATTTGGACAGGCACGACGTTCGATGCAACAACGGTCAATATATCAAA
TATATGAAATTAGAAAGAAAAAAGGCAGGCTGGTTCAATTATCAAATACG
TTATAAGTATATATGTTGTCAAAATATGGCTTCATGTTCAAGTGTTACTC
ATTCGACTTTGGATACCTATAATGGTGGTTTTCAAGGAAACGCTGTCTAC
TTCGATCGCCAAACAGTCAGTTGTGGCAGAAATGCTAATGAAGCCTGCAC
TTGGGCATACACAAATTGGAATGATGACGGAAAAGGCGGCGCTGTTTATT
TGGACAGGCACGACGTTCGATGCAACAACGGTCAATATATCAAATATATG
AAATTAGAAAGAAAAAAGGCAGGCTGGTTCAATTATCAAATACGTTATAA
GTATATATGTTGTCAAAATATGGCTTCATGTTCAAGTGTTACTCATTCGA
CTTTGGATACCTATAATGGTGGTTTTCAAGGAAACGCTGTCTACTTCGAT
CGCCAAACAGTCAGTTGTGGCAGAAATGCTTTGCAACGGGTCAAACTTGT
GAGACATGGCAACAATATTCGATATGATTTTACATGCTGCAAAAAAACTG
ATTCTACACTAACCACATCATGTTATGCGTCAAATACAGCTTTGCAACGG
GTCAAACTTGTGAGACATGGCAACAATATTCGATATGATTTTACATGCTG
CAAAAAAACTGATTCTACACTAACCACATCATGTTATGCGTCAAATACAG
GTTTCAACGATGATGGTCGTGGCAATGCAGCTTACCTTGATCGACACGCT
ATAAGCTGCAGTAACAATTACTATCTTACATATTTTCACTTGAAACGGAA
TTCTGCTCACAACAAATATCGTTATGATTACCAATGTTGTAAAATTAATC
CACCATCACCAAGAAACTAAGTTTCAACGATGATGGTCGTGGCAATGCAG
CTTACCTTGATCGACACGCTATAAGCTGCAGTAACAATTACTATCTTACA
TATTTTCACTTGAAACGGAATTCTGCTCACAACAAATATCGTTATGATTA
CCAATGTTGTAAAATTAATCCACCATCACCAAGAAACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045419XLOC_045419-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000044_pilongenomesc0000044_pilon:1772572..1781738 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1153-1320:169
Aaloc1042-1149:1547
Aaloc748-1038:2451
Aaloc577-744:4112
Aaloc406-573:6305
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Aaloc64-174:8216
Aaloc1-60:9168